Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000466777
• Subject: XM_006534018.2
• Aligned Length: 1072
• Identities: 929
• Gaps: 29

Alignment

Query    1  ATGAACGCCGCTCGCACC-GGCTACC-GAGTCTTCTCGGCCAACTCCACGGCC--GCCTGCACGGAGCTGGCCA  70
            ||||         .|||| |||..|| |||.|||||.||.|..||..|.||||  .|||    ||.||||    
Sbjct    1  ATGA---------CCACCAGGCAGCCTGAGGCTTCTGGGGCTGCTGAAAGGCCTATCCT----GGTGCTG----  57

Query   71  AGCGCATCACAGAGCGCCTTGGTGCTGAATTGGGGAAGTCTGTTGTATATCAAGAGACCAATGGAGAAACAAGA  144
            ||       ||| |||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct   58  AG-------CAG-GCGTCTTGGTGCTGAATTGGGGAAATCTGTTGTATATCAGGAGACCAATGGAGAAACAAGA  123

Query  145  GTTGAAATAAAAGAATCTGTTCGTGGCCAAGATATTTTCATTATACAGACAATACCCAGAGATGTGAATACAGC  218
            ||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  124  GTTGAAATCAAAGAATCTGTTCGTGGCCAAGATATTTTCATTATACAGACAATACCCAGAGATGTGAATACGGC  197

Query  219  TGTGATGGAGTTGCTCATCATGGCTTACGCACTGAAGACTGCCTGTGCCAGGAACATTATTGGGGTCATCCCCT  292
            ||||||||||.||||.||||||||.||.|||||||||||.|||||.||||||||.||.|||||.||||||||||
Sbjct  198  TGTGATGGAGCTGCTGATCATGGCGTATGCACTGAAGACCGCCTGCGCCAGGAATATCATTGGCGTCATCCCCT  271

Query  293  ACTTCCCCTACAGCAAGCAGAGCAAGATGAGGAAGAGGGGTTCCATTGTGTGCAAGCTGCTAGCATCCATGCTG  366
            |||||||||||||||||||.|||||||||.|.||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||
Sbjct  272  ACTTCCCCTACAGCAAGCAAAGCAAGATGCGCAAGAGGGGCTCCATTGTGTGCAAGCTCCTGGCATCCATGCTG  345

Query  367  GCGAAAGCAGGTTTAACTCACATTATCACTATGGATCTTCATCAAAAGGAAATACAAGGCTTTTTCAGCTTTCC  440
            ||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  346  GCGAAAGCTGGTTTAACTCACATTATCACTATGGACCTCCACCAAAAGGAAATACAAGGCTTTTTCAGCTTTCC  419

Query  441  TGTGGACAACCTTAGAGCCTCACCTTTCCTGCTTCAGTATATCCAGGAAGAAATTCCAAATTACAGAAATGCAG  514
            .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  420  CGTGGACAACCTTAGAGCCTCACCTTTCCTGCTTCAGTATATCCAGGAAGAAATTCCAAATTACAGAAATGCAG  493

Query  515  TCATTGTAGCTAAGTCTCCTGATGCTGCAAAGAGGGCCCAGTCCTATGCGGAGAGACTGCGTCTGGGTTTGGCC  588
            |||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||.||.||.||.|||||..||||.
Sbjct  494  TCATTGTAGCTAAGTCTCCTGATGCTGCAAAAAGGGCTCAGTCCTATGCTGAAAGGCTCCGCCTGGGGCTGGCT  567

Query  589  GTCATTCACGGGGAAGCTCAGTGCACGGAACTGGACATGGACGATGGTCGTCACTCCCCGCCTATGGTCAAAAA  662
            ||.||.|||||.|||||.|||||.||.||.|||||.||||||||.|||||.||||||||.||.||||||||.||
Sbjct  568  GTGATCCACGGAGAAGCGCAGTGTACAGAGCTGGATATGGACGACGGTCGGCACTCCCCACCCATGGTCAAGAA  641

Query  663  TGCTACTGTGCACCCAGGCCTGGAGTTGCCATTGATGATGGCCAAAGAGAAGCCACCGATAACTGTAGTTGGAG  736
            .||.||.||||||||||||||||||.||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||.||.||||
Sbjct  642  CGCCACGGTGCACCCAGGCCTGGAGCTGCCCTTAATGATGGCCAAAGAGAAGCCACCAATAACAGTGGTCGGAG  715

Query  737  ATGTTGGAGGCCGCATCGCAATCATCGTGGATGACATTATTGACGATGTGGAGAGTTTTGTTGCTGCCGCGGAG  810
            |.||.||.||.|||||.||.||.||.|||||||||||.|||||.||.||||||||.|||||||||||.||.|||
Sbjct  716  ACGTCGGGGGACGCATTGCGATTATAGTGGATGACATCATTGATGACGTGGAGAGCTTTGTTGCTGCTGCAGAG  789

Query  811  ATCCTGAAAGAGAGAGGCGCCTATAAGATCTATGTTATGGCCACCCACGGCATCCTGTCTGCAGAGGCCCCTCG  884
            |||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||.||
Sbjct  790  ATCCTGAAAGAGAGAGGTGCTTACAAGATCTATGTCATGGCCACGCACGGCATCCTGTCTGCTGAAGCCCCCCG  863

Query  885  CCTGATTGAGGAGTCCTCCGTAGACGAGGTGGTGGTGACGAATACTGTCCCTCATGAGGTTCAGAAGCTGCAGT  958
            .|||||||||||||||.||.|.||.||||||||||||||.||.||||||||||||||..|||||||.||.||||
Sbjct  864  TCTGATTGAGGAGTCCCCCATTGATGAGGTGGTGGTGACAAACACTGTCCCTCATGAACTTCAGAAACTACAGT  937

Query  959  GTCCCAAGATAAAGACTGTGGATATCAGTTTGATTCTTTCTGAAGCCATTCGGAGAATCCACAATGGAGAGTCC  1032
            ||||||||||||||||||||||.|||||..|||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct  938  GTCCCAAGATAAAGACTGTGGACATCAGCCTGATTCTTTCTGAGGCGATTCGGAGAATCCACAATGGAGAGTCT  1011

Query 1033  ATGGCCTACCTTTTCCGAAACATCACTGTGGATGAC  1068
            |||||.|||||.|||||.||||||||.|||||||||
Sbjct 1012  ATGGCTTACCTCTTCCGGAACATCACAGTGGATGAC  1047