Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000466777
• Subject: XM_011249196.2
• Aligned Length: 1087
• Identities: 929
• Gaps: 44

Alignment

Query    1  ATGAACGCCGCTCGCACC-GGCTACC-GAGTCTTCTCGGCCAACTCCACGGCC--GCCTGCACGGAGCTGGCCA  70
            ||||         .|||| |||..|| |||.|||||.||.|..||..|.||||  .|||    ||.||||    
Sbjct    1  ATGA---------CCACCAGGCAGCCTGAGGCTTCTGGGGCTGCTGAAAGGCCTATCCT----GGTGCTG----  57

Query   71  AGCGCATCACAGAGCGCCTTGGTGCTGAATTGGGGAAGTCTGTTGTATATCAAGAGACCAATGGAGAAACAAGA  144
            ||       ||| |||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct   58  AG-------CAG-GCGTCTTGGTGCTGAATTGGGGAAATCTGTTGTATATCAGGAGACCAATGGAGAAACAAGA  123

Query  145  GTTGAAATAAAAGAATCTGTTCGTGGCCAAGATATTTTCATTATACAGACAATACCC---------------AG  203
            ||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||               ||
Sbjct  124  GTTGAAATCAAAGAATCTGTTCGTGGCCAAGATATTTTCATTATACAGACAATACCCAGTTTTTACTGTTTTAG  197

Query  204  AGATGTGAATACAGCTGTGATGGAGTTGCTCATCATGGCTTACGCACTGAAGACTGCCTGTGCCAGGAACATTA  277
            ||||||||||||.||||||||||||.||||.||||||||.||.|||||||||||.|||||.||||||||.||.|
Sbjct  198  AGATGTGAATACGGCTGTGATGGAGCTGCTGATCATGGCGTATGCACTGAAGACCGCCTGCGCCAGGAATATCA  271

Query  278  TTGGGGTCATCCCCTACTTCCCCTACAGCAAGCAGAGCAAGATGAGGAAGAGGGGTTCCATTGTGTGCAAGCTG  351
            ||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.|.||||||||.|||||||||||||||||.
Sbjct  272  TTGGCGTCATCCCCTACTTCCCCTACAGCAAGCAAAGCAAGATGCGCAAGAGGGGCTCCATTGTGTGCAAGCTC  345

Query  352  CTAGCATCCATGCTGGCGAAAGCAGGTTTAACTCACATTATCACTATGGATCTTCATCAAAAGGAAATACAAGG  425
            ||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||
Sbjct  346  CTGGCATCCATGCTGGCGAAAGCTGGTTTAACTCACATTATCACTATGGACCTCCACCAAAAGGAAATACAAGG  419

Query  426  CTTTTTCAGCTTTCCTGTGGACAACCTTAGAGCCTCACCTTTCCTGCTTCAGTATATCCAGGAAGAAATTCCAA  499
            |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  420  CTTTTTCAGCTTTCCCGTGGACAACCTTAGAGCCTCACCTTTCCTGCTTCAGTATATCCAGGAAGAAATTCCAA  493

Query  500  ATTACAGAAATGCAGTCATTGTAGCTAAGTCTCCTGATGCTGCAAAGAGGGCCCAGTCCTATGCGGAGAGACTG  573
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||.||.||.
Sbjct  494  ATTACAGAAATGCAGTCATTGTAGCTAAGTCTCCTGATGCTGCAAAAAGGGCTCAGTCCTATGCTGAAAGGCTC  567

Query  574  CGTCTGGGTTTGGCCGTCATTCACGGGGAAGCTCAGTGCACGGAACTGGACATGGACGATGGTCGTCACTCCCC  647
            ||.|||||..||||.||.||.|||||.|||||.|||||.||.||.|||||.||||||||.|||||.||||||||
Sbjct  568  CGCCTGGGGCTGGCTGTGATCCACGGAGAAGCGCAGTGTACAGAGCTGGATATGGACGACGGTCGGCACTCCCC  641

Query  648  GCCTATGGTCAAAAATGCTACTGTGCACCCAGGCCTGGAGTTGCCATTGATGATGGCCAAAGAGAAGCCACCGA  721
            .||.||||||||.||.||.||.||||||||||||||||||.||||.||.|||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  642  ACCCATGGTCAAGAACGCCACGGTGCACCCAGGCCTGGAGCTGCCCTTAATGATGGCCAAAGAGAAGCCACCAA  715

Query  722  TAACTGTAGTTGGAGATGTTGGAGGCCGCATCGCAATCATCGTGGATGACATTATTGACGATGTGGAGAGTTTT  795
            ||||.||.||.|||||.||.||.||.|||||.||.||.||.|||||||||||.|||||.||.||||||||.|||
Sbjct  716  TAACAGTGGTCGGAGACGTCGGGGGACGCATTGCGATTATAGTGGATGACATCATTGATGACGTGGAGAGCTTT  789

Query  796  GTTGCTGCCGCGGAGATCCTGAAAGAGAGAGGCGCCTATAAGATCTATGTTATGGCCACCCACGGCATCCTGTC  869
            ||||||||.||.||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||
Sbjct  790  GTTGCTGCTGCAGAGATCCTGAAAGAGAGAGGTGCTTACAAGATCTATGTCATGGCCACGCACGGCATCCTGTC  863

Query  870  TGCAGAGGCCCCTCGCCTGATTGAGGAGTCCTCCGTAGACGAGGTGGTGGTGACGAATACTGTCCCTCATGAGG  943
            |||.||.|||||.||.|||||||||||||||.||.|.||.||||||||||||||.||.||||||||||||||..
Sbjct  864  TGCTGAAGCCCCCCGTCTGATTGAGGAGTCCCCCATTGATGAGGTGGTGGTGACAAACACTGTCCCTCATGAAC  937

Query  944  TTCAGAAGCTGCAGTGTCCCAAGATAAAGACTGTGGATATCAGTTTGATTCTTTCTGAAGCCATTCGGAGAATC  1017
            |||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||..|||||||||||||.||.||||||||||||
Sbjct  938  TTCAGAAACTACAGTGTCCCAAGATAAAGACTGTGGACATCAGCCTGATTCTTTCTGAGGCGATTCGGAGAATC  1011

Query 1018  CACAATGGAGAGTCCATGGCCTACCTTTTCCGAAACATCACTGTGGATGAC  1068
            ||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.||||||||.|||||||||
Sbjct 1012  CACAATGGAGAGTCTATGGCTTACCTCTTCCGGAACATCACAGTGGATGAC  1062