Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000466827
• Subject: NM_011990.2
• Aligned Length: 1509
• Identities: 1316
• Gaps: 9

Alignment

Query    1  ATGGTCAGAAAGCCTGTTGTGTCCACCATCTCCAAAGGAGGTTACCTGCAGGGAAATGTTAACGGGAGGCTGCC  74
            ||||||||||||||.||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.|||.|.|.||||||||||||
Sbjct    1  ATGGTCAGAAAGCCAGTTGTGGCCACCATCTCCAAAGGAGGTTACCTGCAGGGCAATATGAGCGGGAGGCTGCC  74

Query   75  TTCCCTGGGCAACAAGGAGCCACCTGGGCAGGAGAAAGTGCAG--CTGAAGAGGAAAGTCACTTTACTGAGGGG  146
            .|||.||||..||.|.||||||||||||||||||||.||  ||  |||||.|.|||..|||||||.||||||||
Sbjct   75  CTCCATGGGGGACCAAGAGCCACCTGGGCAGGAGAAGGT--AGTTCTGAAAAAGAAGATCACTTTGCTGAGGGG  146

Query  147  AGTCTCCATTATCATTGGCACCATCATTGGAGCAGGAATCTTCATCTCTCCTAAGGGCGTGCTCCAGAACACGG  220
            .||||||||.|||||.||||||.||||.|||.||||.|||||||||||.||.||||||.|.|||||||||||||
Sbjct  147  GGTCTCCATCATCATCGGCACCGTCATCGGATCAGGCATCTTCATCTCCCCCAAGGGCATACTCCAGAACACGG  220

Query  221  GCAGCGTGGGCATGTCTCTGACCATCTGGACGGTGTGTGGGGTCCTGTCACTATTTGGAGCTTTGTCTTATGCT  294
            ||||||||||||||||.|||....|||||.|.|..|||||.||.||||||||.||||||||..||||.|||||.
Sbjct  221  GCAGCGTGGGCATGTCCCTGGTTTTCTGGTCTGCCTGTGGAGTACTGTCACTTTTTGGAGCCCTGTCCTATGCA  294

Query  295  GAATTGGGAACAACTATAAAGAAATCTGGAGGTCATTACACATATATTTTGGAAGTCTTTGGTCCATTACCAGC  368
            |||||.||.||||..||||||||||||||.||||||||||||||.|||.||||.|||||||||||.||.|..||
Sbjct  295  GAATTAGGTACAAGCATAAAGAAATCTGGTGGTCATTACACATACATTCTGGAGGTCTTTGGTCCTTTGCTGGC  368

Query  369  TTTTGTACGAGTCTGGGTGGAACTCCTCATAATACGCCCTGCAGCTACTGCTGTGATATCCCTGGCATTTGGAC  442
            ||||||.|||||||||||||||||.|||.||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  369  TTTTGTTCGAGTCTGGGTGGAACTGCTCGTAATACGCCCTGGAGCTACTGCTGTGATATCCCTGGCATTTGGAC  442

Query  443  GCTACATTCTGGAACCATTTTTTATTCAATGTGAAATCCCTGAACTTGCGATCAAGCTCATTACAGCTGTGGGC  516
            |||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||.|.||||||||||||
Sbjct  443  GCTACATCCTGGAACCATTTTTTATTCAATGTGAAATTCCTGAACTTGCAATCAAGCTCGTGACAGCTGTGGGC  516

Query  517  ATAACTGTAGTGATGGTCCTAAATAGCATGAGTGTCAGCTGGAGCGCCCGGATCCAGATTTTCTTAACCTTTTG  590
            ||.|||||.|||||||||||||||||||.|||||||||||||||.||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct  517  ATCACTGTGGTGATGGTCCTAAATAGCACGAGTGTCAGCTGGAGTGCCCGGATCCAGATTTTCCTAACCTTTTG  590

Query  591  CAAGCTCACAGCAATTCTGATAATTATAGTCCCTGGAGTTATGCAGCTAATTAAAGGTCAAACGCAGAACTTTA  664
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.||..||||||
Sbjct  591  CAAGCTCACAGCAATTCTGATAATTATAGTCCCTGGAGTTATACAGCTAATTAAAGGGCAAACACATCACTTTA  664

Query  665  AAGACGCCTTTTCAGGAAGAGATTCAAGTATTACGCGGTTGCCACTGGCTTTTTATTATGGAATGTATGCATAT  738
            ||||.||.||||||||||||||..|||||.|.|.|.|||||||..||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct  665  AAGATGCATTTTCAGGAAGAGACACAAGTCTAATGGGGTTGCCCTTGGCTTTTTATTATGGGATGTATGCATAT  738

