Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000467117
• Subject: NM_019468.2
• Aligned Length: 1546
• Identities: 1310
• Gaps: 8

Alignment

Query    1  ATGGCAGAGCAGGTGGCCCTGAGCCGGACCCAGGTGTGCGGGATCCTGCGGGAAGAGCTTTTCCAGGGCGATGC  74
            |||||||||||||||.||||.|||||||||||.|||||.|||||||||.||||||||.|.|.|||....|||||
Sbjct    1  ATGGCAGAGCAGGTGACCCTAAGCCGGACCCAAGTGTGTGGGATCCTGAGGGAAGAGTTGTACCAAAATGATGC  74

Query   75  CTTCCATCAGTCGGATACACACATATTCATCATCATGGGTGCATCGGGTGACCTGGCCAAGAAGAAGATCTACC  148
            ||||||.||..|.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct   75  CTTCCACCAAGCTGATACACACATATTTATCATCATGGGTGCATCGGGTGACCTGGCCAAGAAGAAGATCTATC  148

Query  149  CCACCATCTGGTGGCTGTTCCGGGATGGCCTTCTGCCCGAAAACACCTTCATCGTGGGCTATGCCCGTTCCCGC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||.||.|.||||||||.||||||||||||||.||.|..
Sbjct  149  CCACCATCTGGTGGCTGTTCCGGGATGGTCTTCTACCCAAAGAAACCTTCATTGTGGGCTATGCCCGCTCACAA  222

Query  223  CTCACAGTGGCTGACATCCGCAAACAGAGTGAGCCCTTCTTCAAGGCCACCCCAGAGGAGAAG-CTCAAGCTGG  295
            ||||||||||.||||||||..||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||.|| ||| |.||||||||
Sbjct  223  CTCACAGTGGATGACATCCAAAAGCAGAGTGAGCCCTTCTTTAAGGCCACTCCAGAAGA-AAGACCCAAGCTGG  295

Query  296  AGGACTTCTTTGCCCGCAACTCCTATGTGGCTGGCCAGTACGATGATGCAGCCTCCTACCAGCGCCTCAACAGC  369
            ||||.|||||..|.||.|||||||||||.|.|||||||||.||||||.||||||||||..|||.||||||||||
Sbjct  296  AGGAGTTCTTCACGCGTAACTCCTATGTAGTTGGCCAGTATGATGATCCAGCCTCCTATAAGCACCTCAACAGC  369

Query  370  CACATGAATGCCCTCCACCTGGGGTCACAGGCCAACCGCCTCTTCTACCTGGCCTTGCCCCCGACCGTCTACGA  443
            .||||.||||||||.||||.||||...||||||||||..||.||||||||||||||||||||.||.|||||.||
Sbjct  370  TACATTAATGCCCTGCACCAGGGGATGCAGGCCAACCATCTATTCTACCTGGCCTTGCCCCCCACAGTCTATGA  443

Query  444  GGCCGTCACCAAGAACATTCACGAGTCCTGCATGAGCCAGATAGGCTGGAACCGCATCATCGTGGAGAAGCCCT  517
            .||.|||||||||||||||||.|||.||||||||||.||||.|||||..|||||||||||.||||||||.||||
Sbjct  444  AGCAGTCACCAAGAACATTCAAGAGACCTGCATGAGTCAGACAGGCTTTAACCGCATCATAGTGGAGAAACCCT  517

Query  518  TCGGGAGGGACCTGCAGAGCTCTGACCGGCTGTCCAACCACATCTCCTCCCTGTTCCGTGAGGACCAGATCTAC  591
            |||||||.||||||||||||||..|.|...||||.||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||
Sbjct  518  TCGGGAGAGACCTGCAGAGCTCCAATCAATTGTCTAACCACATCTCCTCTCTTTTCCGTGAAGACCAGATCTAC  591

Query  592  CGCATCGACCACTACCTGGGCAAGGAGATGGTGCAGAACCTCATGGTGCTGAGATTTGCCAACAGGATCTTCGG  665
            |||||.|||||||||||||.|||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||
Sbjct  592  CGCATTGACCACTACCTGGACAAAGAGATGGTCCAGAACCTCATGGTGCTGAGGTTTGCTAACAGGATCTTTGG  665

Query  666  CCCCATCTGGAACCGGGACAACATCGCCTGCGTTATCCTCACCTTCAAGGAGCCCTTTGGCACTGAGGGTCGCG  739
            |||.||||||||..|.||||||||.||.||.||.||||||||.||.||.|||||||||||.|||||||||||.|
Sbjct  666  CCCTATCTGGAATGGAGACAACATTGCTTGTGTGATCCTCACATTTAAAGAGCCCTTTGGTACTGAGGGTCGTG  739

Query  740  GGGGCTATTTCGATGAATTTGGGATCATCCGGGACGTGATGCAGAACCACCTACTGCAGATGCTGTGTCTGGTG  813
            ||||||||||.||||||||||||||||||.||||.||.|||||||.||||||.|||||||||.|||||||||||
Sbjct  740  GGGGCTATTTTGATGAATTTGGGATCATCAGGGATGTTATGCAGAGCCACCTCCTGCAGATGTTGTGTCTGGTG  813

