Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000466603
• Subject: NM_001293707.1
• Aligned Length: 1644
• Identities: 1303
• Gaps: 147

Alignment

Query    1  ATGGCGTCGGCCTCCTCCGGGCCGTCGTCTTCGGTCGGTTTTTCATCCTTTGATCCCGCGGTCCCTTCCTGTAC  74
            ||||||||.||||||||.|||||..||   .|||.|||.|||||||||.|||||.|||.||.||||.|..||||
Sbjct    1  ATGGCGTCCGCCTCCTCAGGGCCAGCG---GCGGCCGGGTTTTCATCCCTTGATGCCGGGGCCCCTGCTGGTAC  71

Query   75  CTTGTCCTCAGCATCTGGAATCAAGAGACCCATGGCATCTGAGGTGCCTTATGCCTCTGGCATGCCCATCAAGA  148
            |....|..||||||||||||||||||||.|||..|.||||||||..||||..|||||||.||||||..|.||.|
Sbjct   72  CGCAGCAGCAGCATCTGGAATCAAGAGAGCCACAGTATCTGAGGGACCTTCCGCCTCTGTCATGCCTGTTAAAA  145

Query  149  AAATAGGCCATAGAAGTGTTGATTCCTCAGGAGAGACAACATATAAAAAGACAACCTCATCAGCCTTGAAAGGT  222
            |||||||||||.||||||||||||||||.||||||||.|||||.||.||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct  146  AAATAGGCCATCGAAGTGTTGATTCCTCTGGAGAGACTACATACAAGAAGACAACTTCATCAGCCTTGAAAGGT  219

Query  223  GCCATCCAGTTAGGCATTACCCACACTGTGGGGAGCCTGAGTACCAAACCAGAGCGTGATGTCCTCATGCAAGA  296
            |||||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  220  GCCATCCAGTTAGGCATCACTCACACTGTGGGCAGCCTGAGCACCAAACCAGAGCGTGATGTCCTCATGCAAGA  293

Query  297  TTTCTACGTGGTTGAGAGTATCTTCTTTCCCAGTGAAGGGAGCAACCTGACCCCTGCTCATCACTACAATGACT  370
            .|||||||||||.|||||.|||||.||.|||||||||||.|||||||||||.||.|||||.||.||||||||||
Sbjct  294  CTTCTACGTGGTGGAGAGCATCTTTTTCCCCAGTGAAGGCAGCAACCTGACACCGGCTCACCATTACAATGACT  367

Query  371  TTCGTTTCAAGACCTATGCACCTGTTGCCTTCCGCTACTTCCGGGAGCTATTTGGTATCCGGCCCGATGATTAC  444
            ||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||||||.|.|||||.|||||.||||||||.|||||||||
Sbjct  368  TTCGATTCAAGACCTATGCGCCTGTTGCCTTCCGTTACTTCAGAGAGCTCTTTGGCATCCGGCCTGATGATTAC  441

Query  445  TTGTATTCCCTCTGCAGTGAGCCGCTGATTGAACTCTGTAGCTCTGGAGCTAGTGGTTCCCTATTCTATGTGTC  518
            |||||.|||||.|||||||||||..||||||||||||..|..||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  442  TTGTACTCCCTTTGCAGTGAGCCATTGATTGAACTCTCCAATTCTGGAGCTAGTGGTTCCCTCTTCTATGTGTC  515

Query  519  CAGCGACGATGAGTTCATTATTAAGACAGTCCAACATAAAGAGGCGGAATTTCTGCAGAAGCTGCTTCCAGGAT  592
            |||.||.|||||.|||||.||||||||.|||||.||||||||.||.|||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct  516  CAGTGATGATGAATTCATCATTAAGACCGTCCAGCATAAAGAAGCAGAATTTCTGCAGAAGTTGCTTCCAGGAT  589

Query  593  ACTACATGAACCTCAACCAGAACCCTCGGACTTTGCTGCCTAAATTCTATGGACTGTACTGTGTGCAGGCAGGT  666
            ||||||||||.||.|||||.||||||||.|||||||||||.|||||.||||||.|||||||||||||.|||||.
Sbjct  590  ACTACATGAATCTTAACCAAAACCCTCGTACTTTGCTGCCCAAATTTTATGGATTGTACTGTGTGCAAGCAGGC  663

Query  667  GGCAAGAACATTCGGATTGTGGTGATGAACAATCTTTTACCAAGATCGGTAAAAATGCATATCAAATATGACCT  740
            |||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||.||..|.||.||.|||||||||||.|||||||||||
Sbjct  664  GGCAAGAACATACGAATTGTGGTGATGAACAATCTCTTGCCTCGGTCAGTCAAAATGCATATGAAATATGACCT  737

