Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000466542
- Subject:
- XM_017003797.1
- Aligned Length:
- 1875
- Identities:
- 1304
- Gaps:
- 570
Alignment
Query 1 ATGCCAGGCACAAAACGGTTTCAACATGTCATTGAGACCCCGGAGCCTGGCAAGTGGGAGTTGTCTGGGTACGA 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 GGCAGCTGTGCCAATCACGGAGAAGTCAAACCCACTGACCCAGGATCTAGACAAAGCAGATGCTGAGAACATTG 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 TTCGACTGCTAGGGCAATGTGATGCTGAGATCTTCCAGGAGGAGGGGCAAGCCCTGTCCACATACCAGAGACTC 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 TACAGCGAATCCATTCTGACCACCATGGTACAGGTGGCTGGGAAAGTTCAGGAAGTGCTGAAGGAGCCAGATGG 296
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 297 GGGGCTGGTTGTGCTGAGTGGAGGGGGCACCTCTGGCCGGATGGCATTCCTCATGTCGGTGTCCTTTAATCAGC 370
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 371 TGATGAAAGGTCTGGGACAGAAACCTCTTTACACCTACCTCATTGCAGGTGGTGACAGGTCTGTGGTGGCCTCT 444
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 445 AGGGAGGGGACAGAAGATAGTGCCTTGCACGGGATTGAGGAACTGAAGAAGGTGGCTGCCGGGAAGAAGAGAGT 518
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 519 GATTGTCATTGGCATTTCTGTGGGACTCTCTGCTCCCTTTGTGGCAGGCCAGATGGACTGCTGCATGAACAACA 592
||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ----------------------------------------------------ATGGACTGCTGCATGAACAACA 22
Query 593 CAGCTGTCTTCTTGCCAGTCCTGGTTGGCTTCAATCCAGTGAGCATGGCCAGAAATGACCCCATTGAAGACTGG 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 23 CAGCTGTCTTCTTGCCAGTCCTGGTTGGCTTCAATCCAGTGAGCATGGCCAGAAATGACCCCATTGAAGACTGG 96
Query 667 AGTTCAACATTCCGACAAGTAGCAGAGCGGATGCAGAAAATGCAGGAGAAACAGAAAGCTTTTGTGCTCAATCC 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 97 AGTTCAACATTCCGACAAGTAGCAGAGCGGATGCAGAAAATGCAGGAGAAACAGAAAGCTTTTGTGCTCAATCC 170
Query 741 TGCCATCGGGCCCGAGGGTCTCAGCGGCTCCTCCCGGATGAAAGGTGGAAGTGCCACCAAGATTCTGCTGGAAA 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 171 TGCCATCGGGCCCGAGGGTCTCAGCGGCTCCTCCCGGATGAAAGGTGGAAGTGCCACCAAGATTCTGCTGGAAA 244
Query 815 CCCTGTTATTAGCAGCCCATAAGACTGTGGACCAGGGCATTGCAGCATCTCAAAGATGCCTCCTGGAAATCTTG 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 245 CCCTGTTATTAGCAGCCCATAAGACTGTGGACCAGGGCATTGCAGCATCTCAAAGATGCCTCCTGGAAATCTTG 318
Query 889 CGGACATTTGAGCGAGCTCATCAGGTGACCTACAGCCAAAGCCCCAAGATTGCCACCCTGATGAAGAGTGTCAG 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 319 CGGACATTTGAGCGAGCTCATCAGGTGACCTACAGCCAAAGCCCCAAGATTGCCACCCTGATGAAGAGTGTCAG 392
Query 963 CACCAGTCTGGAGAAGAAAGGCCACGTGTACCTGGTTGGCTGGCAGACCCTGGGCATCATTGCCATCATGGATG 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 393 CACCAGTCTGGAGAAGAAAGGCCACGTGTACCTGGTTGGCTGGCAGACCCTGGGCATCATTGCCATCATGGATG 466
