Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000466777
• Subject: XM_006534017.3
• Aligned Length: 1170
• Identities: 963
• Gaps: 102

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGCCCAGGAAGCTGCTGCTGCTGCCCCCGCTGTCCGCGTGCTCTGCTCTGCGTGTCCCGCGGGCTCGGCCCGC  74

Query    1  -------------ATGAACGCCGCTCGCACCGGCTACCGAGTCTTCTCGGCCAACTCCACGGCCGCCTGCACGG  61
                         ||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CGCCTCGCCGGCCATGAACGCAGCCCGCACCGGCTACCGAGTCTTCTCGGCCAACTCCACGGCCGCCTGCACGG  148

Query   62  AGCTGGCCAAGCGCATCACAGAGCGCCTTGGTGCTGAATTGGGGAAGTCTGTTGTATATCAAGAGACCAATGGA  135
            |.|||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct  149  AACTGGCCAAGCGCATCACTGAGCGTCTTGGTGCTGAATTGGGGAAATCTGTTGTATATCAGGAGACCAATGGA  222

Query  136  GAAACAAGAGTTGAAATAAAAGAATCTGTTCGTGGCCAAGATATTTTCATTATACAGACAATACCC--------  201
            |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        
Sbjct  223  GAAACAAGAGTTGAAATCAAAGAATCTGTTCGTGGCCAAGATATTTTCATTATACAGACAATACCCAGTTTTTA  296

Query  202  -------AGAGATGTGAATACAGCTGTGATGGAGTTGCTCATCATGGCTTACGCACTGAAGACTGCCTGTGCCA  268
                   ||||||||||||||.||||||||||||.||||.||||||||.||.|||||||||||.|||||.||||
Sbjct  297  CTGTTTTAGAGATGTGAATACGGCTGTGATGGAGCTGCTGATCATGGCGTATGCACTGAAGACCGCCTGCGCCA  370

Query  269  GGAACATTATTGGGGTCATCCCCTACTTCCCCTACAGCAAGCAGAGCAAGATGAGGAAGAGGGGTTCCATTGTG  342
            ||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.|.||||||||.|||||||||
Sbjct  371  GGAATATCATTGGCGTCATCCCCTACTTCCCCTACAGCAAGCAAAGCAAGATGCGCAAGAGGGGCTCCATTGTG  444

Query  343  TGCAAGCTGCTAGCATCCATGCTGGCGAAAGCAGGTTTAACTCACATTATCACTATGGATCTTCATCAAAAGGA  416
            ||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||
Sbjct  445  TGCAAGCTCCTGGCATCCATGCTGGCGAAAGCTGGTTTAACTCACATTATCACTATGGACCTCCACCAAAAGGA  518

Query  417  AATACAAGGCTTTTTCAGCTTTCCTGTGGACAACCTTAGAGCCTCACCTTTCCTGCTTCAGTATATCCAGGAAG  490
            ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AATACAAGGCTTTTTCAGCTTTCCCGTGGACAACCTTAGAGCCTCACCTTTCCTGCTTCAGTATATCCAGGAAG  592

Query  491  AAATTCCAAATTACAGAAATGCAGTCATTGTAGCTAAGTCTCCTGATGCTGCAAAGAGGGCCCAGTCCTATGCG  564
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.
Sbjct  593  AAATTCCAAATTACAGAAATGCAGTCATTGTAGCTAAGTCTCCTGATGCTGCAAAAAGGGCTCAGTCCTATGCT  666

Query  565  GAGAGACTGCGTCTGGGTTTGGCCGTCATTCACGGGGAAGCTCAGTGCACGGAACTGGACATGGACGATGGTCG  638
            ||.||.||.||.|||||..||||.||.||.|||||.|||||.|||||.||.||.|||||.||||||||.|||||
Sbjct  667  GAAAGGCTCCGCCTGGGGCTGGCTGTGATCCACGGAGAAGCGCAGTGTACAGAGCTGGATATGGACGACGGTCG  740

Query  639  TCACTCCCCGCCTATGGTCAAAAATGCTACTGTGCACCCAGGCCTGGAGTTGCCATTGATGATGGCCAAAGAGA  712
            .||||||||.||.||||||||.||.||.||.||||||||||||||||||.||||.||.||||||||||||||||
Sbjct  741  GCACTCCCCACCCATGGTCAAGAACGCCACGGTGCACCCAGGCCTGGAGCTGCCCTTAATGATGGCCAAAGAGA  814

Query  713  AGCCACCGATAACTGTAGTTGGAGATGTTGGAGGCCGCATCGCAATCATCGTGGATGACATTATTGACGATGTG  786
            |||||||.|||||.||.||.|||||.||.||.||.|||||.||.||.||.|||||||||||.|||||.||.|||
Sbjct  815  AGCCACCAATAACAGTGGTCGGAGACGTCGGGGGACGCATTGCGATTATAGTGGATGACATCATTGATGACGTG  888

Query  787  GAGAGTTTTGTTGCTGCCGCGGAGATCCTGAAAGAGAGAGGCGCCTATAAGATCTATGTTATGGCCACCCACGG  860
            |||||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.||||||||.|||||
Sbjct  889  GAGAGCTTTGTTGCTGCTGCAGAGATCCTGAAAGAGAGAGGTGCTTACAAGATCTATGTCATGGCCACGCACGG  962

Query  861  CATCCTGTCTGCAGAGGCCCCTCGCCTGATTGAGGAGTCCTCCGTAGACGAGGTGGTGGTGACGAATACTGTCC  934
            ||||||||||||.||.|||||.||.|||||||||||||||.||.|.||.||||||||||||||.||.|||||||
Sbjct  963  CATCCTGTCTGCTGAAGCCCCCCGTCTGATTGAGGAGTCCCCCATTGATGAGGTGGTGGTGACAAACACTGTCC  1036

Query  935  CTCATGAGGTTCAGAAGCTGCAGTGTCCCAAGATAAAGACTGTGGATATCAGTTTGATTCTTTCTGAAGCCATT  1008
            |||||||..|||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||..|||||||||||||.||.|||
Sbjct 1037  CTCATGAACTTCAGAAACTACAGTGTCCCAAGATAAAGACTGTGGACATCAGCCTGATTCTTTCTGAGGCGATT  1110

Query 1009  CGGAGAATCCACAATGGAGAGTCCATGGCCTACCTTTTCCGAAACATCACTGTGGATGAC  1068
            |||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.||||||||.|||||||||
Sbjct 1111  CGGAGAATCCACAATGGAGAGTCTATGGCTTACCTCTTCCGGAACATCACAGTGGATGAC  1170