Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000467060
• Subject: XM_011510487.3
• Aligned Length: 1278
• Identities: 1208
• Gaps: 69

Alignment

Query    1  ATGACTCCTCTCTGCCTCAATTGCTCTGTCCTCCCTGGAGACCTGTACCCAGGGGGTGCAAGGAACCCCATGGC  74
                                                                                 |||||
Sbjct    1  ---------------------------------------------------------------------ATGGC  5

Query   75  TTGCAATGGCAGTGCGGCCAGGGGGCACTTTGACCCTGAGGACTTGAACCTGACTGACGAGGCACTGAGACTCA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    6  TTGCAATGGCAGTGCGGCCAGGGGGCACTTTGACCCTGAGGACTTGAACCTGACTGACGAGGCACTGAGACTCA  79

Query  149  AGTACCTGGGGCCCCAGCAGACAGAGCTGTTCATGCCCATCTGTGCCACATACCTGCTGATCTTCGTGGTGGGC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   80  AGTACCTGGGGCCCCAGCAGACAGAGCTGTTCATGCCCATCTGTGCCACATACCTGCTGATCTTCGTGGTGGGC  153

Query  223  GCTGTGGGCAATGGGCTGACCTGTCTGGTCATCCTGCGCCACAAGGCCATGCGCACGCCTACCAACTACTACCT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  154  GCTGTGGGCAATGGGCTGACCTGTCTGGTCATCCTGCGCCACAAGGCCATGCGCACGCCTACCAACTACTACCT  227

Query  297  CTTCAGCCTGGCCGTGTCGGACCTGCTGGTGCTGCTGGTGGGCCTGCCCCTGGAGCTCTATGAGATGTGGCACA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  228  CTTCAGCCTGGCCGTGTCGGACCTGCTGGTGCTGCTGGTGGGCCTGCCCCTGGAGCTCTATGAGATGTGGCACA  301

Query  371  ACTACCCCTTCCTGCTGGGCGTTGGTGGCTGCTATTTCCGCACGCTACTGTTTGAGATGGTCTGCCTGGCCTCA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  302  ACTACCCCTTCCTGCTGGGCGTTGGTGGCTGCTATTTCCGCACGCTACTGTTTGAGATGGTCTGCCTGGCCTCA  375

Query  445  GTGCTCAACGTCACTGCCCTGAGCGTGGAACGCTATGTGGCCGTGGTGCACCCACTCCAGGCCAGGTCCATGGT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  376  GTGCTCAACGTCACTGCCCTGAGCGTGGAACGCTATGTGGCCGTGGTGCACCCACTCCAGGCCAGGTCCATGGT  449

Query  519  GACGCGGGCCCATGTGCGCCGAGTGCTTGGGGCCGTCTGGGGTCTTGCCATGCTCTGCTCCCTGCCCAACACCA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  450  GACGCGGGCCCATGTGCGCCGAGTGCTTGGGGCCGTCTGGGGTCTTGCCATGCTCTGCTCCCTGCCCAACACCA  523

Query  593  GCCTGCACGGCATCCAGCAGCTGCACGTGCCCTGCCGGGGCCCAGTGCCAGACTCAGCTGTTTGCATGCTGGTC  666
            |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  524  GCCTGCACGGCATCCGGCAGCTGCACGTGCCCTGCCGGGGCCCAGTGCCAGACTCAGCTGTTTGCATGCTGGTC  597

Query  667  CGCCCACGGGCCCTCTACAACATGGTAGTGCAGACCACCGCGCTGCTCTTCTTCTGCCTGCCCATGGCCATCAT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  598  CGCCCACGGGCCCTCTACAACATGGTAGTGCAGACCACCGCGCTGCTCTTCTTCTGCCTGCCCATGGCCATCAT  671

Query  741  GAGCGTGCTCTACCTGCTCATTGGGCTGCGACTGCGGCGGGAGAGGCTGCTGCTCATGCAGGAGGCCAAGGGCA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  672  GAGCGTGCTCTACCTGCTCATTGGGCTGCGACTGCGGCGGGAGAGGCTGCTGCTCATGCAGGAGGCCAAGGGCA  745

Query  815  GGGGCTCTGCAGCAGCCAGGTCCAGATACACCTGCAGGCTCCAGCAGCACGATCGGGGCCGGAGACAAGTGACC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  746  GGGGCTCTGCAGCAGCCAGGTCCAGATACACCTGCAGGCTCCAGCAGCACGATCGGGGCCGGAGACAAGTGACC  819

Query  889  AAGATGCTGTTTGTCCTGGTCGTGGTGTTTGGCATCTGCTGGGCCCCGTTCCACGCCGACCGCGTCATGTGGAG  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  820  AAGATGCTGTTTGTCCTGGTCGTGGTGTTTGGCATCTGCTGGGCCCCGTTCCACGCCGACCGCGTCATGTGGAG  893

Query  963  CGTCGTGTCACAGTGGACAGATGGCCTGCACCTGGCCTTCCAGCACGTGCACGTCATCTCCGGCATCTTCTTCT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  894  CGTCGTGTCACAGTGGACAGATGGCCTGCACCTGGCCTTCCAGCACGTGCACGTCATCTCCGGCATCTTCTTCT  967

Query 1037  ACCTGGGCTCGGCGGCCAACCCCGTGCTCTATAGCCTCATGTCCAGCCGCTTCCGAGAGACCTTCCAGGAGGCC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  968  ACCTGGGCTCGGCGGCCAACCCCGTGCTCTATAGCCTCATGTCCAGCCGCTTCCGAGAGACCTTCCAGGAGGCC  1041

Query 1111  CTGTGCCTCGGGGCCTGCTGCCATCGCCTCAGACCCCGCCACAGCTCCCACAGCCTCAGCAGGATGACCACAGG  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1042  CTGTGCCTCGGGGCCTGCTGCCATCGCCTCAGACCCCGCCACAGCTCCCACAGCCTCAGCAGGATGACCACAGG  1115

Query 1185  CAGCACCCTGTGTGATGTGGGCTCCCTGGGCAGCTGGGTCCACCCCCTGGCTGGGAACGATGGCCCAGAGGCGC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1116  CAGCACCCTGTGTGATGTGGGCTCCCTGGGCAGCTGGGTCCACCCCCTGGCTGGGAACGATGGCCCAGAGGCGC  1189

Query 1259  AGCAAGAGACCGATCCATCC  1278
            ||||||||||||||||||||
Sbjct 1190  AGCAAGAGACCGATCCATCC  1209