Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000466542
• Subject: XM_006503883.3
• Aligned Length: 1884
• Identities: 1472
• Gaps: 180

Alignment

Query    1  ATGCCAGGCACAAAACGGTTTCAACATGTCATTGAGACCCCGGAGCCTGGCAAGTGGGAGTTGTCTGGGTACGA  74
            ||||||.||||.||.||||.|||.|||||.||.||||||||.||||||||..|.||||||              
Sbjct    1  ATGCCAAGCACCAAGCGGTATCAGCATGTGATCGAGACCCCTGAGCCTGGGGAATGGGAG--------------  60

Query   75  GGCAGCTGTGCCAATCACGGAGAAGTCAAACCCACTGACCCAGGATCTAGACAAAGCAGATGCTGAGAACATTG  148
                                                                                      
Sbjct   61  --------------------------------------------------------------------------  60

Query  149  TTCGACTGCTAGGGCAATGTGATGCTGAGATCTTCCAGGAGGAGGGGCAAGCCCTGTCCACATACCAGAGACTC  222
              ||||||                                                                  
Sbjct   61  --CGACTG------------------------------------------------------------------  66

Query  223  TACAGCGAATCCATTCTGACCACCATGGTACAGGTGGCTGGGAAAGTTCAGGAAGTGCTGAAGGAGCCAGATGG  296
            |||||.||.||..||||||||||||||.|.||.||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   67  TACAGTGAGTCAGTTCTGACCACCATGTTGCAAGTGGCTGGCAAGGTCCAGGAAGTGCTGAAGGAGCCAGATGG  140

Query  297  GGGGCTGGTTGTGCTGAGTGGAGGGGGCACCTCTGGCCGGATGGCATTCCTCATGTCGGTGTCCTTTAATCAGC  370
            |||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||.|||||.||.||.||||
Sbjct  141  GGGCCTGGTGGTGCTGAGTGGAGGGGGCACCTCTGGTCGTATGGCATTCCTTATGTCTGTGTCTTTCAACCAGC  214

Query  371  TGATGAAAGGTCTGGGACAGAAACCTCTTTACACCTACCTCATTGCAGGTGGTGACAGGTCTGTGGTGGCCTCT  444
            |||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||.||||||
Sbjct  215  TGATGAAAGGTCTGGGACAAAAACCTCTTTACACATACCTCATTGCAGGGGGTGACAGGTCTGTTGTAGCCTCT  288

Query  445  AGGGAGGGGACAGAAGATAGTGCCTTGCACGGGATTGAGGAACTGAAGAAGGTGGCTGCCGGGAAGAAGAGAGT  518
            .||||..|||||||||||||.|||.|.|||||.||.|||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||
Sbjct  289  CGGGAACGGACAGAAGATAGCGCCCTACACGGAATCGAGGAGCTGAAGAAGGTGGCTGCTGGGAAAAAGAGAGT  362

Query  519  GATTGTCATTGGCATTTCTGTGGGACTCTCTGCTCCCTTTGTGGCAGGCCAGATGGACTGCTGCATGAACAACA  592
            |.|.||.||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.|||||||.|.||||
Sbjct  363  GGTCGTTATAGGCATTTCCGTGGGACTCTCTGCGCCCTTTGTGGCAGGCCAGATGGACTACTGCATGGATAACA  436

Query  593  CAGCTGTCTTCTTGCCAGTCCTGGTTGGCTTCAATCCAGTGAGCATGGCCAGAAATGACCCCATTGAAGACTGG  666
            ||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct  437  CAGCTGTCTTCTTGCCGGTCCTGGTTGGCTTCAATCCGGTGAGCATGGCCAGAAATGATCCCATTGAAGACTGG  510

Query  667  AGTTCAACATTCCGACAAGTAGCAGAGCGGATGCAGAAAATGCAGGAGAAACAGAAAGCTTTTGTGCTCAATCC  740
            ||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||.||||.||||||||||||||
Sbjct  511  AGATCGACATTCCGACAAGTGGCAGAGCGGATGCAGAAGATGCAGGAGAAACAGGAAGCCTTTGTGCTCAATCC  584

Query  741  TGCCATCGGGCCCGAGGGTCTCAGCGGCTCCTCCCGGATGAAAGGTGGAAGTGCCACCAAGATTCTGCTGGAAA  814
            ||||||||||||.|||||.|||||.|||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||
Sbjct  585  TGCCATCGGGCCTGAGGGGCTCAGTGGCTCTTCCCGAATGAAAGGTGGAAGCGCCACCAAGATTCTACTGGAAA  658

Query  815  CCCTGTTATTAGCAGCCCATAAGACTGTGGACCAGGGCATTGCAGCATCTCAAAGATGCCTCCTGGAAATCTTG  888
            |||||.||.||||||||||||||||||||||||||||..|||...|.||||||||||||||.|||||||||.||
Sbjct  659  CCCTGCTACTAGCAGCCCATAAGACTGTGGACCAGGGTGTTGTGTCCTCTCAAAGATGCCTTCTGGAAATCCTG  732

Query  889  CGGACATTTGAGCGAGCTCATCAGGTGACCTACAGCCAAAGCCCCAAGATTGCCACCCTGATGAAGAGTGTCAG  962
            .|||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||..||||.||||||||.||||.||||...||..|
Sbjct  733  AGGACATTTGAGCGGGCTCATCAGGTAACCTACAGTCAAAGTTCCAAAATTGCCACTCTGACGAAGCAAGTTGG  806

Query  963  CACCAGTCTGGAGAAGAAAGGCCACGTGTACCTGGTTGGCTGGCAGACCCTGGGCATCATTGCCATCATGGATG  1036
            ||.|||.||||||||.||||||||||||.||.|||||||||||||||||||.||.|||||.|||||.|||||||
Sbjct  807  CATCAGCCTGGAGAAAAAAGGCCACGTGCACTTGGTTGGCTGGCAGACCCTCGGTATCATCGCCATTATGGATG  880

