Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000467160
• Subject: XM_006721612.2
• Aligned Length: 2901
• Identities: 1997
• Gaps: 897

Alignment

Query    1  ATGGGACCAGGCCAGCCTGCACCAACCTGTGTTCATCTAGCACCTAGGACCCAACTTGATGGGAGGAGCGACCC  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  CAAAGTACTTCAGACCCAGAACCAGCTGCAGTTTAATAGGAATGTTCCTACACATTCAAGCAACTTGGCGATCC  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  GATATTCTTGCCCACATGCCATTAGAATTGAAAAACTGAAGCACTCATACAATGAATCATACCATTGTAAAGAT  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  GCAGATTGTAGAGTTGGTCCTGACCTGGGCAGTTCTGTTTCATTTTCCGTCATATCCCAAGAGAGACTTAGCTA  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  TGCTGTCCACCTAGCCAGAAGAGATGTGAAACGAAGACAATTTGAAAAACATATAAAAGAACATCATCTCAGAA  370
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  371  GTCAGCCTCAAAGCTCTCAGAAGTGTGGACATACTAAGTATAAAATACCCGACCACAGGGTGGAAAGGAAGGAA  444
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  445  TCAAAGAGTCAAGCAGCCTGTCAGTGTAGCCACCAGCCATCCAAAGTAGAAATCTCCAGCTCCGGTGCCAAAGT  518
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  519  ATACCTTTACTCATCTCATCCAGGCCAGTCAGATCTTACTGTGCCAAATTCGCCACCCACCCATGATCCGGGAC  592
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  593  TTCAGCCTCATCCCAGGATAGGTGACCACAAAAACATAAGTGAACAGAAAAGCCTGCTAGAAGTCCAGCGACTC  666
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  667  CAGAAAGAACTGAGCAGTTGTATCCACAAAATTGAAGAGGTAACTAAAAAAGATAGACTAGAAGAAGCTTTGGA  740
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  741  TCCAGATGAAGAACGTCGAATCCGTATCAGGAGACAGGAGCAAGCTGCTCGCTCTGCCCGAATGCTCTACGTCC  814
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  815  TCCAGCAGCAGGTAAAAGAAATCCAGGAAGAATTGGATAAATTGAGTCCACATAAAATTAAACACACTAAGAAG  888
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  889  TCATGGGCAATGTCTAAGCTGGCGGCTGCCCATCGAGGAGCCATTCGGGCCTTACAGATGTTTGTCACTCAGTT  962
                     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ---------ATGTCTAAGCTGGCGGCTGCCCATCGAGGAGCCATTCGGGCCTTACAGATGTTTGTCACTCAGTT  65

Query  963  TACTGACCGAGGGGAGCATCCACTTCCTGCTCGGTGTAAGGAACTGGGCAGCCTTATTCGCCAGCTTTCACTTT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   66  TACTGACCGAGGGGAGCATCCACTTCCTGCTCGGTGTAAGGAACTGGGCAGCCTTATTCGCCAGCTTTCACTTT  139

Query 1037  GTTCTGTCAAGCTGGATGCAGACCCTTCTGTTCCTGATGTGGTTATAGATATTCTGCAACAAATTGAGGCTTTG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  140  GTTCTGTCAAGCTGGATGCAGACCCTTCTGTTCCTGATGTGGTTATAGATATTCTGCAACAAATTGAGGCTTTG  213

Query 1111  GAATCTCTCCTGGAAAAGAAACTGTCACCAAAAAAGGTGAAAAAATGTTTCAGTGAAATTCGGAGCAGATTTCC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  214  GAATCTCTCCTGGAAAAGAAACTGTCACCAAAAAAGGTGAAAAAATGTTTCAGTGAAATTCGGAGCAGATTTCC  287

Query 1185  TATCGGTAGCCAAAAGGCCTTGGAGAGATGGCCAAGTACATCACCAAAGGGTGAGAGGAGGCCCCTCACAGCAA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  288  TATCGGTAGCCAAAAGGCCTTGGAGAGATGGCCAAGTACATCACCAAAGGGTGAGAGGAGGCCCCTCACAGCAA  361

