Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000466958
• Subject: NM_001145078.2
• Aligned Length: 1885
• Identities: 1326
• Gaps: 407

Alignment

Query    1  ATGGCGGCAGCGGTGCTGACGGACCGGGCCCAGGTGTCTGTGACCTTTGATGATGTGGCTGTGACTTTCACCAA  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  GGAGGAGTGGGGGCAGCTGGACCTAGCTCAGCGGACCCTGTACCAGGAGGTGATGCTGGAAAACTGTGGGCTCC  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  TGGTGTCTCTGGGGTGTCCTGTTCCCAAAGCTGAGCTGATCTGCCACCTAGAGCATGGGCAGGAGCCATGGACC  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  AGGAAGGAAGACCTCTCCCAAGACACCTGTCCAGGCGACAAAGGAAAACCTAAGACCACAGAACCTACCACTTG  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  TGAGCCAGCCTTGTCAGAGGGAATCTCACTTCAGGGACAAGTGACACAAGGAAACTCAGTGGACTCACAGTTGG  370
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  371  GGCAAGCCGAGGATCAGGATGGGCTATCAGAAATGCAGGAAGGACACTTCAGACCAGGAATAGATCCCC---AG  441
                                            |||||||.||.||.|||.||||||||..|||||.|||   ||
Sbjct    1  --------------------------------ATGCAGGGAGAACGCTTGAGACCAGGGTTAGATTCCCAAAAG  42

Query  442  GAGAAGTCTCCTGGGAAGATGAGCCCTGAATGTGATGGTTTAGGGACAGCTGATGGTGTGTGTTCAAGGATTGG  515
            ||||||..||||||.||.||||||||..||..||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||..
Sbjct   43  GAGAAGCTTCCTGGAAAAATGAGCCCCAAACATGATGGTTTAGGGACAGCTGATAGTGTGTGTTCAAGGATTAT  116

Query  516  ACAGGAGCAAGTCTCTCCAGGAGATACAGTCCATAGCCATAACTCATGTGAGTCAGGTAAAGATCCCATGATTC  589
            ||||||.|.||||||...|||||||...||||||..|..|.|||||..||..|||||||||.||||..|.||||
Sbjct  117  ACAGGATCGAGTCTCCTTAGGAGATGATGTCCATGACTGTGACTCACATGGATCAGGTAAAAATCCAGTTATTC  190

Query  590  AGGAAGAGGAAAATAACTTTAAATGCAGTGAATGTGGAAAAGTATTTAACAAGAAACACCTCCTTGCTGGACAT  663
            |||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||.|||||||||||||.|||.||||||.|.|||
Sbjct  191  AGGAAGAGGAAAATATCTTTAAATGCAATGAATGTGAAAAAGTGTTTAACAAGAAACGCCTGCTTGCTCGGCAT  264

Query  664  GAGAAAATTCACTCTGGAGTTAAGCCCTATGAATGCACAGAATGTGGGAAAACCTTTATTAAGAGCACACATCT  737
            ||||..||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||..|||||.|||.|.||
Sbjct  265  GAGAGGATTCACTCTGGAGTGAAGCCCTATGAATGCACAGAGTGTGGAAAAACCTTTAGCAAGAGTACATACCT  338

Query  738  CCTGCAACATCACATGATCCACACTGGGGAGAGGCCCTATGAGTGCATGGAGTGTGGAAAGGCCTTCAACCGCA  811
            ||||||.||.||||||.|||||||||||||||.|||||||.||||||||||||||||.|||||.||.||.||.|
Sbjct  339  CCTGCAGCACCACATGGTCCACACTGGGGAGAAGCCCTATAAGTGCATGGAGTGTGGGAAGGCTTTTAATCGGA  412

Query  812  AGTCATACCTTACCCAGCACCAGCGGATTCACAGTGGAGAGAAGCCTTACAAGTGCAATGAATGCGGAAAGGCC  885
            |||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.||||||.|||||||||
Sbjct  413  AGTCACACCTTACCCAGCACCAGCGGATTCACAGTGGAGAGAAGCCTTATAAGTGCAGTGAATGTGGAAAGGCC  486

Query  886  TTCACCCACCGCTCCAATTTTGTCTTGCATAACAGGAGACACACTGGAGAAAAATCCTTTGTGTGCACAGAATG  959
            ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.||||||||||||.|||.||
Sbjct  487  TTCACCCACCGCTCCACTTTTGTCTTGCATAACAGGAGCCACACTGGAGAAAAACCCTTTGTGTGCAAAGAGTG  560

Query  960  TGGCCAAGTCTTTCGACATAGGCCAGGCTTTC-TCCGGCACTATGTTGTCCACAGTGGTGAGAATCCCTATGAG  1032
            ||||.|||.|||||||.|||||||||| |||| |.||.|||||..|..||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  561  TGGCAAAGCCTTTCGAGATAGGCCAGG-TTTCATTCGACACTACATCATCCACAGTGGTGAGAATCCCTACGAG  633

