Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000466827
- Subject:
- XM_006500778.3
- Aligned Length:
- 1530
- Identities:
- 1187
- Gaps:
- 180
Alignment
Query 1 ATGGTCAGAAAGCCTGTTGTGTCCACCATCTCCAAAGGAGGTTACCTGCAGGGAAATGTTAACGGGAGGCTGCC 74
.||||..|| ||| |||| || |||| ||||
Sbjct 1 ----------------ATGTGCTCA-CAT-TCCA-----------CT-----GAAA---------GAGG----- 26
Query 75 TTCCCTGGG----CAACAAGGA----GCCACCTGGGCAGGAGAAAGTGCAGCTGA--AGAG---GAAAGTCACT 135
.|||||.| .||.|||.| || |.|||||| || |||| |||||||.|
Sbjct 27 -ACCCTGTGATCTAAATAAGAATGATGC----------GAAGAAAG-------GATCAGAGTACGAAAGTCGC- 81
Query 136 TTACTGAGGGGAGTCTCCATTATCATTGGCACCATCATTGGAGCAGGAATCTTCATCTCTCCT---------AA 200
|.| ||||| |||||| || ||.|||| ||
Sbjct 82 ---CAG------GTCTC---------------------TGGAGC-----TC-----CTTTCCTGTCAAAACAAA 115
Query 201 GGGCGTGCTCCAGAACACGGGCAGCGTGGGCATGTCTCTGAC-CATCTGGACGGTGTGTGGGGTCCTGTCACTA 273
||.| |||.|||.||| |..|| ||.|||||.|
Sbjct 116 --GCAT-CTCAAGAGCAC-------------------CCCACACACCTGGAGG--------------------- 146
Query 274 TTTGGAGCTTTGTCTTATGCTGAATTGGGAACAACTATAAAGAAATCTGGAGGTCATTACACATATATTTTGGA 347
.|||||..||||.|||||.|||||.||.||||..||||||||||||||.||||||||||||||.|||.||||
Sbjct 147 --AGGAGCCCTGTCCTATGCAGAATTAGGTACAAGCATAAAGAAATCTGGTGGTCATTACACATACATTCTGGA 218
Query 348 AGTCTTTGGTCCATTACCAGCTTTTGTACGAGTCTGGGTGGAACTCCTCATAATACGCCCTGCAGCTACTGCTG 421
.|||||||||||.||.|..||||||||.|||||||||||||||||.|||.||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 219 GGTCTTTGGTCCTTTGCTGGCTTTTGTTCGAGTCTGGGTGGAACTGCTCGTAATACGCCCTGGAGCTACTGCTG 292
Query 422 TGATATCCCTGGCATTTGGACGCTACATTCTGGAACCATTTTTTATTCAATGTGAAATCCCTGAACTTGCGATC 495
||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||
Sbjct 293 TGATATCCCTGGCATTTGGACGCTACATCCTGGAACCATTTTTTATTCAATGTGAAATTCCTGAACTTGCAATC 366
Query 496 AAGCTCATTACAGCTGTGGGCATAACTGTAGTGATGGTCCTAAATAGCATGAGTGTCAGCTGGAGCGCCCGGAT 569
||||||.|.||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||.|||||||||||||||.||||||||
Sbjct 367 AAGCTCGTGACAGCTGTGGGCATCACTGTGGTGATGGTCCTAAATAGCACGAGTGTCAGCTGGAGTGCCCGGAT 440
Query 570 CCAGATTTTCTTAACCTTTTGCAAGCTCACAGCAATTCTGATAATTATAGTCCCTGGAGTTATGCAGCTAATTA 643
||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 441 CCAGATTTTCCTAACCTTTTGCAAGCTCACAGCAATTCTGATAATTATAGTCCCTGGAGTTATACAGCTAATTA 514
Query 644 AAGGTCAAACGCAGAACTTTAAAGACGCCTTTTCAGGAAGAGATTCAAGTATTACGCGGTTGCCACTGGCTTTT 717
||||.|||||.||..||||||||||.||.||||||||||||||..|||||.|.|.|.|||||||..||||||||
Sbjct 515 AAGGGCAAACACATCACTTTAAAGATGCATTTTCAGGAAGAGACACAAGTCTAATGGGGTTGCCCTTGGCTTTT 588
Query 718 TATTATGGAATGTATGCATATGCTGGCTGGTTTTACCTCAACTTTGTTACTGAAGAAGTAGAAAACCCTGAAAA 791