Query 1259  AGGACACATTCCCACAGGAAACAAGTCGACCTTCTGTAGCAAAGCAGCTTCTTGCCGATAAGTATCAGCCCAAT  1332
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  362  AGGACACATTCCCACAGGAAACAAGTCGACCTTCTGTAGCAAAGCAGCTTCTTGCCGATAAGTATCAGCCCGAT  435

Query 1333  ACGGAGCTTCCGGAGACCCAGAGGTTGCAGAGTGAGCTTGATGTATTAGATGCGGATATAGTTCCGGAAGAAGG  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  436  ACGGAGCTTCCGGAGACCCAGAGGTTGCAGAGTGAGCTTGATGTATTAGATGCGGATATAGTTCTGGAAGAAGG  509

Query 1407  ACCATTTATTCTAGACCAAAGTGCAAGCTTCAAAGACGAGGTGTTAGCCGTGGCAAAAACAAAAGCAGGGAAAA  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  510  ACCATTTATTCTAGACCAAAGTGCAAGCTTCAAAGACGAGGTGTTAGCCGTGGCAAAAACAAAAGCAGGGAAAA  583

Query 1481  AGAAGCCTGTGACTGAGAATGTGCCGTTTAGGAAGAAAGATACTCTGGCGCCAGCAAGACAGCAAGGACTCCGC  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  584  AGAAGCCTGTGACTGAGAATGTGCCGTTTAGGAAGAAAGATACTCTGGCGCCAGCAAGACAGCAAGGACTCCGC  657

Query 1555  AAAGCTGAAAGAGGTAGACAAAGCCAACCTCACAGTAAAAGCAGAGTGCAGCAGACAACAGTTTCATCCAGATT  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  658  AAAGCTGAAAGAGGTAGACAAAGCCAACCTCACAGTAAAAGCAGAGTGCAGCAGACAACAGTTTCATCCAGATT  731

Query 1629  AAAAATGAACCGGCAGCCTGTGAAAGACCGCAAGGCACCATGGATACCCCCAAACCCCACATCCCCACCAGCGT  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  732  AAAAATGAACCGGCAGCCTGTGAAAGACCGCAAGGCACCATGGATACCCCCAAACCCCACATCCCCACCAGCGT  805

Query 1703  CTCCTAAATGTGCCGCATGGCTAAAGGTGAAAACTAGCCCCAGAGATGCCACAAAAGAGCCTCTCCAGCAAGAA  1776
            |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  806  CTCCTAAATGTGCTGCATGGCTAAAGGTGAAAACTAGCCCCAGAGATGCCACAAAAGAGCCTCTCCAGCAAGAA  879

Query 1777  GATCCTCAAGAGGAAAGTCACCTGACAGGTGCTGTTGAGCATGAAGCAGCCAGGCTCGCTTGGCTTGATGCTGA  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  880  GATCCTCAAGAGGAAAGTCACCTGACAGGTGCTGTTGAGCATGAAGCAGCCAGGCTCGCTTGGCTTGATGCTGA  953

Query 1851  AACTTCCAAAAGATTGAAGGAACTAGAAGAGTTAAAAGCCAAGGAAATTGACAGCATGCAAAAACAGAGGCTTG  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  954  AACTTCCAAAAGATTGAAGGAACTAGAAGAGTTAAAAGCCAAGGAAATTGACAGCATGCAAAAACAGAGGCTTG  1027

Query 1925  ATTGGCTTGATGCTGAAACTTCTAGAAGAACAAAGGAACTGAATGAGCTCAAAGCTGAAGAAATGTATAGACTC  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1028  ATTGGCTTGATGCTGAAACTTCTAGAAGAACAAAGGAACTGAATGAGCTCAAAGCTGAAGAAATGTATAGACTC  1101

Query 1999  CAACAATTGAGTGTTTCTGCCACCCACTTAGCAGACAAGGTAGAGGAGGCAGTTCTGGATCGTTTGAAGCCTCT  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1102  CAACAATTGAGTGTTTCTGCCACCCACTTAGCAGACAAGGTAGAGGAGGCAGTTCTGGATCGTTTGAAGCCTCT  1175

