Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000466954
- Subject:
- NM_001113486.1
- Aligned Length:
- 1781
- Identities:
- 1475
- Gaps:
- 109
Alignment
Query 1 -----------------ATGGAG----AGGGAC--------------------------CGGAT--------CT 19
| |||| |.|||| ||||| |.
Sbjct 1 ATGAAGAAGTCCTACTCA-GGAGTCACACGGACCTCCAGCGGTCGCCTCCGGAGGCTTGCGGATCCCACTGGCC 73
Query 20 CAGCCTTGAAAAGATCTTTTGAGGTCGAGGAGGTCGAGACACCCAACTCCACCCCACCCCGGAGGGTCCAGACT 93
|||||||.||.|||||.|||||.|||||||||.|.|||.|.|||||||||||.||||||||||||||||||||.
Sbjct 74 CAGCCTTAAAGAGATCGTTTGAAGTCGAGGAGATTGAGCCGCCCAACTCCACGCCACCCCGGAGGGTCCAGACC 147
Query 94 CCCCTACTCCGAGCCACTGTGGCCAGCTCCACCCAGAAATTCCAGGACCTGGGCGTGAAGAACTCAGAACCCTC 167
||.||.|||||.|||||.|||||||||||||.|||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||.|
Sbjct 148 CCTCTGCTCCGCGCCACGGTGGCCAGCTCCAGCCAGAAATTCCAGGACCTGGGGGTGAAGAACTCAGAGCCCGC 221
Query 168 GGCCCGCCATGTGGACTCCCTAAGCCAACGCTCCCCCAAGGCGTCCCTGCGGAGGGTGGAGCTCTCGGGCCCCA 241
.|||||||.|||.||||||||.|||||.||||||||||||.|.||||||||||||||||||||..||||..|||
Sbjct 222 TGCCCGCCTTGTAGACTCCCTGAGCCAGCGCTCCCCCAAGCCTTCCCTGCGGAGGGTGGAGCTGGCGGGAGCCA 295
Query 242 AGGCGGCCGAGCCGGTGTCCCGGCGCACTGAGCTGTCCATTGACATCTCGTCCAAGCAGGTGGAGA--ACG--- 310
|||||.|.|||||..||||.||.|||||.|||.|.|||||.||||||||.|||||||||||||||| |||
Sbjct 296 AGGCGCCTGAGCCCATGTCTCGACGCACAGAGATCTCCATCGACATCTCCTCCAAGCAGGTGGAGAGCACGGCC 369
Query 311 -CCGGGGCCATCGGCCCGTCCCGGTTCGGGCTCAAGAGGGCCGAGGTGTTGGGCCACAAGACGCCAGAACCGGC 383
|||..|| |||.||.||.||||||||.||.||||||||.||.||..|||||||||||||.|||||.||.|.
Sbjct 370 TCCGCTGC---CGGGCCCTCACGGTTCGGCCTTAAGAGGGCTGAAGTCCTGGGCCACAAGACCCCAGAGCCTGT 440
Query 384 CCCTCGGAGGACGGAGATCACCATCGTCAAACCCCAGGAGTCAGCCCACCGGAGGATGGAGCCCCCTGCCTCCA 457
||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||||..|.|||.|||.|||||.||||||||||||
Sbjct 441 CCCTCGGAGGACGGAGATCACCATTGTCAAGCCTCAGGAGTCAGTGCTCCGCAGGGTGGAGACCCCTGCCTCCA 514
Query 458 AGGTCCCCGAGGTGCCCACTGCC---CCTGCCACCGACGCAGCCCCCAAGAGGGTGGAGATCCAGATGCCCAAG 528
||.|.||||||| .|.||||| ||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||.||||||||
Sbjct 515 AGATTCCCGAGG---GCTCTGCCGTGCCTGCCACAGATGCAGCCCCCAAGAGGGTAGAGATCCAGGTGCCCAAG 585
Query 529 CCTGCTGAGGCGCCCA-----CCGCCCCCAGCCCAG-CCCAGACCTTGGAGAATTCAGAGCCTGCCCCTGTGTC 596
||.||||||||.|||| ||||.||| | ||||||||.|||||||.||.||| |||||..||||
Sbjct 586 CCAGCTGAGGCACCCAACTGTCCGCTCCC------GTCCCAGACCCTGGAGAACTCCGAG---GCCCCGATGTC 650
Query 597 TCAGCTGCAGAGCAGGCTGGAGCCCAAGCC--CCAGCCCCCTGTGGCTGAGGCTACACCC----CGGAGCCAGG 664
|||.||||||||||||||||||||||.||| || |||||||||| .||| ||||.|||||
Sbjct 651 TCAACTGCAGAGCAGGCTGGAGCCCAGGCCTTCC--------GTGGCTGAGG----TCCCATATCGGAACCAGG 712
Query 665 AGGCCACTGAGGCGGCTCCCAGCTGCGTTGGCGACATGGCCGACACCCCCAGAGATGCCGGGCTCAAGCAGGCG 738
|.|.|.|.||||.|.||||||||||.||||||||||||||.||||.|||.|||||||||..||||||||||||.
