Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000466992
• Subject: NM_001355505.1
• Aligned Length: 1418
• Identities: 1107
• Gaps: 172

Alignment

Query    1  ATGGCGGCCATGGAGACCGAGACGGCGCCGCTGACCCTAGAGTCGCTGCCCACCGATCCCCTGCTCCTCATCTT  74
            |||||.|||.|.|||.|||||||||.||.|||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||.||||||||
Sbjct    1  ATGGCTGCCGTAGAGGCCGAGACGGGGCTGCTGACCCTGGAGTCGCTGCCCACCGACCCTCTGCTGCTCATCTT  74

Query   75  ATCCTTTTTGGACTATCGGGATCTAATCAACTGTTGTTATGTCAGTCGAAGACTTAGCCAGCTATCAAGTCATG  148
            ||||||..|||||||..||||.||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||.||||.|||||
Sbjct   75  ATCCTTCGTGGACTACAGGGACCTAATCAATTGTTGCTATGTTAGTCGAAGACTTAGCCAGCTTTCAACTCATG  148

Query  149  ATCCGCTGTGGAGAAGACATTGCAAAAAATACTGGCTGATATCTGAGGAAGAGAAAACACAGAAGAATCAGTGT  222
            ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.|...|||||.||||||.
Sbjct  149  ATCCACTGTGGAGAAGACATTGCAAAAAATACTGGCTGATATCTGAGGAAGAAAAAGCCGGGAAGAGTCAGTGC  222

Query  223  TGGAAATCTCTCTTCATAGATACTTACTCTGATGTAGGAAGATACATTGACCATTATGCTGCTATTAAAAAGGC  296
            ||||.|||.|||||||||||.||.|||||.||.||.||.||.|||||.||||||||.||.||.|||||||||||
Sbjct  223  TGGAGATCCCTCTTCATAGAGACCTACTCAGACGTGGGGAGGTACATCGACCATTACGCCGCCATTAAAAAGGC  296

Query  297  CTGGGATGATCTCAAGAAATATTTGGAGCCCAGGTGTCCTCGGATGGTTTTATCTCTGAAAGAGGGTGCTCGAG  370
            ||||..|||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|
Sbjct  297  CTGGCGTGACCTCAAGAAGTACTTGGAGCCCAGGTGTCCTCGGATGGTTTTATCTCTGAAAGAGGGCGCACGTG  370

Query  371  AGGAAGACCTCGATGCTGTGGAAGCGCAGATTGGCTGCAAGCTTCCTGACGATTATCGATGTTCATACCGAATT  444
            ||||||||||.||||||||.|||||.|||||.||.||||||||.||.||.||||||||.|||||||||||.||.
Sbjct  371  AGGAAGACCTGGATGCTGTCGAAGCTCAGATCGGTTGCAAGCTCCCGGATGATTATCGCTGTTCATACCGGATC  444

Query  445  CACAATGGACAGAAGTTAGTGGTTCCTGGGTTATTGGGAAGCATGGCACTGTCTAATCACTATCGTTCTGAAGA  518
            |||||.||.||.|||||||||||.||.|||||..|||||||.|||||||||||.||||||||.||.||||||||
Sbjct  445  CACAACGGGCAAAAGTTAGTGGTGCCGGGGTTGCTGGGAAGTATGGCACTGTCCAATCACTACCGCTCTGAAGA  518

Query  519  TTTGTTAGACGTCGATACAGCTGCCGGAGGATTCCAGCAGAGACAGGGACTGAAATACTGTCTCCCTTTAACTT  592
            |.|..||||.||.|||||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  519  TCTACTAGATGTTGATACTGCTGCAGGAGGATTTCAGCAGAGACAGGGACTGAAATACTGTCTCCCTTTAACCT  592

Query  593  TTTGCATACATACTGGTTTGAGTCAGTACATAGCAGTGGAAGCTGCAGAGGGCCGAAACAAAAATGAAGTTTTC  666
            ||||||||||.||.||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||.||.||.||.|||||.|||
Sbjct  593  TTTGCATACACACCGGCTTGAGTCAGTACATAGCTGTGGAGGCTGCAGAGGGGCGGAATAAGAACGAAGTGTTC  666

