Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000466644
• Subject: NM_009678.2
• Aligned Length: 1270
• Identities: 1105
• Gaps: 2

Alignment

Query    1  ATGTCCGCCTCGGCTGTCTTCATTCTGGACGTTAAGGGCAAGCCATTGATCAGCCGCAACTACAAGGGCGATGT  74
            |||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||..||||.|||||.||||||||.||.|||||
Sbjct    1  ATGTCGGCCTCGGCAGTCTTCATTCTGGACGTCAAGGGCAAGCCTCTGATTAGCCGAAACTACAAAGGTGATGT  74

Query   75  GGCCATGAGCA-AGATTGAGCACTTCATGCCTTTGCTGGTACAGCGGGAGGAGGAAGGCGCCCTGGCCCCGCTG  147
            |.|||||| || |||||||.|||||||||||..||||..|.|||||.||||||||.||||..||||||||||||
Sbjct   75  GCCCATGA-CAGAGATTGACCACTTCATGCCGCTGCTTATGCAGCGTGAGGAGGAGGGCGTGCTGGCCCCGCTG  147

Query  148  CTGAGCCACGGCCAGGTCCACTTCCTATGGATCAAACACAGCAACCTCTACTTGGTGGCCACCACATCGAAGAA  221
            |||||||||||||..||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||...||||||
Sbjct  148  CTGAGCCACGGCCGAGTGCACTTCCTGTGGATCAAACACAGCAACCTCTACTTGGTGGCCACCACGCTGAAGAA  221

Query  222  TGCCAATGCCTCCCTGGTGTACTCCTTCCTGTATAAGACAATAGAGGTATTCTGCGAATACTTCAAGGAGCTGG  295
            .||.||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||..|.|||||.||||||||.|||||.||||||||||
Sbjct  222  CGCTAATGCCTCTCTGGTGTACTCCTTTCTGTACAAGACTGTGGAGGTCTTCTGCGAGTACTTTAAGGAGCTGG  295

Query  296  AGGAGGAGAGCATCCGGGACAACTTTGTCATCGTCTACGAGTTGCTGGACGAGCTCATGGACTTTGGCTTCCCG  369
            |||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||.|||||||.||||||||||||||.|||||.|||
Sbjct  296  AGGAGGAGAGCATCCGGGACAACTTCGTCATCGTGTACGAGCTGCTGGATGAGCTCATGGACTTCGGCTTTCCG  369

Query  370  CAGACCACCGACAGCAAGATCCTGCAGGAGTACATCACTCAGCAGAGCAACAAGCTGGAGACGGGCAAGTCACG  443
            ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.|||.||||||||||||||||.|||||.||.||
Sbjct  370  CAGACCACAGACAGCAAGATCCTGCAGGAGTACATCACACAACAGGGCAACAAGCTGGAGACTGGCAAATCTCG  443

Query  444  GGTGCCACCCACTGTCACCAACGCTGTGTCCTGGCGCTCCGAGGGTATCAAGTATAAGAAGAACGAGGTCTTCA  517
            .||.|||||.||.||||||||.||.|||||.||||||||.|||||.||.|||||.||.|||||.||||||||||
Sbjct  444  TGTACCACCTACAGTCACCAATGCGGTGTCGTGGCGCTCTGAGGGCATTAAGTACAAAAAGAATGAGGTCTTCA  517

Query  518  TTGATGTCATAGAGTCTGTCAACCTGCTGGTCAATGCCAACGGCAGCGTCCTTCTGAGCGAAATCGTCGGTACC  591
            ||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||.||.||.|||.|.||.|||||.||.||.||.|||
Sbjct  518  TTGATGTCATTGAGTCTGTCAACCTTCTGGTCAATGCTAATGGGAGTGTCTTGCTCAGCGAGATTGTGGGCACC  591