Query 1033  TGCTTGGAGTGTGGCAAGGTCTTCAAACACAGGTCATATCTCATGTGGCACCAGCAGACTCATACCGGGGAGAA  1106
            |||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  634  TGCTTCGAATGTGGCAAGGTCTTCAAACACAGATCATACCTCATGTGGCACCAGCAGACTCATACCGGGGAGAA  707

Query 1107  GCCCTATGAGTGCAGTGAATGTGGGAAGGTCTTCTTGGAGAGTGCAGCCCTGATTCACCACTATGTCATCCACA  1180
            |||||||||||||||||||||||||||||.|||||..|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct  708  GCCCTATGAGTGCAGTGAATGTGGGAAGGCCTTCTGTGAGAGCGCAGCGCTGATTCACCACTATGTCATCCACA  781

Query 1181  CTGGAGAGAAGCCCTTTGAGTGCCTCGAGTGTGGGAAGGCTTTCAACCACCGATCCTACCTCAAGAGGCACCAG  1254
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  782  CTGGAGAGAAGCCCTTTGAGTGCCTCGAGTGTGGGAAGGCTTTCAACCACCGATCCTACCTCAAAAGGCACCAG  855

Query 1255  CGGATTCACACTGGGGAGAAGCCCTTCGTGTGCAGTGAATGTGGAAAGGCCTTCACCCACTGCTCTACTTTTAT  1328
            |||||||||||||||||||||||.|..|||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  856  CGGATTCACACTGGGGAGAAGCCATATGTGTGTAGTGAATGCGGAAAGGCCTTCACCCACTGCTCTACTTTCAT  929

Query 1329  CTTGCATAAAAGGGCCCACACTGGAGAAAAGCCTTTCGAGTGCAAAGAGTGTGGGAAAGCCTTTAGCAATCGGA  1402
            ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.
Sbjct  930  CTTGCATAAAAGGGCCCACACTGGAGAAAAACCTTTCGAGTGCAAAGAGTGTGGGAAAGCCTTTAGCAATAGGG  1003

Query 1403  AGGACCTCATTCGCCACTTCAGCATCCACACTGGAGAGAAGCCCTATGAGTGCGTGGAGTGTGGAAAGGCCTTC  1476
            ..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1004  CAGACCTCATTCGCCACTTCAGCATCCACACTGGAGAGAAGCCCTATGAGTGCATGGAGTGTGGAAAGGCCTTC  1077

Query 1477  ACCCGCATGTCGGGCCTCACGAGGCACAAGCGGATTCATAGTGGAGAGAAGCCCTATGAATGTGTTGAGTGTGG  1550
            |.|||||.|||.||||||||.||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||..|.||||||||
Sbjct 1078  AACCGCAGGTCAGGCCTCACAAGGCACCAGCGGATTCATAGTGGAGAGAAGCCCTATGAATGCATCGAGTGTGG  1151

Query 1551  GAAATCGTTTTGCTGGAGCACAAACCTCATTCGACATGCCATTATCCACACTGGAGAGAAGCCCTATAAATGTA  1624
            ||||.|.|||||||||||||||||||||||||||||..|.||.||||||||||||||||||||.|||.|.||.|
Sbjct 1152  GAAAACATTTTGCTGGAGCACAAACCTCATTCGACACTCTATCATCCACACTGGAGAGAAGCCGTATGAGTGCA  1225

Query 1625  GTGAATGTGGAAAGGCCTTCAGTCGCAGCTCGTCCCTCACTCAGCATCAAAGGATGCATACTGGGAAAAATCCC  1698
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.
Sbjct 1226  GTGAATGTGGAAAGGCCTTCAGTCGCAGCTCGTCCCTCACTCAGCATCAAAGGATGCATACTGGGAGAAATCCT  1299

Query 1699  ATCAGTGTAACAGATGTGGGAAGACCTTTTACAAGTGGACAAACCTCAGTTACCCTTCGAGAACTTCTTTTAGG  1772
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|.|.|.|.|||||||.|.||.||
Sbjct 1300  ATCAGTGTAACAGATGTGGGAAGACCTTTTACAAGTGGGCAGACCTCAGTCAACATCCAAGAACTTTTATTGGG  1373

Query 1773  GAAGGACTTTTTGAATGTAACCACTGAGGCAAATATTTTGCCAGAGGAAACATCTTCCTCTGCATCTGATCAAC  1846
            |||..|||||||||||||.||||||||||.||||.||||||.|||||||.||||||.|...||||||||||...
Sbjct 1374  GAAAAACTTTTTGAATGTCACCACTGAGGAAAATCTTTTGCAAGAGGAAGCATCTTACATGGCATCTGATCGTA  1447

Query 1847  CATACCAAAGAGAAACCCCACAAGTGTCTTCACTG  1881
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1448  CATACCAAAGAGAAACCCCACAAGTGTCTTCACTG  1482