Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000466542
• Subject: XM_006503881.3
• Aligned Length: 1885
• Identities: 1607
• Gaps: 26

Alignment

Query    1  ATGCCAGGCACAAAACGGTTTCAACATGTCATTGAGACCCCGGAGCCTGGCAAGTGGGAGTTGTCTGGGTACGA  74
            ||||||.||||.||.||||.|||.|||||.||.||||||||.||||||||..|.|||||||||||.|||||.||
Sbjct    1  ATGCCAAGCACCAAGCGGTATCAGCATGTGATCGAGACCCCTGAGCCTGGGGAATGGGAGTTGTCAGGGTATGA  74

Query   75  GGCAGCTGTGCCAATCACGGAGAAGTCAAACCCACTGACCCAGGATC-TAGACAAAGCAGATGCTGAGAACATT  147
            .|||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||| |||.| |.||||||||||||||.|||||.|||
Sbjct   75  AGCAGCTGTGCCAATCACAGAGAAGTCCAACCCACTGACCC-GGAACTTGGACAAAGCAGATGCAGAGAAAATT  147

Query  148  GTTCGACTGCTAGGGCAATGTGATGCTGAGATCTTCCAGGAGGAGGGGCAAGCCCTGTCCACATACCAGAGACT  221
            ||||.||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||..|.||.||||.||||||.||||
Sbjct  148  GTTCAACTGCTGGGGCAGTGTGATGCTGAGATATTCCAGGAGGAGGGGCAAATCATGCCCACCTACCAGCGACT  221

Query  222  CTACAGCGAATCCATTCTGACCACCATGGTACAGGTGGCTGGGAAAGTTCAGGAAGTGCTGAAGGAGCCAGATG  295
            .|||||.||.||..||||||||||||||.|.||.||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct  222  GTACAGTGAGTCAGTTCTGACCACCATGTTGCAAGTGGCTGGCAAGGTCCAGGAAGTGCTGAAGGAGCCAGATG  295

Query  296  GGGGGCTGGTTGTGCTGAGTGGAGGGGGCACCTCTGGCCGGATGGCATTCCTCATGTCGGTGTCCTTTAATCAG  369
            ||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||.|||||.||.||.|||
Sbjct  296  GGGGCCTGGTGGTGCTGAGTGGAGGGGGCACCTCTGGTCGTATGGCATTCCTTATGTCTGTGTCTTTCAACCAG  369

Query  370  CTGATGAAAGGTCTGGGACAGAAACCTCTTTACACCTACCTCATTGCAGGTGGTGACAGGTCTGTGGTGGCCTC  443
            ||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||
Sbjct  370  CTGATGAAAGGTCTGGGACAAAAACCTCTTTACACATACCTCATTGCAGGGGGTGACAGGTCTGTTGTAGCCTC  443

Query  444  TAGGGAGGGGACAGAAGATAGTGCCTTGCACGGGATTGAGGAACTGAAGAAGGTGGCTGCCGGGAAGAAGAGAG  517
            |.||||..|||||||||||||.|||.|.|||||.||.|||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||
Sbjct  444  TCGGGAACGGACAGAAGATAGCGCCCTACACGGAATCGAGGAGCTGAAGAAGGTGGCTGCTGGGAAAAAGAGAG  517

Query  518  TGATTGTCATTGGCATTTCTGTGGGACTCTCTGCTCCCTTTGTGGCAGGCCAGATGGACTGCTGCATGAACAAC  591
            ||.|.||.||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.|||||||.|.|||
Sbjct  518  TGGTCGTTATAGGCATTTCCGTGGGACTCTCTGCGCCCTTTGTGGCAGGCCAGATGGACTACTGCATGGATAAC  591

Query  592  ACAGCTGTCTTCTTGCCAGTCCTGGTTGGCTTCAATCCAGTGAGCATGGCCAGAAATGACCCCATTGAAGACTG  665
            |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct  592  ACAGCTGTCTTCTTGCCGGTCCTGGTTGGCTTCAATCCGGTGAGCATGGCCAGAAATGATCCCATTGAAGACTG  665