Query  814  GCCATGGAGAAGCCCGCCTCCACCAACTCAGATGACGTCCGTGATGAGAAGGTCAAGGTGTTGAAATGCATCTC  887
            ||||||||.|||||.||..||||..|.||||||||.||||||.|||||||||||||.|||||||||.|.|||||
Sbjct  814  GCCATGGAAAAGCCTGCTACCACAGATTCAGATGATGTCCGTAATGAGAAGGTCAAAGTGTTGAAACGTATCTC  887

Query  888  AGAGGTGCAGGCCAACAATGTGGTCCTGGGCCAGTACGTGGGGAACCCCGATGGAGAGGGCGAGGCCACCAAAG  961
            |||||||.|..|..||||||||.||||.||||||||.||||||||||||.|||||||.||.||.||..||||.|
Sbjct  888  AGAGGTGGAAACTGACAATGTGATCCTTGGCCAGTATGTGGGGAACCCCAATGGAGAAGGAGAAGCTGCCAATG  961

Query  962  GGTACCTGGACGACCCCACGGTGCCCCGCGGGTCCACCACCGCCACTTTTGCAGCCGTCGTCCTCTATGTGGAG  1035
            |.|||.|.||.||||||||.||.|||||.||||||||.||.|||||.|||||.||.|..||||||||||||.||
Sbjct  962  GATACTTAGATGACCCCACAGTACCCCGTGGGTCCACAACTGCCACCTTTGCTGCAGCTGTCCTCTATGTGAAG  1035

Query 1036  AATGAGAGGTGGGATGGGGTGCCCTTCATCCTGCGCTGCGGCAAGGCCCTGAACGAGCGCAAGGCCGAGGTGAG  1109
            |||||..|||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||.||||||||.||.|||||.||.||.|||||
Sbjct 1036  AATGAACGGTGGGATGGGGTACCCTTCATACTGCGCTGTGGCAAAGCCCTGAATGAACGCAAAGCTGAAGTGAG  1109

Query 1110  GCTGCAGTTCCATGATGTGGCCGGCGACATCTTCCACCAGCAGTGCAAGCGCAACGAGCTGGTGATCCGCGTGC  1183
            .|||||.||||..|||.|..|.||||||||||||||||||.||||||||||.||.||||||||.|||||..|||
Sbjct 1110  ACTGCAATTCCGAGATATACCAGGCGACATCTTCCACCAGAAGTGCAAGCGTAATGAGCTGGTCATCCGTATGC  1183

Query 1184  AGCCCAACGAGGCCGTGTACACCAAGATGATGACCAAGAAGCCGGGCATGTTCTTCAACCCCGAGGAGTCGGAG  1257
            |||||||.|||||.||.|||||.|.||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||
Sbjct 1184  AGCCCAATGAGGCAGTATACACAACGATGATGACCAAGAAGCCTGGCATGTTCTTTAACCCTGAGGAGTCGGAG  1257

Query 1258  CTGGACCTGACCTACGGCAACAGATACAAGAACGTGAAGCTCCCTGACGCCTATGAGCGCCTCATCCTGGACGT  1331
            ||||||||.||.||.|||||||.|||||||||.|||||||||||||..||||||||.||||||||||||||.||
Sbjct 1258  CTGGACCTAACTTATGGCAACAAATACAAGAATGTGAAGCTCCCTGGTGCCTATGAACGCCTCATCCTGGATGT  1331

Query 1332  CTTCTGCGGGAGCCAGATGCACTTCGTGCGCAGCGACGAGCTCCGTGAGGCCTGGCGTATTTTCACCCCACTGC  1405
            ||||||.|||.|||||||||||||.||.||.|..||.||.|||.|.||.|.|||||||||.|||||.|||||||
Sbjct 1332  CTTCTGTGGGTGCCAGATGCACTTTGTCCGTACTGATGAACTCAGGGAAGGCTGGCGTATCTTCACACCACTGC  1405

Query 1406  TGCACCAGATTGAGCTGGAGAAGCCCAAGCCCATCCCCTATATTTATGGCAGCCGAGGCCCCACGGAGGCAGAC  1479
            |||||.|||||||.|..||.||||||.|||||.||||||||.|.|||||||||||.||||||||.||||||||.
Sbjct 1406  TGCACAAGATTGAACGAGAAAAGCCCCAGCCCTTCCCCTATGTATATGGCAGCCGTGGCCCCACAGAGGCAGAT  1479

Query 1480  GAGCTGATGAAGAGAGTGGGTTTCCAGTATGAGGGCACCTACAAGTGGGTGAACCCCCACAAGCTC  1545
            ||||||||||.|||||||||.||||||||..||||.||||||||  ||||    .|.|||||||.|
Sbjct 1480  GAGCTGATGAGGAGAGTGGGCTTCCAGTACAAGGGTACCTACAA--GGGT----ACTCACAAGCAC  1539