Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000466979
• Subject: NM_026277.3
• Aligned Length: 1243
• Identities: 1050
• Gaps: 41

Alignment

Query    1  ATGGCTCCAGTGGAGCACGTTGTGGCGGATGCTGGGGCTTTCCTGCGGCATGCGGCTCTGCAGGACATCGGGAA  74
            |||||.||.|||||||||||||||||.|||||.||.||||||.||.||.|.|||.|||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCGCCGGTGGAGCACGTTGTGGCTGATGCCGGAGCTTTCTTGAGGGACGCGCCTCTGCAGGACATCGGGAA  74

Query   75  GAACATTTACACCATCCGGGAGGTGGTCACTGAGATTCGGGACAAGGCCACACGCAGGCGGCTCGCTGTCCTGC  148
            ||||||.||||||||||||||||||||....||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.||.||||
Sbjct   75  GAACATCTACACCATCCGGGAGGTGGTGCGAGAGATTCGCGACAAGGCCACGCGCAGGCGGCTGGCAGTGCTGC  148

Query  149  CCTACGAGCTGCGGTTCAAGGAGCCCTTACCGGAATACGTGCGGCTGGTGACTGAGTTTTCAAAGAAAACAGGA  222
            |||||.||||.||||||||||||||..|.||.||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||.
Sbjct  149  CCTACCAGCTTCGGTTCAAGGAGCCTCTCCCAGAGTACGTGCGGCTGGTAACTGAGTTTTCCAAGAAAACTGGG  222

Query  223  GACTACCCCAGCCTCTCTGCCACGGACATCCAAGTGCTTGCACTCACATACCAGTTGGAAGCAGAGTTTGTTGG  296
            |||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||.||.||.||.||||||.||||||||||.|||||.||
Sbjct  223  GACTACCCCAGCCTCTCTGCCACAGATATCCAGGTGCTGGCTCTGACTTACCAGCTGGAAGCAGAATTTGTCGG  296

Query  297  GGTGTCTCACCTAAAACAAGAACCACAGAAGGTTAAGGTGAGCTCATCGATTCAGCACCCAGAAACACCTCTGC  370
            |||||||||.||||||.||||||||.||||||.|||.||||||||.||.|||||||||||.|||||..||||||
Sbjct  297  GGTGTCTCATCTAAAAAAAGAACCAGAGAAGGCTAAAGTGAGCTCTTCAATTCAGCACCCTGAAACTGCTCTGC  370

Query  371  ACATTTCTGGTTTCCATCTGCCCTACAAGCCTAAACCCCCACAAGAAACAGAAAAAGGA-------CACTCAGC  437
            ||||||||||.|||||||||||||.||||.||||||||..|||||||.|||    .|||       |||.||||
Sbjct  371  ACATTTCTGGCTTCCATCTGCCCTCCAAGTCTAAACCCTTACAAGAAGCAG----TGGATCGGGGCCACGCAGC  440

Query  438  TTGTGAGCCTGAGAACCTGGAATTTAGTTCCTTCATGTTCTGGAGAAACCCTTTGCCCAACATCGATCATGAAC  511
            |..||.|||.|||||||||||.||.||.|||||||||||||||||.|.|||..||||.|||||.||.|.|||.|
Sbjct  441  TGATGGGCCCGAGAACCTGGAGTTCAGCTCCTTCATGTTCTGGAGGACCCCGCTGCCTAACATTGACCGTGAGC  514

Query  512  TGCAGGAGCTGCTGATTGACAGAGGTGAGGACGTTCCAAGTGAGGAGGAGGAGGAGGAAGAAAACGGGTTTGAA  585
            |||||||||||||||||||..||.|.|||||         .||.||||||||||||||         ||.||||
Sbjct  515  TGCAGGAGCTGCTGATTGATGGAAGGGAGGA---------GGAAGAGGAGGAGGAGGA---------GTGTGAA  570