||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 589 TATTATGGGATGTATGCATATGCTGGCTGGTTTTACCTCAACTTTATTACTGAAGAAGTAGACAACCCTGAAAA 662
Query 792 AACCATTCCCCTTGCAATATGTATATCCATGGCCATTGTCACCATTGGCTATGTGCTGACAAATGTGGCCTACT 865
||||||.|||||||||||.||.||.||||||||.||..||||..|.|||||.||.||||||||.||||||||.|
Sbjct 663 AACCATCCCCCTTGCAATCTGCATCTCCATGGCTATCATCACAGTGGGCTACGTACTGACAAACGTGGCCTATT 736
Query 866 TTACGACCATTAATGCTGAGGAGCTGCTGCTTTCAAATGCAGTGGCAGTGACCTTTTCTGAGCGGCTACTGGGA 939
||||.|||||.|.|||.|||||||||||||..||.|..||.|||||.||||||||.|||||||||||.||||||
Sbjct 737 TTACCACCATCAGTGCGGAGGAGCTGCTGCAGTCCAGCGCCGTGGCGGTGACCTTCTCTGAGCGGCTGCTGGGA 810
Query 940 AATTTCTCATTAGCAGTTCCGATCTTTGTTGCCCTCTCCTGCTTTGGCTCCATGAACGGTGGTGTGTTTGCTGT 1013
||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 811 AAATTCTCATTAGCAGTCCCGATCTTTGTTGCCCTCTCCTGCTTCGGCTCCATGAACGGTGGTGTGTTCGCTGT 884
Query 1014 CTCCAGGTTATTCTATGTTGCGTCTCGAGAGGGTCACCTTCCAGAAATCCTCTCCATGATTCATGTCCGCAAGC 1087
|||||||||||||||.||.||.||||||||.||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||||.|||||
Sbjct 885 CTCCAGGTTATTCTACGTCGCATCTCGAGAAGGGCACCTTCCGGAAATCCTCTCTATGATTCATGTCCACAAGC 958
Query 1088 ACACTCCTCTACCAGCTGTTATTGTTTTGCACCCTTTGACAATGATAATGCTCTTCTCTGGAGACCTCGACAGT 1161
||||||||||.||||||||||||||||||||.|||.||||.|||.|.|||||||||||.|||||||||.|.|||
Sbjct 959 ACACTCCTCTGCCAGCTGTTATTGTTTTGCATCCTCTGACGATGGTGATGCTCTTCTCCGGAGACCTCTATAGT 1032
Query 1162 CTTTTGAATTTCCTCAGTTTTGCCAGGTGGCTTTTTATTGGGCTGGCAGTTGCTGGGCTGATTTATCTTCGATA 1235
|||.|.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.|||||||||||||||||
Sbjct 1033 CTTCTAAATTTCCTCAGTTTTGCCAGGTGGCTTTTTATGGGGCTGGCAGTCGCAGGACTGATTTATCTTCGATA 1106
Query 1236 CAAATGCCCAGATATGCATCGTCCTTTCAAGGTGCCACTGTTCATCCCAGCTTTGTTTTCCTTCACATGCCTCT 1309
||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||..|.|||||||||||.|||||||
Sbjct 1107 CAAACGCCCAGATATGCATCGTCCTTTCAAGGTGCCTCTCTTCATCCCGGCACTATTTTCCTTCACCTGCCTCT 1180
Query 1310 TCATGGTTGCCCTTTCCCTCTATTCGGACCCATTTAGTACAGGGATTGGCTTCGTCATCACTCTGACTGGAGTC 1383
|||||||||.|||.||.||.||.|||||||||||.||.||.|||.|.||.||..|.|||||..|||||||.|||
Sbjct 1181 TCATGGTTGTCCTCTCTCTTTACTCGGACCCATTCAGCACCGGGGTCGGTTTTCTTATCACCTTGACTGGGGTC 1254
Query 1384 CCTGCGTATTATCTCTTTATTATATGGGACAAGAAACCCAGGTGGTTTAGAATAATGTCAGAGAAAATAACCAG 1457
|||||.|||||||||||.|||.||||||||||||||||||.||||||.|||..|.|.|||||.|.|||||||||
Sbjct 1255 CCTGCATATTATCTCTTCATTGTATGGGACAAGAAACCCAAGTGGTTCAGACGATTATCAGACAGAATAACCAG 1328
Query 1458 AACATTACAAATAATACTGGAAGTTGTACCAGAAGA----AGATAAGTTA 1503
|||||||||.||.|||||.||||||||||||||||| |.|.|| |||
Sbjct 1329 AACATTACAGATTATACTAGAAGTTGTACCAGAAGACTCTAAAGAA-TTA 1377