Query  741  CAAAGGCTCAACCTACAAACGGCGGGCTTCCCAGAAAGAGCGAGAGAAGCCTCTTCCCACATTTAAAGACCTAG  814
            .||.||.|||||.|||||.|||||||||||.||||||||.||||||||..||||.|||||.|||||||||||.|
Sbjct  738  GAAGGGTTCAACTTACAAGCGGCGGGCTTCTCAGAAAGAACGAGAGAAAACTCTCCCCACCTTTAAAGACCTGG  811

Query  815  ACTTCTTACAAGACATCCCTGATGGTCTTTTTTTGGATGCTGACATGTACAACGCTCTCTGTAAGACCCTGCAG  888
            |||||.|||||||.||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||..|||||.||||||||.||.|||
Sbjct  812  ACTTCCTACAAGATATCCCTGACGGCCTATTTTTGGATGCTGACATGTACAGTGCTCTGTGTAAGACTCTACAG  885

Query  889  CGTGACTGTTTGGTGCTGCAGAGCTTCAAGATAATGGATTATAGCCTCTTGATGTCAATCCATAATATAGATCA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||.|||||.||.||.||.||
Sbjct  886  CGTGACTGTTTGGTGCTGCAGAGCTTCAAGATAATGGACTACAGCCTGTTGATGTCCATCCACAACATGGACCA  959

Query  963  TGCACAACGAGAGCCCTTAAGCAGTGAAACACAGTACTCAGTTGATACTCGAAGACCGGCCCCCCAAAAGGCTC  1036
            ||||||..|.||||||...||||.|||.|||||||||||.|.|||.||.||.|||||.|||||.||.|||||.|
Sbjct  960  TGCACAGAGGGAGCCCACGAGCAATGACACACAGTACTCGGCTGACACGCGCAGACCAGCCCCACAGAAGGCGC  1033

Query 1037  TGTATTCCACAGCCATGGAATCCATCCAGGGAGAGGCTCGACGGGGTGGTACCATGGAGACTGATGACCATATG  1110
            |.|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||..||||||||||.|||||.|||
Sbjct 1034  TCTATTCCACAGCTATGGAATCCATCCAGGGCGAGGCTCGACGGGGCGGCACTGTGGAGACTGAGGACCACATG  1107

Query 1111  GGTGGCATCCCTGCCCGGAATAGTAAAGGGGAAAGGCTTCTGCTTTATATTGGCATCATTGACATTCTACAGTC  1184
            ||||||||||||||||||||||..|||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||
Sbjct 1108  GGTGGCATCCCTGCCCGGAATAACAAAGGAGAAAGGCTCCTGCTTTATATTGGCATCATTGATATTCTTCAGTC  1181

Query 1185  TTACAGGTTTGTTAAGAAGTTGGAGCACTCTTGGAAAGCCCTGGTACATGACGGAGACACTGTCTCAGTGCATC  1258
            .||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||.||.||.||.||||||||||
Sbjct 1182  CTACAGGTTTGTTAAGAAGTTGGAGCACTCTTGGAAAGCACTGGTCCATGATGGGGATACGGTGTCAGTGCATC  1255

Query 1259  GCCCAGGCTTCTACGCTGAACGGTTCCAGCGCTTCATGTGCAACACAGTATTTAAGAAGATTCCCT----GC--  1326
            |.|||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||||    ||  
Sbjct 1256  GTCCAGGCTTCTATGCTGAGCGGTTCCAGCGTTTCATGTGCAACACAGTGTTCAAGAAGATTCCCTTGAAGCCT  1329

Query 1327  --------------------------------------------------------------------------  1326
                                                                                      
Sbjct 1330  TCTCCTACCAAAAAGTTTCGGTCTGGCCCGTCTTTCTCTCGGCGATCAGGCCCCAGCGGCAACTCCTGCACCTC  1403

Query 1327  ----------------------------------------------------------------GTTCACCTTG  1336
                                                                            ||.|||||||
Sbjct 1404  CCAGCTGATGGCCTCTGGGGAACACAGAGCACAAGTGACCACCAAGGCGGAAGTGGAGCCAGATGTACACCTTG  1477

Query 1337  GTCGTCCTGATGTTTTACCTCAGACTCCACCTTTGGAGGAAATCAGTGAGGGCTCGCCTATTCCTGACCCCAGT  1410
            |.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||.||||||.|||||||
Sbjct 1478  GGCGTCCTGATGTCTTACCTCAGACTCCACCTTTGGAGGAAATAAGTGAGGGTTCACCTGTTCCTGGCCCCAGT  1551

Query 1411  TTCTCACCTCTAGTTGGAGAGACTTTGCAAATGCTAACTACAAGTACAACCTTGGAAAAGCTTGAAGTTGCAGA  1484
            |||||||||.||||||||.|..||||||||||.||||.|...|||.|||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1552  TTCTCACCTGTAGTTGGACAACCTTTGCAAATACTAAATTTGAGTTCAACCTTGGAAAAGCTTGATGTTGCAGA  1625

Query 1485  GTCAGAGTTCACCCAT  1500
            |||||||||||||||.
Sbjct 1626  GTCAGAGTTCACCCAC  1641