Sbjct 713 AAGACTCCGAGGTGACTCCCAGCTGTGTTGGCGACATGGCTGACAACCCTAGAGATGCCATGCTCAAGCAGGCC 786
Query 739 CCTGCATCACGGAACGAGAAGGCCCCGGTGGACTTCGGCTACGTGGGGATTGACTCCATCCTGGAGCAGATGCG 812
||.||.|||||||||||.||||||||..||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 787 CCCGCGTCACGGAACGAAAAGGCCCCCATGGAGTTCGGCTATGTGGGGATCGACTCCATCCTGGAGCAGATGCG 860
Query 813 CCGGAAGGCCATGAAGCAGGGCTTCGAGTTCAACATCATGGTGGTCGGGCAGAGCGGCTTGGGTAAATCCACCT 886
|.|||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||.|.||.||.|||||.|
Sbjct 861 CAGGAAGGCTATGAAACAGGGCTTCGAGTTTAACATCATGGTGGTTGGGCAGAGCGGCCTCGGGAAGTCCACTT 934
Query 887 TAATCAACACCCTCTTCAAATCCAAAATCAGCCGGAAGTCGGTGCAGCCCACCTCAGAGGAGCGCATCCCCAAG 960
|||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||
Sbjct 935 TAATCAATACCCTCTTCAAGTCCAAAATCAGCCGGAAGTCGGTGCAGCCCACCTCGGAGGAACGCATCCCCAAG 1008
Query 961 ACCATCGAGATCAAGTCCATCACGCACGATATTGAGGAGAAAGGCGTCCGGATGAAGCTGACAGTGATTGACAC 1034
||.|||||.||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.||.||.||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1009 ACGATCGAAATCAAGTCGATCACCCACGATATTGAAGAGAAGGGGGTTCGAATGAAGCTGACAGTGATTGACAC 1082
Query 1035 ACCAGGGTTCGGGGACCACATCAACAACGAGAACTGCTGGCAGCCCATCATGAAGTTCATCAATGACCAGTACG 1108
.||.||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.|
Sbjct 1083 GCCGGGCTTCGGAGACCACATCAACAATGAGAACTGCTGGCAGCCCATTATGAAGTTCATCAATGACCAATATG 1156
Query 1109 AGAAATACCTGCAGGAGGAGGTCAACATCAACCGCAAGAAGCGCATCCCGGACACCCGCGTCCACTGCTGCCTC 1182
||||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1157 AGAAGTACCTGCAGGAGGAAGTCAACATCAACCGGAAGAAGCGCATTCCCGACACCCGTGTCCACTGCTGCCTC 1230
Query 1183 TACTTCATCCCCGCCACCGGCCACTCCCTCAGGCCCCTGGACATCGAGTTTATGAAACGCCTGAGCAAGGTGGT 1256
|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.|||||.|||||.|||||.|||||
Sbjct 1231 TACTTCATCCCAGCCACCGGCCACTCGCTCAGGCCCCTGGACATTGAATTCATGAAGCGCCTAAGCAAAGTGGT 1304
Query 1257 CAACATCGTCCCTGTCATCGCCAAGGCGGACACACTCACCCTGGAGGAGAGGGTCCACTTCAAACAGCGGATCA 1330
.|||||.|||||.||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1305 GAACATTGTCCCAGTCATCGCCAAGGCTGACACGCTGACCCTGGAGGAGAGGGTCTACTTCAAACAGCGGATCA 1378
Query 1331 CCGCAGACCTGCTGTCCAACGGCATCGACGTGTACCCCCAGAAGGAATTTGATGAGGACTCGGAGGACCGGCTG 1404
|.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||.|.||.|||||||||
Sbjct 1379 CTGCAGACCTGCTGTCCAACGGCATTGACGTGTACCCGCAGAAGGAGTTTGATGAGGACGCAGAAGACCGGCTG 1452
Query 1405 GTGAACGAGAAGTTCCGGGAGATGATCCCATTTGCTGTGGTGGGCAGTGACCACGAGTACCAGGTCAACGGCAA 1478
||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||.|||||.|||||
Sbjct 1453 GTGAACGAAAAGTTCCGGGAGATGATCCCATTTGCTGTGGTGGGCAGCGACCATGAGTATCAAGTCAATGGCAA 1526
Query 1479 GAGGATCCTTGGGAGGAAGACCAAGTGGGGTACCATCGAAGTTGAAAACACCACACACTGTGAGTTTGCCTACC 1552
||||||.||.||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||.||.|||||.||||||||.|||||.||||
Sbjct 1527 GAGGATTCTGGGAAGGAAGACCAAGTGGGGCACTATCGAAGTTGAGAATACCACTCACTGTGAATTTGCTTACC 1600
Query 1553 TGCGGGACCTTCTCATCAGGACGCACATGCAGAACATCAAGGACATCACCAGCAGCATCCACTTCGAGGCGTAC 1626
|||||||.||.||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||.||||||||||||.||.|||
Sbjct 1601 TGCGGGATCTCCTTATCAGGACGCACATGCAAAACATCAAAGACATCACCAGCAACATCCACTTCGAAGCCTAC 1674
Query 1627 CGTGTGAAGCGCCTCAACGAGGGCAGCAGCGCCATGGCCAACGGCGTGGA-GGAGAAGGAGCCAGAAGCCCCGG 1699
||.|||||.||||||||||||||||.||||||||||||||||| ||| .|||||||||||.|||||||.||
Sbjct 1675 CGAGTGAAACGCCTCAACGAGGGCAACAGCGCCATGGCCAACG----GGATCGAGAAGGAGCCGGAAGCCCAGG 1744
Query 1700 AGAGG 1704
|||.|
Sbjct 1745 AGATG 1749