Query 1037 GAGTAGAGTGCATCCACACCTTTGGTGCTGATTTCCGAGATGTCCGTGGCTTTCTCATTGGTGATCACAGTGAC 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 467 GAGTAGAGTGCATCCACACCTTTGGTGCTGATTTCCGAGATGTCCGTGGCTTTCTCATTGGTGATCACAGTGAC 540
Query 1111 ATGTTTAACCAGAAGGCTGAGCTCACCAACCAGGGTCCCCAGTTCACCTTCTCCCAGGAGGACTTCCTGACTTC 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 541 ATGTTTAACCAGAAGGCTGAGCTCACCAACCAGGGTCCCCAGTTCACCTTCTCCCAGGAGGACTTCCTGACTTC 614
Query 1185 CATCCTTCCCTCTCTCACGGAAATCGATACTGTGGTCTTCATTTTCACCCTGGATGACAACCTCACGGAGGTGC 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 615 CATCCTTCCCTCTCTCACGGAAATCGATACTGTGGTCTTCATTTTCACCCTGGATGACAACCTCACGGAGGTGC 688
Query 1259 AGACTATAGTGGAGCAGGTGAAAGAGAAGACCAACCACATCCAGGCCCTGGCACACAGCACCGTGGGTCAGACC 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 689 AGACTATAGTGGAGCAGGTGAAAGAGAAGACCAACCACATCCAGGCCCTGGCACACAGCACCGTGGGTCAGACC 762
Query 1333 TTGCCGATCCCTCTGAAGAAGCTCTTTCCCTCCATCATCAGCATCACATGGCCACTGCTTTTCTTTGAATATGA 1406
||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 763 TTGCTGATCCCTCTGAAGAAGCTCTTTCCCTCCATCATCAGCATCACATGGCCACTGCTTTTCTTTGAATATGA 836
Query 1407 AGGGAACTTCATCCAGAAGTTCCAGCGTGAGCTAAGCACCAAATGGGTGCTGAATACAGTGAGTACAGGTGCTC 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 837 AGGGAACTTCATCCAGAAGTTCCAGCGTGAGCTAAGCACCAAATGGGTGCTGAATACAGTGAGTACAGGTGCTC 910
Query 1481 ATGTGCTTCTTGGTAAGATCCTACAAAACCACATGTTGGACCTTCGGATTAGCAACTCCAAGCTCTTCTGGCGG 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 911 ATGTGCTTCTTGGTAAGATCCTACAAAACCACATGTTGGACCTTCGGATTAGCAACTCCAAGCTCTTCTGGCGG 984
Query 1555 GCGCTGGCCATGCTGCAGCGGTTCTCTGGACAGTCCAAGGCTCGATGCATCGAGAGCCTCCTCCGAGCGATCCA 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 985 GCGCTGGCCATGCTGCAGCGGTTCTCTGGACAGTCCAAGGCTCGATGCATCGAGAGCCTCCTCCGAGCGATCCA 1058
Query 1629 CTTTCCCCAGCCACTGTCAGATGATATTCGGGCTGCTCCCATCTCCTGCCATGTCCAGGTTGCACATGAGAAGG 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1059 CTTTCCCCAGCCACTGTCAGATGATATTCGGGCTGCTCCCATCTCCTGCCATGTCCAGGTTGCACATGAGAAGG 1132
Query 1703 AACAGGTGATACCCATCGCCTTGCTGAGCCTCCTATTCCGGTGCTCGATCACTGAGGCTCAGGCACACCTGGCT 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1133 AACAGGTGATACCCATCGCCTTGCTGAGCCTCCTATTCCGGTGCTCGATCACTGAGGCTCAGGCACACCTGGCT 1206
Query 1777 GCAGCTCCTTCTGTCTGTGAGGCTGTCAGGAGTGCTCTTGCTGGGCCAGGTCAGAAGCGCACTGCGGACCCCCT 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1207 GCAGCTCCTTCTGTCTGTGAGGCTGTCAGGAGTGCTCTTGCTGGGCCAGGTCAGAAGCGCACTGCGGACCCCCT 1280
Query 1851 CGAGATCCTAGAGCCTGACGTTCAG 1875
|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1281 CGAGATCCTAGAGCCTGACGTTCAG 1305
