Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000466644
• Subject: NM_001110300.1
• Aligned Length: 1276
• Identities: 1105
• Gaps: 8

Alignment

Query    1  ATGTCCGCCTCGGCTGTCTTCATTCTGGACGTTAAGGGCAAGCCATTGATCAGCCGCAACTACAAGGGCGATGT  74
            |||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||..||||.|||||.||||||||.||.|||||
Sbjct    1  ATGTCGGCCTCGGCAGTCTTCATTCTGGACGTCAAGGGCAAGCCTCTGATTAGCCGAAACTACAAAGGTGATGT  74

Query   75  GGCCATGAGCA-AGATTGAGCACTTCATGCCTTTGCTGGTACAGCGGGAGGAGGAAGGCGCCCTGGCCCCGCTG  147
            |.|||||| || |||||||.|||||||||||..||||..|.|||||.||||||||.||||..||||||||||||
Sbjct   75  GCCCATGA-CAGAGATTGACCACTTCATGCCGCTGCTTATGCAGCGTGAGGAGGAGGGCGTGCTGGCCCCGCTG  147

Query  148  CTGAGCCACGGCCAGGTCCACTTCCTATGGATCAAACACAGCAACCTCTACTTGGTGGCCACCACATCGAAGAA  221
            |||||||||||||..||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||...||||||
Sbjct  148  CTGAGCCACGGCCGAGTGCACTTCCTGTGGATCAAACACAGCAACCTCTACTTGGTGGCCACCACGCTGAAGAA  221

Query  222  TGCCAATGCCTCCCTGGTGTACTCCTTCCTGTATAAGACAATAGAGGTATTCTGCGAATACTTCAAGGAGCTGG  295
            .||.||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||..|.|||||.||||||||.|||||.||||||||||
Sbjct  222  CGCTAATGCCTCTCTGGTGTACTCCTTTCTGTACAAGACTGTGGAGGTCTTCTGCGAGTACTTTAAGGAGCTGG  295

Query  296  AGGAGGAGAGCATCCGGGACAACTTTGTCATCGTCTACGAGTTGCTGGACGAGCTCATGGACTTTGGCTTCCCG  369
            |||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||.|||||||.||||||||||||||.|||||.|||
Sbjct  296  AGGAGGAGAGCATCCGGGACAACTTCGTCATCGTGTACGAGCTGCTGGATGAGCTCATGGACTTCGGCTTTCCG  369

Query  370  CAGACCACCGACAGCAAGATCCTGCAGGAGTACATCACTCAGCAGAGCAACAAGCTGGAGACGGGCAAGTCACG  443
            ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.|||.||||||||||||||||.|||||.||.||
Sbjct  370  CAGACCACAGACAGCAAGATCCTGCAGGAGTACATCACACAACAGGGCAACAAGCTGGAGACTGGCAAATCTCG  443

Query  444  GGTGCCACCCACTGTCACCAACGCTGTGTCCTGGCGCTCCGAGGGTATCAAGTATAAGAAGAACGAGGTCTTCA  517
            .||.|||||.||.||||||||.||.|||||.||||||||.|||||.||.|||||.||.|||||.||||||||||
Sbjct  444  TGTACCACCTACAGTCACCAATGCGGTGTCGTGGCGCTCTGAGGGCATTAAGTACAAAAAGAATGAGGTCTTCA  517

Query  518  TTGATGTCATAGAGTCTGTCAACCTGCTGGTCAATGCCAACGGCAGCGTCCTTCTGAGCGAAATCGTCGGTACC  591
            ||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||.||.||.|||.|.||.|||||.||.||.||.|||
Sbjct  518  TTGATGTCATTGAGTCTGTCAACCTTCTGGTCAATGCTAATGGGAGTGTCTTGCTCAGCGAGATTGTGGGCACC  591

