Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000466678
- Subject:
- NM_001370539.1
- Aligned Length:
- 2247
- Identities:
- 1486
- Gaps:
- 759
Alignment
Query 1 ATGGCCAGCAGCCAAGGGGGACCAGCCCTCCTCCAGCCTGTTCCTGCTGATGTGGTCAGCAGCCAGGGGGTACC 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 ATCCATCCTCCAGCCAGCTCCTGCTGAGGTGATCAGCAGCCAAGCGACACCACCCCTGCTCCAGCCTGCTCCGC 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 AACTGTCTGTTGACCTGACAGAAGTGGAGGTCTTGGGAGAAGACACTGTGGAGAACATCAATCCAAGAACTTCA 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 GAACAACATAGGCAGGGATCTGATGGTAATCACACCATCCCAGCATCTTCGTTGCATTCAATGACCAACTTCAT 296
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 297 CAGCGGACTGCAGAGACTTCATGGCATGCTGGAATTCCTGAGACCTTCATCTTCAAACCACAGTGTAGGGCCAA 370
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 371 TGAGAACAAGAAGGAGGGTATCTGCTTCACGGAGGGCAAGAGCCGGAGGGTCTCAGAGGACAGACAGTGCCAGG 444
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 445 TTGAGAGCACCATTGGATGCTTACTTTCAGGTGAGCAGGACCCAGCCTGACTTGCCAGCTACCACTTATGATTC 518
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 519 AGAGACTAGGAATCCTGTATCTGAAGAGTTGCAGGTGTCTAGTAGTTCTGATTCTGACAGTGACAGCTCTGCAG 592
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 593 AGTATGGAGGGGTTGTTGACCAGGCAGAGGAATCTGGAGCTGTCATTTTAGAAGAGCAACTAGCAGGTGTCTCA 666
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 667 GCAGAGCAAGAAGTTACATGTATCGATGGAGGCAAGACCCTCCCCAAACAGCCATCTCCCCAGAAGTCTGAGCC 740
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 741 TCTGCTACCTTCTGCTTCTATGGATGAGGAAGAAGGGGACACTTGTACAATATGTCTGGAACAGTGGACCAATG 814
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 -------------------ATGGATGAGGAAGAAGGGGACACTTGTACAATATGTCTGGAACAGTGGACCAATG 55
Query 815 CTGGGGACCACCGGCTCTCAGCATTACGCTGTGGGCATCTCTTTGGGTATAGGTGCATTTCCACGTGGCTTAAA 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 56 CTGGGGACCACCGGCTCTCAGCATTACGCTGTGGGCATCTCTTTGGGTATAGGTGCATTTCCACGTGGCTTAAA 129
Query 889 GGACAAGTACGAAAATGTCCCCAGTGCAACAAGAAAGCCAGGCACAGTGACATTGTCGTCCTTTATGCCCGAAC 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 130 GGACAAGTACGAAAATGTCCCCAGTGCAACAAGAAAGCCAGGCACAGTGACATTGTCGTCCTTTATGCCCGAAC 203
Query 963 CCTGAGAGCTTTGGACACTAGTGAACAGGAGCGCATGAAAAGTTCCCTACTGAAGGAACAGATGCTAAGGAAAC 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 204 CCTGAGAGCTTTGGACACTAGTGAACAGGAGCGCATGAAAAGTTCCCTACTGAAGGAACAGATGCTAAGGAAAC 277
Query 1037 AGGCCGAGTTAGAATCAGCACAGTGCCGACTCCAACTGCAGGTCCTCACTGATAAGTGCACTAAGCTTCAAAGG 1110
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 278 AGGCCGAGTTAGAATCAGCACAGTGCCGACTCCAACTGCAGGTCCTCACTGATAAGTGCACTAGGCTTCAAAGG 351
Query 1111 CGTGTTCAGGACTTGCAAAAACTTACGTCACATCAAAGTCAGAATTTACAGCAACCCAGGGGCTCCCAAGCATG 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 352 CGTGTTCAGGACTTGCAAAAACTTACGTCACATCAAAGTCAGAATTTACAGCAACCCAGGGGCTCCCAAGCATG 425
Query 1185 GGTCCTGAGCTGCTCACCCTCCAGCCAGGGCCAGCACAAGCACAAGTACCACTTCCAAAAGACCTTCACAGTAT 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 426 GGTCCTGAGCTGCTCACCCTCCAGCCAGGGCCAGCACAAGCACAAGTACCACTTCCAAAAGACCTTCACAGTAT 499
