Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000467145
- Subject:
- XM_006516246.2
- Aligned Length:
- 1576
- Identities:
- 1162
- Gaps:
- 212
Alignment
Query 1 ATGGCCAGAAAGGCTCTCAAGCTTGCTTCGTGGACCAGCATGGCTCTTGCTGCCTCTGGCATCTACTTCTACAG 74
|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.||||||||||||||||.||..|||||.|||||||
Sbjct 1 ATGGCCAGAAAGGCTCTCAAGCTTGCTTCATGGACCAGCGTGGCTCTTGCTGCCTCCGGTGTCTACCTCTACAG 74
Query 75 TAACAAGTACTTGGACCCTAATGACTTTGGCGCTGTCAGGGTGGGCAGAGCAGTTGCTACGACGGCTGTCATCA 148
||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||
Sbjct 75 TAACAACTACTTGGACCCTAATGACTTTGGCGCTGTCAGGGTGGGCAGAGCTGTTGCTACGACAGCTGTCATCA 148
Query 149 GTTACGACTACCTCACTTCCCTGAAGAGTGTCCCTTATGGCTCAGAGGAGTACTTGCAGCTGAGATCTAAGGTG 222
|.||.|||||||||||.|||||||.|||||||||.||||||||.||||||||.|||||
Sbjct 149 GCTATGACTACCTCACCTCCCTGAGGAGTGTCCCATATGGCTCTGAGGAGTATTTGCA---------------- 206
Query 223 CACCTTCGCTCTGCCAGGCGTCTCTGTGAGCTCTGCTGTGCCAACCGGGGCACCTTCATCAAGGTGGGCCAGCA 296
|||||
Sbjct 207 -----------------GCGTC---------------------------------------------------- 211
Query 297 CCTGGGGGCTCTGGACTACCTGTTGCCAGAGGAGTACACCAGCACGCTGAAGGTACTGCACAGCCAGGCTCCAC 370
Sbjct 212 -------------------------------------------------------------------------- 211
Query 371 AGAGCAGCATGCAAGAGATCCGCCAGGTCATCCGAGAAGATCTGGGCAAGGAGATCCATGATTTGTTCCAGAGC 444
||||| .|||||||.||||||||||.||||
Sbjct 212 ----------------GATCC-----------------------------CAGATCCACGATTTGTTCCTGAGC 240
Query 445 TTCGATGACACCCCTCTGGGGACGGCCTCCCTGGCCCAGGTCCACAAGGCAGTGCTGCATGATGGGCGGACGGT 518
|||||||||||||||||.|||.|.||||||||||||||||||||||||||.|||.||||||||||.|||||.||
Sbjct 241 TTCGATGACACCCCTCTTGGGGCAGCCTCCCTGGCCCAGGTCCACAAGGCGGTGTTGCATGATGGTCGGACAGT 314
Query 519 GGCCGTGAAGGTCCAGCACCCAAAGGTGCGGGCTCAGAGCTCGAAGGACATTCTCCTGATGGAGGTGCTCGTTC 592
|||.||.||||||||||||||.|||||.|.||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||.|
Sbjct 315 GGCAGTTAAGGTCCAGCACCCGAAGGTTCAGGCTCAAAGCTCTAAGGACATTCTCCTGATGGAGGTGCTTGTCC 388
Query 593 TGGCTGTGAAGCAGCTGTTCCCAGAGTTTGAGTTTATGTGGCTTGTGGATGAAGCCAAGAAGAACCTGCCTTTG 666
||||.||||||||.||.||||||||.|||||.||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||.|.
Sbjct 389 TGGCCGTGAAGCAACTTTTCCCAGATTTTGAATTCATGTGGCTGGTGGATGAAGCGAAGAAGAACCTGCCTCTC 462
Query 667 GAGCTGGATTTCCTCAATGAAGGGAGGAATGCTGAGAAGGTGTCCCAGATGCTCAGGCATTTTGACTTCTTGAA 740
|||.||||.|||||.||||||||||||||.||||||||.|||.||||.|||||||||||.|||||||||.|.||
Sbjct 463 GAGTTGGACTTCCTGAATGAAGGGAGGAACGCTGAGAAAGTGGCCCACATGCTCAGGCACTTTGACTTCCTAAA 536
Query 741 GGTCCCCCGAATCCACTGGGACCTGTCCACGGAGCGGGTCCTCCTGATGGAGTTTGTGGATGGCGGGCAGGTCA 814
|||.||||..|||||||||||.|||||.||..||.||||.|||||||||||.|||||.||.||.||.||.||||
Sbjct 537 GGTTCCCCAGATCCACTGGGAGCTGTCTACCAAGAGGGTGCTCCTGATGGAATTTGTAGAGGGAGGTCAAGTCA 610
Query 815 ATGACAGAGACTACATGGAGAGGAACAAGATCGACGTCAATGAGATCTCACGCCACCTGGGCAAGATGTATAGT 888
|.|||||.|.|||||||||||.||||.|||||||.||.|||||||||||..|||||||||||||||||||.|||
Sbjct 611 ACGACAGGGCCTACATGGAGAAGAACCAGATCGATGTGAATGAGATCTCCTGCCACCTGGGCAAGATGTACAGT 684
Query 889 GAGATGATCTTCGTCAATGGCTTCGTGCACTGCGATCCCCACCCCGGCAATGTACTGGTGCGGAAGCACCCCGG 962
|||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.||||||||.|||||||..||.|.
