Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000466545
- Subject:
- XM_011250518.2
- Aligned Length:
- 3201
- Identities:
- 2758
- Gaps:
- 165
Alignment
Query 1 ATGGG---------------------------------------GGACAAGAAAGATGACAAGGACTCACCCAA 35
||||| ||||||.||||||||||||..|||.|||||
Sbjct 1 ATGGGGTCTGGTGGTTCTGACAGCTACCGTGTCGCCACCTCGCAGGACAAAAAAGATGACAAGAGCTCGCCCAA 74
Query 36 GAAGAACAAGGGCAAGGAGCGCCGGGACCTGGATGACCTCAAGAAGGAGGTGGCTATGACAGAGCACAAGATGT 109
|||||.|||||.|||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 GAAGAGCAAGGCCAAAGAGCGCCGGGACCTGGATGACCTCAAGAAGGAAGTGGCTATGACAGAGCACAAGATGT 148
Query 110 CAGTGGAAGAGGTCTGCCGGAAATACAACACAGACTGTGTGCAGGGTTTGACCCACAGCAAAGCCCAGGAGATC 183
||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||.||||.|||||.|||||||||||||||
Sbjct 149 CAGTAGAAGAGGTCTGCCGGAAATACAATACTGACTGCGTGCAGGGTCTGACACACAGTAAAGCCCAGGAGATC 222
Query 184 CTGGCCCGGGATGGGCCTAACGCACTCACGCCACCGCCTACCACCCCAGAGTGGGTCAAGTTTTGCCGGCAGCT 257
||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||
Sbjct 223 CTAGCCCGGGATGGGCCTAACGCCCTCACACCACCGCCCACCACCCCAGAATGGGTCAAGTTCTGCCGGCAGCT 296
Query 258 CTTCGGGGGCTTCTCCATCCTGCTGTGGATCGGGGCTATCCTCTGCTTCCTGGCCTACGGTATCCAGGCGGGCA 331
.||.||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||.||||||||.||.|
Sbjct 297 GTTTGGTGGCTTCTCTATCCTGCTGTGGATCGGGGCAATCCTTTGCTTCCTGGCCTATGGCATCCAGGCAGGGA 370
Query 332 CCGAGGACGACCCCTCTGGTGACAACCTGTACCTGGGCATCGTGCTGGCGGCCGTGGTGATCATCACTGGCTGC 405
|.|||||.|||||.||.||||||||.||||||||||||||.||||||||.||.||.|||||||||||.||||||
Sbjct 371 CGGAGGATGACCCTTCCGGTGACAATCTGTACCTGGGCATAGTGCTGGCCGCAGTCGTGATCATCACCGGCTGC 444
Query 406 TTCTCCTACTACCAGGAGGCCAAGAGCTCCAAGATCATGGAGTCCTTCAAGAACATGGTGCCCCAGCAAGCCCT 479
||||||||||||||.||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 445 TTCTCCTACTACCAAGAAGCCAAGAGTTCTAAGATCATGGAGTCCTTCAAGAACATGGTCCCCCAGCAAGCCCT 518
Query 480 GGTGATCCGGGAAGGTGAGAAGATGCAGGTGAACGCTGAGGAGGTGGTGGTCGGGGACCTGGTGGAGATCAAGG 553
.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 TGTGATCCGGGAAGGTGAAAAGATGCAGGTGAATGCGGAGGAGGTGGTGGTCGGGGACCTGGTGGAGATCAAGG 592
Query 554 GTGGAGACCGAGTGCCAGCTGACCTGCGGATCATCTCAGCCCACGGCTGCAAGGTGGACAACTCCTCCCTGACT 627
||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 GTGGTGACCGGGTGCCAGCTGACCTGCGCATCATCTCGGCCCATGGCTGCAAGGTGGACAACTCCTCCCTGACT 666
Query 628 GGCGAATCCGAGCCCCAGACTCGCTCTCCCGACTGCACGCACGACAACCCCTTGGAGACTCGGAACATCACCTT 701
||||||||.|||||.|||||.|||||.||.||||||||.||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GGCGAATCTGAGCCTCAGACCCGCTCCCCGGACTGCACACACGACAACCCCCTGGAGACTCGGAACATCACCTT 740
