Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000466676
• Subject: NM_001321350.2
• Aligned Length: 2841
• Identities: 2442
• Gaps: 399

Alignment

Query    1  ATGTCTTGGCTGCGTTTCTGGGGCCCATGGCCCCTCCTTACGTGGCAACTATTGTCTTTACTAGTCAAGGAGGC  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  TCAGCCTCTGGTGTGGGTCAAGGACCCGCTCCAGCTGACCTCTAACCCCCTGGGGCCACCTGAGCCCTGGTCTT  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  CCCGCTCCTCCCATCTCCCATGGGAATCTCCCCATGCACCTGCTCCCCCAGCAGCCCCGGGGGACTTTGATTAC  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  CTGGGGCCCTCTGCTTCTTCGCAGATGTCAGCCCTGCCTCAGGAACCAACTGAAAATTTGGCTCCATTCCTGAA  296
                                    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ------------------------ATGTCAGCCCTGCCTCAGGAACCAACTGAAAATTTGGCTCCATTCCTGAA  50

Query  297  GGAATTGGATTCAGCTGGAGAGCTGCCCCTGGGGCCAGAGCCGTTCTTGGCTGCACATCAGGACTTAAATGACA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   51  GGAATTGGATTCAGCTGGAGAGCTGCCCCTGGGGCCAGAGCCGTTCTTGGCTGCACATCAGGACTTAAATGACA  124

Query  371  AGCGGACTCCAGAAGAAAGGCTCCCAGAGGTGGTTCCGCTTCTCAACCGGGATCAGAACCAGGCCCTAGTTCAG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  125  AGCGGACTCCAGAAGAAAGGCTCCCAGAGGTGGTTCCGCTTCTCAACCGGGATCAGAACCAGGCCCTAGTTCAG  198

Query  445  CTTCCTCGCCTCAAGTGGGTTCAAACTACAGATCTAGATCGGGCTGCAGGTCATCAGGCAGATGAAATACTTGT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  199  CTTCCTCGCCTCAAGTGGGTTCAAACTACAGATCTAGATCGGGCTGCAGGTCATCAGGCAGATGAAATACTTGT  272

Query  519  TCCACTAGACAGTAAGGTTTCAAGACCAACCAAATTTGTTGTTTCGCCCAAGAACCTGAAGAAAGATCTAGCTG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  273  TCCACTAGACAGTAAGGTTTCAAGACCAACCAAATTTGTTGTTTCGCCCAAGAACCTGAAGAAAGATCTAGCTG  346

Query  593  AACGTTGGAGCCTTCCTGAGATTGTTGGGATTCCACACCAATTATCCAAACCTCAGCGTCAGAAACAGACTTTG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  347  AACGTTGGAGCCTTCCTGAGATTGTTGGGATTCCACACCAATTATCCAAACCTCAGCGTCAGAAACAGACTTTG  420

Query  667  CCAGATGATTATTTGAGTATGGACACACTGTATCCCGGCAGCCTACCTCCAGAACTCCGGGTGAACGCAGATGA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  421  CCAGATGATTATTTGAGTATGGACACACTGTATCCCGGCAGCCTACCTCCAGAACTCCGGGTGAACGCAGATGA  494

Query  741  GCCTCCAGGGCCTCCTGAGCAAGTTGGACTTTCTCAATTCCATCTAGAGCCCAAAAGTCAAAATCCAGAGACCC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  495  GCCTCCAGGGCCTCCTGAGCAAGTTGGACTTTCTCAATTCCATCTAGAGCCCAAAAGTCAAAATCCAGAGACCC  568

Query  815  TTGAAGACATCCAGTCCTCTTCACTCCAGGAAGAAGCCCCAGCGCAGCTTCTACAGCTCCCTCAGGAGGTAGAA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  569  TTGAAGACATCCAGTCCTCTTCACTCCAGGAAGAAGCCCCAGCGCAGCTTCTACAGCTCCCTCAGGAGGTAGAA  642

Query  889  CCTTCAACCCAGCAGGAGGCCCCAGCTCTGCCTCCAGAGTCCTCTATGGAGAGTCTAGCTCAAACTCCACTGAA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  643  CCTTCAACCCAGCAGGAGGCCCCAGCTCTGCCTCCAGAGTCCTCTATGGAGAGTCTAGCTCAAACTCCACTGAA  716

