Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000466542
• Subject: XM_006503882.3
• Aligned Length: 1885
• Identities: 1560
• Gaps: 80

Alignment

Query    1  ATGCCAGGCACAAAACGGTTTCAACATGTCATTGAGACCCCGGAGCCTGGCAAGTGGGAGTTGTCTGGGTACGA  74
            ||||||.||||.||.||||.|||.|||||.||.||||||||.||||||||..|.|||||||||||.|||||.||
Sbjct    1  ATGCCAAGCACCAAGCGGTATCAGCATGTGATCGAGACCCCTGAGCCTGGGGAATGGGAGTTGTCAGGGTATGA  74

Query   75  GGCAGCTGTGCCAATCACGGAGAAGTCAAACCCACTGACCCAGGATC-TAGACAAAGCAGATGCTGAGAACATT  147
            .|||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||| |||.| |.||||||||||||||.|||||.|||
Sbjct   75  AGCAGCTGTGCCAATCACAGAGAAGTCCAACCCACTGACCC-GGAACTTGGACAAAGCAGATGCAGAGAAAATT  147

Query  148  GTTCGACTGCTAGGGCAATGTGATGCTGAGATCTTCCAGGAGGAGGGGCAAGCCCTGTCCACATACCAGAGACT  221
            ||||.||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||..|.||.||||.||||||.||||
Sbjct  148  GTTCAACTGCTGGGGCAGTGTGATGCTGAGATATTCCAGGAGGAGGGGCAAATCATGCCCACCTACCAGCGACT  221

Query  222  CTACAGCGAATCCATTCTGACCACCATGGTACAGGTGGCTGGGAAAGTTCAGGAAGTGCTGAAGGAGCCAGATG  295
            .|||||.||.||..||||||||||||||.|.||.||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct  222  GTACAGTGAGTCAGTTCTGACCACCATGTTGCAAGTGGCTGGCAAGGTCCAGGAAGTGCTGAAGGAGCCAGATG  295

Query  296  GGGGGCTGGTTGTGCTGAGTGGAGGGGGCACCTCTGGCCGGATGGCATTCCTCATGTCGGTGTCCTTTAATCAG  369
            ||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||.|||||.||.||.|||
Sbjct  296  GGGGCCTGGTGGTGCTGAGTGGAGGGGGCACCTCTGGTCGTATGGCATTCCTTATGTCTGTGTCTTTCAACCAG  369

Query  370  CTGATGAAAGGTCTGGGACAGAAACCTCTTTACACCTACCTCATTGCAGGTGGTGACAGGTCTGTGGTGGCCTC  443
            ||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||
Sbjct  370  CTGATGAAAGGTCTGGGACAAAAACCTCTTTACACATACCTCATTGCAGGGGGTGACAGGTCTGTTGTAGCCTC  443

Query  444  TAGGGAGGGGACAGAAGATAGTGCCTTGCACGGGATTGAGGAACTGAAGAAGGTGGCTGCCGGGAAGAAGAGAG  517
            |.||||..|||||||||||||.|||.|.|||||.||.|||||.|||||||||                      
Sbjct  444  TCGGGAACGGACAGAAGATAGCGCCCTACACGGAATCGAGGAGCTGAAGAAG----------------------  495

Query  518  TGATTGTCATTGGCATTTCTGTGGGACTCTCTGCTCCCTTTGTGGCAGGCCAGATGGACTGCTGCATGAACAAC  591
                                            ||.|||||||||||||||||||||||||.|||||||.|.|||
Sbjct  496  --------------------------------GCGCCCTTTGTGGCAGGCCAGATGGACTACTGCATGGATAAC  537

Query  592  ACAGCTGTCTTCTTGCCAGTCCTGGTTGGCTTCAATCCAGTGAGCATGGCCAGAAATGACCCCATTGAAGACTG  665
            |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct  538  ACAGCTGTCTTCTTGCCGGTCCTGGTTGGCTTCAATCCGGTGAGCATGGCCAGAAATGATCCCATTGAAGACTG  611

