Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000467072
• Subject: NM_011102.4
• Aligned Length: 2091
• Identities: 1870
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGGCTGGTCTGGGCCCCGGCGTAGGCGATTCAGAGGGGGGACCCCGGCCCCTGTTTTGCAGAAAGGGGGCCCT  74
            |||||.|||||||||||.||||.||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||
Sbjct    1  ATGGCGGGTCTGGGCCCTGGCGGAGGCGACTCAGAGGGGGGACCCCGACCCCTGTTTTGCAGAAAGGGGGCGCT  74

Query   75  GAGGCAGAAGGTGGTCCACGAAGTCAAGAGCCACAAGTTCACCGCTCGCTTCTTCAAGCAGCCCACCTTCTGCA  148
            |||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||
Sbjct   75  GAGGCAGAAGGTGGTCCACGAGGTGAAGAGCCACAAGTTCACCGCTCGTTTCTTCAAGCAGCCAACCTTCTGCA  148

Query  149  GCCACTGCACCGACTTCATCTGGGGTATCGGAAAGCAGGGCCTGCAATGTCAAGTCTGCAGCTTTGTGGTTCAT  222
            |.|||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.
Sbjct  149  GTCACTGTACCGACTTCATCTGGGGCATTGGAAAGCAGGGCCTGCAATGTCAAGTCTGTAGCTTTGTGGTTCAC  222

Query  223  CGACGATGCCACGAATTTGTGACCTTCGAGTGTCCAGGCGCTGGGAAGGGCCCCCAGACGGATGACCCCCGGAA  296
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.||
Sbjct  223  CGCCGATGCCACGAATTTGTGACCTTCGAGTGTCCAGGCGCTGGAAAGGGCCCCCAGACGGACGACCCTCGCAA  296

Query  297  CAAACACAAGTTCCGCCTGCATAGCTACAGCAGCCCCACCTTCTGCGACCACTGTGGCTCCCTCCTCTACGGGC  370
            |||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct  297  CAAGCACAAGTTCCGTCTGCACAGCTACAGCAGTCCCACCTTCTGCGACCACTGTGGCTCCCTCCTTTACGGGC  370

Query  371  TTGTGCACCAGGGCATGAAATGCTCCTGCTGCGAGATGAACGTGCACCGGCGCTGTGTGCGTAGCGTGCCCTCC  444
            |.||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct  371  TGGTGCACCAGGGCATGAAATGTTCCTGTTGCGAGATGAATGTGCACCGGCGCTGTGTGCGCAGCGTGCCCTCC  444

Query  445  CTGTGCGGTGTGGACCACACCGAGCGCCGCGGGCGCCTGCAGCTGGAGATCCGGGCTCCCACAGCAGATGAGAT  518
            ||.|||||||||||||||||.||||||||.||.||.|||||.|||||.|||||||||||.||..|.||||||||
Sbjct  445  CTTTGCGGTGTGGACCACACAGAGCGCCGTGGACGTCTGCAACTGGAAATCCGGGCTCCTACGTCGGATGAGAT  518

Query  519  CCACGTAACTGTTGGCGAGGCCCGTAACCTAATTCCTATGGACCCCAATGGTCTCTCTGATCCCTATGTGAAAC  592
            |||..|.|||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||
Sbjct  519  CCATATTACTGTTGGCGAGGCCCGGAACCTCATTCCTATGGACCCCAATGGCCTGTCTGATCCCTACGTGAAAC  592

Query  593  TGAAGCTCATCCCAGACCCTCGGAACCTGACGAAACAGAAGACCCGAACGGTGAAAGCCACGCTAAACCCTGTG  666
            |||||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||....||.|||||||||||.||.||.||.|||
Sbjct  593  TGAAGCTGATCCCGGACCCTCGGAACCTGACAAAACAGAAGACAAAGACCGTGAAAGCCACACTGAATCCCGTG  666

Query  667  TGGAATGAGACCTTTGTGTTCAACCTGAAGCCAGGGGATGTGGAGCGCCGGCTCAGCGTGGAGGTGTGGGACTG  740
            |||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||
Sbjct  667  TGGAACGAGACCTTCGTGTTCAACCTGAAGCCAGGGGATGTAGAGCGCCGGCTCAGTGTGGAGGTGTGGGATTG  740

