Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000466913
- Subject:
- XM_005255386.4
- Aligned Length:
- 1355
- Identities:
- 1157
- Gaps:
- 178
Alignment
Query 1 ---ATGCTG--GCGTCTCAAGGAGTTCTCCTGCATCCTTATGGCG-TGCCTA---TG---AT-TGTACCGGCAG 61
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Sbjct 1 ATGATGCAGCATCCTCTGACGGGGGCCACCTGC------GTGGCGCTCCCCAACGTGGGCATGTGTCCC--CAG 66
Query 62 CT--------CCTT-ACCTTCCTGGACTGA-TTCAGGGTAATCAGGAAGCAGCCGCTGCCCCTGACACAATGGC 125
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Sbjct 67 CTTTCGTGTGCCTTGACTTTTATGTACTTACAGCAGGGTAATCAGGAAGCAGCCGCTGCCCCTGACACAATGGC 140
Query 126 TCAGCCTTACGCTTCGGCCCAGTTTGCTCCCCCGCAGAACGGTATCCCCGCGGAATACACGGCCCCTCATCCCC 199
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Sbjct 141 TCAGCCTTACGCTTCGGCCCAGTTTGCTCCCCCGCAGAACGGTATCCCCGCGGAATACACGGCCCCTCATCCCC 214
Query 200 ACCCCGCGCCAGAGTACACAGGCCAGACCACGGTTCCCGAGCACACATTAAACCTGTACCCTCCCGCCCAGACG 273
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Sbjct 215 ACCCCGCGCCAGAGTACACAGGCCAGACCACGGTTCCCGAGCACACATTAAACCTGTACCCTCCCGCCCAGACG 288
Query 274 CACTCCGAGCAGAGCCCGGCGGACACGAGCGCTCAGACCGTCTCTGGCACCGCCACACAGACAGATGACGCAGC 347
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Sbjct 289 CACTCCGAGCAGAGCCCGGCGGACACGAGCGCTCAGACCGTCTCTGGCACCGCCACACAGACAGATGACGCAGC 362
Query 348 ACCGACGGATGGCCAGCCCCAGACACAACCTTCTGAAAACACGGAAAACAAGTCTCAGCCCAAGCGGCTGCATG 421
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Sbjct 363 ACCGACGGATGGCCAGCCCCAGACACAACCTTCTGAAAACACGGAAAACAAGTCTCAGCCCAAGCGGCTGCATG 436
Query 422 TCTCCAATATCCCCTTCAGGTTCCGGGATCCGGACCTCAGACAAATGTTTGGTCAATTTGGTAAAATCTTAGAT 495
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Sbjct 437 TCTCCAATATCCCCTTCAGGTTCCGGGATCCGGACCTCAGACAAATGTTTGGTCAATTTGGTAAAATCTTAGAT 510
Query 496 GTTGAAATTATTTTTAATGAGCGAGGCTCAAAGGGATTTGGTTTCGTAACTTTCGAAAATAGTGCCGATGCGGA 569
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Sbjct 511 GTTGAAATTATTTTTAATGAGCGAGGCTCAAAGGGATTTGGTTTCGTAACTTTCGAAAATAGTGCCGATGCGGA 584
Query 570 CAGGGCGAGGGAGAAATTACACGGCACCGTGGTAGAGGGCCGTAAAATCGAGGTAAATAATGCCACAGCACGTG 643
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Sbjct 585 CAGGGCGAGGGAGAAATTACACGGCACCGTGGTAGAGGGCCGTAAAATCGAGGTAAATAATGCCACAGCACGTG 658
Query 644 TAATGACAAATAAAAAGACCGTCAACCCTTATACAAATGGCTGGAAATTGAATCCAGTTGTGGGTGCAGTCTAC 717
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Sbjct 659 TAATGACAAATAAAAAGACCGTCAACCCTTATACAAATGGCTGGAAATTGAATCCAGTTGTGGGTGCAGTCTAC 732
Query 718 AGTCCCGAATTCTATGCAGGCACGGTCCTGTTGTGCCAGGCCAACCAGGAGGGATCTTCCATGTACAGTGCCCC 791
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Sbjct 733 AGTCCCGAATTCTATGCAGGCACGGTCCTGTTGTGCCAGGCCAACCAGGAGGGATCTTCCATGTACAGTGCCCC 806
Query 792 CAGTTCACTTGTATATACTTCTGCAATGCCAGGCTTCCCGTATCCAGCAGCCACCGCCGCGGCCGCCTACCGAG 865
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Sbjct 807 CAGTTCACTTGTATATACTTCTGCAATGCCAGGCTTCCCGTATCCAGCAGCCACCGCCGCGGCCGCCTACCGAG 880
Query 866 GGGCGCACCTGCGAGGCCGCGGTCGCACCGTGTACAACACCTTCAGGGCCGCGGCGCCCCCGCCCCCGATCCCG 939
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Sbjct 881 GGGCGCACCTGCGAGGCCGCGGTCGCACCGTGTACAACACCTTCAGGGCCGCGGCGCCCCCGCCCCCGATCCCG 954
Query 940 GCCTACGGCGGAGTAGTGTATCAAGAGCCTGTGTATGGCAATAAATTGCTGCAGGGTGGTTATGCTGCATACCG 1013
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Sbjct 955 GCCTACGGCGGAGTAGTGTATCAAGAGCCTGTGTATGGCAATAAATTGCTGCAGGGTGGTTATGCTGCATACCG 1028
Query 1014 CTACGCCCAGCCTACCCCTGCCACTGCCGCTGCCTACAGTGACAGAAATCAGTTCGTCTTCGTTGCAGCAGATG 1087
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Sbjct 1029 CTACGCCCAGCCTACCCCTGCCACTGCCGCTGCCTACAGTGACAGAAATCAGTTCGTCTTCGTTGCAGCAGATG 1102
Query 1088 AAATTTCTTGTAACACCTCTGCAGTTACGGACGAGTTTATGCTGCCGACCCCTACCACCACGCACTTGCTCCAG 1161
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Sbjct 1103 AAATTTCTTGTAACACCTCTGCAGTTACGGACGAGTTTATGCTGCCGACCCCTACCACCACGCACTTGCTCCAG 1176
Query 1162 CCCCCACCTACGGCGTTGGTGCCA-------------------------------------------------- 1185
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Sbjct 1177 CCCCCACCTACGGCGTTGGTGCCATGCCCCAAGGTTCCAGCCCCAGCACAGACTTCAGAGGAGCTAAGCTGCAC 1250
Query 1186 -------------------------------------------------------------------------- 1185
Sbjct 1251 ACTTCCAGGCCTCTGCTGTCAGGCAGCTGAGAATCTGACTGCCTCTCCTCCCCTATTACAATTCATGTTTAAAG 1324
Query 1186 ----------------------- 1185
Sbjct 1325 TCATAGTCGCCCAGGAAAGAAAA 1347