Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000466954
• Subject: XM_006533744.1
• Aligned Length: 1726
• Identities: 1474
• Gaps: 53

Alignment

Query    1  ATGGAGAGGGACCGGATCTCAGCCTTGAAAAGATCTTTTGAGGTCGAGGAGGTCGAGACACCCAACTCCACCCC  74
            ||||||||.||.||.|||.|||||||.||.|||||.|||||.|||||||||.|.|||.|.|||||||||||.||
Sbjct    1  ATGGAGAGAGATCGCATCACAGCCTTAAAGAGATCGTTTGAAGTCGAGGAGATTGAGCCGCCCAACTCCACGCC  74

Query   75  ACCCCGGAGGGTCCAGACTCCCCTACTCCGAGCCACTGTGGCCAGCTCCACCCAGAAATTCCAGGACCTGGGCG  148
            ||||||||||||||||||.||.||.|||||.|||||.|||||||||||||.|||||||||||||||||||||.|
Sbjct   75  ACCCCGGAGGGTCCAGACCCCTCTGCTCCGCGCCACGGTGGCCAGCTCCAGCCAGAAATTCCAGGACCTGGGGG  148

Query  149  TGAAGAACTCAGAACCCTCGGCCCGCCATGTGGACTCCCTAAGCCAACGCTCCCCCAAGGCGTCCCTGCGGAGG  222
            |||||||||||||.|||.|.|||||||.|||.||||||||.|||||.||||||||||||.|.||||||||||||
Sbjct  149  TGAAGAACTCAGAGCCCGCTGCCCGCCTTGTAGACTCCCTGAGCCAGCGCTCCCCCAAGCCTTCCCTGCGGAGG  222

Query  223  GTGGAGCTCTCGGGCCCCAAGGCGGCCGAGCCGGTGTCCCGGCGCACTGAGCTGTCCATTGACATCTCGTCCAA  296
            ||||||||..||||..||||||||.|.|||||..||||.||.|||||.|||.|.|||||.||||||||.|||||
Sbjct  223  GTGGAGCTGGCGGGAGCCAAGGCGCCTGAGCCCATGTCTCGACGCACAGAGATCTCCATCGACATCTCCTCCAA  296

Query  297  GCAGGTGGAGA--ACG----CCGGGGCCATCGGCCCGTCCCGGTTCGGGCTCAAGAGGGCCGAGGTGTTGGGCC  364
            |||||||||||  |||    |||..||   |||.||.||.||||||||.||.||||||||.||.||..||||||
Sbjct  297  GCAGGTGGAGAGCACGGCCTCCGCTGC---CGGGCCCTCACGGTTCGGCCTTAAGAGGGCTGAAGTCCTGGGCC  367

Query  365  ACAAGACGCCAGAACCGGCCCCTCGGAGGACGGAGATCACCATCGTCAAACCCCAGGAGTCAGCCCACCGGAGG  438
            |||||||.|||||.||.|.||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||||..|.|||.|||
Sbjct  368  ACAAGACCCCAGAGCCTGTCCCTCGGAGGACGGAGATCACCATTGTCAAGCCTCAGGAGTCAGTGCTCCGCAGG  441

Query  439  ATGGAGCCCCCTGCCTCCAAGGTCCCCGAGGTGCCCACTGCC---CCTGCCACCGACGCAGCCCCCAAGAGGGT  509
            .|||||.||||||||||||||.|.|||||||   .|.|||||   ||||||||.||.|||||||||||||||||
Sbjct  442  GTGGAGACCCCTGCCTCCAAGATTCCCGAGG---GCTCTGCCGTGCCTGCCACAGATGCAGCCCCCAAGAGGGT  512

Query  510  GGAGATCCAGATGCCCAAGCCTGCTGAGGCGCCCA-----CCGCCCCCAGCCCAG-CCCAGACCTTGGAGAATT  577
            .|||||||||.||||||||||.||||||||.||||     ||||.|||      | ||||||||.|||||||.|
Sbjct  513  AGAGATCCAGGTGCCCAAGCCAGCTGAGGCACCCAACTGTCCGCTCCC------GTCCCAGACCCTGGAGAACT  580

Query  578  CAGAGCCTGCCCCTGTGTCTCAGCTGCAGAGCAGGCTGGAGCCCAAGCC--CCAGCCCCCTGTGGCTGAGGCTA  649
            |.|||   |||||..|||||||.||||||||||||||||||||||.|||  ||        ||||||||||   
Sbjct  581  CCGAG---GCCCCGATGTCTCAACTGCAGAGCAGGCTGGAGCCCAGGCCTTCC--------GTGGCTGAGG---  640

Query  650  CACCC----CGGAGCCAGGAGGCCACTGAGGCGGCTCCCAGCTGCGTTGGCGACATGGCCGACACCCCCAGAGA  719
             .|||    ||||.||||||.|.|.|.||||.|.||||||||||.||||||||||||||.||||.|||.|||||
Sbjct  641  -TCCCATATCGGAACCAGGAAGACTCCGAGGTGACTCCCAGCTGTGTTGGCGACATGGCTGACAACCCTAGAGA  713

Query  720  TGCCGGGCTCAAGCAGGCGCCTGCATCACGGAACGAGAAGGCCCCGGTGGACTTCGGCTACGTGGGGATTGACT  793
            ||||..||||||||||||.||.||.|||||||||||.||||||||..||||.||||||||.||||||||.||||
Sbjct  714  TGCCATGCTCAAGCAGGCCCCCGCGTCACGGAACGAAAAGGCCCCCATGGAGTTCGGCTATGTGGGGATCGACT  787

