Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000466771
- Subject:
- XM_017022975.1
- Aligned Length:
- 1629
- Identities:
- 1552
- Gaps:
- 72
Alignment
Query 1 ---------------------------------------------------------------------ATGGC 5
|||||
Sbjct 1 ATGCTCTTCCTTCTGCCGAGCTCCCCGGATTATGGTGCACTGAGAAGGCATCTGGAAGCCTGGGCCCTCATGGC 74
Query 6 ATCCAACGATAAAGGCATGGCACCCTCGCTGGGCTCTCCCTGGGCCTCCCGGATGGGGCCCTGGGATGCCATCC 79
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 ATCCAACGATAAAGGCATGGCACCCTCGCTGGGCTCTCCCTGGGCCTCCCAGATGGGGCCCTGGGATGCCATCC 148
Query 80 TCAAGGCTGTCAAAGACCAGCTCCCGTCTCTGGACTCAGACTCCCCTTTGTCGGACTATGGGGAAGAGGAGCTG 153
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 TCAAGGCTGTCAAAGACCAGCTCCCGTCTCTGGACTCAGACTCCCCTTTGTCGGACTATGGGGAAGAGGAGCTG 222
Query 154 TTCATCTTCCAGCGAAACCAAACCTCCCTGATTCCAGACCTGTCGGAGGAGCTGGCTGAAGATCCTGCCGATGG 227
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 TTCATCTTCCAGCGAAACCAAACCTCCCTGATTCCAGACCTGTCGGAGGAGCTGGCTGAAGATCCTGCCGATGG 296
Query 228 CGACAAGTCCAGGGCCTGGGTCGCTGCAGCTGAAGAGTCCCTTCCCGAGCCAGTTCTGGTGCCTGCAGAATTGG 301
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 CGACAAGTCCAGGGCCTGGGTCGCTGCAGCTGAAGAGTCCCTTCCCGAGCCAGTTCTGGTGCCTGCAGAATTGG 370
Query 302 CCACAGAACCTGGGTGCAGACAGAACACAAGGACAAAGGATGCATCCTCTCAGGAAGGAAGAGACCCTGGCAGG 375
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 CCACAGAACCTGGGTGCAGACAGAACACAAGGACAAAGGATGCATCCTCTCAGGAAGGAAGAGACCCTGGCAGG 444
Query 376 CCTTTTGAAAGCTCTGGTGAAGTCAGCGCTCTTCTTGGGATGGCCGAGGAGCCCCCCAGGTGGCTGGAAGGCGA 449
||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 CCTTTTGAAAGCTCTGGTGAGGTCAGCGCTCTTCTTGGGATGGCCGAGGAGCCCCCCAGGTGGCTGGAAGGCGA 518
Query 450 CCTTGGAAGCCTGTCTTTCAACACCAAAGGATCCCAGGGTCCTCCCTGGGACCCACAGGCCGAAGCCACTCTCT 523
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 CCTTGGAAGCCTGTCTTTCAACACCAAAGGATCCCAGGGTCCTCCCTGGGACCCACAGGCCGAAGCCACTCTCT 592
Query 524 CCTGCCATGAAGGAGACCCAAAGGCAGAGCCCCTCAGCACTGCCTCACAAGAATCTGTGAACCGCCGGGCCCTC 597
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 CCTGCCATGAAGGAGACCCAAAGGCAGAGCCCCTCAGCACTGCCTCACAAGAATCTGTGAACCGCCGGGCCCTC 666
Query 598 CGACAGGAGAGAAGGAAGATGATAGAGACGGACATCCTCCAGAAAGTCACCCGGGATGCCTGCGGCCCGACCAG 671
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 CGACAGGAGAGAAGGAAGATGATAGAGACGGACATCCTCCAGAAAGTCACCCGGGATGCCTGCGGCCCGACCAG 740
Query 672 CAGTGACAAAGGTGGGGTGAAGGAGGCGCCCTGCCACGCTGCGGAGTCAGCTCCCAGATCCAAAATGCCCCTCG 745
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 CAGTGACAAAGGTGGGGTGAAGGAGGCGCCCTGCCACGCTGCGGAGTCAGCTCCCAGATCCAAAATGCCCCTCG 814