Query 702 CTTTTCCACCAACTGTGTGGAAGGCACGGCTCGGGGCGTGGTGGTGGCCACGGGCGACCGCACTGTCATGGGCC 775
|||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||.|||||.||.||||||||.||||||||||
Sbjct 741 CTTTTCCACCAACTGCGTGGAAGGCACCGCTCGGGGTGTGGTGGTAGCCACAGGTGACCGCACCGTCATGGGCC 814
Query 776 GTATCGCCACCCTGGCATCAGGGC-TGGAGGTGGGCAAGACGCCCATCGCCATCGAGATTGAGCACTTCATCCA 848
|.||.|||||||||||.|| |||| ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||
Sbjct 815 GCATTGCCACCCTGGCCTC-GGGCTTGGAGGTGGGCAAGACGCCCATCGCCATTGAGATTGAGCATTTCATCCA 887
Query 849 GCTCATCACCGGCGTGGCTGTCTTCCTGGGTGTCTCCTTCTTCATCCTCTCCCTCATTCTCGGATACACCTGGC 922
||||||.||.||||||||.||.||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||||
Sbjct 888 GCTCATTACGGGCGTGGCCGTGTTCCTGGGCGTGTCCTTCTTCATCCTCTCTCTCATTCTGGGTTACACCTGGC 961
Query 923 TTGAGGCTGTCATCTTCCTCATCGGCATCATCGTGGCCAATGTCCCAGAGGGTCTGCTGGCCACTGTCACTGTG 996
|.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||
Sbjct 962 TCGAGGCAGTCATCTTCCTCATCGGCATCATTGTGGCCAATGTCCCAGAGGGGCTGCTGGCTACTGTCACGGTG 1035
Query 997 TGTCTGACGCTGACCGCCAAGCGCATGGCCCGGAAGAACTGCCTGGTGAAGAACCTGGAGGCTGTAGAAACCCT 1070
|||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||.||
Sbjct 1036 TGTCTGACGCTGACCGCCAAGCGCATGGCTCGCAAGAACTGCCTGGTGAAGAACCTGGAGGCGGTGGAGACGCT 1109
Query 1071 GGGCTCCACGTCCACCATCTGCTCAGATAAGACAGGGACCCTCACTCAGAACCGCATGACAGTCGCCCACATGT 1144
||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1110 GGGCTCCACGTCCACCATCTGCTCGGACAAGACCGGCACTCTCACCCAGAACCGCATGACCGTCGCCCACATGT 1183
Query 1145 GGTTTGACAACCAGATCCACGAGGCTGACACCACTGAGGACCAGTCAGGGACCTCATTTGACAAGAGTTCGCAC 1218
|||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||.||.||||||||.||.|||
Sbjct 1184 GGTTTGACAACCAGATCCACGAGGCAGACACCACAGAGGATCAGTCAGGGACCTCTTTCGACAAGAGCTCACAC 1257
Query 1219 ACCTGGGTGGCCCTGTCTCACATCGCTGGGCTCTGCAATCGCGCTGTCTTCAAGGGTGGTCAGGACAACATCCC 1292
|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||.||.|||||||||||.||.||||||||||||||
Sbjct 1258 ACCTGGGTGGCCCTGTCCCACATCGCCGGGCTCTGCAACCGGGCCGTCTTCAAGGGCGGGCAGGACAACATCCC 1331
Query 1293 TGTGCTCAAGAGGGATGTGGCTGGGGATGCGTCTGAGTCTGCCCTGCTCAAGTGCATCGAGCTGTCCTCTGGCT 1366
.||.|||||||||||.|||||.||.|||||.||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||.|
Sbjct 1332 AGTACTCAAGAGGGACGTGGCCGGTGATGCCTCCGAGTCTGCCCTGCTTAAGTGCATTGAGCTGTCCTCGGGTT 1405
Query 1367 CCGTGAAGCTGATGCGTGAACGCAACAAGAAAGTGGCTGAGATTCCCTTCAATTCCACCAACAAATACCAGCTC 1440
||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||.
