Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000466644
• Subject: XM_006509949.3
• Aligned Length: 1276
• Identities: 1011
• Gaps: 113

Alignment

Query    1  ATGTCCGCCTCGGCTGTCTTCATTCTGGACGTTAAGGGCAAGCCATTGATCAGCCGCAACTACAAGGGCGATGT  74
            |||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||..||||.|||||.||||||||.||.|||||
Sbjct    1  ATGTCGGCCTCGGCAGTCTTCATTCTGGACGTCAAGGGCAAGCCTCTGATTAGCCGAAACTACAAAGGTGATGT  74

Query   75  GGCCATGAGCA-AGATTGAGCACTTCATGCCTTTGCTGGTACAGCGGGAGGAGGAAGGCGCCCTGGCCCCGCTG  147
            |.|||||| || |||||||.|||||||||||..||||..|.|||||.||||||||.||||..||||||||||||
Sbjct   75  GCCCATGA-CAGAGATTGACCACTTCATGCCGCTGCTTATGCAGCGTGAGGAGGAGGGCGTGCTGGCCCCGCTG  147

Query  148  CTGAGCCACGGCCAGGTCCACTTCCTATGGATCAAACACAGCAACCTCTACTTGGTGGCCACCACATCGAAGAA  221
            |||||||||||||..||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||...||||||
Sbjct  148  CTGAGCCACGGCCGAGTGCACTTCCTGTGGATCAAACACAGCAACCTCTACTTGGTGGCCACCACGCTGAAGAA  221

Query  222  TGCCAATGCCTCCCTGGTGTACTCCTTCCTGTATAAGACAATAGAGGTATTCTGCGAATACTTCAAGGAGCTGG  295
            .||.||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||                                   
Sbjct  222  CGCTAATGCCTCTCTGGTGTACTCCTTTCTGTACAAGAC-----------------------------------  260

Query  296  AGGAGGAGAGCATCCGGGACAACTTTGTCATCGTCTACGAGTTGCTGGACGAGCTCATGGACTTTGGCTTCCCG  369
                                     |||                                             |
Sbjct  261  -------------------------TGT---------------------------------------------G  264

Query  370  CAGACCACCGACAGCAAGATCCTGCAGGAGTACATCACTCAGCAGAGCAACAAGCTGGAGACGGGCAAGTCACG  443
            .|||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.|||.||||||||||||||||.|||||.||.||
Sbjct  265  GAGACCACAGACAGCAAGATCCTGCAGGAGTACATCACACAACAGGGCAACAAGCTGGAGACTGGCAAATCTCG  338

Query  444  GGTGCCACCCACTGTCACCAACGCTGTGTCCTGGCGCTCCGAGGGTATCAAGTATAAGAAGAACGAGGTCTTCA  517
            .||.|||||.||.||||||||.||.|||||.||||||||.|||||.||.|||||.||.|||||.||||||||||
Sbjct  339  TGTACCACCTACAGTCACCAATGCGGTGTCGTGGCGCTCTGAGGGCATTAAGTACAAAAAGAATGAGGTCTTCA  412

Query  518  TTGATGTCATAGAGTCTGTCAACCTGCTGGTCAATGCCAACGGCAGCGTCCTTCTGAGCGAAATCGTCGGTACC  591
            ||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||.||.||.|||.|.||.|||||.||.||.||.|||
Sbjct  413  TTGATGTCATTGAGTCTGTCAACCTTCTGGTCAATGCTAATGGGAGTGTCTTGCTCAGCGAGATTGTGGGCACC  486

Query  592  ATCAAGCTCAAGGTGTTTCTGTCGGGAATGCCAGAGCTGCGGCTGGGCCTCAATGACCGCGTGCTCTTCGAGCT  665
            ||||||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||
Sbjct  487  ATCAAGCTGAAGGTGTTTCTGTCTGGGATGCCAGAGCTGCGGCTGGGCCTCAATGACCGAGTGCTCTTTGAGCT  560

Query  666  CACTGGCC------GCAGCAAGAACAAATCAGTAGAGCTGGAGGATGTAAAATTCCACCAGTGCGTGCGGCTCT  733
            .|||||||      |||||||||||||.||.||.||.|||||.|||||.|||||||||||.||.|||.||||.|
Sbjct  561  TACTGGCCTTTCAGGCAGCAAGAACAAGTCTGTGGAACTGGAAGATGTGAAATTCCACCAATGTGTGAGGCTTT  634

Query  734  CTCGCTTTGACAACGACCGCACCATCTCCTTCATCCCGCCTGATGGTGACTTTGAGCTCATGTCATACCGCCTC  807
            |.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||.|||||.||||||||.||||||||.|||||.||.
Sbjct  635  CACGCTTTGACAACGACCGAACCATCTCCTTCATACCCCCAGATGGGGACTTTGAACTCATGTCCTACCGGCTT  708

Query  808  AGCACCCAGGTCAAGCCACTGATCTGGATTGAGTCTGTCATTGAGAAGTTCTCCCACAGCCGCGTGGAGATCAT  881
            ||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||
Sbjct  709  AGCACCCAGGTCAAACCCCTGATCTGGATCGAGTCAGTCATTGAGAAATTCTCGCACAGCCGAGTGGAGATCAT  782

Query  882  GGTCAAGGCCAAGGGGCAGTTTAAGAAACAGTCAGTGGCCAACGGTGTGGAGATATCTGTGCCTGTACCCAGCG  955
            |||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||.||.|||||.||.||||||||.||.||.||.|
Sbjct  783  GGTGAAGGCCAAGGGTCAGTTTAAGAAGCAGTCGGTGGCCAATGGCGTGGAAATCTCTGTGCCCGTTCCTAGTG  856

Query  956  ATGCCGACTCCCCCAGATTCAAGACCAGTGTGGGCAGCGCCAAGTATGTGCCGGAGAGAAACGTCGTGATTTGG  1029
            ||||.|||||.||..|.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||..||.||.||.||.|||
Sbjct  857  ATGCAGACTCTCCGCGCTTCAAGACCAGTGTGGGCAGTGCCAAGTATGTGCCTGAGAAGAATGTTGTCATCTGG  930

Query 1030  AGTATTAAGTCTTTCCCGGGGGGCAAGGAGTACTTGATGCGAGCCCACTTTGGCCTCCCCAGTGTGGAAAAGGA  1103
            ||.||.|||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||..||
Sbjct  931  AGCATCAAGTCATTCCCTGGGGGAAAGGAGTACTTGATGCGTGCCCACTTTGGCCTCCCCAGCGTGGAAACTGA  1004

Query 1104  AGAGGTGGAGGGCCGGCCCCCCATCGGGGTCAAGTTTGAGATCCCCTACTTCACCGTCTCTGGGATCCAGGTCC  1177
            .|||||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||.|||||.||||||||||
Sbjct 1005  GGAGGTAGAGGGCCGACCACCCATCGGGGTCAAGTTTGAGATTCCATACTTTACCGTTTCTGGCATCCAGGTCC  1078

Query 1178  GATACATGAAGATCATTGAGAAAAGTGGTTACCAGGCCCTGCCCTGGGTTCGCTACATCACCCAGAGTGGCGAT  1251
            |.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||.|||
Sbjct 1079  GTTACATGAAGATCATCGAGAAAAGTGGGTACCAGGCCCTGCCCTGGGTCCGTTACATCACGCAGAGTGGTGAT  1152

Query 1252  TACCAATTTCGTCCCAGC  1269
            ||.|||.|||||.|||||
Sbjct 1153  TATCAACTTCGTACCAGC  1170