Query  963  TCATGAAGTGACAGTTCAACCTCCAGGTGAGGATCAAGCTCATTATAATTTGCCCAAGTTTACAGTCAAACCTG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  717  TCATGAAGTGACAGTTCAACCTCCAGGTGAGGATCAAGCTCATTATAATTTGCCCAAGTTTACAGTCAAACCTG  790

Query 1037  CAGATGTGGAGGTTACCATGACTTCAGAGCCTAAAAATGAGACAGAATCTACCCAAGCCCAGCAGGAGGCCCCA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  791  CAGATGTGGAGGTTACCATGACTTCAGAGCCTAAAAATGAGACAGAATCTACCCAAGCCCAGCAGGAGGCCCCA  864

Query 1111  ATTCAGCCTCCCGAGGAGGCGGAACCTTCTTCTACAGCCCTGAGGACTACAGATCCTCCTCCAGAACACCCTGA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  865  ATTCAGCCTCCCGAGGAGGCGGAACCTTCTTCTACAGCCCTGAGGACTACAGATCCTCCTCCAGAACACCCTGA  938

Query 1185  GGTGACACTTCCACCTTCAGACAAGGGTCAGGCTCAGCATTCACACCTGACTGAAGCCACAGTTCAACCTCTGG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  939  GGTGACACTTCCACCTTCAGACAAGGGTCAGGCTCAGCATTCACACCTGACTGAAGCCACAGTTCAACCTCTGG  1012

Query 1259  ACCTGGAGCTTAGCATAACTACAGAGCCTACTACAGAGGTTAAACCGTCTCCAACCACGGAGGAAACCTCAGCT  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1013  ACCTGGAGCTTAGCATAACTACAGAGCCTACTACAGAGGTTAAACCGTCTCCAACCACGGAGGAAACCTCAGCT  1086

Query 1333  CAGCCTCCAGACCCGGGGCTTGCCATAACTCCAGAACCCACTACAGAGATTGGACATTCCACAGCCCTGGAGAA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1087  CAGCCTCCAGACCCGGGGCTTGCCATAACTCCAGAACCCACTACAGAGATTGGACATTCCACAGCCCTGGAGAA  1160

Query 1407  GACTAGAGCTCCTCATCCAGACCAGGTTCAGACTCTGCATCGAAGCCTGACTGAAGTCACAGGTCCACCTACAA  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1161  GACTAGAGCTCCTCATCCAGACCAGGTTCAGACTCTGCATCGAAGCCTGACTGAAGTCACAGGTCCACCTACAA  1234

Query 1481  AGTTAGAATCTTCGCAGGATTCATTGGTGCAGTCTGAAACTGCACCAGAGGAACAGAAGGCCTCCACAAGCACC  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1235  AGTTAGAATCTTCGCAGGATTCATTGGTGCAGTCTGAAACTGCACCAGAGGAACAGAAGGCCTCCACAAGCACC  1308

Query 1555  AACATATGTGAGCTCTGCACCTGCGGAGATGAGACTCTGTCATGTGTTGGTCTCAGCCCAAAGCAGAGGCTCCG  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1309  AACATATGTGAGCTCTGCACCTGCGGAGATGAGACTCTGTCATGTGTTGGTCTCAGCCCAAAGCAGAGGCTCCG  1382

Query 1629  CCAAGTGCCTGTGCCAGAGCCCGACACCTACAATGGCATCTTCACCACCTTAAATTTCCAAGGAAACTATATTT  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1383  CCAAGTGCCTGTGCCAGAGCCCGACACCTACAATGGCATCTTCACCACCTTAAATTTCCAAGGAAACTATATTT  1456

Query 1703  CATACCTTGATGGAAATGTATGGAAAGCATACAGTTGGACCGAGAAACTAATTCTCAGTGAAAATTATTTGACT  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1457  CATACCTTGATGGAAATGTATGGAAAGCATACAGTTGGACCGAGAAACTAATTCTCAGTGAAAATTATTTGACT  1530

Query 1777  GAATTACCTAAGGATTCATTTGAAGGCCTGCTATACCTCCAGTAT-----------------------------  1821
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                             
Sbjct 1531  GAATTACCTAAGGATTCATTTGAAGGCCTGCTATACCTCCAGTATTTAGATTTATCCTGCAATAAAATACGATA  1604

Query 1822  --------------------------------------------------------------------------  1821
                                                                                      
