Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000466984
• Subject: XM_006532342.1
• Aligned Length: 789
• Identities: 611
• Gaps: 114

Alignment

Query   1  ATGAACCCCAACTGCGCCCGGTGCGGCAAGATCGTGTATCCCACGGAGAAGGTGAACTGTCTGGATAAGTTCTG  74
                                                                                     
Sbjct   1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  75  GCATAAAGCATGCTTCCATTGCGAGACCTGCAAGATGACACTGAACATGAAGAACTACAAGGGCTACGAGAAGA  148
                                             |||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||||
Sbjct   1  ----------------------------------ATGACCCTGAACATGAAGAACTACAAGGGTTATGAGAAGA  40

Query 149  AGCCCTACTGCAACGCACACTACCCCAAGCAGTCCTTCACCATGGTGGCGGACACCCCGGAAAACCTTCGCCTC  222
           ||||.||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.||||||
Sbjct  41  AGCCTTACTGCAATGCACACTATCCCAAGCAGTCCTTCACCATGGTGGCCGACACTCCGGAAAATCTCCGCCTC  114

Query 223  AAGCAACAGAGTGAGCTCCAGAGTCAGGTGCGCTACAAGGAGGAGTTTGAGAAGAACAAGGGCAAAGGTTTCAG  296
           |||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 115  AAGCAACAGAGCGAGCTGCAGAGTCAGGTGCGCTACAAGGAGGAATTTGAGAAGAATAAGGGCAAAGGTTTCAG  188

Query 297  CGTAGTGGCAGACACGCCCGAGCTCCAGAGAATCAAGAAGACCCAGGACCAGATCAGTAATATAAAATACCATG  370
           |||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||
Sbjct 189  CGTGGTGGCAGACACGCCTGAGCTGCAGAGAATCAAGAAGACCCAGGACCAGATCAGCAATATCAAATACCATG  262

Query 371  AGGAGTTTGAGAAGAGCCGCATGGGCCCTAGCGGGGGCGAGGGCATGGAGCCAGAGCGTCGGGATTCGCAGGAC  444
           |||||||||||||||||||||||||.||.||.||.||.||.||..||||.||||||||.||.||..|.||||||
Sbjct 263  AGGAGTTTGAGAAGAGCCGCATGGGGCCCAGTGGAGGAGAAGGGGTGGAACCAGAGCGCCGAGAAGCCCAGGAC  336

Query 445  GGCAGCAGCTACCGGCGGCCC------CTGGAGCAGCAGCAGCCTCACCACATCCCGACCAGTGCCCCGGTTTA  512
           .||||||||||||||.|||||      |.|.||||||.||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||
Sbjct 337  AGCAGCAGCTACCGGAGGCCCACAGAGCAGCAGCAGCCGCAGCCTCACCATATCCCGACCAGTGCCCCCGTGTA  410

Query 513  CCAGCAGCCCCAGCAGCAGCCGGTGGCCCAGTCCTATGGTGGCTACAAGGAGCCTGCAGCCCCAGTCTCCATAC  586
           ||||||||||||||||||||.|.||.||..||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||
Sbjct 411  CCAGCAGCCCCAGCAGCAGCAGATGACCTCGTCCTATGGTGGGTACAAGGAGCCAGCAGCCCCTGTCTCCATAC  484

Query 587  AGCGCAGCGCCCCAGGTGGTGGCGGGAAGCGGTACCGCGCGGTGTATGACTACAGCGCCGCCGACGAGGACGAG  660
           |||||||.|||||||||||.||.|||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 485  AGCGCAGTGCCCCAGGTGGCGGTGGGAAACGGTACCGTGCAGTGTATGACTACAGCGCTGCCGACGAGGACGAG  558

Query 661  GTCTCCTTCCAGGACGGGGACACCATCGTCAACGTGCAGCAGATCGACGACGGCTGGATGTACGGGACGGTGGA  734
           ||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||
Sbjct 559  GTCTCCTTCCAGGATGGGGACACCATCGTCAATGTGCAGCAGATCGATGACGGCTGGATGTACGGGACCGTAGA  632

Query 735  GCGCACCGGCGACACGGGGATGCTGCCGGCCAACTACGTGGAGGCCATT  783
           |||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.
Sbjct 633  GCGCACCGGTGACACGGGGATGCTGCCAGCCAACTACGTGGAGGCCATC  681