Query  592  ATCAAGCTCAAGGTGTTTCTGTCGGGAATGCCAGAGCTGCGGCTGGGCCTCAATGACCGCGTGCTCTTCGAGCT  665
            ||||||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||
Sbjct  592  ATCAAGCTGAAGGTGTTTCTGTCTGGGATGCCAGAGCTGCGGCTGGGCCTCAATGACCGAGTGCTCTTTGAGCT  665

Query  666  CACTGGCCGCAGCAAGAACAAATCAGTAGAGCTGGAGGATGTAAAATTCCACCAGTGCGTGCGGCTCTCTCGCT  739
            .||||||||||||||||||||.||.||.||.|||||.|||||.|||||||||||.||.|||.||||.||.||||
Sbjct  666  TACTGGCCGCAGCAAGAACAAGTCTGTGGAACTGGAAGATGTGAAATTCCACCAATGTGTGAGGCTTTCACGCT  739

Query  740  TTGACAACGACCGCACCATCTCCTTCATCCCGCCTGATGGTGACTTTGAGCTCATGTCATACCGCCTCAGCACC  813
            |||||||||||||.||||||||||||||.||.||.|||||.||||||||.||||||||.|||||.||.||||||
Sbjct  740  TTGACAACGACCGAACCATCTCCTTCATACCCCCAGATGGGGACTTTGAACTCATGTCCTACCGGCTTAGCACC  813

Query  814  CAGGTCAAGCCACTGATCTGGATTGAGTCTGTCATTGAGAAGTTCTCCCACAGCCGCGTGGAGATCATGGTCAA  887
            ||||||||.||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||.||
Sbjct  814  CAGGTCAAACCCCTGATCTGGATCGAGTCAGTCATTGAGAAATTCTCGCACAGCCGAGTGGAGATCATGGTGAA  887

Query  888  GGCCAAGGGGCAGTTTAAGAAACAGTCAGTGGCCAACGGTGTGGAGATATCTGTGCCTGTACCCAGCGATGCCG  961
            |||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||.||.|||||.||.||||||||.||.||.||.|||||.|
Sbjct  888  GGCCAAGGGTCAGTTTAAGAAGCAGTCGGTGGCCAATGGCGTGGAAATCTCTGTGCCCGTTCCTAGTGATGCAG  961

Query  962  ACTCCCCCAGATTCAAGACCAGTGTGGGCAGCGCCAAGTATGTGCCGGAGAGAAACGTCGTGATTTGGAGTATT  1035
            ||||.||..|.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||..||.||.||.||.|||||.||.
Sbjct  962  ACTCTCCGCGCTTCAAGACCAGTGTGGGCAGTGCCAAGTATGTGCCTGAGAAGAATGTTGTCATCTGGAGCATC  1035

Query 1036  AAGTCTTTCCCGGGGGGCAAGGAGTACTTGATGCGAGCCCACTTTGGCCTCCCCAGTGTGGAAAAGGAAGAGGT  1109
            |||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||..||.|||||
Sbjct 1036  AAGTCATTCCCTGGGGGAAAGGAGTACTTGATGCGTGCCCACTTTGGCCTCCCCAGCGTGGAAACTGAGGAGGT  1109

Query 1110  GGAGGGCCGGCCCCCCATCGGGGTCAAGTTTGAGATCCCCTACTTCACCGTCTCTGGGATCCAGGTCCGATACA  1183
            .||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||.|||||.|||||||||||.||||
Sbjct 1110  AGAGGGCCGACCACCCATCGGGGTCAAGTTTGAGATTCCATACTTTACCGTTTCTGGCATCCAGGTCCGTTACA  1183

Query 1184  TGAAGATCATTGAGAAAAGTGGTTACCAGGCCCTGCCCTGGGTTCGCTACATCACCCAGAGTGGCGATTACCAA  1257
            ||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||.|||||.|||
Sbjct 1184  TGAAGATCATCGAGAAAAGTGGGTACCAGGCCCTGCCCTGGGTCCGTTACATCACGCAGAGTGGTGATTATCAA  1257

Query 1258  TTTCGTCCCAGC  1269
            .|||||.|||||
Sbjct 1258  CTTCGTACCAGC  1269