Query 746 TGGAGCCTCCGGAGGGACCACCAGTGCTCTCGCTCCAGCAACTTGAAGCGTGGGATTTGGATGACATCCTTCAG 819
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 TGGAGCCTCCGGAGGGACCACCAGTGCTCTCGCTCCAGCAACTTGAAGCGTGGGATTTGGATGACATCCTTCAG 888
Query 820 AGTCTGGCGGGACAAGAAGACAACCAGGGAAATCGTGCACCTGGAACTGTGTGGTGGGCAGCTGACCACCGCCA 893
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 AGTCTGGCGGGACAAGAAGACAACCAGGGAAATCGTGCACCTGGAACTGTGTGGTGGGCAGCTGACCACCGCCA 962
Query 894 AGTTCAAGACTGCATGGTGCCGAGCGCCCACAACAGGCTCATGGAACAGCTGGCCCTCCTGTGCACCACGCAGT 967
||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 AGTTCAAGACCGCATGGTGCCGAGCGCCCACAACAGGCTCATGGAACAGCTGGCCCTCCTGTGCACCACGCAGT 1036
Query 968 CCAAGGCCTCTGCTTGTGCCCGGAAGGTGCCTGCCGACACTCCCCAGGACACCAAAGAGGCAGATTCAGGAAGC 1041
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 CCAAGGCCTCTGCTTGTGCCCGGAAGGTGCCTGCCGACACTCCCCAGGACACCAAAGAGGCAGATTCAGGAAGC 1110
Query 1042 AGATGTGCCTCAAGGAAGCGGGGCTCCCAGGCTGGGCCAGGCCCGCAGCTGGCCCAGGGCATGAGGCTTAACGC 1115
|||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 AGATGTGCCTCAAGGAAGCAGGGCTCCCAGGCTGGGCCAGGCCCGCAGCTGGCCCAGGGCATGAGGCTTAACGC 1184
Query 1116 AGAGTCCCCCACCATCTTTATTGACCTGCGGCAGATGGAGCTACCAGACCACCTGTCCCCAGAAAGCTCCAGCC 1189
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 AGAGTCCCCCACCATCTTTATTGACCTGCGGCAGATGGAGCTACCAGACCACCTGTCCCCAGAAAGCTCCAGCC 1258
Query 1190 ACAGCTCCTCTGACAGT---GAGGAGGAGGAGGAAGAGATGGCAGCTCTGGGAGACGCAGAGGGGGCATCTCCT 1260
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 ACAGCTCCTCTGACAGTGAGGAGGAGGAGGAGGAAGAGATGGCAGCTCTGGGAGACGCAGAGGGGGCATCTCCT 1332
Query 1261 TCCTCCCTGGGGCTACGGACCTGTACCGGGAAAAGCCAGCTTCTCCAGCAGCTCAGGGCCTTTCAGAAGGGGAC 1334
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 TCCTCCCTGGGGCTACGGACCTGTACCGGGAAAAGCCAGCTTCTCCAGCAGCTCAGGGCCTTTCAGAAGGGGAC 1406
Query 1335 AGCCCAGCCCGAGCTGCCTGCCAGCAAGGGGCCCGCGGGTGGGAGGGCTCAGGCCCTTGAAGACACAGCTGGAT 1408
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1407 AGCCCAGCCCGAGCTGCCTGCCAGCAAGGGGCCCGCGGGTGGGAGGGCTCAGGCCCCTGAAGACACAGCTGGAT 1480
Query 1409 CACGAACTGGGAGGAAGCAACACATGAAGCTCTGTGCCAAGGGGCAGAGCGCCCAGGCTCGACTCCCAAGAGGC 1482
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 CACGAACTGGGAGGAAGCAACACATGAAGCTCTGTGCCAAGGGGCAGAGCGCCCAGGCTCGACTCCCAAGAGGC 1554
Query 1483 AGGCCCAGAGCCCTGGGGGATGTTCCTGAGCCAGGGGCAGCCAGGGAGGCCCTGATGCCTCCTCTGGAGCAACT 1556
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 AGGCCCAGAGCCCTGGGGGATGTTCCTGAGCCAGGGGCAGCCAGGGAGGCCCTGATGCCTCCTCTGGAGCAACT 1628
Query 1557 A 1557
|
Sbjct 1629 A 1629