Query  741  GGACCGGACCTCCCGCAACGACTTCATGGGGGCCATGTCCTTTGGCGTCTCGGAGCTGCTCAAGGCGCCCGTGG  814
            |||..||||.|||||.||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||.||.||||
Sbjct  741  GGATAGGACATCCCGAAATGACTTCATGGGTGCCATGTCCTTTGGTGTCTCAGAGCTACTCAAGGCCCCTGTGG  814

Query  815  ATGGCTGGTACAAGTTACTGAACCAGGAGGAGGGCGAGTATTACAATGTGCCGGTGGCCGATGCTGACAACTGC  888
            ||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  ATGGATGGTACAAGTTACTGAACCAGGAGGAGGGCGAATATTACAATGTACCGGTGGCCGATGCTGACAACTGC  888

Query  889  AGCCTCCTCCAGAAGTTTGAGGCTTGTAACTACCCCCTGGAATTGTATGAGCGGGTGCGGATGGGCCCCTCTTC  962
            |||||||||||||||||||||||.||.||.||||||.||||||||||||||.|.||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AGCCTCCTCCAGAAGTTTGAGGCCTGCAATTACCCCTTGGAATTGTATGAGAGAGTGCGGATGGGCCCCTCTTC  962

Query  963  CTCTCCCATCCCCTCCCCTTCCCCTAGTCCCACCGACCCCAAGCGCTGCTTCTTCGGGGCGAGTCCAGGACGCC  1036
            |||.||||||||.||.||.|||||.|||||.||.|||.|||||||.||||||||.||.||.||.||||||||||
Sbjct  963  CTCCCCCATCCCTTCTCCATCCCCCAGTCCTACGGACTCCAAGCGATGCTTCTTTGGTGCCAGCCCAGGACGCC  1036

Query 1037  TGCACATCTCCGACTTCAGCTTCCTCATGGTTCTAGGAAAAGGCAGTTTTGGGAAGGTGATGCTGGCCGAGCGC  1110
            ||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||
Sbjct 1037  TGCATATCTCTGACTTCAGCTTCCTCATGGTTCTAGGGAAAGGCAGTTTTGGGAAGGTAATGCTGGCAGAGCGC  1110

Query 1111  AGGGGCTCTGATGAGCTCTACGCCATCAAGATCTTGAAAAAGGACGTGATCGTCCAGGACGACGATGTGGACTG  1184
            ||.|||||.||.||.|||||.|||||||||||..||||.||.|||||.|||||||||||.||||||||.|||||
Sbjct 1111  AGAGGCTCCGACGAACTCTATGCCATCAAGATACTGAAGAAAGACGTCATCGTCCAGGATGACGATGTAGACTG  1184

Query 1185  CACGCTGGTGGAGAAACGTGTGCTGGCGCTGGGGGGCCGGGGTCCTGGCGGCCGGCCCCACTTCCTCACCCAGC  1258
            |||.||.||.|||||.|||||.|||||..||||.|||||.||||||||.||||||||.|||||.|||||.||||
Sbjct 1185  CACCCTCGTAGAGAAGCGTGTCCTGGCATTGGGAGGCCGAGGTCCTGGAGGCCGGCCACACTTTCTCACGCAGC  1258

Query 1259  TCCACTCCACCTTCCAGACCCCGGACCGCCTGTATTTCGTGATGGAGTACGTCACCGGGGGAGACTTGATGTAC  1332
            |.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||.||.||.||||||
Sbjct 1259  TTCACTCCACCTTTCAGACTCCGGACCGCCTGTATTTTGTGATGGAGTATGTCACTGGGGGCGATTTAATGTAC  1332

Query 1333  CACATTCAACAGCTGGGCAAGTTTAAGGAGCCCCATGCAGCGTTCTACGCGGCAGAAATCGCTATCGGCCTCTT  1406
            |||||.||.||.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||.||||||||.||.||||||||
Sbjct 1333  CACATCCAGCAACTGGGCAAGTTTAAGGAGCCTCATGCAGCATTCTACGCTGCGGAAATCGCCATAGGCCTCTT  1406

