Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000466676
- Subject:
- NM_052888.3
- Aligned Length:
- 2841
- Identities:
- 2688
- Gaps:
- 153
Alignment
Query 1 ATGTCTTGGCTGCGTTTCTGGGGCCCATGGCCCCTCCTTACGTGGCAACTATTGTCTTTACTAGTCAAGGAGGC 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGTCTTGGCTGCGTTTCTGGGGCCCATGGCCCCTCCTTACGTGGCAACTATTGTCTTTACTAGTCAAGGAGGC 74
Query 75 TCAGCCTCTGGTGTGGGTCAAGGACCCGCTCCAGCTGACCTCTAACCCCCTGGGGCCACCTGAGCCCTGGTCTT 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 TCAGCCTCTGGTGTGGGTCAAGGACCCGCTCCAGCTGACCTCTAACCCCCTGGGGCCACCTGAGCCCTGGTCTT 148
Query 149 CCCGCTCCTCCCATCTCCCATGGGAATCTCCCCATGCACCTGCTCCCCCAGCAGCCCCGGGGGACTTTGATTAC 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 CCCGCTCCTCCCATCTCCCATGGGAATCTCCCCATGCACCTGCTCCCCCAGCAGCCCCGGGGGACTTTGATTAC 222
Query 223 CTGGGGCCCTCTGCTTCTTCGCAGATGTCAGCCCTGCCTCAGGAACCAACTGAAAATTTGGCTCCATTCCTGAA 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 CTGGGGCCCTCTGCTTCTTCGCAGATGTCAGCCCTGCCTCAGGAACCAACTGAAAATTTGGCTCCATTCCTGAA 296
Query 297 GGAATTGGATTCAGCTGGAGAGCTGCCCCTGGGGCCAGAGCCGTTCTTGGCTGCACATCAGGACTTAAATGACA 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GGAATTGGATTCAGCTGGAGAGCTGCCCCTGGGGCCAGAGCCGTTCTTGGCTGCACATCAGGACTTAAATGACA 370
Query 371 AGCGGACTCCAGAAGAAAGGCTCCCAGAGGTGGTTCCGCTTCTCAACCGGGATCAGAACCAGGCCCTAGTTCAG 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 AGCGGACTCCAGAAGAAAGGCTCCCAGAGGTGGTTCCGCTTCTCAACCGGGATCAGAACCAGGCCCTAGTTCAG 444
Query 445 CTTCCTCGCCTCAAGTGGGTTCAAACTACAGATCTAGATCGGGCTGCAGGTCATCAGGCAGATGAAATACTTGT 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 CTTCCTCGCCTCAAGTGGGTTCAAACTACAGATCTAGATCGGGCTGCAGGTCATCAGGCAGATGAAATACTTGT 518
Query 519 TCCACTAGACAGTAAGGTTTCAAGACCAACCAAATTTGTTGTTTCGCCCAAGAACCTGAAGAAAGATCTAGCTG 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 TCCACTAGACAGTAAGGTTTCAAGACCAACCAAATTTGTTGTTTCGCCCAAGAACCTGAAGAAAGATCTAGCTG 592
Query 593 AACGTTGGAGCCTTCCTGAGATTGTTGGGATTCCACACCAATTATCCAAACCTCAGCGTCAGAAACAGACTTTG 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 AACGTTGGAGCCTTCCTGAGATTGTTGGGATTCCACACCAATTATCCAAACCTCAGCGTCAGAAACAGACTTTG 666
Query 667 CCAGATGATTATTTGAGTATGGACACACTGTATCCCGGCAGCCTACCTCCAGAACTCCGGGTGAACGCAGATGA 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 CCAGATGATTATTTGAGTATGGACACACTGTATCCCGGCAGCCTACCTCCAGAACTCCGGGTGAACGCAGATGA 740
Query 741 GCCTCCAGGGCCTCCTGAGCAAGTTGGACTTTCTCAATTCCATCTAGAGCCCAAAAGTCAAAATCCAGAGACCC 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 GCCTCCAGGGCCTCCTGAGCAAGTTGGACTTTCTCAATTCCATCTAGAGCCCAAAAGTCAAAATCCAGAGACCC 814
Query 815 TTGAAGACATCCAGTCCTCTTCACTCCAGGAAGAAGCCCCAGCGCAGCTTCTACAGCTCCCTCAGGAGGTAGAA 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 TTGAAGACATCCAGTCCTCTTCACTCCAGGAAGAAGCCCCAGCGCAGCTTCTACAGCTCCCTCAGGAGGTAGAA 888
Query 889 CCTTCAACCCAGCAGGAGGCCCCAGCTCTGCCTCCAGAGTCCTCTATGGAGAGTCTAGCTCAAACTCCACTGAA 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 CCTTCAACCCAGCAGGAGGCCCCAGCTCTGCCTCCAGAGTCCTCTATGGAGAGTCTAGCTCAAACTCCACTGAA 962
