Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000467160
• Subject: NM_014804.3
• Aligned Length: 2901
• Identities: 2890
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGGGACCAGGCCAGCCTGCACCAACCTGTGTTCATCTAGCACCTAGGACCCAACTTGATGGGAGGAGCGACCC  74
            |||||||||||||||||.||..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGGACCAGGCCAGCCAGCTTCAACCTGTGTTCATCTAGCACCTAGGACCCAACTTGATGGGAGGAGCGACCC  74

Query   75  CAAAGTACTTCAGACCCAGAACCAGCTGCAGTTTAATAGGAATGTTCCTACACATTCAAGCAACTTGGCGATCC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CAAAGTACTTCAGACCCAGAACCAGCTGCAGTTTAATAGGAATGTTCCTACACATTCAAGCAACTTGGCGATCC  148

Query  149  GATATTCTTGCCCACATGCCATTAGAATTGAAAAACTGAAGCACTCATACAATGAATCATACCATTGTAAAGAT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GATATTCTTGCCCACATGCCATTAGAATTGAAAAACTGAAGCACTCATACAATGAATCATACCATTGTAAAGAT  222

Query  223  GCAGATTGTAGAGTTGGTCCTGACCTGGGCAGTTCTGTTTCATTTTCCGTCATATCCCAAGAGAGACTTAGCTA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GCAGATTGTAGAGTTGGTCCTGACCTGGGCAGTTCTGTTTCATTTTCCGTCATATCCCAAGAGAGACTTAGCTA  296

Query  297  TGCTGTCCACCTAGCCAGAAGAGATGTGAAACGAAGACAATTTGAAAAACATATAAAAGAACATCATCTCAGAA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TGCTGTCCACCTAGCCAGAAGAGATGTGAAACGAAGACAATTTGAAAAACATATAAAAGAACATCATCTCAGAA  370

Query  371  GTCAGCCTCAAAGCTCTCAGAAGTGTGGACATACTAAGTATAAAATACCCGACCACAGGGTGGAAAGGAAGGAA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GTCAGCCTCAAAGCTCTCAGAAGTGTGGACATACTAAGTATAAAATACCCGACCACAGGGTGGAAAGGAAGGAA  444

Query  445  TCAAAGAGTCAAGCAGCCTGTCAGTGTAGCCACCAGCCATCCAAAGTAGAAATCTCCAGCTCCGGTGCCAAAGT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  445  TCAAAGAGTCAAGCAGCCTGTCAGTGTAGCCACCAGCCATCCAAAGTAGAAATCTCCAGCTCTGGTGCCAAAGT  518

Query  519  ATACCTTTACTCATCTCATCCAGGCCAGTCAGATCTTACTGTGCCAAATTCGCCACCCACCCATGATCCGGGAC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  ATACCTTTACTCATCTCATCCAGGCCAGTCAGATCTTACTGTGCCAAATTCGCCACCCACCCATGATCCGGGAC  592

Query  593  TTCAGCCTCATCCCAGGATAGGTGACCACAAAAACATAAGTGAACAGAAAAGCCTGCTAGAAGTCCAGCGACTC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TTCAGCCTCATCCCAGGATAGGTGACCACAAAAACATAAGTGAACAGAAAAGCCTGCTAGAAGTCCAGCGACTC  666

Query  667  CAGAAAGAACTGAGCAGTTGTATCCACAAAATTGAAGAGGTAACTAAAAAAGATAGACTAGAAGAAGCTTTGGA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CAGAAAGAACTGAGCAGTTGTATCCACAAAATTGAAGAGGTAACTAAAAAAGATAGACTAGAAGAAGCTTTGGA  740

Query  741  TCCAGATGAAGAACGTCGAATCCGTATCAGGAGACAGGAGCAAGCTGCTCGCTCTGCCCGAATGCTCTACGTCC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TCCAGATGAAGAACGTCGAATCCGTATCAGGAGACAGGAGCAAGCTGCTCGCTCTGCCCGAATGCTCTACGTCC  814

Query  815  TCCAGCAGCAGGTAAAAGAAATCCAGGAAGAATTGGATAAATTGAGTCCACATAAAATTAAACACACTAAGAAG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TCCAGCAGCAGGTAAAAGAAATCCAGGAAGAATTGGATAAATTGAGTCCACATAAAATTAAACACACTAAGAAG  888

Query  889  TCATGGGCAATGTCTAAGCTGGCGGCTGCCCATCGAGGAGCCATTCGGGCCTTACAGATGTTTGTCACTCAGTT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TCATGGGCAATGTCTAAGCTGGCGGCTGCCCATCGAGGAGCCATTCGGGCCTTACAGATGTTTGTCACTCAGTT  962

