Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000466541
• Subject: NM_001142621.3
• Aligned Length: 2580
• Identities: 2576
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGATGAGCATCAAAGCCTTTACGCTTGTCTCTGCTGTGGAGCGGGAGCTGCTGATGGGCGACAAGGAGCGCGT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGATGAGCATCAAAGCCTTTACGCTTGTCTCTGCTGTGGAGCGGGAGCTGCTGATGGGCGACAAGGAGCGCGT  74

Query   75  CAACATAGAGTGCGTGGAGTGCTGCGGCAGGGACCTCTACGTGGGCACCAACGACTGCTTCGTCTACCACTTCC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CAACATAGAGTGCGTGGAGTGCTGCGGCAGGGACCTCTACGTGGGCACCAACGACTGCTTCGTCTACCACTTCC  148

Query  149  TGTTGGAGGAGAGGCCAGTGCCTGCTGGGCCAGCCACGTTCACTGCCACCAAACAGCTGCAGAGACACTTGGGC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TGTTGGAGGAGAGGCCAGTGCCTGCTGGGCCAGCCACGTTCACTGCCACCAAACAGCTGCAGAGACACTTGGGC  222

Query  223  TTCAAGAAGCCCGTGAACGAGCTGCGCGCGGCCTCAGCACTCAACAGGCTGCTGGTGCTGTGTGACAACTCCAT  296
            ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TTCAAGAAGCCCGTGAACGAGCTGCGTGCGGCCTCAGCACTCAACAGGCTGCTGGTGCTGTGTGACAACTCCAT  296

Query  297  CAGCCTGGTCAACATGCTGAACCTCGAGCCAGTGCCTTCGGGGGCCCGCATCAAGGGGGCAGCCACGTTTGCAC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CAGCCTGGTCAACATGCTGAACCTCGAGCCAGTGCCTTCGGGGGCCCGCATCAAGGGGGCAGCCACGTTTGCAC  370

Query  371  TGAACGAGAACCCTGTGAGTGGGGACCCCTTCTGTGTAGAAGTTTGCATCATCTCTGTCAAACGCAGAACCATC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TGAACGAGAACCCTGTGAGTGGGGACCCCTTCTGTGTAGAAGTTTGCATCATCTCTGTCAAACGCAGAACCATC  444

Query  445  CAGATGTTTCTGGTGTACGAGGACCGGGTGCAGATCGTCAAGGAGGTGTCGACTGCCGAACAGCCCCTCGCTGT  518
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct  445  CAGATGTTTCTGGTGTACGAGGACCGGGTGCAGATCGTCAAGGAGGTGTCGACTGCCGAGCAGCCCCTCGCTGT  518

Query  519  GGCTGTGGACGGCCACTTCCTGTGTCTGGCTCTGACCACTCAGTACATCATCCACAATTACAGCACAGGCGTCT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GGCTGTGGACGGCCACTTCCTGTGTCTGGCTCTGACCACTCAGTACATCATCCACAATTACAGCACAGGCGTCT  592

Query  593  CCCAGGACCTTTTTCCCTACTGCAGTGAGGAGAGGCCGCCGATCGTCAAGAGGATAGGGAGACAGGAGTTCCTG  666
            ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CCCAGGACCTGTTTCCCTACTGCAGTGAGGAGAGGCCGCCGATCGTCAAGAGGATAGGGAGACAGGAGTTCCTG  666

Query  667  CTGGCGGGCCCCGGAGGGCTGGGCATGTTTGCCACAGTCGCAGGGATATCCCAGCGTGCCCCCGTGCACTGGTC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  667  CTGGCGGGCCCCGGAGGGCTGGGCATGTTTGCCACAGTCGCAGGGATATCCCAGCGCGCCCCCGTGCACTGGTC  740

Query  741  GGAGAATGTGATTGGGGCGGCTGTGTCCTTTCCATACGTCATAGCGCTCGATGACGAATTCATCACAGTCCACA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GGAGAATGTGATTGGGGCGGCTGTGTCCTTTCCATACGTCATAGCGCTCGATGACGAATTCATCACAGTCCACA  814

Query  815  GCATGTTGGATCAGCAACAGAAGCAGACGCTGCCCTTTAAGGAGGGCCATATCCTACAGGACTTTGAAGGAAGA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GCATGTTGGATCAGCAACAGAAGCAGACGCTGCCCTTTAAGGAGGGCCATATCCTACAGGACTTTGAAGGAAGA  888