Query 1407  CTTCCTTCACAATCAGGGCATCATCTACAGGGACCTGAAGCTGGACAATGTGATGCTGGATGCTGAGGGACACA  1480
            ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||.||||.||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1407  CTTCCTTCACAACCAGGGCATCATCTACAGGGACCTCAAGTTGGATAATGTGATGCTGGATGCTGAAGGACACA  1480

Query 1481  TCAAGATCACTGACTTTGGCATGTGTAAGGAGAACGTCTTCCCCGGGACGACAACCCGCACCTTCTGCGGGACC  1554
            ||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||.|.|||||||||||||||||.||.|||
Sbjct 1481  TCAAGATCACAGACTTTGGCATGTGTAAAGAGAATGTCTTCCCTGGGTCCACAACCCGCACCTTCTGTGGCACC  1554

Query 1555  CCGGACTACATAGCCCCGGAGATCATTGCCTACCAGCCCTATGGGAAGTCTGTCGATTGGTGGTCCTTTGGAGT  1628
            ||.|||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||.||
Sbjct 1555  CCAGACTACATAGCACCTGAGATCATTGCCTATCAGCCCTACGGGAAGTCTGTCGACTGGTGGTCTTTTGGGGT  1628

Query 1629  TCTGCTGTATGAGATGTTGGCAGGACAGCCTCCCTTCGATGGGGAGGACGAGGAGGAGCTGTTTCAGGCCATCA  1702
            .|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.|||||.|||.|||||||.|||||||
Sbjct 1629  CCTGCTGTATGAGATGTTGGCAGGACAGCCACCCTTTGATGGGGAAGATGAGGAAGAGTTGTTTCAAGCCATCA  1702

Query 1703  TGGAACAAACTGTCACCTACCCCAAGTCGCTTTCCCGGGAAGCCGTGGCCATCTGCAAGGGGTTCCTGACCAAG  1776
            |||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1703  TGGAACAAACTGTCACCTATCCCAAGTCACTTTCCCGGGAAGCTGTGGCCATCTGCAAAGGGTTCCTGACCAAG  1776

Query 1777  CACCCAGGGAAGCGCCTGGGCTCAGGGCCTGATGGGGAACCTACCATCCGTGCACATGGCTTTTTCCGCTGGAT  1850
            ||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||.|||||
Sbjct 1777  CACCCAGGAAAACGCCTGGGCTCAGGGCCAGATGGGGAACCCACCATCCGGGCTCATGGCTTTTTCCGTTGGAT  1850

Query 1851  TGACTGGGAGCGGCTGGAACGATTGGAGATCCCGCCTCCTTTCAGACCCCGCCCGTGTGGCCGCAGCGGCGAGA  1924
            .||.||||||.||.||||..||.||||.||..|.||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||.|
Sbjct 1851  CGATTGGGAGAGGTTGGAGAGACTGGAAATTGCACCTCCTTTCAGACCACGTCCGTGTGGCCGCAGTGGCGAAA  1924

Query 1925  ACTTTGACAAGTTCTTCACGCGGGCGGCGCCAGCGCTGACCCCTCCAGACCGCCTAGTCCTGGCCAGCATCGAC  1998
            |||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||.|.||.||.||||||||||||
Sbjct 1925  ACTTTGACAAGTTCTTCACGCGGGCAGCGCCAGCACTGACCCCGCCAGACCGCTTGGTTCTAGCCAGCATCGAC  1998

Query 1999  CAGGCCGATTTCCAGGGCTTCACCTACGTGAACCCCGACTTCGTGCACCCGGATGCCCGCAGCCCCACCAGCCC  2072
            ||.||.||||||||||||||.||.||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1999  CAAGCTGATTTCCAGGGCTTTACTTATGTGAACCCGGACTTCGTGCACCCAGATGCCCGCAGCCCCACAAGCCC  2072

Query 2073  AGTGCCTGTGCCCGTCATG  2091
            .|||||.|||||.||||||
Sbjct 2073  TGTGCCCGTGCCTGTCATG  2091