Query  666  GAGTTCAACATTCCGACAAGTAGCAGAGCGGATGCAGAAAATGCAGGAGAAACAGAAAGCTTTTGTGCTCAATC  739
            |||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||.||||.|||||||||||||
Sbjct  666  GAGATCGACATTCCGACAAGTGGCAGAGCGGATGCAGAAGATGCAGGAGAAACAGGAAGCCTTTGTGCTCAATC  739

Query  740  CTGCCATCGGGCCCGAGGGTCTCAGCGGCTCCTCCCGGATGAAAGGTGGAAGTGCCACCAAGATTCTGCTGGAA  813
            |||||||||||||.|||||.|||||.|||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||||||
Sbjct  740  CTGCCATCGGGCCTGAGGGGCTCAGTGGCTCTTCCCGAATGAAAGGTGGAAGCGCCACCAAGATTCTACTGGAA  813

Query  814  ACCCTGTTATTAGCAGCCCATAAGACTGTGGACCAGGGCATTGCAGCATCTCAAAGATGCCTCCTGGAAATCTT  887
            ||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||..|||...|.||||||||||||||.|||||||||.|
Sbjct  814  ACCCTGCTACTAGCAGCCCATAAGACTGTGGACCAGGGTGTTGTGTCCTCTCAAAGATGCCTTCTGGAAATCCT  887

Query  888  GCGGACATTTGAGCGAGCTCATCAGGTGACCTACAGCCAAAGCCCCAAGATTGCCACCCTGATGAAGAGTGTCA  961
            |.|||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||..||||.||||||||.||||.||||...||..
Sbjct  888  GAGGACATTTGAGCGGGCTCATCAGGTAACCTACAGTCAAAGTTCCAAAATTGCCACTCTGACGAAGCAAGTTG  961

Query  962  GCACCAGTCTGGAGAAGAAAGGCCACGTGTACCTGGTTGGCTGGCAGACCCTGGGCATCATTGCCATCATGGAT  1035
            |||.|||.||||||||.||||||||||||.||.|||||||||||||||||||.||.|||||.|||||.||||||
Sbjct  962  GCATCAGCCTGGAGAAAAAAGGCCACGTGCACTTGGTTGGCTGGCAGACCCTCGGTATCATCGCCATTATGGAT  1035

Query 1036  GGAGTAGAGTGCATCCACACCTTTGGTGCTGATTTCCGAGATGTCCGTGGCTTTCTCATTGGTGATCACAGTGA  1109
            ||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||.|||||||||||||.||||||||.||||.|||
Sbjct 1036  GGGGTAGAGTGTATCCACACTTTTGGTGCTGATTTCCGAGATATCCGTGGCTTTCTTATTGGTGACCACAATGA  1109

Query 1110  CATGTTTAACCAGAAGGCTGAGCTCACCAACCAGGGTCCCCAGTTCACCTTCTCCCAGGAGGACTTCCTGACTT  1183
            |||||||||||||||||.||||||||.|||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||
Sbjct 1110  CATGTTTAACCAGAAGGATGAGCTCAGCAATCAGGGTCCCCAGTTCACCTTCTCTCAGGATGACTTCCTGACTT  1183

Query 1184  CCATCCTTCCCTCTCTCACGGAAATCGATACTGTGGTCTTCATTTTCACCCTGGATGACAACCTCACGGAGGTG  1257
            |..|.||.||.||.||.||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||||||.|.||.||.
Sbjct 1184  CTGTTCTGCCATCCCTTACGGAAATTGACACTGTGGTCTTCATTTTTACCCTGGATGATAACCTCGCAGAAGTA  1257