Query  592  ATCAAGCTCAAGGTGTTTCTGTCGGGAATGCCAGAGCTGCGGCTGGGCCTCAATGACCGCGTGCTCTTCGAGCT  665
            ||||||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||
Sbjct  592  ATCAAGCTGAAGGTGTTTCTGTCTGGGATGCCAGAGCTGCGGCTGGGCCTCAATGACCGAGTGCTCTTTGAGCT  665

Query  666  CACTGGCC------GCAGCAAGAACAAATCAGTAGAGCTGGAGGATGTAAAATTCCACCAGTGCGTGCGGCTCT  733
            .|||||||      |||||||||||||.||.||.||.|||||.|||||.|||||||||||.||.|||.||||.|
Sbjct  666  TACTGGCCTTTCAGGCAGCAAGAACAAGTCTGTGGAACTGGAAGATGTGAAATTCCACCAATGTGTGAGGCTTT  739

Query  734  CTCGCTTTGACAACGACCGCACCATCTCCTTCATCCCGCCTGATGGTGACTTTGAGCTCATGTCATACCGCCTC  807
            |.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||.|||||.||||||||.||||||||.|||||.||.
Sbjct  740  CACGCTTTGACAACGACCGAACCATCTCCTTCATACCCCCAGATGGGGACTTTGAACTCATGTCCTACCGGCTT  813

Query  808  AGCACCCAGGTCAAGCCACTGATCTGGATTGAGTCTGTCATTGAGAAGTTCTCCCACAGCCGCGTGGAGATCAT  881
            ||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||
Sbjct  814  AGCACCCAGGTCAAACCCCTGATCTGGATCGAGTCAGTCATTGAGAAATTCTCGCACAGCCGAGTGGAGATCAT  887

Query  882  GGTCAAGGCCAAGGGGCAGTTTAAGAAACAGTCAGTGGCCAACGGTGTGGAGATATCTGTGCCTGTACCCAGCG  955
            |||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||.||.|||||.||.||||||||.||.||.||.|
Sbjct  888  GGTGAAGGCCAAGGGTCAGTTTAAGAAGCAGTCGGTGGCCAATGGCGTGGAAATCTCTGTGCCCGTTCCTAGTG  961

Query  956  ATGCCGACTCCCCCAGATTCAAGACCAGTGTGGGCAGCGCCAAGTATGTGCCGGAGAGAAACGTCGTGATTTGG  1029
            ||||.|||||.||..|.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||..||.||.||.||.|||
Sbjct  962  ATGCAGACTCTCCGCGCTTCAAGACCAGTGTGGGCAGTGCCAAGTATGTGCCTGAGAAGAATGTTGTCATCTGG  1035

Query 1030  AGTATTAAGTCTTTCCCGGGGGGCAAGGAGTACTTGATGCGAGCCCACTTTGGCCTCCCCAGTGTGGAAAAGGA  1103
            ||.||.|||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||..||
Sbjct 1036  AGCATCAAGTCATTCCCTGGGGGAAAGGAGTACTTGATGCGTGCCCACTTTGGCCTCCCCAGCGTGGAAACTGA  1109

Query 1104  AGAGGTGGAGGGCCGGCCCCCCATCGGGGTCAAGTTTGAGATCCCCTACTTCACCGTCTCTGGGATCCAGGTCC  1177
            .|||||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||.|||||.||||||||||
Sbjct 1110  GGAGGTAGAGGGCCGACCACCCATCGGGGTCAAGTTTGAGATTCCATACTTTACCGTTTCTGGCATCCAGGTCC  1183

Query 1178  GATACATGAAGATCATTGAGAAAAGTGGTTACCAGGCCCTGCCCTGGGTTCGCTACATCACCCAGAGTGGCGAT  1251
            |.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||.|||
Sbjct 1184  GTTACATGAAGATCATCGAGAAAAGTGGGTACCAGGCCCTGCCCTGGGTCCGTTACATCACGCAGAGTGGTGAT  1257

Query 1252  TACCAATTTCGTCCCAGC  1269
            ||.|||.|||||.|||||
Sbjct 1258  TATCAACTTCGTACCAGC  1275