Query 1259 CTCAGGCAGGAAACTGCCGGATCATGGCATACTGTGATGCTCTGAGCTGCCTGGTGATATCACAGCCTTCTCCT 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 500 CTCAGGCAGGAAACTGCCGGATCATGGCATACTGTGATGCTCTGAGCTGCCTGGTGATATCACAGCCTTCTCCT 573
Query 1333 CAGGCCTCTTTTCTTCCAGGCTTTGGTGTTAAGATGTTGAGTACTGCCAACATGAAGAGCAGTCAGTACATTCC 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 574 CAGGCCTCTTTTCTTCCAGGCTTTGGTGTTAAGATGTTGAGTACTGCCAACATGAAGAGCAGTCAGTACATTCC 647
Query 1407 GATGCATGGCAAACAGATCCGTGGACTGGCGTTTAGCAGTTACCTCAGAGGCTTGCTACTCTCTGCTTCCCTAG 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 648 GATGCATGGCAAACAGATCCGTGGACTGGCGTTTAGCAGTTACCTCAGAGGCTTGCTACTCTCTGCTTCCCTAG 721
Query 1481 ACAACACTATTAAACTGACCAGCCTGGAGACAAATACCGTGGTCCAGACTTATAATGCTGGACGTCCTGTCTGG 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 722 ACAACACTATTAAACTGACCAGCCTGGAGACAAATACCGTGGTCCAGACTTATAATGCTGGACGTCCTGTCTGG 795
Query 1555 AGCTGTTGCTGGTGTCTTGATGAGGCTAACTACATCTATGCTGGACTGGCCAATGGTTCAATTCTGGTATATGA 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 796 AGCTGTTGCTGGTGTCTTGATGAGGCTAACTACATCTATGCTGGACTGGCCAATGGTTCAATTCTGGTATATGA 869
Query 1629 CGTGCGAAACACGAGCAGTCATGTGCAGGAGTTAGTAGCTCAGAAAGCCAGATGCCCACTGGTCTCCCTGTCAT 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 870 CGTGCGAAACACGAGCAGTCATGTGCAGGAGTTAGTAGCTCAGAAAGCCAGATGCCCACTGGTCTCCCTGTCAT 943
Query 1703 ACATGCCCAGAGCTGCCTCAGCTGCATTTCCATATGGTGGGGTGCTGGCTGGAACCTTGGAGGATGCTTCATTC 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 944 ACATGCCCAGAGCTGCCTCAGCTGCATTTCCATATGGTGGGGTGCTGGCTGGAACCTTGGAGGATGCTTCATTC 1017
Query 1777 TGGGAACAGAAAATGGACTTTTCTCATTGGCCTCATGTGCTGCCCTTGGAGCCAGGGGGCTGCATAGACTTTCA 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1018 TGGGAACAGAAAATGGACTTTTCTCATTGGCCTCATGTGCTGCCCTTGGAGCCAGGGGGCTGCATAGACTTTCA 1091
Query 1851 GACAGAGAACAGCTCCCGGCACTGTCTTGTGACCTACAGGCCTGATAAAAATCACACCACCATACGAAGTGTGC 1924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1092 GACAGAGAACAGCTCCCGGCACTGTCTTGTGACCTACAGGCCTGATAAAAATCACACCACCATACGAAGTGTGC 1165
Query 1925 TGATGGAAATGTCCTACCGACTGGATGACACTGGAAATCCAATCTGCTCCTGCCAGCCTGTACATACATTTTTT 1998
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1166 TGATGGAAATGTCCTACCGACTGGATGACACTGGAAATCCAATCTGCTCCTGCCAGCCTGTACATACATTTTTT 1239
Query 1999 GGAGGACCTACTTGCAAACTATTGACCAAAAATGCCATTTTCCAAAGCCCAGAGAATGATGGCAACATCCTGGT 2072
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1240 GGAGGACCTACTTGCAAACTATTGACCAAAAATGCCATTTTCCAAAGCCCAGAGAATGATGGCAACATCCTGGT 1313
Query 2073 GTGTACTGGGGATGAAGCAGCAAATTCTGCCCTGCTGTGGGATGCTGCCAGTGGCTCGTTGCTCCAGGACCTAC 2146
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1314 GTGTACTGGGGATGAAGCAGCAAATTCTGCCCTGCTGTGGGATGCTGCCAGTGGCTCGTTGCTCCAGGACCTAC 1387
Query 2147 AGACCGATCAGCCTGTGTTGGACATCTGCCCATTTGAGGTGAACCGTAACAGCTACTTGGCTACCTTAACAGAG 2220
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1388 AGACCGATCAGCCTGTGTTGGACATCTGCCCATTTGAGGTGAACCGTAACAGCTACTTGGCTACCTTAACAGAG 1461
Query 2221 AAGATGGTCCACACCTATAAGTGGGAG 2247
|||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1462 AAGATGGTCCACATCTATAAGTGGGAG 1488