Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000466913
• Subject: XM_011245920.1
• Aligned Length: 1193
• Identities: 932
• Gaps: 175

Alignment

Query    1  ATGCTGGCGTCTCAAGGAGTTCTCCTGCATCCTTATGGCGTGCCTATG-ATTGTACCG-------GCAGCTCCT  66
                                                         ||| |||||   |       ||||||   
Sbjct    1  ---------------------------------------------ATGAATTGT---GAAAGAGAGCAGCT---  23

Query   67  TACCTTCCTGGACTGATTCAGGGTAATCAGGAAGCAGCCGCTGCCCCTGACACAATGGCTCAGCCTTACGCTTC  140
                      ||       .|||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||
Sbjct   24  ----------GA-------GGGGTAATCAGGAAGCAGCCGCCGCCCCTGACACAATGGCTCAGCCTTATGCCTC  80

Query  141  GGCCCAGTTTGCTCCCCCGCAGAACGGTATCCCCGCGGAATACACGGCCCCTCATCCCCACCCCGCGCCAGAGT  214
            .||.|||||.||.||.||.|||||.||.|||||.||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||
Sbjct   81  AGCGCAGTTCGCACCACCCCAGAATGGCATCCCTGCAGAATACACGGCCCCTCATCCTCATCCCGCGCCAGAGT  154

Query  215  ACACAGGCCAGACCACGGTTCCCGAGCACACATTAAACCTGTACCCTCCCGCCCAGACGCACTCCGAGCAGAGC  288
            ||||.|||||||||||.||.||.||.|||||||||||||||||.|||||..|.|||||||||||.|||||||| 
Sbjct  155  ACACCGGCCAGACCACTGTCCCTGACCACACATTAAACCTGTATCCTCCTACACAGACGCACTCGGAGCAGAG-  227

Query  289  CCGGCGGACACGAGCGCTCAGACCGTCTCTGGCACCGCCACACAGACAGATGACGCAGCACCGACGGATGGCCA  362
              .||.|||||.||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||.|||||
Sbjct  228  --TGCTGACACCAGTGCGCAGACCGTCTCCGGCACCGCCACACAGACAGATGATGCAGCCCCGACCGACGGCCA  299

Query  363  GCCCCAGACACAACCTTCTGAAAACACGGAAAACAAGTCTCAGCCCAAGCGGCTGCATGTCTCCAATATCCCCT  436
            |||||||||||||||||||||||||||.||||.||||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|
Sbjct  300  GCCCCAGACACAACCTTCTGAAAACACAGAAAGCAAGTCCCAGCCCAAGCGGCTGCATGTGTCCAACATCCCTT  373

Query  437  TCAGGTTCCGGGATCCGGACCTCAGACAAATGTTTGGTCAATTTGGTAAAATCTTAGATGTTGAAATTATTTTT  510
            ||.|||||||||||||.||||||.||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  374  TCCGGTTCCGGGATCCAGACCTCCGACAAATGTTTGGTCAATTTGGTAAAATATTAGATGTTGAAATTATTTTT  447

Query  511  AATGAGCGAGGCTCAAAGGGATTTGGTTTCGTAACTTTCGAAAATAGTGCCGATGCGGACAGGGCGAGGGAGAA  584
            ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  448  AATGAGCGAGGCTCCAAGGGATTTGGTTTCGTAACTTTCGAAAATAGTGCGGATGCGGACAGGGCGAGGGAGAA  521

Query  585  ATTACACGGCACCGTGGTAGAGGGCCGTAAAATCGAGGTAAATAATGCCACAGCACGTGTAATGACAAATAAAA  658
            |||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||.|||||||||||.|
Sbjct  522  ATTGCACGGTACCGTGGTAGAGGGCCGTAAAATCGAGGTTAATAATGCGACAGCACGCGTGATGACAAATAAGA  595

Query  659  AGACCGTCAACCCTTATACAAATGGCTGGAAATTGAATCCAGTTGTGGGTGCAGTCTACAGTCCCGAATTCTAT  732
            ||||.||||||||.||.||.||||||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||.|||||.||||||
Sbjct  596  AGACTGTCAACCCCTACACCAATGGCTGGAAATTAAATCCAGTTGTGGGCGCGGTCTACAGCCCCGACTTCTAT  669

Query  733  GCAGGCACGGTCCTGTTGTGCCAGGCCAACCAGGAGGGATCTTCCATGTACAGTGCCCCCAGTTCACTTGTATA  806
            |||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct  670  GCAGGCACGGTGCTGTTGTGCCAGGCCAACCAGGAGGGATCTTCCATGTACAGTGGCCCCAGTTCACTTGTATA  743

Query  807  TACTTCTGCAATGCCAGGCTTCCCGTATCCAGCAGCCACCGCCGCGGCCGCCTACCGAGGGGCGCACCTGCGAG  880
            |||||||||||||||.||||||||.|||||.||.|||||.||.||.||.||.|||||||||||.|||||.||||
Sbjct  744  TACTTCTGCAATGCCTGGCTTCCCATATCCGGCCGCCACTGCTGCAGCTGCATACCGAGGGGCTCACCTTCGAG  817

Query  881  GCCGCGGTCGCACCGTGTACAACACCTTCAGGGCCGCGGCGCCCCCGCCCCCGATCCCGGCCTACGGCGGAGTA  954
            ||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||.||||     
Sbjct  818  GCCGTGGTCGCACCGTGTACAACACCTTCAGGGCTGCAGCGCCCCCGCCCCCAATCCCGGCCTATGGCG-----  886

Query  955  GTGTATCAAGAGCCTGTGTATGGCAATAAATTGCTGCAGGGTGGTTATGCTGCATACCGCTACGCCCAGCCTAC  1028
                                                  |||||||||||||||.||||||||.||||||||.||
Sbjct  887  --------------------------------------GGGTGGTTATGCTGCGTACCGCTATGCCCAGCCCAC  922

Query 1029  CCCTGCCACTGCCGCTGCCTACAGTGACAGAAATCAGTTCGTCTTCGTTGCAGCAGATGAAATTTCTTGTAACA  1102
            |||||||||||||||||||||||||||                                               
Sbjct  923  CCCTGCCACTGCCGCTGCCTACAGTGA-----------------------------------------------  949

Query 1103  CCTCTGCAGTTACGGACGAGTTTATGCTGCCGACCCCTACCACCACGCACTTGCTCCAGCCCCCACCTACGGCG  1176
                  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  950  ------CAGTTACGGACGAGTTTATGCTGCCGACCCCTACCACCACACACTTGCTCCAGCCCCCACCTACGGCG  1017

Query 1177  TTGGTGCCA  1185
            |||||||||
Sbjct 1018  TTGGTGCCA  1026