Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000466644
• Subject: XM_024451304.1
• Aligned Length: 1515
• Identities: 1266
• Gaps: 246

Alignment

Query    1  ATGTCCGCCTCGGCTGTCTTCATTCTGGACGTTAAGGGCAAGCCATTGATCAGCCGCAACTACAAGGGCGATGT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTCCGCCTCGGCTGTCTTCATTCTGGACGTTAAGGGCAAGCCATTGATCAGCCGCAACTACAAGGGCGATGT  74

Query   75  GGCCATGAGCAAGATTGAGCACTTCATGCCTTTGCTGGTACAGCGGGAGGAGGAAGGCGCCCTGGCCCCGCTGC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGCCATGAGCAAGATTGAGCACTTCATGCCTTTGCTGGTACAGCGGGAGGAGGAAGGCGCCCTGGCCCCGCTGC  148

Query  149  TGAGCCACGGCCAGGTCCACTTCCTATGGATCAAACACAGCAACCTCTACT-----------------------  199
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                       
Sbjct  149  TGAGCCACGGCCAGGTCCACTTCCTATGGATCAAACACAGCAACCTCTACTGTATCCACCCCACGTGGTGTCCC  222

Query  200  --------------------------------------------------------------------------  199
                                                                                      
Sbjct  223  TGGAGGTGGGTGTGGGGGCTGTCGGCGATGGTGGCAGCTCAGGCCAAGAGAGGGTGGGCTGAGGACAGGAGTTG  296

Query  200  --------------------------------------------------------------------------  199
                                                                                      
Sbjct  297  CACCGCACATCTCTGTGGCTTAGGCTGGGGGGCAGGGGCAGGTAGAGATGAGGGTGGTGGCAAGGGACAGGGTG  370

Query  200  ---------------------------------------------------------------------TGGTG  204
                                                                                 |||||
Sbjct  371  GAGGTTCGGGGTCTGTATTCCATTTACTTCTCCATAAATGGCACCTTTTCCTTAACCTTGCTGCCCCAGTGGTG  444

Query  205  GCCACCACATCGAAGAATGCCAATGCCTCCCTGGTGTACTCCTTCCTGTATAAGACAATAGAGGTATTCTGCGA  278
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GCCACCACATCGAAGAATGCCAATGCCTCCCTGGTGTACTCCTTCCTGTATAAGACAATAGAGGTATTCTGCGA  518

Query  279  ATACTTCAAGGAGCTGGAGGAGGAGAGCATCCGGGACAACTTTGTCATCGTCTACGAGTTGCTGGACGAGCTCA  352
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  ATACTTCAAGGAGCTGGAGGAGGAGAGCATCCGGGACAACTTTGTCATCGTCTACGAGTTGCTGGACGAGCTCA  592

Query  353  TGGACTTTGGCTTCCCGCAGACCACCGACAGCAAGATCCTGCAGGAGTACATCACTCAGCAGAGCAACAAGCTG  426
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TGGACTTTGGCTTCCCGCAGACCACCGACAGCAAGATCCTGCAGGAGTACATCACTCAGCAGAGCAACAAGCTG  666

Query  427  GAGACGGGCAAGTCACGGGTGCCACCCACTGTCACCAACGCTGTGTCCTGGCGCTCCGAGGGTATCAAGTATAA  500
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GAGACGGGCAAGTCACGGGTGCCACCCACTGTCACCAACGCTGTGTCCTGGCGCTCCGAGGGTATCAAGTATAA  740

Query  501  GAAGAACGAGGTCTTCATTGATGTCATAGAGTCTGTCAACCTGCTGGTCAATGCCAACGGCAGCGTCCTTCTGA  574
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GAAGAACGAGGTCTTCATTGATGTCATAGAGTCTGTCAACCTGCTGGTCAATGCCAACGGCAGCGTCCTTCTGA  814

Query  575  GCGAAATCGTCGGTACCATCAAGCTCAAGGTGTTTCTGTCGGGAATGCCAGAGCTGCGGCTGGGCCTCAATGAC  648
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GCGAAATCGTCGGTACCATCAAGCTCAAGGTGTTTCTGTCAGGAATGCCAGAGCTGCGGCTGGGCCTCAATGAC  888

Query  649  CGCGTGCTCTTCGAGCTCACTGGCC------GCAGCAAGAACAAATCAGTAGAGCTGGAGGATGTAAAATTCCA  716
            |||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CGCGTGCTCTTCGAGCTCACTGGCCTTTCAGGCAGCAAGAACAAATCAGTAGAGCTGGAGGATGTAAAATTCCA  962

Query  717  CCAGTGCGTGCGGCTCTCTCGCTTTGACAACGACCGCACCATCTCCTTCATCCCGCCTGATGGTGACTTTGAGC  790
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CCAGTGCGTGCGGCTCTCTCGCTTTGACAACGACCGCACCATCTCCTTCATCCCGCCTGATGGTGACTTTGAGC  1036

Query  791  TCATGTCATACCGCCTCAGCACCCAGGTCAAGCCACTGATCTGGATTGAGTCTGTCATTGAGAAGTTCTCCCAC  864
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TCATGTCATACCGCCTCAGCACCCAGGTCAAGCCACTGATCTGGATTGAGTCTGTCATTGAGAAGTTCTCCCAC  1110

Query  865  AGCCGCGTGGAGATCATGGTCAAGGCCAAGGGGCAGTTTAAGAAACAGTCAGTGGCCAACGGTGTGGAGATATC  938
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  AGCCGCGTGGAGATCATGGTCAAGGCCAAGGGGCAGTTTAAGAAACAGTCAGTGGCCAACGGTGTGGAGATATC  1184

Query  939  TGTGCCTGTACCCAGCGATGCCGACTCCCCCAGATTCAAGACCAGTGTGGGCAGCGCCAAGTATGTGCCGGAGA  1012
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TGTGCCTGTACCCAGCGATGCCGACTCCCCCAGATTCAAGACCAGTGTGGGCAGCGCCAAGTATGTGCCGGAGA  1258

Query 1013  GAAACGTCGTGATTTGGAGTATTAAGTCTTTCCCGGGGGGCAAGGAGTACTTGATGCGAGCCCACTTTGGCCTC  1086
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  GAAACGTCGTGATTTGGAGTATTAAGTCTTTCCCGGGGGGCAAGGAGTACTTGATGCGAGCCCACTTTGGCCTC  1332

Query 1087  CCCAGTGTGGAAAAGGAAGAGGTGGAGGGCCGGCCCCCCATCGGGGTCAAGTTTGAGATCCCCTACTTCACCGT  1160
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CCCAGTGTGGAAAAGGAAGAGGTGGAGGGCCGGCCCCCCATCGGGGTCAAGTTTGAGATCCCCTACTTCACCGT  1406

Query 1161  CTCTGGGATCCAGGTCCGATACATGAAGATCATTGAGAAAAGTGGTTACCAGGCCCTGCCCTGGGTTCGCTACA  1234
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CTCTGGGATCCAGGTCCGATACATGAAGATCATTGAGAAAAGTGGTTACCAGGCCCTGCCCTGGGTTCGCTACA  1480

Query 1235  TCACCCAGAGTGGCGATTACCAATTTCGTCCCAGC  1269
            |||||||||||||||||||||||.|||||.|||||
Sbjct 1481  TCACCCAGAGTGGCGATTACCAACTTCGTACCAGC  1515