Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000466876
• Subject: NM_022011.4
• Aligned Length: 1188
• Identities: 1074
• Gaps: 3

Alignment

Query    1  ATGGATGAAGAACCTGAAAGAACTAAGCGATGGGAAGGAGGCTATGAAAGAACATGGGAGATTCTTAAAGAAGA  74
            |||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGATGAAGAACCTGAGAGAACCAAGCGGTGGGAAGGAGGCTATGAGAGAACCTGGGAAATTCTTAAAGAAGA  74

Query   75  TGAATCTGGATCACTTAAAGCTACAATAGAAGACATTCTATTCAAGGCAAAGAGAAAAAGAGTATTTGAGCACC  148
            ||||.||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||
Sbjct   75  TGAAACTGGATCACTTAAAGCTACAATAGAAGATATTCTCTTCAAGGCAAAGAGGAAAAGAGTGTTTGAGCACC  148

Query  149  ATGGACAAGTTCGACTTGGAATGATGCGCCACCTTTATGTGGTAGTAGATGGATCAAGAACAATGGAAGACCAA  222
            ||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.||.
Sbjct  149  ATGGACAAGTCCGACTTGGAATGATGCGCCACCTGTATGTGGTGGTGGATGGATCGAGAACAATGGAAGATCAG  222

Query  223  GATTTAAAGCCTAATAGACTGACGTGTACTTTAAAGTTGTTGGAATACTTTGTAGAGGAATATTTTGATCAAAA  296
            |||||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||.||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  223  GATTTAAAGCCCAATAGACTGACTTGCACTTTAAAGTTGCTGGAATACTTTGTAGAAGAATATTTTGATCAAAA  296

Query  297  TCCTATTAGTCAGATTGGAATAATTGTAACTAAGAGTAAAAGAGCTGAAAAATTGACTGAACTTTCAGGAAACC  370
            .|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.||||||||||
Sbjct  297  CCCTATCAGTCAGATTGGAATAATTGTAACTAAGAGTAAAAGAGCTGAAAAACTGACTGAACTCTCAGGAAACC  370

Query  371  CAAGAAAACATATAACGTCTTTGAAGGAAGCTGTGGATATGACCTGCCATGGAGAGCCATCTCTTTATAATTCC  444
            ||||.|||||||||||.|||||||||.|||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||
Sbjct  371  CAAGGAAACATATAACATCTTTGAAGAAAGCTGTAGATATGACCTGCCATGGAGAACCATCGCTCTATAATTCC  444

Query  445  CTAAGCATGGCTATGCAGACTCTAAAACACATGCCTGGACATACAAGTCGAGAAGTACTAATCATCTTTAGCAG  518
            .|||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.|||||||.||.||||||||.|||||
Sbjct  445  TTAAGCATGGCTATGCAGACCCTAAAACACATGCCTGGACATACAAGTAGAGAAGTGCTCATCATCTTCAGCAG  518

Query  519  CCTTACAACTTGCGATCCATCTAATATTTATGATTTAATCAAGACCCTAAAGGCAGCTAAAATTAGAGTATCTG  592
            |||.||.||.||.|||||||||||||||||.|||.|.|||||||||||.|||.||||||||||||||||.||||
Sbjct  519  CCTCACCACCTGTGATCCATCTAATATTTACGATCTCATCAAGACCCTGAAGACAGCTAAAATTAGAGTGTCTG  592

Query  593  TTATTGGATTGTCTGCAGAAGTTCGCGTTTGCACTGTACTTGCTCGTGAAACTGGTGGCACGTACCATGTTATT  666
            ||||||||||.|||||.||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.
Sbjct  593  TTATTGGATTATCTGCGGAGGTTCGAGTTTGTACTGTACTTGCTCGTGAAACTGGTGGCACATACCATGTTATC  666

Query  667  TTAGATGAAAGCCATTACAAAGAGTTGCTCACACATCATCTTAGTCCTCCTCCTGCTAGCTCAAGTTCTGAATG  740
            ||||||||||.|||||||||.||||||.|..||||||||.|.||.||.||||||||.||||||||.||.||.||
Sbjct  667  TTAGATGAAACCCATTACAAGGAGTTGTTGGCACATCATGTGAGCCCCCCTCCTGCCAGCTCAAGCTCCGAGTG  740

Query  741  CTCACTTATTCGTATGGGATTTCCTCAGCACACCATTGCTTCTTTATCTGACCAGGATGCAAAACCCTCTTTCA  814
            ||||||.|||||.||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||.||||
Sbjct  741  CTCACTCATTCGCATGGGATTCCCTCAGCATACCATTGCTTCTTTGTCTGATCAGGATGCAAAACCATCCTTCA  814

Query  815  GCATGGCGCATTTGGATGGCAA---TACTGAGCCAGGGCTTACATTAGGAGGCTATTTCTGCCCACAGTGTCGG  885
            |||||||||||||||||..|||   .||||||||||||||||||.|.||||||||.||||||||||||||.||.
Sbjct  815  GCATGGCGCATTTGGATAACAACAGCACTGAGCCAGGGCTTACACTGGGAGGCTACTTCTGCCCACAGTGCCGA  888

Query  886  GCAAAGTACTGTGAGCTACCTGTTGAATGTAAAATCTGTGGTCTTACTTTGGTGTCTGCTCCCCACTTGGCACG  959
            |||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||.||||||.|
Sbjct  889  GCAAAGTACTGCGAGCTTCCTGTTGAATGTAAAATATGTGGTCTTACTTTGGTGTCTGCACCTCATTTGGCAAG  962

Query  960  GTCTTACCATCATTTGTTTCCTTTGGATGCTTTTCAAGAAATTCCCCTAGAAGAATATAATGGAGAAAGATTTT  1033
            .||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.||||||||.||||
Sbjct  963  ATCTTACCATCATTTATTTCCTTTGGATGCTTTTCAAGAAATTTCCCTAGAAGAATATAAAGGAGAAAGGTTTT  1036

Query 1034  GTTATGGATGTCAGGGGGAATTGAAAGACCAACATGTTTATGTTTGTGCTGTGTGCCAAAATGTTTTCTGTGTG  1107
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||..|.|||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1037  GTTATGGATGTCAGGGGGAATTGAAAGACCAACATGTCTATGTTTGCACAGTGTGCCAAAATGTTTTTTGTGTG  1110

Query 1108  GACTGTGATGTTTTTGTTCATGATTCTCTACACTGTTGCCCTGGCTGTATTCATAAGATTCCAGCTCCTTCAGG  1181
            |||||||||||.|||||||||||.|||||.||.|||||.||||||||||||||||||||.|||.||||||||||
Sbjct 1111  GACTGTGATGTCTTTGTTCATGACTCTCTCCATTGTTGTCCTGGCTGTATTCATAAGATCCCAACTCCTTCAGG  1184

Query 1182  TGTT  1185
            |.||
Sbjct 1185  TATT  1188