Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000466599
• Subject: XM_011248660.1
• Aligned Length: 1533
• Identities: 1420
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGGAGACATTCCCTGCAGTGGCTGAGAAGGTCCTCAAGGAGTTCCAGGTGTTACTGCAGCACAGCCCCTCTCC  74
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.||||||||.|||||.|||||
Sbjct    1  ATGGAGACATTCCCTGCAGTGGCTGAGAAGGTCCTTAAGGAGTTCCAAGTATTGCTGCAGCATAGCCCATCTCC  74

Query   75  CATTGGAAGTACCCGCATGCTGCAGCTTATGACCATCAATATGTTTGCAGTACACAACTCCCAGCTGAAAGACT  148
            .||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||.|||||||||.|||||||||
Sbjct   75  TATTGGAAGTACCCGTATGCTGCAGCTTATGACCATCAACATGTTTGCCGTGCATAACTCCCAGTTGAAAGACT  148

Query  149  GCTTCTCGGAGGAGTGCCGCTCTGTGATCCAGGAACAAGCCGCAGCTCTGGGCTTGGCCATGTTTTCTCTACTG  222
            |||||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||.|..||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct  149  GCTTCTCAGAGGAGTGTCGTTCTGTGATCCAGGAACAAGCTGCATCCTTGGGCTTGGCTATGTTTTCTCTACTG  222

Query  223  GTCCGCCGCTGCACCTGCTTACTTAAGGAGTCCGCCAAAGCTCAGCTGTCCTCTCCTGAGGACCAGGATGACCA  296
            ||||..||||||||.|||.||||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||
Sbjct  223  GTCCAGCGCTGCACATGCCTACTTAAGGACTCTGCTAAAGCTCAGCTGTCCTCTCCTGAGGACCAAGAGGACCA  296

Query  297  AGACGACATCAAGGTGTCTTCCTTTGTCCCGGACCTGAAGGAGCTGCTCCCCAGTGTCAAAGTCTGGTCAGATT  370
            |||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||
Sbjct  297  AGATGACATCAAGGTATCTTCCTTCGTCCCGGACCTGAAGGAGCTGCTCCCCAGTGTGAAAGTCTGGTCTGATT  370

Query  371  GGATGCTCGGCTACCCGGACACCTGGAATCCTCCTCCCACATCCCTGGATCTGCCCTCGCATGTTGCTGTGGAT  444
            |||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||..||||||||||||.|||.||||||||||||
Sbjct  371  GGATGCTTGGCTACCCAGACACCTGGAATCCTCCACCCACATCTTTGGATCTGCCCTTGCAGGTTGCTGTGGAT  444

Query  445  GTATGGTCGACGCTGGCTGATTTCTGTAACATACTGACTGCAGTGAATCAGTCTGAGGTGCCACTGTACAAGGA  518
            ||.|||||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GTCTGGTCAACACTAGCTGATTTCTGTAACATACTGACTGCAGTCAATCAGTCTGAGGTGCCACTGTACAAGGA  518

Query  519  CCCGGATGATGACCTCACCCTTCTTATCCTGGAAGAGGATCGGCTTCTCTCGGGCTTTGTCCCCTTGCTGGCTG  592
            |||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CCCAGATGATGACCTCACCCTGCTTATCCTGGAAGAGGATCGGCTTCTCTCTGGCTTTGTCCCCTTGCTGGCTG  592

Query  593  CCCCTCAGGACCCCTGCTACGTGGAGAAAACCTCGGATAAGGTTATTGCAGCTGACTGCAAAAGGGTCACAGTG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CCCCTCAGGACCCCTGCTACGTGGAGAAAACCTCGGATAAGGTTATTGCAGCTGACTGCAAAAGGGTCACAGTG  666

Query  667  CTGAAGTATTTTCTGGAAGCCCTTTGTGGACAAGAAGAGCCTCTGCTGGCATTCAAGGGTGGAAAGTATGTGTC  740
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct  667  CTGAAGTATTTTCTGGAAGCCCTTTGTGGACAAGAAGAGCCTCTGCTGGCATTCAAGGGTGGAAAATATGTGTC  740

Query  741  AGTGGCACCCGTCCCAGACACCATGGGAAAGGAAATGGGAAGCCAAGAGGGAACACGACTGGAAGATGAGGAGG  814
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||.|
Sbjct  741  AGTGGCACCCGTCCCAGACACCATGGGAAAGGAAATGGGAAGCCAAGAGGGAAAACAACTGGAAGATGAGGAAG  814

