Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000466588
• Subject: NM_001321027.1
• Aligned Length: 972
• Identities: 863
• Gaps: 84

Alignment

Query   1  ATGGATTCGAAATATCAGTGTGTGAAGCTGAATGATGGTCACTTCATGCCTGTCCTGGGATTTGGCACCTATGC  74
           ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  ATGGATTCGAAATACCAGTGTGTGAAGCTGAATGATGGTCACTTCATGCCTGTCCTGGGATTTGGCACCTATGC  74

Query  75  GCCTGCAGAGGTTCCTAAAAGTAAAGCTTTAGAGGCCACCAAATTGGCAATTGAAGCTGGCTTCCGCCATATTG  148
           ||||||||||||||||||||||||||||.||||||||..||||||||||||.|||||.||.||||.||||||||
Sbjct  75  GCCTGCAGAGGTTCCTAAAAGTAAAGCTCTAGAGGCCGTCAAATTGGCAATAGAAGCCGGGTTCCACCATATTG  148

Query 149  ATTCTGCTCATTTATACAATAATGAGGAGCAGGTTGGACTGGCCATCCGAAGCAAGATTGCAGATGGCAGTGTG  222
           |||||||.|||.|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149  ATTCTGCACATGTTTACAATAATGAGGAGCAGGTTGGACTGGCCATCCGAAGCAAGATTGCAGATGGCAGTGTG  222

Query 223  AAGAGAGAAGACATATTCTACACTTCAAAGCTTTGGTGCAATTCCCATCGACCAGAGTTGGTCCGACCAGCCTT  296
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223  AAGAGAGAAGACATATTCTACACTTCAAAGCTTTGGAGCAATTCCCATCGACCAGAGTTGGTCCGACCAGCCTT  296

Query 297  GGAAAGGTCACTGAAAAATCTTCAATTGGATTATGTTGACCTCTACCTTATTCATTTTCCAGTGTCTGTAAAGC  370
           ||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||   
Sbjct 297  GGAAAGGTCACTGAAAAATCTTCAATTGGACTATGTTGACCTCTATCTTATTCATTTTCCAGTGTCTGTAA---  367

Query 371  CAGGTGAGGAAGTGATCCCAAAAGATGAAAATGGAAAAATACTATTTGACACAGTGGATCTCTGTGCCACGTGG  444
                                                                                     
Sbjct 368  --------------------------------------------------------------------------  367

Query 445  GAGGCCGTGGAGAAGTGTAAAGATGCAGGATTGGCCAAGTCCATCGGGGTGTCCAACTTCAACCGCAGGCAGCT  518
            |||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||
Sbjct 368  -AGGCCATGGAGAAGTGTAAAGATGCAGGATTGGCCAAGTCCATCGGGGTGTCCAACTTCAACCACAGGCTGCT  440

Query 519  GGAGATGATCCTCAACAAGCCAGGGCTCAAGTACAAGCCTGTCTGCAACCAGGTGGAATGTCATCCTTACTTCA  592
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 441  GGAGATGATCCTCAACAAGCCAGGGCTCAAGTACAAGCCTGTCTGCAACCAGGTGGAATGTCATCCTTACTTCA  514

Query 593  ACCAGAGAAAACTGCTGGATTTCTGCAAGTCAAAAGACATTGTTCTGGTTGCCTATAGTGCTCTGGGATCCCAC  666
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 515  ACCAGAGAAAACTGCTGGATTTCTGCAAGTCAAAAGACATTGTTCTGGTTGCCTATAGTGCTCTGGGATCCCAT  588

Query 667  CGAGAAGAACCATGGGT-GATGCG--CTGCTCATTGTAGCTCTTGGAGGACCCAGTCCTTTGTGCCTTGGCAAA  737
           ||||||||||||||||| ||..||  ||.|.|   |..||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 589  CGAGAAGAACCATGGGTGGACCCGAACTCCCC---GGTGCTCTTGGAGGACCCAGTCCTTTGTGCCTTGGCAAA  659

Query 738  AAAGCACAAGCGAACCCCAGCCCTGATTGCCCTGCGCTACCAGCTACAGCGTGGGGTTGTGGTCCTGGCCAAGA  811
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 660  AAAGCACAAGCGAACCCCAGCCCTGATTGCCCTGCGCTACCAGCTGCAGCGTGGGGTTGTGGTCCTGGCCAAGA  733

Query 812  GCTACAATGAGCAGCGCATCAGACAGAACGTGCAGGTGTTTGAATTCCAGTTGACTTCAGAGGAGATGAAAGCC  885
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 734  GCTACAATGAGCAGCGCATCAGACAGAACGTGCAGGTGTTTGAATTCCAGTTGACTTCAGAGGAGATGAAAGCC  807

Query 886  ATAGATGGCCTAAACAGAAATGTGCGATATTTGACCCTTGATATTTTTGCTGGCCCCCCTAATTATCCATTTTC  959
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 808  ATAGATGGCCTAAACAGAAATGTGCGATATTTGACCCTTGATATTTTTGCTGGCCCCCCTAATTATCCATTTTC  881

Query 960  TGATGAATAT  969
           ||||||||||
Sbjct 882  TGATGAATAT  891