Query 963 TCATGAAGTGACAGTTCAACCTCCAGGTGAGGATCAAGCTCATTATAATTTGCCCAAGTTTACAGTCAAACCTG 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 TCATGAAGTGACAGTTCAACCTCCAGGTGAGGATCAAGCTCATTATAATTTGCCCAAGTTTACAGTCAAACCTG 1036
Query 1037 CAGATGTGGAGGTTACCATGACTTCAGAGCCTAAAAATGAGACAGAATCTACCCAAGCCCAGCAGGAGGCCCCA 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 CAGATGTGGAGGTTACCATGACTTCAGAGCCTAAAAATGAGACAGAATCTACCCAAGCCCAGCAGGAGGCCCCA 1110
Query 1111 ATTCAGCCTCCCGAGGAGGCGGAACCTTCTTCTACAGCCCTGAGGACTACAGATCCTCCTCCAGAACACCCTGA 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 ATTCAGCCTCCCGAGGAGGCGGAACCTTCTTCTACAGCCCTGAGGACTACAGATCCTCCTCCAGAACACCCTGA 1184
Query 1185 GGTGACACTTCCACCTTCAGACAAGGGTCAGGCTCAGCATTCACACCTGACTGAAGCCACAGTTCAACCTCTGG 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 GGTGACACTTCCACCTTCAGACAAGGGTCAGGCTCAGCATTCACACCTGACTGAAGCCACAGTTCAACCTCTGG 1258
Query 1259 ACCTGGAGCTTAGCATAACTACAGAGCCTACTACAGAGGTTAAACCGTCTCCAACCACGGAGGAAACCTCAGCT 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 ACCTGGAGCTTAGCATAACTACAGAGCCTACTACAGAGGTTAAACCGTCTCCAACCACGGAGGAAACCTCAGCT 1332
Query 1333 CAGCCTCCAGACCCGGGGCTTGCCATAACTCCAGAACCCACTACAGAGATTGGACATTCCACAGCCCTGGAGAA 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 CAGCCTCCAGACCCGGGGCTTGCCATAACTCCAGAACCCACTACAGAGATTGGACATTCCACAGCCCTGGAGAA 1406
Query 1407 GACTAGAGCTCCTCATCCAGACCAGGTTCAGACTCTGCATCGAAGCCTGACTGAAGTCACAGGTCCACCTACAA 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 GACTAGAGCTCCTCATCCAGACCAGGTTCAGACTCTGCATCGAAGCCTGACTGAAGTCACAGGTCCACCTACAA 1480
Query 1481 AGTTAGAATCTTCGCAGGATTCATTGGTGCAGTCTGAAACTGCACCAGAGGAACAGAAGGCCTCCACAAGCACC 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 AGTTAGAATCTTCGCAGGATTCATTGGTGCAGTCTGAAACTGCACCAGAGGAACAGAAGGCCTCCACAAGCACC 1554
Query 1555 AACATATGTGAGCTCTGCACCTGCGGAGATGAGACTCTGTCATGTGTTGGTCTCAGCCCAAAGCAGAGGCTCCG 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 AACATATGTGAGCTCTGCACCTGCGGAGATGAGACTCTGTCATGTGTTGGTCTCAGCCCAAAGCAGAGGCTCCG 1628
Query 1629 CCAAGTGCCTGTGCCAGAGCCCGACACCTACAATGGCATCTTCACCACCTTAAATTTCCAAGGAAACTATATTT 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 CCAAGTGCCTGTGCCAGAGCCCGACACCTACAATGGCATCTTCACCACCTTAAATTTCCAAGGAAACTATATTT 1702
Query 1703 CATACCTTGATGGAAATGTATGGAAAGCATACAGTTGGACCGAGAAACTAATTCTCAGTGAAAATTATTTGACT 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 CATACCTTGATGGAAATGTATGGAAAGCATACAGTTGGACCGAGAAACTAATTCTCAGTGAAAATTATTTGACT 1776
Query 1777 GAATTACCTAAGGATTCATTTGAAGGCCTGCTATACCTCCAGTAT----------------------------- 1821
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 GAATTACCTAAGGATTCATTTGAAGGCCTGCTATACCTCCAGTATTTAGATTTATCCTGCAATAAAATACGATA 1850
Query 1822 -------------------------------------------------------------------------- 1821
Sbjct 1851 TATTGAAAGACAAACATTTGAATCACTACCATTTTTGCAGTATATAAATCTGGGCTGCAATTTAATTACAAAAC 1924