Query  889  GTGATCGTTGCCACAAGTAAAGGAGTTTACATCTTGGTTCCATTACCTTTGGAAAAACAAATACAGGATCTTCT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GTGATCGTTGCCACAAGTAAAGGAGTTTACATCTTGGTTCCATTACCTTTGGAAAAACAAATACAGGATCTTCT  962

Query  963  AGCAAGCCGCAGAGTAGAAGAGGCTTTGGTTTTAGCAAAAGGAGCCCGGAGGAACATTCCAAAGGAAAAATTTC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  AGCAAGCCGCAGAGTAGAAGAGGCTTTGGTTTTAGCAAAAGGAGCCCGGAGGAACATTCCAAAGGAAAAATTTC  1036

Query 1037  AGGTAATGTACAGAAGGATTCTGCAGCAGGCGGGATTTATACAGTTTGCACAACTTCAGTTCCTGGAAGCTAAA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AGGTAATGTACAGAAGGATTCTGCAGCAGGCGGGATTTATACAGTTTGCACAACTTCAGTTCCTGGAAGCTAAA  1110

Query 1111  GAGCTCTTCAGAAGCGGCCAGCTTGATGTCCGGGAGCTGATCTCTCTCTACCCCTTCCTGTTGCCCACCTCCTC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GAGCTCTTCAGAAGCGGCCAGCTTGATGTCCGGGAGCTGATCTCTCTCTACCCCTTCCTGTTGCCCACCTCCTC  1184

Query 1185  CTCCTTCACCCGGTCCCACCCTCCTCTTCATGAGTACGCAGACCTGAACCAGCTGACCCAGGGGGACCAGGAGA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CTCCTTCACCCGGTCCCACCCTCCTCTTCATGAGTACGCAGACCTGAACCAGCTGACCCAGGGGGACCAGGAGA  1258

Query 1259  AGATGGCCAAGTGCAAACGCTTCCTCATGAGCTACCTGAACGAGGTCCGCAGCACAGAGGTAGCAAATGGCTAC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  AGATGGCCAAGTGCAAACGCTTCCTCATGAGCTACCTGAACGAGGTCCGCAGCACAGAGGTAGCAAATGGCTAC  1332

Query 1333  AAGGAGGACATCGACACAGCCTTGCTCAAACTGTATGCAGAGGCTGACCACGACAGCCTGCTGGACCTCCTGGT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  AAGGAGGACATCGACACAGCCTTGCTCAAACTGTATGCAGAGGCTGACCACGACAGCCTGCTGGACCTCCTGGT  1406

Query 1407  CACTGAGAACTTCTGTCTTCTGACGGACAGTGCTGCCTGGCTAGAGAAGCACAAAAAGTATTTTGCACTTGGAC  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CACTGAGAACTTCTGTCTTCTGACGGACAGTGCTGCCTGGCTAGAGAAGCACAAAAAGTATTTTGCACTTGGAC  1480

Query 1481  TGCTCTATCATTATAATAACCAAGATGCTGCTGCAGTTCAGTTGTGGGTGAACATTGTGAATGGCGATGTCCAG  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  TGCTCTATCATTATAATAACCAAGATGCTGCTGCAGTTCAGTTGTGGGTGAACATTGTGAATGGCGATGTCCAG  1554

Query 1555  GACTCCACACGCTCAGACCTGTATGAATACATCGTGGATTTTCTTACCTACTGCTTAGACGAGGAACTAGTGTG  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  GACTCCACACGCTCAGACCTGTATGAATACATCGTGGATTTTCTTACCTACTGCTTAGACGAGGAACTAGTGTG  1628

Query 1629  GGCCTATGCTGATTGGGTCCTGCAGAAAAGTGAAGAGGTCGGAGTTCAGGTTTTCACCAAGAGACCTTTGGATG  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  GGCCTATGCTGATTGGGTCCTGCAGAAAAGTGAAGAGGTCGGAGTTCAGGTTTTCACCAAGAGACCTTTGGATG  1702

