Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000466543
- Subject:
- XM_011532478.3
- Aligned Length:
- 1629
- Identities:
- 1496
- Gaps:
- 132
Alignment
Query 1 ATGATGCCCACACCAGTTATCCTATTGAAAGAGGGGACTGATAGCTCCCAAGGCATCCCCCAGCTTGTGAGTAA 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 CATCAGTGCCTGCCAGGTGATTGCTGAGGCTGTAAGAACTACCCTGGGTCCCCGTGGCATGGACAAGCTTATTG 148
||||||||||||||||
Sbjct 1 ----------------------------------------------------------ATGGACAAGCTTATTG 16
Query 149 TAGATGGCAGAGGCAAAGCAACAATTTCTAATGATGGGGCCACAATTCTGAAACTTCTTGATGTTGTCCATCCT 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 17 TAGATGGCAGAGGCAAAGCAACAATTTCTAATGATGGGGCCACAATTCTGAAACTTCTTGATGTTGTCCATCCT 90
Query 223 GCAGCAAAGACTTTGGTAGACATTGCCAAATCCCAAGATGCTGAGGTGGGTGATGGCACCACCTCAGTGACCTT 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 91 GCAGCAAAGACTTTGGTAGACATTGCCAAATCCCAAGATGCTGAGGTGGGTGATGGCACCACCTCAGTGACCTT 164
Query 297 GCTGGCTGCAGAGTTTCTGAAGCAGGTGAAACCCTATGTGGAGGAAGGTTTACACCCCCAGATCATCATTCGAG 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 165 GCTGGCTGCAGAGTTTCTGAAGCAGGTGAAACCCTATGTGGAGGAAGGTTTACACCCCCAGATCATCATTCGAG 238
Query 371 CTTTCCGCACAGCCACCCAGCTGGCAGTTAACAAGATCAAAGAGATTGCTGTGACCGTGAAGAAGGCAGATAAA 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 239 CTTTCCGCACAGCCACCCAGCTGGCAGTTAACAAGATCAAAGAGATTGCTGTGACCGTGAAGAAGGCAGATAAA 312
Query 445 GTGGAGCAGAGGAAGCTGCTGGAAAAGTGTGCCATGACCGCTCTGAGCTCCAAGCTGATCTCCCAGCAGAAAGC 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 313 GTGGAGCAGAGGAAGCTGCTGGAAAAGTGTGCCATGACCGCTCTGAGCTCCAAGCTGATCTCCCAGCAGAAAGC 386
Query 519 TTTCTTTGCTAAGATGGTGGTGGATGCAGTGATGATGCTCGATGATTTGCTGCAGCTTAAAATGATTGGAATCA 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 387 TTTCTTTGCTAAGATGGTGGTGGATGCAGTGATGATGCTCGATGATTTGCTGCAGCTTAAAATGATTGGAATCA 460
Query 593 AGAAGGTACAGGGTGGAGCCCTCGAGGATTCTCAGCTGGTAGCTGGTGTTGCATTCAAGAAGACTTTCTCTTAC 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 461 AGAAGGTACAGGGTGGAGCCCTCGAGGATTCTCAGCTGGTAGCTGGTGTTGCATTCAAGAAGACTTTCTCTTAC 534
Query 667 GCTGGGTTTGAAATGCAACCCAAAAAGTACCACAATCCCAAGATTGCCCTTTTGAATGTCGAGCTCGAGTTGAA 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 535 GCTGGGTTTGAAATGCAACCCAAAAAGTACCACAATCCCAAGATTGCCCTTTTGAATGTCGAGCTCGAGTTGAA 608
Query 741 AGCTGAGAAAGACAATGCTGAGATAAGAGTCCACACAGTTGAGGATTATCAGGCAATTGTTGATGCTGAGTGGA 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 609 AGCTGAGAAAGACAATGCTGAGATAAGAGTCCACACAGTTGAGGATTATCAGGCAATTGTTGATGCTGAGTGGA 682