Sbjct 685 GAGATGATCTTTGTCAATGGCTTCGTGCACTGTGACCCCCACCCAGGCAACGTACTGGTACGGAAGCGTCCTGA 758
Query 963 CACGGGAAAGGCGGAGATTGTCCTGTTGGACCATGGGCTTTACCAGATGCTCACGGAAGAATTCCGCCTGAATT 1036
||||||.|||||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||.||||||||||.||.|||||||||.|.|
Sbjct 759 CACGGGCAAGGCTGAGATTGTCCTCTTAGACCATGGGCTTTACCAGGTGCTCACGGAGGAGTTCCGCCTGGACT 832
Query 1037 ACTGCCACCTCTGGCAGTCTCTGATCTGGACTGACATGAAGAGAGTGAAGGAGTACAGCCAGCGACTGGGAGCC 1110
|||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||.|..|..||||..|||||||||||||.||||||||.
Sbjct 833 ACTGCCATCTGTGGCAGTCTCTGATCTGGACTGACATGGACGGGCTGAAACAGTACAGCCAGCGCCTGGGAGCT 906
Query 1111 GGGGATCTCTACCCCTTGTTTGCCTGCATGCTGACGGCGCGATCGTGGGACTCGGTC-AACAGAGGCATCAGCC 1183
|..||.||||||||..||||||||||.||||||||.||.||.||.||||||||.||| ||||| |||||..|.|
Sbjct 907 GCAGACCTCTACCCACTGTTTGCCTGTATGCTGACAGCCCGGTCCTGGGACTCAGTCAAACAG-GGCATTGGGC 979
Query 1184 AAGCTCCCGTCACTGCCACTGAGGACTTAGAGATTCGCAACAACGCGGCCAACTACCTCCCCCAGATCAGCCAT 1257
|||||||.|||.||||.||||||||||.||||||||||||.||.||.|||..||||||.||..||||||||||.
Sbjct 980 AAGCTCCAGTCTCTGCTACTGAGGACTCAGAGATTCGCAATAATGCAGCCTGCTACCTGCCTGAGATCAGCCAG 1053
Query 1258 CTCCTCAACCACGTGCCGCGCCAGATGCTGCTCATCTTGAAGACCAACGACCTGCTGCGTGGCATTGAGGCCGC 1331
|||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||.|||||||.||.||.||.||.|||.||||||||.||.|
Sbjct 1054 CTCCTTAACCATGTGCCTCGCCAGATGCTGCTCATCCTGAAGACTAATGATCTACTCCGTAGCATTGAGACCAC 1127
Query 1332 CCTGGGCACCCGCGCCAGCGCCAGCTCCTTTCTCAACATGTCACGTTGCTGCATCAGAGCGCTAGCTGAGCACA 1405
|||||||||.|||.||||.|||||.|||||.|||||||||||.||.||.||.|||||.|||||.|||||.||||
Sbjct 1128 CCTGGGCACGCGCTCCAGTGCCAGTTCCTTCCTCAACATGTCTCGGTGTTGTATCAGGGCGCTGGCTGAACACA 1201
Query 1406 AGAAGAAGAATACCTGTTCATTCTTCAGAAGGACCCAGATCTCTTTCAGCGAGGCCTTCAACTTATGGCAGATC 1479
||||||.|.||.||.|.||.||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||.|.|.|.|||||||||
Sbjct 1202 AGAAGAGGGATGCCGGCTCTTTCTTCAGAAGGACTCAGATATCTTTCAGTGAGGCCTTTAGCCTGTGGCAGATC 1275
Query 1480 AACCTCCATGAGCTCATCCTGCGTGTGAAGGGGTTGAAGCTGGCTGACCGGGTCTTGGCCCTAATATGCTGGCT 1553
|||||.|||||.||..|.||.||.||||.||..||||.|||.|||..|.||||||..||.||..|..|||||||
Sbjct 1276 AACCTTCATGAACTTCTGCTTCGAGTGAGGGCCTTGAGGCTAGCTTGCTGGGTCTCAGCTCTCCTGGGCTGGCT 1349
Query 1554 GTTCCCTGCTCCACTC------ 1569
|...|..|||||||.|
Sbjct 1350 GACTCGGGCTCCACACAGAATG 1371