Sbjct 1406 CCGTAAAGCTGATGCGAGAACGGAACAAGAAAGTGGCTGAGATTCCGTTCAACTCGACCAACAAATACCAGCTA 1479
Query 1441 TCCATCCATGAGACCGAGGACCCCAACGACAACCGATACCTGCTGGTGATGAAGGGTGCCCCCGAGCGCATCCT 1514
||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||.||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||.||
Sbjct 1480 TCCATCCATGAGACTGAGGATCCCAATGACAACCGGTACCTGCTAGTGATGAAGGGCGCCCCCGAACGCATTCT 1553
Query 1515 GGACCGCTGCTCCACCATCCTGCTACAGGGCAAGGAGCAGCCTCTGGACGAGGAAATGAAGGAGGCCTTCCAGA 1588
|||||||||..||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1554 GGACCGCTGTGCCACCATCCTCCTGCAGGGCAAGGAGCAGCCTCTGGATGAGGAGATGAAGGAGGCCTTCCAGA 1627
Query 1589 ATGCCTACCTTGAGCTCGGTGGCCTGGGCGAGCGCGTGCTTGGTTTCTGCCATTATTACCTGCCCGAGGAGCAG 1662
||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||.|||||.|||
Sbjct 1628 ATGCCTACCTGGAGCTTGGTGGCCTGGGCGAGCGTGTGCTGGGTTTCTGCCATTACTACCTGCCTGAGGAACAG 1701
Query 1663 TTCCCCAAGGGCTTTGCCTTCGACTGTGATGACGTGAACTTCACCACGGACAACCTCTGCTTTGTGGGCCTCAT 1736
||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||
Sbjct 1702 TTCCCCAAGGGCTTTGCCTTTGACTGTGATGACGTGAACTTCACCACAGACAACCTTTGCTTTGTGGGTCTCAT 1775
Query 1737 GTCCATGATCGACCCACCCCGGGCAGCCGTCCCTGACGCGGTGGGCAAGTGTCGCAGCGCAGGCATCAAGGTCA 1810
|||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1776 GTCCATGATTGACCCTCCCCGGGCAGCCGTCCCTGACGCTGTGGGCAAATGCCGAAGCGCAGGCATCAAGGTCA 1849
Query 1811 TCATGGTCACCGGCGATCACCCCATCACGGCCAAGGCCATTGCCAAGGGTGTGGGCATCATCTCTGAGGGCAAC 1884
||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||
Sbjct 1850 TCATGGTCACCGGCGATCACCCCATCACTGCCAAGGCCATTGCCAAGGGTGTGGGTATCATCTCTGAGGGTAAC 1923
Query 1885 GAGACTGTGGAGGACATCGCCGCCCGGCTCAACATTCCCGTCAGCCAGGTTAACCCCCGGGATGCCAAGGCCTG 1958
||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||.||||||||||.|||||
Sbjct 1924 GAGACTGTCGAAGACATCGCTGCCCGGCTCAACATCCCTGTCAGCCAGGTGAACCCCAGGGATGCCAAAGCCTG 1997
Query 1959 CGTGATCCACGGCACCGACCTCAAGGACTTCACCTCCGAGCAAATCGACGAGATCCTGCAGAATCACACCGAGA 2032
.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||.||||||||.||||||||||
Sbjct 1998 TGTGATTCACGGCACCGACCTCAAGGACTTCACCTCGGAGCAGATTGACGAGATTCTGCAGAACCACACCGAGA 2071
Query 2033 TCGTCTTCGCCCGCACATCCCCCCAGCAGAAGCTCATCATTGTGGAGGGCTGTCAGAGACAGGGTGCAATTGTG 2106
|||||||.|||||.||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 2072 TCGTCTTTGCCCGAACCTCCCCTCAGCAGAAGCTCATCATCGTGGAGGGCTGTCAGAGACAGGGAGCAATTGTG 2145
Query 2107 GCTGTGACCGGGGATGGTGTGAACGACTCCCCCGCTCTGAAGAAGGCCGACATTGGGGTGGCCATGGGCATCGC 2180
||||||||.||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||
Sbjct 2146 GCTGTGACTGGCGATGGTGTGAATGACTCCCCTGCTCTGAAGAAGGCTGACATCGGGGTGGCCATGGGCATTGC 2219
Query 2181 TGGCTCTGACGTCTCCAAGCAGGCAGCTGACATGATCCTGCTGGACGACAACTTTGCCTCCATCGTCACAGGGG 2254
|||||||||.|||||.||||||||.||.||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||.|||||.||.|
Sbjct 2220 TGGCTCTGATGTCTCTAAGCAGGCTGCCGACATGATTCTGCTGGATGACAACTTTGCTTCCATTGTCACTGGTG 2293
Query 2255 TGGAGGAGGGCCGCCTGATCTTCGACAACCTAAAGAAGTCCATTGCCTACACCCTGACCAGCAATATCCCGGAG 2328