Query 815 ACATTCTCTATGACAAGTTAGAGAAGATCCATCATTCTGGAGCCAAAGTTGTCTTGTCCAAACTCCCCATTGGG 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 683 ACATTCTCTATGACAAGTTAGAGAAGATCCATCATTCTGGAGCCAAAGTTGTCTTGTCCAAACTCCCCATTGGG 756
Query 889 GATGTGGCCACCCAGTACTTTGCTGACAGGGACATGTTCTGTGCTGGCCGAGTACCTGAGGAGGATCTGAAGAG 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 757 GATGTGGCCACCCAGTACTTTGCTGACAGGGACATGTTCTGTGCTGGCCGAGTACCTGAGGAGGATCTGAAGAG 830
Query 963 GACAATGATGGCCTGTGGAGGCTCAATCCAGACCAGTGTGAATGCTCTGTCAGCAGATGTGCTGGGTCGATGCC 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 831 GACAATGATGGCCTGTGGAGGCTCAATCCAGACCAGTGTGAATGCTCTGTCAGCAGATGTGCTGGGTCGATGCC 904
Query 1037 AGGTGTTTGAAGAGACCCAGATTGGAGGCGAGAGGTACAATTTTTTTACTGGCTGCCCCAAGGCCAAGACATGC 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 905 AGGTGTTTGAAGAGACCCAGATTGGAGGCGAGAGGTACAATTTTTTTACTGGCTGCCCCAAGGCCAAGACATGC 978
Query 1111 ACCTTCATTCTCCGTGGCGGCGCCGAGCAGTTTATGGAGGAGACAGAGCGGTCCCTGCATGATGCCATCATGAT 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 979 ACCTTCATTCTCCGTGGCGGCGCCGAGCAGTTTATGGAGGAGACAGAGCGGTCCCTGCATGATGCCATCATGAT 1052
Query 1185 CGTCAGGAGGGCCATCAAGAATGATTCAGTGGTGGCTGGTGGCGGGGCCATTGAGATGGAACTCTCCAAGTACC 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1053 CGTCAGGAGGGCCATCAAGAATGATTCAGTGGTGGCTGGTGGCGGGGCCATTGAGATGGAACTCTCCAAGTACC 1126
Query 1259 TGCGGGATTACTCAAGGACTATTCCAGGAAAACAGCAGCTGTTGATTGGGGCTTATGCCAAGGCCTTGGAGATT 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1127 TGCGGGATTACTCAAGGACTATTCCAGGAAAACAGCAGCTGTTGATTGGGGCATATGCCAAGGCCTTGGAGATT 1200
Query 1333 ATCCCACGCCAGCTGTGTGACAATGCTGGCTTTGATGCCACAAACATTCTCAACAAGCTGCGGGCTCGGCATGC 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1201 ATCCCACGCCAGCTGTGTGACAATGCTGGCTTTGATGCCACAAACATTCTCAACAAGCTGCGGGCTCGGCATGC 1274
Query 1407 CCAGGGGGGTACATGGTATGGAGTAGACATCAACAACGAGGACATTGCTGACAACTTTGAAGCTTTCGTGTGGG 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1275 CCAGGGGGGTACATGGTATGGAGTAGACATCAACAACGAGGACATTGCTGACAACTTTGAAGCTTTCGTGTGGG 1348
Query 1481 AGCCAGCTATGGTGCGGATCAATGCGCTGACAGCAGCCTCTGAGGCTGCGTGCCTGATCGTGTCTGTAGATGAA 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1349 AGCCAGCTATGGTGCGGATCAATGCGCTGACAGCAGCCTCTGAGGCTGCGTGCCTGATCGTGTCTGTAGATGAA 1422
Query 1555 ACCATCAAGAACCCCCGCTCGACTGTGGATGCTCCCACAGCAGCAGGCCGGGGCCGTGGTCGTGGCCGCCCCCA 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1423 ACCATCAAGAACCCCCGCTCGACTGTGGATGCTCCCACAGCAGCAGGCCGGGGCCGTGGTCGTGGCCGCCCCCA 1496
Query 1629 C 1629
|
Sbjct 1497 C 1497