Query 1703  AACAGCAGAAGAACAGTTTTAATCCAGACGACATTATCAATTGCCTTAAAAAATACCCTAAAGCCCTTGTGAAG  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  AACAGCAGAAGAACAGTTTTAATCCAGACGACATTATCAATTGCCTTAAAAAATACCCTAAAGCCCTTGTGAAG  1776

Query 1777  TATCTGGAACATCTTGTGATAGACAAGAGACTGCAGAAAGAAGAGTATCACACCCACTTAGCTGTGCTGTACCT  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  TATCTGGAACATCTTGTGATAGACAAGAGACTGCAGAAAGAAGAGTATCACACCCACTTAGCTGTGCTGTACCT  1850

Query 1851  GGAAGAGGTGCTGCTGCAGAGGGCCTCCGCCAGTGGCAAGGGTGCAGAGGCCACCGAGACGCAGGCCAAGCTGC  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  GGAAGAGGTGCTGCTGCAGAGGGCCTCCGCCAGTGGCAAGGGTGCAGAGGCCACCGAGACGCAGGCCAAGCTGC  1924

Query 1925  GGCGGCTGCTCCAGAAATCTGATTTATACCGAGTCCACTTTCTTCTCGAGAGGCTGCAGGGAGCTGGCCTGCCC  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  GGCGGCTGCTCCAGAAATCTGATTTATACCGAGTCCACTTTCTTCTCGAGAGGCTGCAGGGAGCTGGCCTGCCC  1998

Query 1999  ATGGAGAGCGCCATCCTGCACGGGAAGCTGGGCGAGCATGAGAAGGCGCTGCATATCCTGGTGCACGAGCTGCA  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  ATGGAGAGCGCCATCCTGCACGGGAAGCTGGGCGAGCATGAGAAGGCGCTGCATATCCTGGTGCACGAGCTGCA  2072

Query 2073  GGACTTTGCAGCGGCCGAGGACTACTGCCTGTGGTGCTCCGAGGGCCGAGACCCACCCCACCGCCAGCAACTCT  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  GGACTTTGCAGCGGCCGAGGACTACTGCCTGTGGTGCTCCGAGGGCCGAGACCCACCCCACCGCCAGCAACTCT  2146

Query 2147  TTCACACGCTGCTGGCCATCTACCTGCATGCTGGCCCCACTGCCCACGAGCTGGCCGTGGCTGCCGTGGACCTG  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  TTCACACGCTGCTGGCCATCTACCTGCATGCTGGCCCCACTGCCCACGAGCTGGCCGTGGCTGCCGTGGACCTG  2220

Query 2221  CTGAACCGCCACGCCACCGAATTTGATGCAGCCCAGGTGCTGCAGATGCTGCCTGACACCTGGTCAGTGCAGCT  2294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  CTGAACCGCCACGCCACCGAATTTGATGCAGCCCAGGTGCTGCAGATGCTGCCTGACACCTGGTCAGTGCAGCT  2294

Query 2295  CCTCTGCCCATTCCTGATGGGGGCCATGAGGGACAGCATCCATGCCAGGAGGACCATGCAGGTGGCTCTCGGCC  2368
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  CCTCTGCCCATTCCTGATGGGGGCCATGAGGGACAGCATCCATGCCAGGAGGACCATGCAGGTGGCTCTCGGCC  2368

Query 2369  TGGCCAGGTCCGAAAACTTAATCTACACCTACGATAAGATGAAGTTGAAAGGAAGCTCAATCCAACTCTCAGAC  2442
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369  TGGCCAGGTCCGAAAACTTAATCTACACCTACGATAAGATGAAGTTGAAAGGAAGCTCAATCCAACTCTCAGAC  2442

Query 2443  AAAAAGCTTTGTCAGATATGCCAAAATCCCTTTTGTGAGCCTGTGTTTGTTAGATACCCAAATGGTGGTCTTGT  2516
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443  AAAAAGCTTTGTCAGATATGCCAAAATCCCTTTTGTGAGCCTGTGTTTGTTAGATACCCAAATGGTGGTCTTGT  2516

Query 2517  GCACACCCACTGTGCCGCCAGCAGACACACAAACCCCAGCTCATCCAGTCCTGGCACTCGGACT  2580
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517  GCACACCCACTGTGCCGCCAGCAGACACACAAACCCCAGCTCATCCAGTCCTGGCACTCGGACT  2580