Query  666  GAGTTCAACATTCCGACAAGTAGCAGAGCGGATGCAGAAAATGCAGGAGAAACAGAAAGCTTTTGTGCTCAATC  739
            |||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||.||||.|||||||||||||
Sbjct  612  GAGATCGACATTCCGACAAGTGGCAGAGCGGATGCAGAAGATGCAGGAGAAACAGGAAGCCTTTGTGCTCAATC  685

Query  740  CTGCCATCGGGCCCGAGGGTCTCAGCGGCTCCTCCCGGATGAAAGGTGGAAGTGCCACCAAGATTCTGCTGGAA  813
            |||||||||||||.|||||.|||||.|||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||||||
Sbjct  686  CTGCCATCGGGCCTGAGGGGCTCAGTGGCTCTTCCCGAATGAAAGGTGGAAGCGCCACCAAGATTCTACTGGAA  759

Query  814  ACCCTGTTATTAGCAGCCCATAAGACTGTGGACCAGGGCATTGCAGCATCTCAAAGATGCCTCCTGGAAATCTT  887
            ||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||..|||...|.||||||||||||||.|||||||||.|
Sbjct  760  ACCCTGCTACTAGCAGCCCATAAGACTGTGGACCAGGGTGTTGTGTCCTCTCAAAGATGCCTTCTGGAAATCCT  833

Query  888  GCGGACATTTGAGCGAGCTCATCAGGTGACCTACAGCCAAAGCCCCAAGATTGCCACCCTGATGAAGAGTGTCA  961
            |.|||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||..||||.||||||||.||||.||||...||..
Sbjct  834  GAGGACATTTGAGCGGGCTCATCAGGTAACCTACAGTCAAAGTTCCAAAATTGCCACTCTGACGAAGCAAGTTG  907

Query  962  GCACCAGTCTGGAGAAGAAAGGCCACGTGTACCTGGTTGGCTGGCAGACCCTGGGCATCATTGCCATCATGGAT  1035
            |||.|||.||||||||.||||||||||||.||.|||||||||||||||||||.||.|||||.|||||.||||||
Sbjct  908  GCATCAGCCTGGAGAAAAAAGGCCACGTGCACTTGGTTGGCTGGCAGACCCTCGGTATCATCGCCATTATGGAT  981

Query 1036  GGAGTAGAGTGCATCCACACCTTTGGTGCTGATTTCCGAGATGTCCGTGGCTTTCTCATTGGTGATCACAGTGA  1109
            ||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||.|||||||||||||.||||||||.||||.|||
Sbjct  982  GGGGTAGAGTGTATCCACACTTTTGGTGCTGATTTCCGAGATATCCGTGGCTTTCTTATTGGTGACCACAATGA  1055

Query 1110  CATGTTTAACCAGAAGGCTGAGCTCACCAACCAGGGTCCCCAGTTCACCTTCTCCCAGGAGGACTTCCTGACTT  1183
            |||||||||||||||||.||||||||.|||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||
Sbjct 1056  CATGTTTAACCAGAAGGATGAGCTCAGCAATCAGGGTCCCCAGTTCACCTTCTCTCAGGATGACTTCCTGACTT  1129

Query 1184  CCATCCTTCCCTCTCTCACGGAAATCGATACTGTGGTCTTCATTTTCACCCTGGATGACAACCTCACGGAGGTG  1257
            |..|.||.||.||.||.||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||||||.|.||.||.
Sbjct 1130  CTGTTCTGCCATCCCTTACGGAAATTGACACTGTGGTCTTCATTTTTACCCTGGATGATAACCTCGCAGAAGTA  1203

Query 1258  CAGACTATAGTGGAGCAGGTGAAAGAGAAGACCAACCACATCCAGGCCCTGGCACACAGCACCGTGGGTCAGAC  1331
            |||.|..|.|..||...|||||..|||||||......|||||||||||||||..||||||||.|||||.|||.|
Sbjct 1204  CAGGCCCTGGCAGAAAGGGTGAGGGAGAAGAGTTGGAACATCCAGGCCCTGGTGCACAGCACAGTGGGGCAGTC  1277