Query 1822 --------------------------------------------------TTAATTCTCAATCGCAATCCTCTG 1845
||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 TGAGCCTTGGAACATTTCAGGCCTGGCACGGAATGCAGTTTTTACACAACTTAATTCTCAATCGCAATCCTCTG 1998
Query 1846 ACTACTGTCGAAGATCCATATCTCTTTGAACTGCCGGCATTAAAATATCTAGACATGGGAACAACACACATCAC 1919
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 ACTACTGTCGAAGATCCATATCTCTTTGAACTGCCGGCATTAAAATATCTAGACATGGGAACAACACACATCAC 2072
Query 1920 ACTTACAACACTTAAGAACATTCTCACGATGACTGTTGAACTGGAAAAACTGATCTTACCTAGCCATATGGCCT 1993
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073 ACTTACAACACTTAAGAACATTCTCACGATGACTGTTGAACTGGAAAAACTGATCTTACCTAGCCATATGGCCT 2146
Query 1994 GCTGCCTCTGCCAATTTAAAAATAGCATTGAGGCTGTCTGCAAGACAGTCAAGCTGCATTGCAACACTGCATGT 2067
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147 GCTGCCTCTGCCAATTTAAAAATAGCATTGAGGCTGTCTGCAAGACAGTCAAGCTGCATTGCAACACTGCATGT 2220
Query 2068 CTGACTAACAGCATACATTGTCCTGAAGAAGCATCTGTAGGGAATCCAGAAGGAGCGTTCATGAAGATGTTACA 2141
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221 CTGACTAACAGCATACATTGTCCTGAAGAAGCATCTGTAGGGAATCCAGAAGGAGCGTTCATGAAGATGTTACA 2294
Query 2142 AGCCCGGAAGCAGCACATGAGCACTCAGCTGACTATTGAGTCGGAGGCGCCCTCAGACAGCAGTGGCATCAACT 2215
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295 AGCCCGGAAGCAGCACATGAGCACTCAGCTGACTATTGAGTCGGAGGCGCCCTCAGACAGCAGTGGCATCAACT 2368
Query 2216 TGTCAGGCTTTGGGGGTGATCAGCTTGAAATTCAGCTAACCGAGCAGCTACGGTCCCTCATCCCCAACGAGGAT 2289
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369 TGTCAGGCTTTGGGGGTGATCAGCTTGAAATTCAGCTAACCGAGCAGCTACGGTCCCTCATCCCCAACGAGGAT 2442
Query 2290 GTGAGAAAGTTCATGTCTCATGTTATCCGGACCTTGAAAATGGAATGTTCAGAAACACATGTGCAAGGGAGCTG 2363
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443 GTGAGAAAGTTCATGTCTCATGTTATCCGGACCTTGAAAATGGAATGTTCAGAAACACATGTGCAAGGGAGCTG 2516
Query 2364 TGCCAAGCTCATGTTGCGAACAGGCCTCCTGATGAAGCTTCTCAGCGAGCAGCAGGAAGCAAAGGCATTGAATG 2437
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517 TGCCAAGCTCATGTTGCGAACAGGCCTCCTGATGAAGCTTCTCAGCGAGCAGCAGGAAGCAAAGGCATTGAATG 2590
Query 2438 TAGAATGGGATACGGACCAACAAAAAACAAATTATATTAATGAGAACATGGAACAGAATGAACAGAAAGAGCAG 2511
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591 TAGAATGGGATACGGACCAACAAAAAACAAATTATATTAATGAGAACATGGAACAGAATGAACAGAAAGAGCAG 2664
Query 2512 AAGTCAAGTGAGCTCATGAAAGAAGTTCCAGGAGATGACTATAAGAACAAACTCATCTTCGCAATATCTGTGAC 2585
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665 AAGTCAAGTGAGCTCATGAAAGAAGTTCCAGGAGATGACTATAAGAACAAACTCATCTTCGCAATATCTGTGAC 2738
Query 2586 TGTAATACTAATAATTTTGATTATAATTTTTTGTCTTATAGAGGTGAATTCACATAAAAGGGCATCAGAAAAAT 2659
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2739 TGTAATACTAATAATTTTGATTATAATTTTTTGTCTTATAGAGGTGAATTCACATAAAAGGGCATCAGAAAAAT 2812
Query 2660 ACAAAGACAACCCATCAATATCAGGAGCC 2688
|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2813 ACAAAGACAACCCATCAATATCAGGAGCC 2841