Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000466678
- Subject:
- XM_017023391.1
- Aligned Length:
- 2322
- Identities:
- 2245
- Gaps:
- 75
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGGCTCATGAAGCAATGGAATATGATGTTCAGGTGCAGTTAAATCATGCCGAACAACAGCCAGCTCCTGCTGG 74
Query 1 -ATGGCCAGCAGCCAAGGGGGACCAGCCCTCCTCCAGCCTGTTCCTGCTGATGTGGTCAGCAGCCAGGGGGTAC 73
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CATGGCCAGCAGCCAAGGGGGACCAGCCCTCCTCCAGCCTGTTCCTGCTGATGTGGTCAGCAGCCAGGGGGTAC 148
Query 74 CATCCATCCTCCAGCCAGCTCCTGCTGAGGTGATCAGCAGCCAAGCGACACCACCCCTGCTCCAGCCTGCTCCG 147
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 CATCCATCCTCCAGCCAGCTCCTGCTGAGGTGATCAGCAGCCAAGCGACACCACCCCTGCTCCAGCCTGCTCCG 222
Query 148 CAACTGTCTGTTGACCTGACAGAAGTGGAGGTCTTGGGAGAAGACACTGTGGAGAACATCAATCCAAGAACTTC 221
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 CAACTGTCTGTTGACCTGACAGAAGTGGAGGTCTTGGGAGAAGACACTGTGGAGAACATCAATCCAAGAACTTC 296
Query 222 AGAACAACATAGGCAGGGATCTGATGGTAATCACACCATCCCAGCATCTTCGTTGCATTCAATGACCAACTTCA 295
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 AGAACAACATAGGCAGGGATCTGATGGTAATCACACCATCCCAGCATCTTCGTTGCATTCAATGACCAACTTCA 370
Query 296 TCAGCGGACTGCAGAGACTTCATGGCATGCTGGAATTCCTGAGACCTTCATCTTCAAACCACAGTGTAGGGCCA 369
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 TCAGCGGACTGCAGAGACTTCATGGCATGCTGGAATTCCTGAGACCTTCATCTTCAAACCACAGTGTAGGGCCA 444
Query 370 ATGAGAACAAGAAGGAGGGTATCTGCTTCACGGAGGGCAAGAGCCGGAGGGTCTCAGAGGACAGACAGTGCCAG 443
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 ATGAGAACAAGAAGGAGGGTATCTGCTTCACGGAGGGCAAGAGCCGGAGGGTCTCAGAGGACAGACAGTGCCAG 518
Query 444 GTTGAGAGCACCATTGGATGCTTACTTTCAGGTGAGCAGGACCCAGCCTGACTTGCCAGCTACCACTTATGATT 517
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 GTTGAGAGCACCATTGGATGCTTACTTTCAGGTGAGCAGGACCCAGCCTGACTTGCCAGCTACCACTTATGATT 592
Query 518 CAGAGACTAGGAATCCTGTATCTGAAGAGTTGCAGGTGTCTAGTAGTTCTGATTCTGACAGTGACAGCTCTGCA 591
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 CAGAGACTAGGAATCCTGTATCTGAAGAGTTGCAGGTGTCTAGTAGTTCTGATTCTGACAGTGACAGCTCTGCA 666
Query 592 GAGTATGGAGGGGTTGTTGACCAGGCAGAGGAATCTGGAGCTGTCATTTTAGAAGAGCAACTAGCAGGTGTCTC 665
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GAGTATGGAGGGGTTGTTGACCAGGCAGAGGAATCTGGAGCTGTCATTTTAGAAGAGCAACTAGCAGGTGTCTC 740
Query 666 AGCAGAGCAAGAAGTTACATGTATCGATGGAGGCAAGACCCTCCCCAAACAGCCATCTCCCCAGAAGTCTGAGC 739
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 AGCAGAGCAAGAAGTTACATGTATCGATGGAGGCAAGACCCTCCCCAAACAGCCATCTCCCCAGAAGTCTGAGC 814
Query 740 CTCTGCTACCTTCTGCTTCTATGGATGAGGAAGAAGGGGACACTTGTACAATATGTCTGGAACAGTGGACCAAT 813
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 CTCTGCTACCTTCTGCTTCTATGGATGAGGAAGAAGGGGACACTTGTACAATATGTCTGGAACAGTGGACCAAT 888
Query 814 GCTGGGGACCACCGGCTCTCAGCATTACGCTGTGGGCATCTCTTTGGGTATAGGTGCATTTCCACGTGGCTTAA 887
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 GCTGGGGACCACCGGCTCTCAGCATTACGCTGTGGGCATCTCTTTGGGTATAGGTGCATTTCCACGTGGCTTAA 962
Query 888 AGGACAAGTACGAAAATGTCCCCAGTGCAACAAGAAAGCCAGGCACAGTGACATTGTCGTCCTTTATGCCCGAA 961
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 AGGACAAGTACGAAAATGTCCCCAGTGCAACAAGAAAGCCAGGCACAGTGACATTGTCGTCCTTTATGCCCGAA 1036
Query 962 CCCTGAGAGCTTTGGACACTAGTGAACAGGAGCGCATGAAAAGTTCCCTACTGAAGGAACAGATGCTAAGGAAA 1035
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 CCCTGAGAGCTTTGGACACTAGTGAACAGGAGCGCATGAAAAGTTCCCTACTGAAGGAACAGATGCTAAGGAAA 1110
Query 1036 CAGGCCGAGTTAGAATCAGCACAGTGCCGACTCCAACTGCAGGTCCTCACTGATAAGTGCACTAAGCTTCAAAG 1109
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 1111 CAGGCCGAGTTAGAATCAGCACAGTGCCGACTCCAACTGCAGGTCCTCACTGATAAGTGCACTAGGCTTCAAAG 1184