|||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||.||||||||.|||||.|||||.|||||.|||
Sbjct 2294 TGGAGGAAGGCCGCCTGATCTTTGACAACCTGAAGAAATCCATCGCCTACACTCTGACTAGCAACATCCCTGAG 2367
Query 2329 ATCACGCCCTTCCTGCTGTTCATCATGGCCAACATCCCGCTGCCCCTGGGCACCATCACCATCCTCTGCATCGA 2402
|||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 2368 ATCACACCCTTCCTGCTCTTCATCATGGCTAACATCCCACTGCCTCTTGGCACCATCACCATCCTCTGCATTGA 2441
Query 2403 TCTGGGCACTGACATGGTCCCTGCCATCTCACTGGCGTACGAGGCTGCCGAAAGCGACATCATGAAGAGACAGC 2476
.|||||.||.||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||
Sbjct 2442 CCTGGGTACCGACATGGTCCCTGCAATCTCCCTGGCCTACGAGGCTGCCGAGAGCGACATCATGAAGAGGCAGC 2515
Query 2477 CCAGGAACCCGCGGACGGACAAATTGGTCAATGAGAGACTCATCAGCATGGCCTACGGGCAGATTGGAATGATC 2550
||||||||||.||.||.||||||.|||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 2516 CCAGGAACCCACGCACAGACAAACTGGTCAACGAAAGGCTCATCAGCATGGCCTACGGGCAGATTGGGATGATC 2589
Query 2551 CAGGCTCTCGGTGGCTTCTTCTCTTACTTTGTGATCCTGGCAGAAAATGGCTTCTTGCCCGGCAACCTGGTGGG 2624
|||||.||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 2590 CAGGCCCTCGGTGGTTTCTTCTCCTACTTTGTCATCCTGGCAGAAAATGGCTTCTTGCCCGGAAACCTGGTGGG 2663
Query 2625 CATCCGGCTGAACTGGGATGACCGCACCGTCAATGACCTGGAAGACAGTTACGGGCAGCAGTGGACATACGAGC 2698
|||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||.||||
Sbjct 2664 CATCCGGCTCAACTGGGATGATCGCACTGTCAATGACCTAGAAGACAGTTATGGGCAGCAGTGGACTTATGAGC 2737
Query 2699 AGAGGAAGGTGGTGGAGTTCACCTGCCACACGGCCTTCTTTGTGAGCATCGTTGTCGTCCAGTGGGCCGATCTG 2772
|||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||.||.|||
Sbjct 2738 AGAGGAAGGTGGTAGAGTTCACATGCCACACAGCCTTCTTTGTGAGTATCGTGGTGGTCCAGTGGGCTGACCTG 2811
Query 2773 ATCATCTGCAAGACCCGGAGGAACTCGGTCTTCCAGCAGGGCATGAAGAACAAGATCCTGATCTTCGGGCTGTT 2846
|||||||||||||||.||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||.||||||||||..||||
Sbjct 2812 ATCATCTGCAAGACCAGGAGGAACTCCGTCTTCCAGCAGGGCATGAAGAATAAGATCTTGATCTTCGGCTTGTT 2885
Query 2847 TGAGGAGACGGCCCTGGCTGCCTTCCTGTCCTACTGCCCCGGCATGGACGTGGCCCTGCGCATGTACCCTCTCA 2920
|||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 2886 TGAGGAGACGGCCCTCGCTGCCTTCCTGTCCTACTGCCCAGGCATGGATGTGGCCCTTCGCATGTACCCTCTCA 2959
Query 2921 AGCCCAGCTGGTGGTTCTGTGCCTTCCCCTACAGTTTCCTCATCTTCGTCTACGACGAAATCCGCAAACTCATC 2994
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||.||||||||||||
Sbjct 2960 AGCCCAGCTGGTGGTTCTGTGCCTTCCCCTACAGTTTCCTCATCTTCGTCTATGATGAGATTCGCAAACTCATC 3033
Query 2995 CTGCGCAGGAACCCAGGGGGT---------------------------TGGGTGGAGAAGGA-------AACCT 3034
||||||||||||||.|||||| ||||.||.||||.| |.|
Sbjct 3034 CTGCGCAGGAACCCCGGGGGTGAGGGCCGCATGGCCAGGGGTAAAGGCTGGGAGGGGAAGCAGAGGGTGAGC-- 3105
Query 3035 ACTAC--------------------------------------------------------------------- 3039
|||.|
Sbjct 3106 ACTCCCTGTGCCTCTCAGATGTGTCCGTTCTTCTTTCTCTTCCCTCTCTCCCCGCCTTGCCTTTCACTCTCTTT 3179
Query 3040 ------------------- 3039
Sbjct 3180 CCAAGTGCGACTGTGTGTC 3198