Query  794  CCATCCTGGAGCAGATGCGCCGGAAGGCCATGAAGCAGGGCTTCGAGTTCAACATCATGGTGGTCGGGCAGAGC  867
            ||||||||||||||||||||.|||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  788  CCATCCTGGAGCAGATGCGCAGGAAGGCTATGAAACAGGGCTTCGAGTTTAACATCATGGTGGTTGGGCAGAGC  861

Query  868  GGCTTGGGTAAATCCACCTTAATCAACACCCTCTTCAAATCCAAAATCAGCCGGAAGTCGGTGCAGCCCACCTC  941
            |||.|.||.||.|||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  862  GGCCTCGGGAAGTCCACTTTAATCAATACCCTCTTCAAGTCCAAAATCAGCCGGAAGTCGGTGCAGCCCACCTC  935

Query  942  AGAGGAGCGCATCCCCAAGACCATCGAGATCAAGTCCATCACGCACGATATTGAGGAGAAAGGCGTCCGGATGA  1015
            .|||||.||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.||.||.||.||||
Sbjct  936  GGAGGAACGCATCCCCAAGACGATCGAAATCAAGTCGATCACCCACGATATTGAAGAGAAGGGGGTTCGAATGA  1009

Query 1016  AGCTGACAGTGATTGACACACCAGGGTTCGGGGACCACATCAACAACGAGAACTGCTGGCAGCCCATCATGAAG  1089
            |||||||||||||||||||.||.||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1010  AGCTGACAGTGATTGACACGCCGGGCTTCGGAGACCACATCAACAATGAGAACTGCTGGCAGCCCATTATGAAG  1083

Query 1090  TTCATCAATGACCAGTACGAGAAATACCTGCAGGAGGAGGTCAACATCAACCGCAAGAAGCGCATCCCGGACAC  1163
            ||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||
Sbjct 1084  TTCATCAATGACCAATATGAGAAGTACCTGCAGGAGGAAGTCAACATCAACCGGAAGAAGCGCATTCCCGACAC  1157

Query 1164  CCGCGTCCACTGCTGCCTCTACTTCATCCCCGCCACCGGCCACTCCCTCAGGCCCCTGGACATCGAGTTTATGA  1237
            |||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.||||
Sbjct 1158  CCGTGTCCACTGCTGCCTCTACTTCATCCCAGCCACCGGCCACTCGCTCAGGCCCCTGGACATTGAATTCATGA  1231

Query 1238  AACGCCTGAGCAAGGTGGTCAACATCGTCCCTGTCATCGCCAAGGCGGACACACTCACCCTGGAGGAGAGGGTC  1311
            |.|||||.|||||.|||||.|||||.|||||.||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||
Sbjct 1232  AGCGCCTAAGCAAAGTGGTGAACATTGTCCCAGTCATCGCCAAGGCTGACACGCTGACCCTGGAGGAGAGGGTC  1305

Query 1312  CACTTCAAACAGCGGATCACCGCAGACCTGCTGTCCAACGGCATCGACGTGTACCCCCAGAAGGAATTTGATGA  1385
            .|||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||
Sbjct 1306  TACTTCAAACAGCGGATCACTGCAGACCTGCTGTCCAACGGCATTGACGTGTACCCGCAGAAGGAGTTTGATGA  1379

Query 1386  GGACTCGGAGGACCGGCTGGTGAACGAGAAGTTCCGGGAGATGATCCCATTTGCTGTGGTGGGCAGTGACCACG  1459
            ||||.|.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|
Sbjct 1380  GGACGCAGAAGACCGGCTGGTGAACGAAAAGTTCCGGGAGATGATCCCATTTGCTGTGGTGGGCAGCGACCATG  1453

Query 1460  AGTACCAGGTCAACGGCAAGAGGATCCTTGGGAGGAAGACCAAGTGGGGTACCATCGAAGTTGAAAACACCACA  1533
            ||||.||.|||||.|||||||||||.||.||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||.||.|||||.
Sbjct 1454  AGTATCAAGTCAATGGCAAGAGGATTCTGGGAAGGAAGACCAAGTGGGGCACTATCGAAGTTGAGAATACCACT  1527

Query 1534  CACTGTGAGTTTGCCTACCTGCGGGACCTTCTCATCAGGACGCACATGCAGAACATCAAGGACATCACCAGCAG  1607
            ||||||||.|||||.|||||||||||.||.||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||.
Sbjct 1528  CACTGTGAATTTGCTTACCTGCGGGATCTCCTTATCAGGACGCACATGCAAAACATCAAAGACATCACCAGCAA  1601

Query 1608  CATCCACTTCGAGGCGTACCGTGTGAAGCGCCTCAACGAGGGCAGCAGCGCCATGGCCAACGGCGTGGA-GGAG  1680
            ||||||||||||.||.|||||.|||||.||||||||||||||||.|||||||||||||||||    ||| .|||
Sbjct 1602  CATCCACTTCGAAGCCTACCGAGTGAAACGCCTCAACGAGGGCAACAGCGCCATGGCCAACG----GGATCGAG  1671

Query 1681  AAGGAGCCAGAAGCCCCGGAGAGG  1704
            ||||||||.|||||||.|||||.|
Sbjct 1672  AAGGAGCCGGAAGCCCAGGAGATG  1695