Query 1037  GAGTAGAGTGCATCCACACCTTTGGTGCTGATTTCCGAGATGTCCGTGGCTTTCTCATTGGTGATCACAGTGAC  1110
            |.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||.|||||||||||||.||||||||.||||.||||
Sbjct  881  GGGTAGAGTGTATCCACACTTTTGGTGCTGATTTCCGAGATATCCGTGGCTTTCTTATTGGTGACCACAATGAC  954

Query 1111  ATGTTTAACCAGAAGGCTGAGCTCACCAACCAGGGTCCCCAGTTCACCTTCTCCCAGGAGGACTTCCTGACTTC  1184
            ||||||||||||||||.||||||||.|||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||
Sbjct  955  ATGTTTAACCAGAAGGATGAGCTCAGCAATCAGGGTCCCCAGTTCACCTTCTCTCAGGATGACTTCCTGACTTC  1028

Query 1185  CATCCTTCCCTCTCTCACGGAAATCGATACTGTGGTCTTCATTTTCACCCTGGATGACAACCTCACGGAGGTGC  1258
            ..|.||.||.||.||.||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||||||.|.||.||.|
Sbjct 1029  TGTTCTGCCATCCCTTACGGAAATTGACACTGTGGTCTTCATTTTTACCCTGGATGATAACCTCGCAGAAGTAC  1102

Query 1259  AGACTATAGTGGAGCAGGTGAAAGAGAAGACCAACCACATCCAGGCCCTGGCACACAGCACCGTGGGTCAGACC  1332
            ||.|..|.|..||...|||||..|||||||......|||||||||||||||..||||||||.|||||.|||.||
Sbjct 1103  AGGCCCTGGCAGAAAGGGTGAGGGAGAAGAGTTGGAACATCCAGGCCCTGGTGCACAGCACAGTGGGGCAGTCC  1176

Query 1333  TTGCCGATC-CCTCTGAAGAAGCTCTTTCCCTCCATCATCAGCATCACATGGCCACTGCTTTTCTTTGAATATG  1405
            ||||| |.| |||||.|||||||||||||||||..||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||||
Sbjct 1177  TTGCC-AGCTCCTCTAAAGAAGCTCTTTCCCTCGCTCATCAGCATCACATGGCCACTTCTTTTCTTCGATTATG  1249

Query 1406  AAGGGAACTTCATCCAGAAGTTCCAGCGTGAGCTAAGCACCAAATGGGTGCTGAATACAGTGAGTACAGGTGCT  1479
            ||||||.||.|.|.||||||||||||||||||.||||||||||.||||||.||||||||||||||||.||.||.
Sbjct 1250  AAGGGAGCTACGTTCAGAAGTTCCAGCGTGAGTTAAGCACCAAGTGGGTGTTGAATACAGTGAGTACTGGGGCC  1323

Query 1480  CATGTGCTTCTTGGTAAGATCCTACAAAACCACATGTTGGACCTTCGGATTAGCAACTCCAAGCTCTTCTGGCG  1553
            ||||||||.||.||.|||||||||||.|||||||||.|||||||.||.||...|||||||||.|||||||||.|
Sbjct 1324  CATGTGCTGCTGGGGAAGATCCTACAGAACCACATGCTGGACCTCCGCATCGCCAACTCCAAACTCTTCTGGAG  1397

Query 1554  GGCGCTGGCCATGCTGCAGCGGTTCTCTGGACAGTCCAAGGCTCGATGCATCGAGAGCCTCCTCCGAGCGATCC  1627
            |||.|||||||||.|||||.|||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.||.||.|.||.|||.|
Sbjct 1398  GGCACTGGCCATGTTGCAGAGGTTCTCAGGACAGTCCAAGGCTCGCTGCATTGAGAGTCTTCTTCAAGTGATAC  1471

Query 1628  ACTTTCCC-CAGCCACTGTCAGATGATATTCGGGCTGCTCCCATCTCCTGCCATGTCCAGGTTGCACATGAGAA  1700
            | |||||| ||.||.|||||..|||||.|.||.||.||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||
Sbjct 1472  A-TTTCCCTCAACCGCTGTCGAATGATGTCCGCGCGGCCCCCATCTCCTGCCATGTCCAGGTTGCCCACGAGAA  1544

Query 1701  GGAACAGGTGATACCCATCGCCTTGCTGAGCCTCCTATTCCGGTGCTCGATCACTGAGGCTCAGGCACACCTGG  1774
            ||||.|||||||.||||..|||||||||||.||||||.||.|||||||.||||||||||||.|||.||.|||||
Sbjct 1545  GGAAAAGGTGATCCCCACAGCCTTGCTGAGTCTCCTACTCAGGTGCTCCATCACTGAGGCTAAGGAACGCCTGG  1618

Query 1775  CTGCAGCTCCTTCTGTCTGTGAGGCTGTCAGGAGTGCTCTTGCTGGGCCAGGTCAGAAGCGCACTGCGGACCC-  1847
            ||||||||.||||.||||||||||.|||.|||||.||.||..||||||||||||||||.||||    |.|.|| 
Sbjct 1619  CTGCAGCTTCTTCAGTCTGTGAGGTTGTTAGGAGCGCCCTCTCTGGGCCAGGTCAGAAACGCA----GCATCCA  1688

Query 1848  --CC--TCGAGATCC--TAGAGCCTGACGTTCAG  1875
              ||  |.||||.||  |.|.|||.         
Sbjct 1689  AGCCTTTGGAGACCCTGTGGTGCCC---------  1713