Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000466788
• Subject: NM_027060.1
• Aligned Length: 1923
• Identities: 1459
• Gaps: 264

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGAGTAACAGCCACCCTCTTCGCCCCTTTACTGCAGTGGGGGAAATCGATCATGTGCACATTTTGTCTGAGCA  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  TATTGGTGCCTTGTTGATTGGTGAAGAATATGGTGATGTCACGTTTGTTGTGGAAAAGAAGCACTTTCCTGCCC  148

Query    1  --------------------ATGTGC---------AGAGCATTATTATATGGTGGAATGCGAGAGTCTCAGCCT  45
                                |.||||         .||||||||.|.|||||.||.|||||||||||.|||||.
Sbjct  149  ACAGGGTAATTTTAGCAGCGAGGTGCCAATATTTTCGAGCATTACTGTATGGCGGGATGCGAGAGTCGCAGCCC  222

Query   46  GAAGCAGAAATTCCTCTCCAAGACACCACTGCAGAAGCATTCACAATGCTACTCAAATATATCTACACTGGGCG  119
            ||||||||.||.|||||||||||||||||.||.||.||.|||||.|||||.||||.||||||||||||.|||||
Sbjct  223  GAAGCAGAGATCCCTCTCCAAGACACCACGGCCGAGGCTTTCACGATGCTCCTCAGATATATCTACACGGGGCG  296

Query  120  GGCAACGCTGACAGATGAGAAGGAGGAGGTGCTGCTGGACTTTTTGAGCCTGGCTCATAAATATGGATTTCCAG  193
            |||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||..|||||||||||||.|||||.||||||||||
Sbjct  297  GGCGACGCTCACTGATGAGAAGGAGGAGGTGCTGCTGGACTTCCTGAGCCTGGCTCACAAATACGGATTTCCAG  370

Query  194  AGCTAGAGGATTCTACCTCTGAGTATCTCTGCACCATACTTAACATTCAGAATGTCTGCATGACTTTTGATGTT  267
            ||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||
Sbjct  371  AGCTGGAGGACTCTACTTCTGAGTATCTCTGCACCATACTGAACATTCAGAATGTCTGTATGACCTTTGATGTT  444

Query  268  GCCAGTCTCTACTCACTTCCCAAGTTAACTTGTATGTGCTGCATGTTTATGGATAGGAATGCTCAGGAAGTCCT  341
            ||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||.||.||
Sbjct  445  GCCAGTCTCTACTCGCTTCCCAAGTTAACTTGTATGTGCTGCATGTTCATGGACAGAAATGCTCAGGAGGTGCT  518

Query  342  CTCAAGTGAAGGTTTCCTCTCCCTTTCTAAGACAGCACTTTTAAACATCGTGTTAAGAGACTCATTTGCAGCTC  415
            ..|.||.||.||.|||||||||||.||.|||||||||||..|.||.|||||.||||||||.||.|||||.||||
Sbjct  519  GGCCAGCGACGGCTTCCTCTCCCTGTCCAAGACAGCACTCCTGAATATCGTCTTAAGAGATTCGTTTGCTGCTC  592

Query  416  CCGAAAAAGATATTTTCCTAGCCTTATTAAACTGGTGTAAGCACAATTCAAAGGAGAATCATGCTGAAATCATG  489
            |.||.||||||||||||.|||||||.|||||||||||||||||||||.||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CTGAGAAAGATATTTTCTTAGCCTTGTTAAACTGGTGTAAGCACAATGCAAAAGAGAATCATGCTGAAATCATG  666

Query  490  CAGGCTGTGCGTTTACCTCTCATGAGCCTCACAGAGCTTCTGAATGTTGTGAGGCCTTCAGGACTGCTGTCTCC  563
            |||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.||||||||.||||||||..|||||||
Sbjct  667  CAGGCTGTGCGCTTACCTCTAATGAGCCTCACTGAGCTTCTGAACGTCGTGAGGCCATCAGGACTCTTGTCTCC  740

Query  564  TGATGCCATCCTGGATGCCATTAAAGTGCGATCTGAGAGCCGGGATATGGACCTCAATTATAGAGGCATGCTCA  637
            .|||||.||.||.||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||
Sbjct  741  GGATGCTATTCTTGATGCCATCAAAGTGCGGTCGGAGAGCCGGGATATGGACCTCAACTACAGAGGCATGCTCA  814

Query  638  TACCAGAAGAAAACATTGCAACTATGAAGTATGGAGCCCAAGTTGTAAAGGGGGAGCTGAAATCAGCCTTATTA  711
            ||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||.||.||.||||||||.||.|||||..|.
Sbjct  815  TACCTGAAGAAAACATTGCAACTATGAAGTATGGGGCTCAGGTTGTGAAAGGAGAGCTGAAGTCGGCCTTGCTG  888

Query  712  GATGGTGATACTCAAAATTATGATTTGGATCATGGATTTTCAAGGCACCCAATTGATGATGACTGCCGTTCCGG  785
            ||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||..|||||||.|||||||||||||||||.||.||
Sbjct  889  GATGGTGACACTCAAAACTATGACTTGGATCATGGATTTTCCCGGCACCCCATTGATGATGACTGCCGCTCTGG  962

