Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000466543
- Subject:
- NM_001166284.1
- Aligned Length:
- 1629
- Identities:
- 1366
- Gaps:
- 261
Alignment
Query 1 ATGATGCCCACACCAGTTATCCTATTGAAAGAGGGGACTGATAGCTCCCAAGGCATCCCCCAGCTTGTGAGTAA 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 CATCAGTGCCTGCCAGGTGATTGCTGAGGCTGTAAGAACTACCCTGGGTCCCCGTGGCATGGACAAGCTTATTG 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 TAGATGGCAGAGGCAAAGCAACAATTTCTAATGATGGGGCCACAATTCTGAAACTTCTTGATGTTGTCCATCCT 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 GCAGCAAAGACTTTGGTAGACATTGCCAAATCCCAAGATGCTGAGGTGGGTGATGGCACCACCTCAGTGACCTT 296
|||.| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 -------------------------------------ATGAT--GGTGGGTGATGGCACCACCTCAGTGACCTT 35
Query 297 GCTGGCTGCAGAGTTTCTGAAGCAGGTGAAACCCTATGTGGAGGAAGGTTTACACCCCCAGATCATCATTCGAG 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 36 GCTGGCTGCAGAGTTTCTGAAGCAGGTGAAACCCTATGTGGAGGAAGGTTTACACCCCCAGATCATCATTCGAG 109
Query 371 CTTTCCGCACAGCCACCCAGCTGGCAGTTAACAAGATCAAAGAGATTGCTGTGACCGTGAAGAAGGCAGATAAA 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 110 CTTTCCGCACAGCCACCCAGCTGGCAGTTAACAAGATCAAAGAGATTGCTGTGACCGTGAAGAAGGCAGATAAA 183
Query 445 GTGGAGCAGAGGAAGCTGCTGGAAAAGTGTGCCATGACCGCTCTGAGCTCCAAGCTGATCTCCCAGCAGAAAGC 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 184 GTGGAGCAGAGGAAGCTGCTGGAAAAGTGTGCCATGACCGCTCTGAGCTCCAAGCTGATCTCCCAGCAGAAAGC 257
Query 519 TTTCTTTGCTAAGATGGTGGTGGATGCAGTGATGATGCTCGATGATTTGCTGCAGCTTAAAATGATTGGAATCA 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 258 TTTCTTTGCTAAGATGGTGGTGGATGCAGTGATGATGCTCGATGATTTGCTGCAGCTTAAAATGATTGGAATCA 331
Query 593 AGAAGGTACAGGGTGGAGCCCTCGAGGATTCTCAGCTGGTAGCTGGTGTTGCATTCAAGAAGACTTTCTCTTAC 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 332 AGAAGGTACAGGGTGGAGCCCTCGAGGATTCTCAGCTGGTAGCTGGTGTTGCATTCAAGAAGACTTTCTCTTAC 405
Query 667 GCTGGGTTTGAAATGCAACCCAAAAAGTACCACAATCCCAAGATTGCCCTTTTGAATGTCGAGCTCGAGTTGAA 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 406 GCTGGGTTTGAAATGCAACCCAAAAAGTACCACAATCCCAAGATTGCCCTTTTGAATGTCGAGCTCGAGTTGAA 479
Query 741 AGCTGAGAAAGACAATGCTGAGATAAGAGTCCACACAGTTGAGGATTATCAGGCAATTGTTGATGCTGAGTGGA 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 480 AGCTGAGAAAGACAATGCTGAGATAAGAGTCCACACAGTTGAGGATTATCAGGCAATTGTTGATGCTGAGTGGA 553
Query 815 ACATTCTCTATGACAAGTTAGAGAAGATCCATCATTCTGGAGCCAAAGTTGTCTTGTCCAAACTCCCCATTGGG 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 554 ACATTCTCTATGACAAGTTAGAGAAGATCCATCATTCTGGAGCCAAAGTTGTCTTGTCCAAACTCCCCATTGGG 627
Query 889 GATGTGGCCACCCAGTACTTTGCTGACAGGGACATGTTCTGTGCTGGCCGAGTACCTGAGGAGGATCTGAAGAG 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 628 GATGTGGCCACCCAGTACTTTGCTGACAGGGACATGTTCTGTGCTGGCCGAGTACCTGAGGAGGATCTGAAGAG 701
Query 963 GACAATGATGGCCTGTGGAGGCTCAATCCAGACCAGTGTGAATGCTCTGTCAGCAGATGTGCTGGGTCGATGCC 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 702 GACAATGATGGCCTGTGGAGGCTCAATCCAGACCAGTGTGAATGCTCTGTCAGCAGATGTGCTGGGTCGATGCC 775
Query 1037 AGGTGTTTGAAGAGACCCAGATTGGAGGCGAGAGGTACAATTTTTTTACTGGCTGCCCCAAGGCCAAGACATGC 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 776 AGGTGTTTGAAGAGACCCAGATTGGAGGCGAGAGGTACAATTTTTTTACTGGCTGCCCCAAGGCCAAGACATGC 849
Query 1111 ACCTTCATTCTCCGTGGCGGCGCCGAGCAGTTTATGGAGGAGACAGAGCGGTCCCTGCATGATGCCATCATGAT 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 850 ACCTTCATTCTCCGTGGCGGCGCCGAGCAGTTTATGGAGGAGACAGAGCGGTCCCTGCATGATGCCATCATGAT 923
Query 1185 CGTCAGGAGGGCCATCAAGAATGATTCAGTGGTGGCTGGTGGCGGGGCCATTGAGATGGAACTCTCCAAGTACC 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 924 CGTCAGGAGGGCCATCAAGAATGATTCAGTGGTGGCTGGTGGCGGGGCCATTGAGATGGAACTCTCCAAGTACC 997
Query 1259 TGCGGGATTACTCAAGGACTATTCCAGGAAAACAGCAGCTGTTGATTGGGGCTTATGCCAAGGCCTTGGAGATT 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 998 TGCGGGATTACTCAAGGACTATTCCAGGAAAACAGCAGCTGTTGATTGGGGCATATGCCAAGGCCTTGGAGATT 1071
Query 1333 ATCCCACGCCAGCTGTGTGACAATGCTGGCTTTGATGCCACAAACATTCTCAACAAGCTGCGGGCTCGGCATGC 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1072 ATCCCACGCCAGCTGTGTGACAATGCTGGCTTTGATGCCACAAACATTCTCAACAAGCTGCGGGCTCGGCATGC 1145
Query 1407 CCAGGGGGGTACATGGTATGGAGTAGACATCAACAACGAGGACATTGCTGACAACTTTGAAGCTTTCGTGTGGG 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1146 CCAGGGGGGTACATGGTATGGAGTAGACATCAACAACGAGGACATTGCTGACAACTTTGAAGCTTTCGTGTGGG 1219
Query 1481 AGCCAGCTATGGTGCGGATCAATGCGCTGACAGCAGCCTCTGAGGCTGCGTGCCTGATCGTGTCTGTAGATGAA 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1220 AGCCAGCTATGGTGCGGATCAATGCGCTGACAGCAGCCTCTGAGGCTGCGTGCCTGATCGTGTCTGTAGATGAA 1293
Query 1555 ACCATCAAGAACCCCCGCTCGACTGTGGATGCTCCCACAGCAGCAGGCCGGGGCCGTGGTCGTGGCCGCCCCCA 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1294 ACCATCAAGAACCCCCGCTCGACTGTGGATGCTCCCACAGCAGCAGGCCGGGGCCGTGGTCGTGGCCGCCCCCA 1367
Query 1629 C 1629
|
Sbjct 1368 C 1368