Query  815  AGGATGTGGTGATTGAAGACTTTGAGGAAGATTCAGAGGCTGAAGGCAGCGGAGGCGAGGATGACATCAGGGAG  888
            |.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||.
Sbjct  815  AAGATGTGGTGATTGAAGACTTTGAGGAAGATTCAGAGGCTGAAGGCAGTGGGGGTGAGGATGACATCAGGGAA  888

Query  889  CTTCGGGCCAAGAAGCTGGCTCTGGCCAGGAAGATAGCTGAGCAGCAGCGTCGCCAGGAAAAGATCCAGGCTGT  962
            |||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CTTCGGGCCAAGAAGCTGGCTCTAGCAAGGAAGATAGCTGAGCAGCAGCGTCGCCAGGAAAAGATCCAGGCTGT  962

Query  963  CCTGGAGGACCACAGTCAGATGAGGCAGATGGAGCTCGAAATCAGACCTTTGTTCCTCGTACCAGACACCAACG  1036
            ..||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||
Sbjct  963  TTTGGAAGACCAGAGTCAGATGAGGCAGATGGAGCTGGAGATCAGACCCTTGTTCCTCGTACCAGATACCAACG  1036

Query 1037  GCTTCATTGACCACCTGGCCAGTCTGGCGCGGCTGCTGGAGAGCAGGAAGTACATCCTGGTGGTGCCCCTCATC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GCTTCATTGACCACCTGGCCAGTCTGGCTCGGCTGCTGGAGAGCAGGAAGTACATCCTGGTGGTGCCCCTCATC  1110

Query 1111  GTGATCAATGAGCTGGACGGCCTGGCCAAGGGGCAGGAGACAGACCACCGGGCTGGGGGCTACGCCCGTGTGGT  1184
            |||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1111  GTGATCAATGAGCTGGACGGCCTCGCCAAAGGGCAGGAGACAGACCACCGGGCTGGGGGCTATGCCCGTGTGGT  1184

Query 1185  ACAAGAGAAGGCCCGCAAGTCCATCGAGTTCCTCGAGCAGCGATTCGAGAGTCGGGACTCTTGCCTGCGAGCCC  1258
            .|||||.||||||||.||.|||||.|||||||||||.|.|.||||.||||||||||||||.||||||||.|||.
Sbjct 1185  GCAAGAAAAGGCCCGAAAATCCATTGAGTTCCTCGAACGGAGATTTGAGAGTCGGGACTCCTGCCTGCGGGCCT  1258

Query 1259  TGACCAGCCGTGGCAATGAACTCGAATCCATCGCCTTCCGCAGTGAGGACATCACTGGCCAGCTGGGTAACAAC  1332
            ||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||
Sbjct 1259  TGACCAGCCGTGGCAATGAACTTGAATCTATCGCCTTCCGAAGTGAGGACATTACTGGACAGCTGGGTAACAAC  1332

Query 1333  GATGATCTCATCCTGTCCTGCTGCCTCCACTACTGCAAAGACAAGGCTAAGGACTTCATGCCCGCCAGCAAAGA  1406
            |||||.||.|||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|.|||||||.||||||||||
Sbjct 1333  GATGACCTGATCCTCTCTTGCTGCCTGCACTACTGCAAAGACAAGGCTAAGGATTACATGCCCACCAGCAAAGA  1406

Query 1407  GGAGCCAATCCGGCTACTGCGGGAGGTGGTGCTGTTGACGGATGACCGGAACCTGCGTGTGAAGGCGCTCACAA  1480
            ||||||||||||.||..|.||||||||||||.||.||||.|||||.||||||||.|||||.||||||||.||||
Sbjct 1407  GGAGCCAATCCGCCTGTTACGGGAGGTGGTGTTGCTGACCGATGATCGGAACCTTCGTGTAAAGGCGCTGACAA  1480

Query 1481  GGAATGTTCCTGTACGGGACATCCCAGCCTTCCTCACGTGGGCCCAGGTGGGC  1533
            |||||||.|||||..|||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1481  GGAATGTGCCTGTGAGGGACATCCCAGCCTTCCTTACGTGGGCCCAGGTGGGC  1533