Query  667  TACCAATGTCCAGACCAAATGGCTCGAAATCCAGCTGCTATTGACATGTTTATTATAGGTGCTACTTTTACTGA  740
            ||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||
Sbjct  667  TACCAATGTCCAGACCAAATGGCTCGGAATCCTGCTGCTATTGACATGTTTATCATAGGTGCTACTTTTACCGA  740

Query  741  CTGGTTTACCTCTTATGTCAAAAATGTTGTATCAGGTGGCTTCCCCATCATCAGAGACCAAATTTTCAGATATG  814
            |||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||.
Sbjct  741  CTGGTTTACATCCTATGTCAACAATGTTGTATCAGGTGGTTTCCCCATCATCAGAGACCAGATTTTCAGATATA  814

Query  815  TTCACGATCCAGAATGTGTAGCAACAACTGGGGATATTACTGTGTCAGTTTCCACATCGTTTCTGCCAGAACTT  888
            ||||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||.
Sbjct  815  TTCATGATCCAGAATGTGTGGCAACAACTGGAGATATTACAGTTTCAGTGTCCACATCGTTTCTGCCAGAACTC  888

Query  889  AGCTCTGTACATCCACCCCACTATTTCTTCACATACCGAATCAGGATTGAAATGTCAAAAGATGCACTTCCTGA  962
            ||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||.||||||||
Sbjct  889  AGCTCTGTGCATCCGCCACACTATTTCTTCACATACCGAATCAGGATTGAAATGTCAAGGGATGCTCTTCCTGA  962

Query  963  GAAGGCCTGTCAGTTGGACAGTCGCTATTGGAGAATAACAAATGCTAAGGGTGACGTGGAAGAAGTTCAAGGAC  1036
            |||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||.||.||.|||||||||||.||.||||
Sbjct  963  GAAGGCCTGTCAGTTGGACAGTCGCTACTGGAGGATAACAAACGCTAAAGGGGATGTGGAAGAAGTCCAGGGAC  1036

Query 1037  CTGGAGTAGTTGGTGAATTTCCAATCATCAGCCCAGGTCGGGTATATGAATACACAAGCTGTACCACATTCTCT  1110
            ||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1037  CTGGAGTAGTCGGTGAATTTCCAATTATTAGCCCAGGTCGGATATATGAATACACAAGCTGTACCACATTTTCT  1110

Query 1111  ACAACATCAGGATACATGGAAGGATATTATACCTTCCATTTTCTTTACTTTAAAGACAAGATCTTTAATGTTGC  1184
            |||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||.||||||.|||||||||||||
Sbjct 1111  ACAACATCAGGCTACATGGAAGGGTATTACACCTTCCATTTTCTGTACTTTAAGGACAAGGTCTTTAATGTTGC  1184

Query 1185  CATTCCCCGATTCCATATGGCATGTCCAACATTCAGGGTGTCTATAGCCCGATTG-----GAAATGGGTCCTGA  1253
            |||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||     .||.||.       
Sbjct 1185  CATCCCCCGATTCCACATGGCATGTCCAACATTCAGGGTGTCTATAGCTCGATTGCCTCCCAAGTGC-------  1251

Query 1254  TGAATATGAAGAGATGGAAGAAGAGGAGGAGGAGGAAGAGGAGGAAGACGAGGATGATGATTCAGCAGATATGG  1327
                                                                                      
Sbjct 1252  --------------------------------------------------------------------------  1251

Query 1328  ATGAATCAGATGAAGATGATGAAGAGGAGAGACGGAGGAGAGTCTTTGATGTTCCCATTCGCAGACGCCGCTGC  1401
                                                                                      
Sbjct 1252  --------------------------------------------------------------------------  1251

Query 1402  TCACGCCTTTTT  1413
                        
Sbjct 1252  ------------  1251