Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000467065
• Subject: NM_001323907.2
• Aligned Length: 1344
• Identities: 1101
• Gaps: 234

Alignment

Query    1  ATGTCTTTGGTGGACTTGGGAAAGAGGTTGCTAGAAGCAGCAAGAAAAGGCCAAGATGATGAAGTGAGAACGTT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTCTTTGGTGGACTTGGGAAAGAGGTTGCTAGAAGCAGCAAGAAAAGGCCAAGATGATGAAGTGAGAACGTT  74

Query   75  GATGGCAAATGGCGCCCCATTCACCACAGACTGGCTTGGAACATCACCCCTCCACCTTGCAGCTCAATATGGTC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||.||             ||||..||| ||            
Sbjct   75  GATGGCAAATGGCGCCCCATTCACCACAGACTGGTTT-------------TCCAAATTG-AG------------  122

Query  149  ATTATTCCACAGCAGAAGTACTCCTTCGAGCAGGTGTTAGCAGGGATGCCCGGACTAAAGTAGACAGGACCCCC  222
                            ||| |||||        ||        ||||                           
Sbjct  123  ----------------AGT-CTCCT--------GT--------GGAT---------------------------  136

Query  223  TTGCACATGGCTGCAGCCGATGGACATGCGCACATCGTGGAACTGCTTGTTCGGAATGGTGCAGATGTGAATGC  296
                |.||      ||..|||                   ||.||     |..|||||||||||||||||||||
Sbjct  137  ----ATAT------AGGTGAT-------------------AATTG-----TAAGAATGGTGCAGATGTGAATGC  176

Query  297  CAAGGACATGCTGAAGATGACAGCTTTGCATTGGGCCACAGAGCGCCACCATCGAGATGTCGTAGAGTTACTTA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  177  CAAGGACATGCTGAAGATGACAGCTTTGCATTGGGCCACAGAGCGCCACCATCGAGATGTCGTAGAGTTACTTA  250

Query  371  TCAAATATGGAGCTGATGTCCATGCTTTCAGCAAATTTGATAAATCAGCCTTTGACATAGCTCTGGAGAAAAAC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  251  TCAAATATGGAGCTGATGTCCATGCTTTCAGCAAATTTGATAAATCAGCCTTTGACATAGCTCTGGAGAAAAAC  324

Query  445  AATGCTGAGATTTTGGTCATCCTCCAGGAAGCAATGCAGAATCAGGTGAATGTTAATCCAGAGAGAGCCAACCC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  325  AATGCTGAGATTTTGGTCATCCTCCAGGAAGCAATGCAGAATCAGGTGAATGTTAATCCAGAGAGAGCCAACCC  398

Query  519  TGTGACTGACCCTGTGAGTATGGCTGCTCCATTCATCTTCACGTCGGGTGAGGTTGTTAACCTCGCAAGCCTTA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  399  TGTGACTGACCCTGTGAGTATGGCTGCTCCATTCATCTTCACGTCGGGTGAGGTTGTTAACCTCGCAAGCCTTA  472

Query  593  TTTCTTCAACCAACACCAAAACAACCTCAGGTGACCCCCATGCCTCAACAGTACAGTTTTCAAATTCTACCACC  666
            |||||||||||||||||||||||||||                                               
Sbjct  473  TTTCTTCAACCAACACCAAAACAACCT-----------------------------------------------  499

Query  667  TCAGTGCTGGCTACCCTTGCAGCTCTTGCTGAGGCATCAGTCCCCCTCTCCAACTCACACAGAGCCACAGCCAA  740
                                                                               |||||||
Sbjct  500  -------------------------------------------------------------------CAGCCAA  506

Query  741  TACAGAGGAAATTATAGAAGGAAATTCCGTTGACTCATCAATCCAGCAAGTAATGGGGAGTGGAGGCCAGAGGG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  507  TACAGAGGAAATTATAGAAGGAAATTCCGTTGACTCATCAATCCAGCAAGTAATGGGGAGTGGAGGCCAGAGGG  580

Query  815  TCATCACCATAGTGACTGATGGAGTCCCTCTGGGTAATATCCAAACTTCAATCCCTACTGGAGGCATTGGCCAG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  581  TCATCACCATAGTGACTGATGGAGTCCCTCTGGGTAATATCCAAACTTCAATCCCTACTGGAGGCATTGGCCAG  654

Query  889  CCATTTATTGTAACTGTGCAAGATGGACAGCAAGTTCTAACTGTACCTGCTGGTAAGGTTGCAGAGGAGACTGT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  655  CCATTTATTGTAACTGTGCAAGATGGACAGCAAGTTCTAACTGTACCTGCTGGTAAGGTTGCAGAGGAGACTGT  728

Query  963  AATTAAAGAGGAAGAAGAAGAGAAGTTGCCACTAACAAAGAAACCAAGGATAGGAGAGAAGACAAACAGTGTGG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  729  AATTAAAGAGGAAGAAGAAGAGAAGTTGCCACTAACAAAGAAACCAAGGATAGGAGAGAAGACAAACAGTGTGG  802

Query 1037  AGGAAAGCAAGGAAGGCAATGAAAGAGAGCTACTACAGCAACAACTCCAGGAGGCCAATCGAAGAGCCCAGGAA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  803  AGGAAAGCAAGGAAGGCAATGAAAGAGAGCTACTACAGCAACAACTCCAGGAGGCCAATCGAAGAGCCCAGGAA  876

Query 1111  TACCGACACCAGCTCCTAAAGAAAGAGCAGGAAGCAGAACAGTACCGTCTTAAGCTGGAGGCCATAGCCCGACA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  877  TACCGACACCAGCTCCTAAAGAAAGAGCAGGAAGCAGAACAGTACCGTCTTAAGCTGGAGGCCATAGCCCGACA  950

Query 1185  GCAGCCCAATGGAGTTGATTTCACCATGGTTGAAGAGGTGGCTGAGGTAGATGCTGTAGTAGTCACAGAGGGGG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  951  GCAGCCCAATGGAGTTGATTTCACCATGGTTGAAGAGGTGGCTGAGGTAGATGCTGTAGTAGTCACAGAGGGGG  1024

Query 1259  AGTTGGAAGAGAGAGAGACAAAAGTGACTGGGTCAGCAGGGACCACAGAGCCTCACACTAGAGTTTCCATGGCA  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1025  AGTTGGAAGAGAGAGAGACAAAAGTGACTGGGTCAGCAGGGACCACAGAGCCTCACACTAGAGTTTCCATGGCA  1098

Query 1333  ACTGTTTCATCT  1344
            ||||||||||||
Sbjct 1099  ACTGTTTCATCT  1110