Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000466644
• Subject: XM_006509950.3
• Aligned Length: 1270
• Identities: 1011
• Gaps: 107

Alignment

Query    1  ATGTCCGCCTCGGCTGTCTTCATTCTGGACGTTAAGGGCAAGCCATTGATCAGCCGCAACTACAAGGGCGATGT  74
            |||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||..||||.|||||.||||||||.||.|||||
Sbjct    1  ATGTCGGCCTCGGCAGTCTTCATTCTGGACGTCAAGGGCAAGCCTCTGATTAGCCGAAACTACAAAGGTGATGT  74

Query   75  GGCCATGAGCA-AGATTGAGCACTTCATGCCTTTGCTGGTACAGCGGGAGGAGGAAGGCGCCCTGGCCCCGCTG  147
            |.|||||| || |||||||.|||||||||||..||||..|.|||||.||||||||.||||..||||||||||||
Sbjct   75  GCCCATGA-CAGAGATTGACCACTTCATGCCGCTGCTTATGCAGCGTGAGGAGGAGGGCGTGCTGGCCCCGCTG  147

Query  148  CTGAGCCACGGCCAGGTCCACTTCCTATGGATCAAACACAGCAACCTCTACTTGGTGGCCACCACATCGAAGAA  221
            |||||||||||||..||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||...||||||
Sbjct  148  CTGAGCCACGGCCGAGTGCACTTCCTGTGGATCAAACACAGCAACCTCTACTTGGTGGCCACCACGCTGAAGAA  221

Query  222  TGCCAATGCCTCCCTGGTGTACTCCTTCCTGTATAAGACAATAGAGGTATTCTGCGAATACTTCAAGGAGCTGG  295
            .||.||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||                                   
Sbjct  222  CGCTAATGCCTCTCTGGTGTACTCCTTTCTGTACAAGAC-----------------------------------  260

Query  296  AGGAGGAGAGCATCCGGGACAACTTTGTCATCGTCTACGAGTTGCTGGACGAGCTCATGGACTTTGGCTTCCCG  369
                                     |||                                             |
Sbjct  261  -------------------------TGT---------------------------------------------G  264

Query  370  CAGACCACCGACAGCAAGATCCTGCAGGAGTACATCACTCAGCAGAGCAACAAGCTGGAGACGGGCAAGTCACG  443
            .|||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.|||.||||||||||||||||.|||||.||.||
Sbjct  265  GAGACCACAGACAGCAAGATCCTGCAGGAGTACATCACACAACAGGGCAACAAGCTGGAGACTGGCAAATCTCG  338

Query  444  GGTGCCACCCACTGTCACCAACGCTGTGTCCTGGCGCTCCGAGGGTATCAAGTATAAGAAGAACGAGGTCTTCA  517
            .||.|||||.||.||||||||.||.|||||.||||||||.|||||.||.|||||.||.|||||.||||||||||
Sbjct  339  TGTACCACCTACAGTCACCAATGCGGTGTCGTGGCGCTCTGAGGGCATTAAGTACAAAAAGAATGAGGTCTTCA  412

Query  518  TTGATGTCATAGAGTCTGTCAACCTGCTGGTCAATGCCAACGGCAGCGTCCTTCTGAGCGAAATCGTCGGTACC  591
            ||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||.||.||.|||.|.||.|||||.||.||.||.|||
Sbjct  413  TTGATGTCATTGAGTCTGTCAACCTTCTGGTCAATGCTAATGGGAGTGTCTTGCTCAGCGAGATTGTGGGCACC  486

Query  592  ATCAAGCTCAAGGTGTTTCTGTCGGGAATGCCAGAGCTGCGGCTGGGCCTCAATGACCGCGTGCTCTTCGAGCT  665
            ||||||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||
Sbjct  487  ATCAAGCTGAAGGTGTTTCTGTCTGGGATGCCAGAGCTGCGGCTGGGCCTCAATGACCGAGTGCTCTTTGAGCT  560

Query  666  CACTGGCCGCAGCAAGAACAAATCAGTAGAGCTGGAGGATGTAAAATTCCACCAGTGCGTGCGGCTCTCTCGCT  739
            .||||||||||||||||||||.||.||.||.|||||.|||||.|||||||||||.||.|||.||||.||.||||
Sbjct  561  TACTGGCCGCAGCAAGAACAAGTCTGTGGAACTGGAAGATGTGAAATTCCACCAATGTGTGAGGCTTTCACGCT  634

Query  740  TTGACAACGACCGCACCATCTCCTTCATCCCGCCTGATGGTGACTTTGAGCTCATGTCATACCGCCTCAGCACC  813
            |||||||||||||.||||||||||||||.||.||.|||||.||||||||.||||||||.|||||.||.||||||
Sbjct  635  TTGACAACGACCGAACCATCTCCTTCATACCCCCAGATGGGGACTTTGAACTCATGTCCTACCGGCTTAGCACC  708

Query  814  CAGGTCAAGCCACTGATCTGGATTGAGTCTGTCATTGAGAAGTTCTCCCACAGCCGCGTGGAGATCATGGTCAA  887
            ||||||||.||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||.||
Sbjct  709  CAGGTCAAACCCCTGATCTGGATCGAGTCAGTCATTGAGAAATTCTCGCACAGCCGAGTGGAGATCATGGTGAA  782

Query  888  GGCCAAGGGGCAGTTTAAGAAACAGTCAGTGGCCAACGGTGTGGAGATATCTGTGCCTGTACCCAGCGATGCCG  961
            |||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||.||.|||||.||.||||||||.||.||.||.|||||.|
Sbjct  783  GGCCAAGGGTCAGTTTAAGAAGCAGTCGGTGGCCAATGGCGTGGAAATCTCTGTGCCCGTTCCTAGTGATGCAG  856

Query  962  ACTCCCCCAGATTCAAGACCAGTGTGGGCAGCGCCAAGTATGTGCCGGAGAGAAACGTCGTGATTTGGAGTATT  1035
            ||||.||..|.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||..||.||.||.||.|||||.||.
Sbjct  857  ACTCTCCGCGCTTCAAGACCAGTGTGGGCAGTGCCAAGTATGTGCCTGAGAAGAATGTTGTCATCTGGAGCATC  930

Query 1036  AAGTCTTTCCCGGGGGGCAAGGAGTACTTGATGCGAGCCCACTTTGGCCTCCCCAGTGTGGAAAAGGAAGAGGT  1109
            |||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||..||.|||||
Sbjct  931  AAGTCATTCCCTGGGGGAAAGGAGTACTTGATGCGTGCCCACTTTGGCCTCCCCAGCGTGGAAACTGAGGAGGT  1004

Query 1110  GGAGGGCCGGCCCCCCATCGGGGTCAAGTTTGAGATCCCCTACTTCACCGTCTCTGGGATCCAGGTCCGATACA  1183
            .||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||.|||||.|||||||||||.||||
Sbjct 1005  AGAGGGCCGACCACCCATCGGGGTCAAGTTTGAGATTCCATACTTTACCGTTTCTGGCATCCAGGTCCGTTACA  1078

Query 1184  TGAAGATCATTGAGAAAAGTGGTTACCAGGCCCTGCCCTGGGTTCGCTACATCACCCAGAGTGGCGATTACCAA  1257
            ||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||.|||||.|||
Sbjct 1079  TGAAGATCATCGAGAAAAGTGGGTACCAGGCCCTGCCCTGGGTCCGTTACATCACGCAGAGTGGTGATTATCAA  1152

Query 1258  TTTCGTCCCAGC  1269
            .|||||.|||||
Sbjct 1153  CTTCGTACCAGC  1164