Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000466913
• Subject: XM_006522177.3
• Aligned Length: 1333
• Identities: 1034
• Gaps: 206

Alignment

Query    1  ATGCTGGCGTCTCAAG-GAGTTCTCCTGCATCCTTATGGCGTGCCTATGATTGTACCGGCAGCTCCTTACCTTC  73
            |||..||       || |||    |.||||.|   ||||                  .||||            
Sbjct    1  ATGGAGG-------AGAGAG----CATGCAGC---ATGG------------------TGCAG------------  30

Query   74  CTGGACTGATTCAGGGTAATCAGGAAGCAGCCGCTGCCCCTGACACAATGGCTCAGCCTTACGCTTCGGCCCAG  147
                       |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||.||.|||
Sbjct   31  -----------CAGGGTAATCAGGAAGCAGCCGCCGCCCCTGACACAATGGCTCAGCCTTATGCCTCAGCGCAG  93

Query  148  TTTGCTCCCCCGCAGAACGGTATCCCCGCGGAATACACGGCCCCTCATCCCCACCCCGCGCCAGAGTACACAGG  221
            ||.||.||.||.|||||.||.|||||.||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||
Sbjct   94  TTCGCACCACCCCAGAATGGCATCCCTGCAGAATACACGGCCCCTCATCCTCATCCCGCGCCAGAGTACACCGG  167

Query  222  CCAGACCACGGTTCCCGAGCACACATTAAACCTGTACCCTCCCGCCCAGACGCACTCCGAGCAGAGCCCGGCGG  295
            |||||||||.||.||.||.|||||||||||||||||.|||||..|.|||||||||||.||||||||   .||.|
Sbjct  168  CCAGACCACTGTCCCTGACCACACATTAAACCTGTATCCTCCTACACAGACGCACTCGGAGCAGAG---TGCTG  238

Query  296  ACACGAGCGCTCAGACCGTCTCTGGCACCGCCACACAGACAGATGACGCAGCACCGACGGATGGCCAGCCCCAG  369
            ||||.||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||.||||||||||||
Sbjct  239  ACACCAGTGCGCAGACCGTCTCCGGCACCGCCACACAGACAGATGATGCAGCCCCGACCGACGGCCAGCCCCAG  312

Query  370  ACACAACCTTCTGAAAACACGGAAAACAAGTCTCAGCCCAAGCGGCTGCATGTCTCCAATATCCCCTTCAGGTT  443
            ||||||||||||||||||||.||||.||||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||.||||
Sbjct  313  ACACAACCTTCTGAAAACACAGAAAGCAAGTCCCAGCCCAAGCGGCTGCATGTGTCCAACATCCCTTTCCGGTT  386

Query  444  CCGGGATCCGGACCTCAGACAAATGTTTGGTCAATTTGGTAAAATCTTAGATGTTGAAATTATTTTTAATGAGC  517
            |||||||||.||||||.||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  387  CCGGGATCCAGACCTCCGACAAATGTTTGGTCAATTTGGTAAAATATTAGATGTTGAAATTATTTTTAATGAGC  460

Query  518  GAGGCTCAAAGGGATTTGGTTTCGTAACTTTCGAAAATAGTGCCGATGCGGACAGGGCGAGGGAGAAATTACAC  591
            |||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  461  GAGGCTCCAAGGGATTTGGTTTCGTAACTTTCGAAAATAGTGCGGATGCGGACAGGGCGAGGGAGAAATTGCAC  534

Query  592  GGCACCGTGGTAGAGGGCCGTAAAATCGAGGTAAATAATGCCACAGCACGTGTAATGACAAATAAAAAGACCGT  665
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||.|||||||||||.|||||.||
Sbjct  535  GGTACCGTGGTAGAGGGCCGTAAAATCGAGGTTAATAATGCGACAGCACGCGTGATGACAAATAAGAAGACTGT  608

Query  666  CAACCCTTATACAAATGGCTGGAAATTGAATCCAGTTGTGGGTGCAGTCTACAGTCCCGAATTCTATGCAGGCA  739
            ||||||.||.||.||||||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||.|||||.|||||||||||||
Sbjct  609  CAACCCCTACACCAATGGCTGGAAATTAAATCCAGTTGTGGGCGCGGTCTACAGCCCCGACTTCTATGCAGGCA  682

Query  740  CGGTCCTGTTGTGCCAGGCCAACCAGGAGGGATCTTCCATGTACAGTGCCCCCAGTTCACTTGTATATACTTCT  813
            ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct  683  CGGTGCTGTTGTGCCAGGCCAACCAGGAGGGATCTTCCATGTACAGTGGCCCCAGTTCACTTGTATATACTTCT  756

Query  814  GCAATGCCAGGCTTCCCGTATCCAGCAGCCACCGCCGCGGCCGCCTACCGAGGGGCGCACCTGCGAGGCCGCGG  887
            ||||||||.||||||||.|||||.||.|||||.||.||.||.||.|||||||||||.|||||.||||||||.||
Sbjct  757  GCAATGCCTGGCTTCCCATATCCGGCCGCCACTGCTGCAGCTGCATACCGAGGGGCTCACCTTCGAGGCCGTGG  830

Query  888  TCGCACCGTGTACAACACCTTCAGGGCCGCGGCGCCCCCGCCCCCGATCCCGGCCTACGGCGGAGTAGTGTATC  961
            |||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct  831  TCGCACCGTGTACAACACCTTCAGGGCTGCAGCGCCCCCGCCCCCAATCCCGGCCTATGGCGGAGTAGTGTATC  904

Query  962  AAGAGCCTGTGTATGGCAATAAATTGCTGCAGGGTGGTTATGCTGCATACCGCTACGCCCAGCCTACCCCTGCC  1035
            |||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||
Sbjct  905  AAGAGCCAGTGTATGGCAATAAATTGCTACAGGGTGGTTATGCTGCGTACCGCTATGCCCAGCCCACCCCTGCC  978

Query 1036  ACTGCCGCTGCCTACAGTGACAGAAATCAGTTCGTCTTCGTTGCAGCAGATGAAATTTCTTGTAACACCTCTGC  1109
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  979  ACTGCCGCTGCCTACAGTGACAGAAATCAGTTCGTCTTCGTTGCAACAGATGAAATTTCTTGTAACACCTCTGC  1052

Query 1110  AGTTACGGACGAGTTTATGCTGCCGACCCCTACCACCACGCACTTGCTCCAGCCCCCACCTACGGCGTTGGTGC  1183
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1053  AGTTACGGACGAGTTTATGCTGCCGACCCCTACCACCACACACTTGCTCCAGCCCCCACCTACGGCGTTGGTGC  1126

Query 1184  CA------------------------------------------------------------------------  1185
            ||                                                                        
Sbjct 1127  CATGCCCCAAGGTTCCAGCCCCAGCACAGACTTCAGAGGAGCTAAGCTGCAGACTTCCAGGCCTCTGCTGTCAG  1200

Query 1186  --------------------------------------------------------------------------  1185
                                                                                      
Sbjct 1201  GCAGCTGAGCATCTGCCTGCCTCTCCTCCCCTTTTACAATTCATGTTTAAAGTCATAGTCGCCCAGGAGAGAAA  1274

Query 1186  -  1185
             
Sbjct 1275  G  1275