Query 1110 GCGTGTTCAGGACTTGCAAAAACTTACGTCACATCAAAGTCAGAATTTACAGCAACCCAGGGGCTCCCAAGCAT 1183
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 GCGTGTTCAGGACTTGCAAAAACTTACGTCACATCAAAGTCAGAATTTACAGCAACCCAGGGGCTCCCAAGCAT 1258
Query 1184 GGGTCCTGAGCTGCTCACCCTCCAGCCAGGGCCAGCACAAGCACAAGTACCACTTCCAAAAGACCTTCACAGTA 1257
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 GGGTCCTGAGCTGCTCACCCTCCAGCCAGGGCCAGCACAAGCACAAGTACCACTTCCAAAAGACCTTCACAGTA 1332
Query 1258 TCTCAGGCAGGAAACTGCCGGATCATGGCATACTGTGATGCTCTGAGCTGCCTGGTGATATCACAGCCTTCTCC 1331
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 TCTCAGGCAGGAAACTGCCGGATCATGGCATACTGTGATGCTCTGAGCTGCCTGGTGATATCACAGCCTTCTCC 1406
Query 1332 TCAGGCCTCTTTTCTTCCAGGCTTTGGTGTTAAGATGTTGAGTACTGCCAACATGAAGAGCAGTCAGTACATTC 1405
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 TCAGGCCTCTTTTCTTCCAGGCTTTGGTGTTAAGATGTTGAGTACTGCCAACATGAAGAGCAGTCAGTACATTC 1480
Query 1406 CGATGCATGGCAAACAGATCCGTGGACTGGCGTTTAGCAGTTACCTCAGAGGCTTGCTACTCTCTGCTTCCCTA 1479
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 CGATGCATGGCAAACAGATCCGTGGACTGGCGTTTAGCAGTTACCTCAGAGGCTTGCTACTCTCTGCTTCCCTA 1554
Query 1480 GACAACACTATTAAACTGACCAGCCTGGAGACAAATACCGTGGTCCAGACTTATAATGCTGGACGTCCTGTCTG 1553
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 GACAACACTATTAAACTGACCAGCCTGGAGACAAATACCGTGGTCCAGACTTATAATGCTGGACGTCCTGTCTG 1628
Query 1554 GAGCTGTTGCTGGTGTCTTGATGAGGCTAACTACATCTATGCTGGACTGGCCAATGGTTCAATTCTGGTATATG 1627
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 GAGCTGTTGCTGGTGTCTTGATGAGGCTAACTACATCTATGCTGGACTGGCCAATGGTTCAATTCTGGTATATG 1702
Query 1628 ACGTGCGAAACACGAGCAGTCATGTGCAGGAGTTAGTAGCTCAGAAAGCCAGATGCCCACTGGTCTCCCTGTCA 1701
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 ACGTGCGAAACACGAGCAGTCATGTGCAGGAGTTAGTAGCTCAGAAAGCCAGATGCCCACTGGTCTCCCTGTCA 1776
Query 1702 TACATGCCCAGAGCTGCCTCAGCTGCATTTCCATATGGTGGGGTGCTGGCTGGAACCTTGGAGGATGCTTCATT 1775
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 TACATGCCCAGAGCTGCCTCAGCTGCATTTCCATATGGTGGGGTGCTGGCTGGAACCTTGGAGGATGCTTCATT 1850
Query 1776 CTGGGAACAGAAAATGGACTTTTCTCATTGGCCTCATGTGCTGCCCTTGGAGCCAGGGGGCTGCATAGACTTTC 1849
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 CTGGGAACAGAAAATGGACTTTTCTCATTGGCCTCATGTGCTGCCCTTGGAGCCAGGGGGCTGCATAGACTTTC 1924
Query 1850 AGACAGAGAACAGCTCCCGGCACTGTCTTGTGACCTACAGGCCTGATAAAAATCACACCACCATACGAAGTGTG 1923
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 AGACAGAGAACAGCTCCCGGCACTGTCTTGTGACCTACAGGCCTGATAAAAATCACACCACCATACGAAGTGTG 1998
Query 1924 CTGATGGAAATGTCCTACCGACTGGATGACACTGGAAATCCAATCTGCTCCTGCCAGCCTGTACATACATTTTT 1997
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 CTGATGGAAATGTCCTACCGACTGGATGACACTGGAAATCCAATCTGCTCCTGCCAGCCTGTACATACATTTTT 2072
Query 1998 TGGAGGACCTACTTGCAAACTATTGACCAAAAATGCCATTTTCCAAAGCCCAGAGAATGATGGCAACATCCTGG 2071
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073 TGGAGGACCTACTTGCAAACTATTGACCAAAAATGCCATTTTCCAAAGCCCAGAGAATGATGGCAACATCCTGG 2146
Query 2072 TGTGTACTGGGGATGAAGCAGCAAATTCTGCCCTGCTGTGGGATGCTGCCAGTGGCTCGTTGCTCCAGGACCTA 2145
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147 TGTGTACTGGGGATGAAGCAGCAAATTCTGCCCTGCTGTGGGATGCTGCCAGTGGCTCGTTGCTCCAGGACCTA 2220
Query 2146 CAGACCGATCAGCCTGTGTTGGACATCTGCCCATTTGAGGTGAACCGTAACAGCTACTTGGCTACCTTAACAGA 2219
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221 CAGACCGATCAGCCTGTGTTGGACATCTGCCCATTTGAGGTGAACCGTAACAGCTACTTGGCTACCTTAACAGA 2294
Query 2220 GAAGATGGTCCACACCTATAAGTGGGAG 2247
||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 2295 GAAGATGGTCCACATCTATAAGTGGGAG 2322