Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
TRCN0000466607
Subject:
NM_145298.6
Aligned Length:
1159
Identities:
1008
Gaps:
41

Alignment

Query    1  ATGAATCCACAGATCAGAAATCCGATGGAGCGGATGTATCGAGACACATTCTACGACAACTTTGAAAACGAACC  74
            |||||.||.||..|||||||..|..|||||||.|||||||||||||||||||.|.||||||||.|.||...|||
Sbjct    1  ATGAAGCCTCACTTCAGAAACACAGTGGAGCGAATGTATCGAGACACATTCTCCTACAACTTTTATAATAGACC  74

Query   75  CATCCTCTATGGTCGGAGCTACACT-TGGCTGTGCTATGAAGTGAAAATAAAGAGGGGCCGCTCAAATCTCCTT  147
            ||||||.|.|.|||||| .|||..| |||||||||||.||||||||||.|||   |||.|.|||||..|.||.|
Sbjct   75  CATCCTTTCTCGTCGGA-ATACCGTCTGGCTGTGCTACGAAGTGAAAACAAA---GGGTCCCTCAAGGCCCCGT  144

Query  148  TGGGACACAGGGGTCTTTCGAGGCCCGGTACTACCCAAACGTCAGTCGAATCACAGGCAGGAGGTGTATTTCCG  221
            |.||||.||..|.||||||||||||                                    |||||||||.||.
Sbjct  145  TTGGACGCAAAGATCTTTCGAGGCC------------------------------------AGGTGTATTCCCA  182

Query  222  GTTTGAGAACCACGCAGAAATGTGCTTCTTATCTTGGTTCTGTGGCAACCGACTGCCTGCTAACAGGCGCTTCC  295
            |..||||.||||||||||||||||||||.|.|||||||||||||||||||..|||||||||.|||.|.|.||||
Sbjct  183  GCCTGAGCACCACGCAGAAATGTGCTTCCTCTCTTGGTTCTGTGGCAACCAGCTGCCTGCTTACAAGTGTTTCC  256

Query  296  AGATCACCTGGTTTGTATCATGGAACCCCTGCCTGCCCTGTGTGGTGAAGGTGACCAAATTCTTGGCTGAGCAC  369
            |||||||||||||||||||.||||.||||||||.|..||||||||.||||.||.||.|||||.|||||||||||
Sbjct  257  AGATCACCTGGTTTGTATCCTGGACCCCCTGCCCGGACTGTGTGGCGAAGCTGGCCGAATTCCTGGCTGAGCAC  330

Query  370  CCCAATGTCACCCTGACCATCTCTGCCGCCCGCCTCTACTACTACCGGGATAGAGATTGGCGGTGGGTGCTCCT  443
            |||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.||||.|||||||..||..|||.||||..
Sbjct  331  CCCAATGTCACCCTGACCATCTCCGCCGCCCGCCTCTACTACTACTGGGAAAGAGATTACCGAAGGGCGCTCTG  404

Query  444  CAGGCTGCATAAGGCAGGGGCCCGTGTGAAGATCATGGACTATGAAGACTTTGCATACTGCTGGGAAAACTTTG  517
            |||||||..|.|||||||||||||.||||||||.||||||.|||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct  405  CAGGCTGAGTCAGGCAGGGGCCCGCGTGAAGATTATGGACGATGAAGAATTTGCATACTGCTGGGAAAACTTTG  478

Query  518  TGTGCAATGAAGGTCAGCCATTCATGCCTTGGTACAAATTCGATGACAATTATGCATCCCTGCACCGCACGCTA  591
            |||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct  479  TGTACAGTGAAGGTCAGCCATTCATGCCTTGGTACAAATTCGATGACAATTATGCATTCCTGCACCGCACGCTA  552

Query  592  AAGGAGATTCTCAGAAACCCGATGGAGGCAATGTACCCACACATATTCTACTTCCACTTTAAAAACCTACTGAA  665
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||..||
Sbjct  553  AAGGAGATTCTCAGAAACCCGATGGAGGCAATGTATCCACACATATTCTACTTCCACTTTAAAAACCTACGCAA  626

Query  666  AGCCTGTGGTCGGAACGAAAGCTGGCTGTGCTTCACCATGGAAGTTACAAAGCACCACTCAGCTGTCTTCCGGA  739
            |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||||||||.||||||.|.|||
Sbjct  627  AGCCTATGGTCGGAACGAAAGCTGGCTGTGCTTCACCATGGAAGTTGTAAAGCACCACTCACCTGTCTCCTGGA  700

Query  740  AGAGGGGCGTCTTCCGAAACCAGGTGGATCCTGAGACCCATTGTCATGCAGAAAGGTGCTTCCTCTCTTGGTTC  813
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  701  AGAGGGGCGTCTTCCGAAACCAGGTGGATCCTGAGACCCATTGTCATGCAGAAAGGTGCTTCCTCTCTTGGTTC  774

Query  814  TGTGACGACATACTGTCTCCTAACACAAACTACGAGGTCACCTGGTACACATCTTGGAGCCCTTGCCCAGAGTG  887
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  775  TGTGACGACATACTGTCTCCTAACACAAACTACGAGGTCACCTGGTACACATCTTGGAGCCCTTGCCCAGAGTG  848

Query  888  TGCAGGGGAGGTGGCCGAGTTCCTGGCCAGGCACAGCAACGTGAATCTCACCATCTTCACCGCCCGCCTCTGCT  961
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  849  TGCAGGGGAGGTGGCCGAGTTCCTGGCCAGGCACAGCAACGTGAATCTCACCATCTTCACCGCCCGCCTCTACT  922

Query  962  ATTTCTGGGATACAGATTACCAGGAGGGGCTCTGCAGCCTGAGTCAGGAAGGGGCCTCCGTGAAGATCATGGGC  1035
            |.||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  923  ACTTCTGGGATACAGATTACCAGGAGGGGCTCCGCAGCCTGAGTCAGGAAGGGGCCTCCGTGGAGATCATGGGC  996

Query 1036  TACAAAGATTTTGTATCTTGTTGGAAAAACTTTGTGTACAGTGATGATGAGCCATTCAAGCCTTGGAAGGGACT  1109
            ||||||||||||..||.|||||||.|||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct  997  TACAAAGATTTTAAATATTGTTGGGAAAACTTTGTGTACAATGATGATGAGCCATTCAAGCCTTGGAAAGGACT  1070

Query 1110  ACAAACCAACTTTCGACTTCTGAAAAGAAGGCTACGGGAGATTCTCCAG  1158
            |.||..||||||||.|.|.|||.|.||.|.|||.|.||||||||||.||
Sbjct 1071  AAAATACAACTTTCTATTCCTGGACAGCAAGCTGCAGGAGATTCTCGAG  1119