Query  586  GACAGAAAAGATGACAGCGATGACGACGGGGGTGGCTGGATAACCCCCAGTAACATCAAGCAGATCCAGCAGGA  659
                        |||||.||||||||.||.|||||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||
Sbjct  571  ------------GACAGTGATGACGATGGTGGTGGGTGGATAACCCCCAGCAACATAAAGCAGATCCAGCAGGA  632

Query  660  GCTGGAGCAGTGTGACGTCCCCGAGGACGTGCGGGTTGGCTGCCTGACCACAGACTTCGCCATGCAGAATGTTC  733
            |.||||||||||||||..|||.||||||||||.|||||||||..|||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  633  GTTGGAGCAGTGTGACACCCCAGAGGACGTGCAGGTTGGCTGTGTGACCACGGACTTCGCCATGCAGAATGTTC  706

Query  734  TGCTGCAGATGGGGCTGCACGTGCTGGCGGTGAACGGCATGCTGATTCGTGAGGCCCGGAGCTACATCTTGCGC  807
            |.||.||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|.||.||||||||||||||||||.|||||
Sbjct  707  TACTTCAGATGGGGCTGCACGTGTTGGCGGTGAACGGCATGCTGGTCCGAGAGGCCCGGAGCTACATCCTGCGC  780

Query  808  TGCCATGGCTGTTTCAAGACAACGTCTGACATGAGCCGAGTGTTCTGCTCACACTGTGGGAACAAGACCCTGAA  881
            ||.|||||||||||||||||.||.||.|||||||.||||||||||||...|||.||||||||||||||||||||
Sbjct  781  TGTCATGGCTGTTTCAAGACGACATCGGACATGAACCGAGTGTTCTGTGGACATTGTGGGAACAAGACCCTGAA  854

Query  882  GAAAGTGTCCGTGACCGTCAGCGACGACGGCACCCTGCACATGCACTTCTCCCGCAACCCCAAGGTGCTGAACC  955
            |||||||||.|||||..|||..|||||.||.|||.||||||||||.||||||||.|||||.||.||.|||||||
Sbjct  855  GAAAGTGTCTGTGACTATCAATGACGATGGGACCTTGCACATGCATTTCTCCCGAAACCCGAAAGTTCTGAACC  928

Query  956  CCCGCGGCCTCCGGTACTCGCTTCCCACTCCCAAAGGGGGCAAATACGCCATCAACCCCCATCTCACCGAGGAT  1029
            |.||.||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  929  CACGAGGCCTCCGGTACTCACTACCCACTCCAAAAGGGGGCAAATACGCCATCAACCCCCATCTGACCGAGGAT  1002

Query 1030  CAGCGCTTCCCTCAGCTGCGACTCTCCCAAAAGGCCAGGCAGAAAACCAACGTGTTCGCCCCTGACTACATCGC  1103
            |||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.|||.||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 1003  CAGCGCTTCCCCCAGCTGCGACTCTCCCAGAAGGCCAGGCAGAAGACCGACGTGTTCGCCCCTGACTACATAGC  1076

Query 1104  CGGGGTGTCACCCTTTGTCGAGAATGACATCTCCAGCCGCTCAGCTACCCTGCAGGTCCGGGACAGCACCTTGG  1177
            ||||||.||.|||||||..|||||||||||||||||||||||.||.|.||||||.|||||||||.|||..||||
Sbjct 1077  CGGGGTTTCTCCCTTTGCAGAGAATGACATCTCCAGCCGCTCGGCCATCCTGCAAGTCCGGGACGGCATGTTGG  1150

Query 1178  GAGCTGGGCGGAGACGCTTAAATCCCAACGCTTCCAGAAAGAAGTTTGTGAAGAAAAGG  1236
            ||||.|||.|||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 1151  GAGCCGGGAGGAGACGCTTAAATCCCAATGCCTCCAGAAAGAAGTTTGTAAAGAAAAGG  1209