Query 1258  CAGACTATAGTGGAGCAGGTGAAAGAGAAGACCAACCACATCCAGGCCCTGGCACACAGCACCGTGGGTCAGAC  1331
            |||.|..|.|..||...|||||..|||||||......|||||||||||||||..||||||||.|||||.|||.|
Sbjct 1258  CAGGCCCTGGCAGAAAGGGTGAGGGAGAAGAGTTGGAACATCCAGGCCCTGGTGCACAGCACAGTGGGGCAGTC  1331

Query 1332  CTTGCCGATC-CCTCTGAAGAAGCTCTTTCCCTCCATCATCAGCATCACATGGCCACTGCTTTTCTTTGAATAT  1404
            |||||| |.| |||||.|||||||||||||||||..||||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||
Sbjct 1332  CTTGCC-AGCTCCTCTAAAGAAGCTCTTTCCCTCGCTCATCAGCATCACATGGCCACTTCTTTTCTTCGATTAT  1404

Query 1405  GAAGGGAACTTCATCCAGAAGTTCCAGCGTGAGCTAAGCACCAAATGGGTGCTGAATACAGTGAGTACAGGTGC  1478
            |||||||.||.|.|.||||||||||||||||||.||||||||||.||||||.||||||||||||||||.||.||
Sbjct 1405  GAAGGGAGCTACGTTCAGAAGTTCCAGCGTGAGTTAAGCACCAAGTGGGTGTTGAATACAGTGAGTACTGGGGC  1478

Query 1479  TCATGTGCTTCTTGGTAAGATCCTACAAAACCACATGTTGGACCTTCGGATTAGCAACTCCAAGCTCTTCTGGC  1552
            .||||||||.||.||.|||||||||||.|||||||||.|||||||.||.||...|||||||||.|||||||||.
Sbjct 1479  CCATGTGCTGCTGGGGAAGATCCTACAGAACCACATGCTGGACCTCCGCATCGCCAACTCCAAACTCTTCTGGA  1552

Query 1553  GGGCGCTGGCCATGCTGCAGCGGTTCTCTGGACAGTCCAAGGCTCGATGCATCGAGAGCCTCCTCCGAGCGATC  1626
            ||||.|||||||||.|||||.|||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.||.||.|.||.|||.
Sbjct 1553  GGGCACTGGCCATGTTGCAGAGGTTCTCAGGACAGTCCAAGGCTCGCTGCATTGAGAGTCTTCTTCAAGTGATA  1626

Query 1627  CACTTTCCC-CAGCCACTGTCAGATGATATTCGGGCTGCTCCCATCTCCTGCCATGTCCAGGTTGCACATGAGA  1699
            || |||||| ||.||.|||||..|||||.|.||.||.||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||
Sbjct 1627  CA-TTTCCCTCAACCGCTGTCGAATGATGTCCGCGCGGCCCCCATCTCCTGCCATGTCCAGGTTGCCCACGAGA  1699

Query 1700  AGGAACAGGTGATACCCATCGCCTTGCTGAGCCTCCTATTCCGGTGCTCGATCACTGAGGCTCAGGCACACCTG  1773
            |||||.|||||||.||||..|||||||||||.||||||.||.|||||||.||||||||||||.|||.||.||||
Sbjct 1700  AGGAAAAGGTGATCCCCACAGCCTTGCTGAGTCTCCTACTCAGGTGCTCCATCACTGAGGCTAAGGAACGCCTG  1773

Query 1774  GCTGCAGCTCCTTCTGTCTGTGAGGCTGTCAGGAGTGCTCTTGCTGGGCCAGGTCAGAAGCGCACTGCGGACCC  1847
            |||||||||.||||.||||||||||.|||.|||||.||.||..||||||||||||||||.||||    |.|.||
Sbjct 1774  GCTGCAGCTTCTTCAGTCTGTGAGGTTGTTAGGAGCGCCCTCTCTGGGCCAGGTCAGAAACGCA----GCATCC  1843

Query 1848  ---CC--TCGAGATCC--TAGAGCCTGACGTTCAG  1875
               ||  |.||||.||  |.|.|||.         
Sbjct 1844  AAGCCTTTGGAGACCCTGTGGTGCCC---------  1869