Query  739  GCTGGCTGGTTTTACCTCAACTTTGTTACTGAAGAAGTAGAAAACCCTGAAAAAACCATTCCCCTTGCAATATG  812
            ||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||
Sbjct  739  GCTGGCTGGTTTTACCTCAACTTTATTACTGAAGAAGTAGACAACCCTGAAAAAACCATCCCCCTTGCAATCTG  812

Query  813  TATATCCATGGCCATTGTCACCATTGGCTATGTGCTGACAAATGTGGCCTACTTTACGACCATTAATGCTGAGG  886
            .||.||||||||.||..||||..|.|||||.||.||||||||.||||||||.|||||.|||||.|.|||.||||
Sbjct  813  CATCTCCATGGCTATCATCACAGTGGGCTACGTACTGACAAACGTGGCCTATTTTACCACCATCAGTGCGGAGG  886

Query  887  AGCTGCTGCTTTCAAATGCAGTGGCAGTGACCTTTTCTGAGCGGCTACTGGGAAATTTCTCATTAGCAGTTCCG  960
            |||||||||..||.|..||.|||||.||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||
Sbjct  887  AGCTGCTGCAGTCCAGCGCCGTGGCGGTGACCTTCTCTGAGCGGCTGCTGGGAAAATTCTCATTAGCAGTCCCG  960

Query  961  ATCTTTGTTGCCCTCTCCTGCTTTGGCTCCATGAACGGTGGTGTGTTTGCTGTCTCCAGGTTATTCTATGTTGC  1034
            |||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||
Sbjct  961  ATCTTTGTTGCCCTCTCCTGCTTCGGCTCCATGAACGGTGGTGTGTTCGCTGTCTCCAGGTTATTCTACGTCGC  1034

Query 1035  GTCTCGAGAGGGTCACCTTCCAGAAATCCTCTCCATGATTCATGTCCGCAAGCACACTCCTCTACCAGCTGTTA  1108
            .||||||||.||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||||.|||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 1035  ATCTCGAGAAGGGCACCTTCCGGAAATCCTCTCTATGATTCATGTCCACAAGCACACTCCTCTGCCAGCTGTTA  1108

Query 1109  TTGTTTTGCACCCTTTGACAATGATAATGCTCTTCTCTGGAGACCTCGACAGTCTTTTGAATTTCCTCAGTTTT  1182
            ||||||||||.|||.||||.|||.|.|||||||||||.|||||||||.|.||||||.|.|||||||||||||||
Sbjct 1109  TTGTTTTGCATCCTCTGACGATGGTGATGCTCTTCTCCGGAGACCTCTATAGTCTTCTAAATTTCCTCAGTTTT  1182

Query 1183  GCCAGGTGGCTTTTTATTGGGCTGGCAGTTGCTGGGCTGATTTATCTTCGATACAAATGCCCAGATATGCATCG  1256
            |||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 1183  GCCAGGTGGCTTTTTATGGGGCTGGCAGTCGCAGGACTGATTTATCTTCGATACAAACGCCCAGATATGCATCG  1256

Query 1257  TCCTTTCAAGGTGCCACTGTTCATCCCAGCTTTGTTTTCCTTCACATGCCTCTTCATGGTTGCCCTTTCCCTCT  1330
            |||||||||||||||.||.||||||||.||..|.|||||||||||.||||||||||||||||.|||.||.||.|
Sbjct 1257  TCCTTTCAAGGTGCCTCTCTTCATCCCGGCACTATTTTCCTTCACCTGCCTCTTCATGGTTGTCCTCTCTCTTT  1330

Query 1331  ATTCGGACCCATTTAGTACAGGGATTGGCTTCGTCATCACTCTGACTGGAGTCCCTGCGTATTATCTCTTTATT  1404
            |.|||||||||||.||.||.|||.|.||.||..|.|||||..|||||||.||||||||.|||||||||||.|||
Sbjct 1331  ACTCGGACCCATTCAGCACCGGGGTCGGTTTTCTTATCACCTTGACTGGGGTCCCTGCATATTATCTCTTCATT  1404

Query 1405  ATATGGGACAAGAAACCCAGGTGGTTTAGAATAATGTCAGAGAAAATAACCAGAACATTACAAATAATACTGGA  1478
            .||||||||||||||||||.||||||.|||..|.|.|||||.|.||||||||||||||||||.||.|||||.||
Sbjct 1405  GTATGGGACAAGAAACCCAAGTGGTTCAGACGATTATCAGACAGAATAACCAGAACATTACAGATTATACTAGA  1478

Query 1479  AGTTGTACCAGAAGA----AGATAAGTTA  1503
            |||||||||||||||    |.|.|| |||
Sbjct 1479  AGTTGTACCAGAAGACTCTAAAGAA-TTA  1506