Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000466607
- Subject:
- XM_024452178.1
- Aligned Length:
- 1366
- Identities:
- 1008
- Gaps:
- 248
Alignment
Query 1 ATGAATCCACAGATCAGAAATCCGATGGAGCGGATGTATCGAGACACATTCTACGACAACTTTGAAAACGAACC 74
|||||.||.||..|||||||..|..|||||||.|||||||||||||||||||.|.||||||||.|.||...|||
Sbjct 1 ATGAAGCCTCACTTCAGAAACACAGTGGAGCGAATGTATCGAGACACATTCTCCTACAACTTTTATAATAGACC 74
Query 75 CATCCTCTATGGTCGGAGCTACACT-TGGCTGTGCTATGAAGTGAAAATAAAGAGGGGCCGCTCAAATCTCCTT 147
||||||.|.|.|||||| .|||..| |||||||||||.||||||||||.||| |||.|.|||||..|.||.|
Sbjct 75 CATCCTTTCTCGTCGGA-ATACCGTCTGGCTGTGCTACGAAGTGAAAACAAA---GGGTCCCTCAAGGCCCCGT 144
Query 148 TGGGACACAGGGGTCTTTCGAGGCCCGGTACTACCCAAACGTCAGTCGAATCACAGGCAGGAGGTGTATTTCCG 221
|.||||.||..|.|||||||||||| |||||||||.||.
Sbjct 145 TTGGACGCAAAGATCTTTCGAGGCC------------------------------------AGGTGTATTCCCA 182
Query 222 GTTTGAGAACCACGCAGAAATGTGCTTCTTATCTTGGTTCTGTGGCAACCGACTGCCTGCTAACAGGCGCTTCC 295
|..||||.||||||||||||||||||||.|.|||||||||||||||||||..|||||||||.|||.|.|.||||
Sbjct 183 GCCTGAGCACCACGCAGAAATGTGCTTCCTCTCTTGGTTCTGTGGCAACCAGCTGCCTGCTTACAAGTGTTTCC 256
Query 296 AGATCACCTGGTTTGTATCATGGAACCCCTGCCTGCCCTGTGTGGTGAAGGTGACCAAATTCTTGGCTGAGCAC 369
|||||||||||||||||||.||||.||||||||.|..||||||||.||||.||.||.|||||.|||||||||||
Sbjct 257 AGATCACCTGGTTTGTATCCTGGACCCCCTGCCCGGACTGTGTGGCGAAGCTGGCCGAATTCCTGGCTGAGCAC 330
Query 370 CCCAATGTCACCCTGACCATCTCTGCCGCCCGCCTCTACTACTACCGGGATAGAGATTGGCGGTGGGTGCTCCT 443
|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.||||.|||||||..||..|||.||||..
Sbjct 331 CCCAATGTCACCCTGACCATCTCCGCCGCCCGCCTCTACTACTACTGGGAAAGAGATTACCGAAGGGCGCTCTG 404
Query 444 CAGGCTGCATAAGGCAGGGGCCCGTGTGAAGATCATGGACTATGA----------------------------- 488
|||||||..|.|||||||||||||.||||||||.||||||.||||
Sbjct 405 CAGGCTGAGTCAGGCAGGGGCCCGCGTGAAGATTATGGACGATGAAGGTGAGAGGTGGAGGGGTCAGGGGAGCG 478
Query 489 -------------------------------------------------------------------------- 488
Sbjct 479 TGAGCGGGAGGAACAGCATGAAAGATGGATGGATCTGCAATGCCATGGCTGGGGGTGTCCCAGGGCAGCCTGCA 552
Query 489 -------------------------------------------------------------------------- 488
Sbjct 553 GGGGCGGGGCCAGCACTGACAGCAACTGACAGCCAGGAGACCAGGCCTGGGAGCGCGGGCCCAGGGTCAGGGCA 626
Query 489 ------------------------------AGACTTTGCATACTGCTGGGAAAACTTTGTGTGCAATGAAGGTC 532
|||.||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||
Sbjct 627 GAGCCTGACTGCTTCCTGCCTCTTCGTCTCAGAATTTGCATACTGCTGGGAAAACTTTGTGTACAGTGAAGGTC 700
Query 533 AGCCATTCATGCCTTGGTACAAATTCGATGACAATTATGCATCCCTGCACCGCACGCTAAAGGAGATTCTCAGA 606
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 701 AGCCATTCATGCCTTGGTACAAATTCGATGACAATTATGCATTCCTGCACCGCACGCTAAAGGAGATTCTCAGA 774
Query 607 AACCCGATGGAGGCAATGTACCCACACATATTCTACTTCCACTTTAAAAACCTACTGAAAGCCTGTGGTCGGAA 680
||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||.|||||||||
Sbjct 775 AACCCGATGGAGGCAATGTATCCACACATATTCTACTTCCACTTTAAAAACCTACGCAAAGCCTATGGTCGGAA 848
Query 681 CGAAAGCTGGCTGTGCTTCACCATGGAAGTTACAAAGCACCACTCAGCTGTCTTCCGGAAGAGGGGCGTCTTCC 754
|||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||||||||.||||||.|.||||||||||||||||||
Sbjct 849 CGAAAGCTGGCTGTGCTTCACCATGGAAGTTGTAAAGCACCACTCACCTGTCTCCTGGAAGAGGGGCGTCTTCC 922
Query 755 GAAACCAGGTGGATCCTGAGACCCATTGTCATGCAGAAAGGTGCTTCCTCTCTTGGTTCTGTGACGACATACTG 828
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 923 GAAACCAGGTGGATCCTGAGACCCATTGTCATGCAGAAAGGTGCTTCCTCTCTTGGTTCTGTGACGACATACTG 996
Query 829 TCTCCTAACACAAACTACGAGGTCACCTGGTACACATCTTGGAGCCCTTGCCCAGAGTGTGCAGGGGAGGTGGC 902
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 997 TCTCCTAACACAAACTACGAGGTCACCTGGTACACATCTTGGAGCCCTTGCCCAGAGTGTGCAGGGGAGGTGGC 1070
Query 903 CGAGTTCCTGGCCAGGCACAGCAACGTGAATCTCACCATCTTCACCGCCCGCCTCTGCTATTTCTGGGATACAG 976
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.|||||||||||||
Sbjct 1071 CGAGTTCCTGGCCAGGCACAGCAACGTGAATCTCACCATCTTCACCGCCCGCCTCTACTACTTCTGGGATACAG 1144
Query 977 ATTACCAGGAGGGGCTCTGCAGCCTGAGTCAGGAAGGGGCCTCCGTGAAGATCATGGGCTACAAAGATTTTGTA 1050
|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||..|
Sbjct 1145 ATTACCAGGAGGGGCTCCGCAGCCTGAGTCAGGAAGGGGCCTCCGTGGAGATCATGGGCTACAAAGATTTTAAA 1218
Query 1051 TCTTGTTGGAAAAACTTTGTGTACAGTGATGATGAGCCATTCAAGCCTTGGAAGGGACTACAAACCAACTTTCG 1124
|.|||||||.|||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.||||||.||..||||||||.
Sbjct 1219 TATTGTTGGGAAAACTTTGTGTACAATGATGATGAGCCATTCAAGCCTTGGAAAGGACTAAAATACAACTTTCT 1292
Query 1125 ACTTCTGAAAAGAAGGCTACGGGAGATTCTCCAG 1158
|.|.|||.|.||.|.|||.|.||||||||||.||
Sbjct 1293 ATTCCTGGACAGCAAGCTGCAGGAGATTCTCGAG 1326