Query  963  TACTGACCGAGGGGAGCATCCACTTCCTGCTCGGTGTAAGGAACTGGGCAGCCTTATTCGCCAGCTTTCACTTT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TACTGACCGAGGGGAGCATCCACTTCCTGCTCGGTGTAAGGAACTGGGCAGCCTTATTCGCCAGCTTTCACTTT  1036

Query 1037  GTTCTGTCAAGCTGGATGCAGACCCTTCTGTTCCTGATGTGGTTATAGATATTCTGCAACAAATTGAGGCTTTG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GTTCTGTCAAGCTGGATGCAGACCCTTCTGTTCCTGATGTGGTTATAGATATTCTGCAACAAATTGAGGCTTTG  1110

Query 1111  GAATCTCTCCTGGAAAAGAAACTGTCACCAAAAAAGGTGAAAAAATGTTTCAGTGAAATTCGGAGCAGATTTCC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GAATCTCTCCTGGAAAAGAAACTGTCACCAAAAAAGGTGAAAAAATGTTTCAGTGAAATTCGGAGCAGATTTCC  1184

Query 1185  TATCGGTAGCCAAAAGGCCTTGGAGAGATGGCCAAGTACATCACCAAAGGGTGAGAGGAGGCCCCTCACAGCAA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TATCGGTAGCCAAAAGGCCTTGGAGAGATGGCCAAGTACATCACCAAAGGGTGAGAGGAGGCCCCTCACAGCAA  1258

Query 1259  AGGACACATTCCCACAGGAAACAAGTCGACCTTCTGTAGCAAAGCAGCTTCTTGCCGATAAGTATCAGCCCAAT  1332
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 1259  AGGACACATTCCCACAGGAAACAAGTCGACCTTCTGTAGCAAAGCAGCTTCTTGCCGATAAGTATCAGCCCGAT  1332

Query 1333  ACGGAGCTTCCGGAGACCCAGAGGTTGCAGAGTGAGCTTGATGTATTAGATGCGGATATAGTTCCGGAAGAAGG  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 1333  ACGGAGCTTCCGGAGACCCAGAGGTTGCAGAGTGAGCTTGATGTATTAGATGCGGATATAGTTCTGGAAGAAGG  1406

Query 1407  ACCATTTATTCTAGACCAAAGTGCAAGCTTCAAAGACGAGGTGTTAGCCGTGGCAAAAACAAAAGCAGGGAAAA  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  ACCATTTATTCTAGACCAAAGTGCAAGCTTCAAAGACGAGGTGTTAGCCGTGGCAAAAACAAAAGCAGGGAAAA  1480

Query 1481  AGAAGCCTGTGACTGAGAATGTGCCGTTTAGGAAGAAAGATACTCTGGCGCCAGCAAGACAGCAAGGACTCCGC  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  AGAAGCCTGTGACTGAGAATGTGCCGTTTAGGAAGAAAGATACTCTGGCGCCAGCAAGACAGCAAGGACTCCGC  1554

Query 1555  AAAGCTGAAAGAGGTAGACAAAGCCAACCTCACAGTAAAAGCAGAGTGCAGCAGACAACAGTTTCATCCAGATT  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  AAAGCTGAAAGAGGTAGACAAAGCCAACCTCACAGTAAAAGCAGAGTGCAGCAGACAACAGTTTCATCCAGATT  1628

Query 1629  AAAAATGAACCGGCAGCCTGTGAAAGACCGCAAGGCACCATGGATACCCCCAAACCCCACATCCCCACCAGCGT  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  AAAAATGAACCGGCAGCCTGTGAAAGACCGCAAGGCACCATGGATACCCCCAAACCCCACATCCCCACCAGCGT  1702

Query 1703  CTCCTAAATGTGCCGCATGGCTAAAGGTGAAAACTAGCCCCAGAGATGCCACAAAAGAGCCTCTCCAGCAAGAA  1776
            |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  CTCCTAAATGTGCTGCATGGCTAAAGGTGAAAACTAGCCCCAGAGATGCCACAAAAGAGCCTCTCCAGCAAGAA  1776

Query 1777  GATCCTCAAGAGGAAAGTCACCTGACAGGTGCTGTTGAGCATGAAGCAGCCAGGCTCGCTTGGCTTGATGCTGA  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  GATCCTCAAGAGGAAAGTCACCTGACAGGTGCTGTTGAGCATGAAGCAGCCAGGCTCGCTTGGCTTGATGCTGA  1850

Query 1851  AACTTCCAAAAGATTGAAGGAACTAGAAGAGTTAAAAGCCAAGGAAATTGACAGCATGCAAAAACAGAGGCTTG  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  AACTTCCAAAAGATTGAAGGAACTAGAAGAGTTAAAAGCCAAGGAAATTGACAGCATGCAAAAACAGAGGCTTG  1924

Query 1925  ATTGGCTTGATGCTGAAACTTCTAGAAGAACAAAGGAACTGAATGAGCTCAAAGCTGAAGAAATGTATAGACTC  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  ATTGGCTTGATGCTGAAACTTCTAGAAGAACAAAGGAACTGAATGAGCTCAAAGCTGAAGAAATGTATAGACTC  1998