Query  786  CATCGAGATTAAGCTAGGTCAGCCATCCATTATCAATCACATACGGATACTCTTGTGGGACCGAGATAGCCGGT  859
            |||.|||||.|||||.||.|||||.||||||||.||.||||||||..|||||.||||||||||.||.|||||||
Sbjct  963  CATTGAGATCAAGCTTGGCCAGCCGTCCATTATAAACCACATACGTCTACTCCTGTGGGACCGTGACAGCCGGT  1036

Query  860  CTTACTCATACTTCATTGAAGTGTCAATGGATGAACTTGATTGGGTCAGAGTGATAGATCATTCACAATATCTG  933
            ||||.||.|||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||.||||||||||.|||||.|||||.||.|||
Sbjct 1037  CTTATTCCTACTTTATTGAAGTGTCCATGGACGAACTTGATTGGATCAGAGTGATCGATCACTCACATTACCTG  1110

Query  934  TGTCGTTCTTGGCAGAAATTATATTTTCCAGCCCGTGTCTGCAGTGGAGATGGAGTCTCACTATGGTGCCCACT  1007
            |||||.||||||||.||.||.|||||.||||||||||||                                   
Sbjct 1111  TGTCGGTCTTGGCAAAAGTTGTATTTCCCAGCCCGTGTC-----------------------------------  1149

Query 1008  CTGGTCTCGAACTCCTGAGCTCAAGCAATCCTCCCTCCTTGGCCTTCCAAAGTGCAGGTATATTCGAATTGTTG  1081
                                                                |||||||||||.|||||.||||
Sbjct 1150  ----------------------------------------------------TGCAGGTATATCCGAATAGTTG  1171

Query 1082  GGACTCACAACACAGTGAACAAGATTTTTCACATTGTGGCTTTTGAATGTATGTTTACAAACAAAACCTTCACT  1155
            ||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.|||||||.
Sbjct 1172  GGACTCACAACACAGTGAACAAGATTTTCCACATTGTGGCTTTTGAATGCATGTTTACAAACAAAGCCTTCACC  1245

Query 1156  CTTGAGAAGGGGCTGATAGTTCCCATGGAGAATGTTGCAACAATTGCTGATTGTGCCAGTGTGATTGAAGGAGT  1229
            ||.||||||||.||||||||||||.||||||||||.|||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1246  CTGGAGAAGGGCCTGATAGTTCCCCTGGAGAATGTGGCAACGATCGCAGATTGTGCCAGTGTGATTGAAGGAGT  1319

Query 1230  CAGTCGGAGCCGAAATGCCTTGCTGAATGGGGACACTAAGAATTATGACTGGGATTCTGGCTACACATGTCACC  1303
            ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||||
Sbjct 1320  CAGTCGGAGCCGGAATGCCTTGCTGAATGGGGACACTAAGAATTATGACTGGGACTCTGGCTACACGTGCCACC  1393

Query 1304  AGCTAGGAAGTGGTGCGATTGTGGTTCAGTTGGCACAACCGTACATGATTGGGTCAATACGGTTACTACTTTGG  1377
            ||||.||.||||||||.||||||||||||.|||||||.||.|||||.|||||.||||||||||||.||||.|||
Sbjct 1394  AGCTGGGCAGTGGTGCCATTGTGGTTCAGCTGGCACAGCCATACATAATTGGCTCAATACGGTTATTACTCTGG  1467

Query 1378  GATTGTGATGATCGAAGCTATAGCTACTACGTTGAGGTTTCTACCAACCAGCAACAGTGGACCATGGTTGCTGA  1451
            ||.||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||.||.||
Sbjct 1468  GACTGCGATGATCGAAGCTACAGCTACTATGTTGAGGTTTCCACCAATCAGCAGCAGTGGACCATGGTGGCCGA  1541

Query 1452  CAGAACTAAAGTCTCCTGCAAGTCCTGGCAGTCAGTAACTTTTGAAAGGCAGCCTGCCTCCTTCATCCGTATCG  1525
            ||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||.||||
Sbjct 1542  CAGAACGAAAGTGTCCTGCAAGTCCTGGCAGTCAGTCACTTTTGAAAGACAGCCTGCATCCTTCATCCGAATCG  1615

Query 1526  TTGGGACACACAACACAGCAAATGAGGTGTTCCACTGTGTCCACTTTGAGTGTCCAGAGCAGCAGAGCAGCCAG  1599
            |.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.||||
Sbjct 1616  TCGGGACACACAACACAGCAAATGAGGTGTTCCACTGTGTCCACTTTGAGTGTCCGGAGCAGCAGAGCAACCAG  1689

Query 1600  AAGGAGGAAAATAGTGAGGAATCGGGGACAGGGGACACCAGCCTGGCCGGTCAGCAGCTCGACTCCCATGCGCT  1673
            ||||||||.|..||||||||..|.||||||||||||.|||||....||..|||||||||||||.|.|||||.|.
Sbjct 1690  AAGGAGGACAGCAGTGAGGAGCCAGGGACAGGGGACCCCAGCACCCCCAATCAGCAGCTCGACCCTCATGCACC  1763

Query 1674  GCGGGCGCCTAGTGGCAGCTCACTACCCTCCAGCCCAGGCTCCAACTCACGCTCCCCCAACCGGCAGCACCAA  1746
            .|||||.||.||.|.||||||||||||..|.||.||||||.|.|||||||||||.|||||||..|||.|||||
Sbjct 1764  ACGGGCACCCAGCGCCAGCTCACTACCACCGAGTCCAGGCCCTAACTCACGCTCACCCAACCAACAGAACCAA  1836