Sbjct 1605  TATTGAAAGACAAACATTTGAATCACTACCATTTTTGCAGTATATAAATCTGGGCTGCAATTTAATTACAAAAC  1678

Query 1822  --------------------------------------------------TTAATTCTCAATCGCAATCCTCTG  1845
                                                              ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1679  TGAGCCTTGGAACATTTCAGGCCTGGCACGGAATGCAGTTTTTACACAACTTAATTCTCAATCGCAATCCTCTG  1752

Query 1846  ACTACTGTCGAAGATCCATATCTCTTTGAACTGCCGGCATTAAAATATCTAGACATGGGAACAACACACATCAC  1919
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1753  ACTACTGTCGAAGATCCATATCTCTTTGAACTGCCGGCATTAAAATATCTAGACATGGGAACAACACACATCAC  1826

Query 1920  ACTTACAACACTTAAGAACATTCTCACGATGACTGTTGAACTGGAAAAACTGATCTTACCTAGCCATATGGCCT  1993
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1827  ACTTACAACACTTAAGAACATTCTCACGATGACTGTTGAACTGGAAAAACTGATCTTACCTAGCCATATGGCCT  1900

Query 1994  GCTGCCTCTGCCAATTTAAAAATAGCATTGAGGCTGTCTGCAAGACAGTCAAGCTGCATTGCAACACTGCATGT  2067
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1901  GCTGCCTCTGCCAATTTAAAAATAGCATTGAGGCTGTCTGCAAGACAGTCAAGCTGCATTGCAACACTGCATGT  1974

Query 2068  CTGACTAACAGCATACATTGTCCTGAAGAAGCATCTGTAGGGAATCCAGAAGGAGCGTTCATGAAGATGTTACA  2141
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1975  CTGACTAACAGCATACATTGTCCTGAAGAAGCATCTGTAGGGAATCCAGAAGGAGCGTTCATGAAGATGTTACA  2048

Query 2142  AGCCCGGAAGCAGCACATGAGCACTCAGCTGACTATTGAGTCGGAGGCGCCCTCAGACAGCAGTGGCATCAACT  2215
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2049  AGCCCGGAAGCAGCACATGAGCACTCAGCTGACTATTGAGTCGGAGGCGCCCTCAGACAGCAGTGGCATCAACT  2122

Query 2216  TGTCAGGCTTTGGGGGTGATCAGCTTGAAATTCAGCTAACCGAGCAGCTACGGTCCCTCATCCCCAACGAGGAT  2289
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2123  TGTCAGGCTTTGGGGGTGATCAGCTTGAAATTCAGCTAACCGAGCAGCTACGGTCCCTCATCCCCAACGAGGAT  2196

Query 2290  GTGAGAAAGTTCATGTCTCATGTTATCCGGACCTTGAAAATGGAATGTTCAGAAACACATGTGCAAGGGAGCTG  2363
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2197  GTGAGAAAGTTCATGTCTCATGTTATCCGGACCTTGAAAATGGAATGTTCAGAAACACATGTGCAAGGGAGCTG  2270

Query 2364  TGCCAAGCTCATGTTGCGAACAGGCCTCCTGATGAAGCTTCTCAGCGAGCAGCAGGAAGCAAAGGCATTGAATG  2437
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2271  TGCCAAGCTCATGTTGCGAACAGGCCTCCTGATGAAGCTTCTCAGCGAGCAGCAGGAAGCAAAGGCATTGAATG  2344

Query 2438  TAGAATGGGATACGGACCAACAAAAAACAAATTATATTAATGAGAACATGGAACAGAATGAACAGAAAGAGCAG  2511
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2345  TAGAATGGGATACGGACCAACAAAAAACAAATTATATTAATGAGAACATGGAACAGAATGAACAGAAAGAGCAG  2418

Query 2512  AAGTCAAGTGAGCTCATGAAAGAAGTTCCAGGAGATGACTATAAGAACAAACTCATCTTCGCAATATCTGTGAC  2585
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2419  AAGTCAAGTGAGCTCATGAAAGAAGTTCCAGGAGATGACTATAAGAACAAACTCATCTTCGCAATATCTGTGAC  2492

Query 2586  TGTAATACTAATAATTTTGATTATAATTTTTTGTCTTATAGAGGTGAATTCACATAAAAGGGCATCAGAAAAAT  2659
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2493  TGTAATACTAATAATTTTGATTATAATTTTTTGTCTTATAGAGGTGAATTCACATAAAAGGGCATCAGAAAAAT  2566

Query 2660  ACAAAGACAACCCATCAATATCAGGAGCC  2688
            |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2567  ACAAAGACAACCCATCAATATCAGGAGCC  2595