Query 1332  CTTGCCGATC-CCTCTGAAGAAGCTCTTTCCCTCCATCATCAGCATCACATGGCCACTGCTTTTCTTTGAATAT  1404
            |||||| |.| |||||.|||||||||||||||||..||||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||
Sbjct 1278  CTTGCC-AGCTCCTCTAAAGAAGCTCTTTCCCTCGCTCATCAGCATCACATGGCCACTTCTTTTCTTCGATTAT  1350

Query 1405  GAAGGGAACTTCATCCAGAAGTTCCAGCGTGAGCTAAGCACCAAATGGGTGCTGAATACAGTGAGTACAGGTGC  1478
            |||||||.||.|.|.||||||||||||||||||.||||||||||.||||||.||||||||||||||||.||.||
Sbjct 1351  GAAGGGAGCTACGTTCAGAAGTTCCAGCGTGAGTTAAGCACCAAGTGGGTGTTGAATACAGTGAGTACTGGGGC  1424

Query 1479  TCATGTGCTTCTTGGTAAGATCCTACAAAACCACATGTTGGACCTTCGGATTAGCAACTCCAAGCTCTTCTGGC  1552
            .||||||||.||.||.|||||||||||.|||||||||.|||||||.||.||...|||||||||.|||||||||.
Sbjct 1425  CCATGTGCTGCTGGGGAAGATCCTACAGAACCACATGCTGGACCTCCGCATCGCCAACTCCAAACTCTTCTGGA  1498

Query 1553  GGGCGCTGGCCATGCTGCAGCGGTTCTCTGGACAGTCCAAGGCTCGATGCATCGAGAGCCTCCTCCGAGCGATC  1626
            ||||.|||||||||.|||||.|||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.||.||.|.||.|||.
Sbjct 1499  GGGCACTGGCCATGTTGCAGAGGTTCTCAGGACAGTCCAAGGCTCGCTGCATTGAGAGTCTTCTTCAAGTGATA  1572

Query 1627  CACTTTCCC-CAGCCACTGTCAGATGATATTCGGGCTGCTCCCATCTCCTGCCATGTCCAGGTTGCACATGAGA  1699
            || |||||| ||.||.|||||..|||||.|.||.||.||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||
Sbjct 1573  CA-TTTCCCTCAACCGCTGTCGAATGATGTCCGCGCGGCCCCCATCTCCTGCCATGTCCAGGTTGCCCACGAGA  1645

Query 1700  AGGAACAGGTGATACCCATCGCCTTGCTGAGCCTCCTATTCCGGTGCTCGATCACTGAGGCTCAGGCACACCTG  1773
            |||||.|||||||.||||..|||||||||||.||||||.||.|||||||.||||||||||||.|||.||.||||
Sbjct 1646  AGGAAAAGGTGATCCCCACAGCCTTGCTGAGTCTCCTACTCAGGTGCTCCATCACTGAGGCTAAGGAACGCCTG  1719

Query 1774  GCTGCAGCTCCTTCTGTCTGTGAGGCTGTCAGGAGTGCTCTTGCTGGGCCAGGTCAGAAGCGCACTGCGGACCC  1847
            |||||||||.||||.||||||||||.|||.|||||.||.||..||||||||||||||||.||||    |.|.||
Sbjct 1720  GCTGCAGCTTCTTCAGTCTGTGAGGTTGTTAGGAGCGCCCTCTCTGGGCCAGGTCAGAAACGCA----GCATCC  1789

Query 1848  ---CC--TCGAGATCC--TAGAGCCTGACGTTCAG  1875
               ||  |.||||.||  |.|.|||.         
Sbjct 1790  AAGCCTTTGGAGACCCTGTGGTGCCC---------  1815