Query 1999  CAACAATTGAGTGTTTCTGCCACCCACTTAGCAGACAAGGTAGAGGAGGCAGTTCTGGATCGTTTGAAGCCTCT  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  CAACAATTGAGTGTTTCTGCCACCCACTTAGCAGACAAGGTAGAGGAGGCAGTTCTGGATCGTTTGAAGCCTCT  2072

Query 2073  CTTGGTCAAGGCCCAGAGAGTCAATTCTACTACAGAAGCAAATATTCATTTGAAAGATGGCTCGTCAGTAAACA  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  CTTGGTCAAGGCCCAGAGAGTCAATTCTACTACAGAAGCAAATATTCATTTGAAAGATGGCTCGTCAGTAAACA  2146

Query 2147  CAGCGCCAGGCCAGCCTGCACAGGAGGTTGCAGCTGTTGATTTTGAATCCAACAACATTCGTCAGCTTGATGAT  2220
            |||||..||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  CAGCGAAAGCCCAGCCTGCACAGGAGGTTGCAGCTGTTGATTTTGAATCCAACAACATTCGTCAGCTTGATGAT  2220

Query 2221  TTTTTGGAAGATTGTGCCAGTGAGCTCTGGGCTGTGACTCATGCTAAGATCTTGGGGTCTGAAACCTTAGCCAC  2294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  TTTTTGGAAGATTGTGCCAGTGAGCTCTGGGCTGTGACTCATGCTAAGATCTTGGGGTCTGAAACCTTAGCCAC  2294

Query 2295  CGTTGAGGACAGCAAGGATAGCCCAGATCTGGAGATCATGATGCGCCGAATGGAAGAGATGGAAAAATACCAGG  2368
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  CGTTGAGGACAGCAAGGATAGCCCAGATCTGGAGATCATGATGCGCCGAATGGAAGAGATGGAAAAATACCAGG  2368

Query 2369  AGTCTGTTCGTCAAAGATATAATAAAATCGCATATGCTGATCCTCGACTTTGGATGCAGGAAGAAAACAATGAC  2442
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369  AGTCTGTTCGTCAAAGATATAATAAAATCGCATATGCTGATCCTCGACTTTGGATGCAGGAAGAAAACAATGAC  2442

Query 2443  CAAAAAATCTCAGCAATAAGTGAAAAGCCTCTATCTCCTCATCCAATCAGAATCACGAAGACAGTGGATCGCAA  2516
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443  CAAAAAATCTCAGCAATAAGTGAAAAGCCTCTATCTCCTCATCCAATCAGAATCACGAAGACAGTGGATCGCAA  2516

Query 2517  GGATCCAGCCGTGAACATCATGTTAGAAAGGCCCTGTAATGGCAATTCCCTGGATGAAAGTGTGGGAACAGAGG  2590
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517  GGATCCAGCCGTGAACATCATGTTAGAAAGGCCCTGTAATGGCAATTCCCTGGATGAAAGTGTGGGAACAGAGG  2590

Query 2591  AAGGATCAGAGAAAAGAGAGGCCCCTCTTCTCTCCCTAGCCGAAGATTCTCAACAGAAAGAAGGCCGAGCTCCC  2664
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591  AAGGATCAGAGAAAAGAGAGGCCCCTCTTCTCTCCCTAGCCGAAGATTCTCAACAGAAAGAAGGCCGAGCTCCC  2664

Query 2665  CTCTTTGTCCCACCGGGTATGCGGCACAGCATCGGTGACTACTGTAGTCGTTTTGAGCAGTACCTTCGGATCAT  2738
            ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665  CTCTTTGTCCCACCGGGTATGCAGCACAGCATCGGTGACTACTGTAGTCGTTTTGAGCAGTACCTTCGGATCAT  2738

Query 2739  ATCTCATGAGGCTGTAGGCTCCTTCAACCCGTGGCTGATAGCTGAAAGCTTTTCAGAAGAGCTGGTAGATGAAG  2812
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2739  ATCTCATGAGGCTGTAGGCTCCTTCAACCCGTGGCTGATAGCTGAAAGCTTTTCAGAAGAGCTGGTAGATGAAG  2812

Query 2813  CTCTGGGTGCTGTGGCTGCTGAACTTCAGGATATGTGCGAAGATTATGCAGAAGCTGTGTTCACCTCAGAATTC  2886
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2813  CTCTGGGTGCTGTGGCTGCTGAACTTCAGGATATGTGCGAAGATTATGCAGAAGCTGTGTTCACCTCAGAATTC  2886

Query 2887  TTAGAGGCTGCTACA  2901
            |||||||||||||||
Sbjct 2887  TTAGAGGCTGCTACA  2901