Query 2073  CTTGGTCAAGGCCCAGAGAGTCAATTCTACTACAGAAGCAAATATTCATTTGAAAGATGGCTCGTCAGTAAACA  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1176  CTTGGTCAAGGCCCAGAGAGTCAATTCTACTACAGAAGCAAATATTCATTTGAAAGATGGCTCGTCAGTAAACA  1249

Query 2147  CAGCGCCAGGCCAGCCTGCACAGGAGGTTGCAGCTGTTGATTTTGAATCCAACAACATTCGTCAGCTTGATGAT  2220
            |||||..||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1250  CAGCGAAAGCCCAGCCTGCACAGGAGGTTGCAGCTGTTGATTTTGAATCCAACAACATTCGTCAGCTTGATGAT  1323

Query 2221  TTTTTGGAAGATTGTGCCAGTGAGCTCTGGGCTGTGACTCATGCTAAGATCTTGGGGTCTGAAACCTTAGCCAC  2294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1324  TTTTTGGAAGATTGTGCCAGTGAGCTCTGGGCTGTGACTCATGCTAAGATCTTGGGGTCTGAAACCTTAGCCAC  1397

Query 2295  CGTTGAGGACAGCAAGGATAGCCCAGATCTGGAGATCATGATGCGCCGAATGGAAGAGATGGAAAAATACCAGG  2368
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1398  CGTTGAGGACAGCAAGGATAGCCCAGATCTGGAGATCATGATGCGCCGAATGGAAGAGATGGAAAAATACCAGG  1471

Query 2369  AGTCTGTTCGTCAAAGATATAATAAAATCGCATATGCTGATCCTCGACTTTGGATGCAGGAAGAAAACAATGAC  2442
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1472  AGTCTGTTCGTCAAAGATATAATAAAATCGCATATGCTGATCCTCGACTTTGGATGCAGGAAGAAAACAATGAC  1545

Query 2443  CAAAAAATCTCAGCAATAAGTGAAAAGCCTCTATCTCCTCATCCAATCAGAATCACGAAGACAGTGGATCGCAA  2516
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1546  CAAAAAATCTCAGCAATAAGTGAAAAGCCTCTATCTCCTCATCCAATCAGAATCACGAAGACAGTGGATCGCAA  1619

Query 2517  GGATCCAGCCGTGAACATCATGTTAGAAAGGCCCTGTAATGGCAATTCCCTGGATGAAAGTGTGGGAACAGAGG  2590
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1620  GGATCCAGCCGTGAACATCATGTTAGAAAGGCCCTGTAATGGCAATTCCCTGGATGAAAGTGTGGGAACAGAGG  1693

Query 2591  AAGGATCAGAGAAAAGAGAGGCCCCTCTTCTCTCCCTAGCCGAAGATTCTCAACAGAAAGAAGGCCGAGCTCCC  2664
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1694  AAGGATCAGAGAAAAGAGAGGCCCCTCTTCTCTCCCTAGCCGAAGATTCTCAACAGAAAGAAGGCCGAGCTCCC  1767

Query 2665  CTCTTTGTCCCACCGGGTATGCGGCACAGCATCGGTGACTACTGTAGTCGTTTTGAGCAGTACCTTCGGATCAT  2738
            ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1768  CTCTTTGTCCCACCGGGTATGCAGCACAGCATCGGTGACTACTGTAGTCGTTTTGAGCAGTACCTTCGGATCAT  1841

Query 2739  ATCTCATGAGGCTGTAGGCTCCTTCAACCCGTGGCTGATAGCTGAAAGCTTTTCAGAAGAGCTGGTAGATGAAG  2812
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1842  ATCTCATGAGGCTGTAGGCTCCTTCAACCCGTGGCTGATAGCTGAAAGCTTTTCAGAAGAGCTGGTAGATGAAG  1915

Query 2813  CTCTGGGTGCTGTGGCTGCTGAACTTCAGGATATGTGCGAAGATTATGCAGAAGCTGTGTTCACCTCAGAATTC  2886
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1916  CTCTGGGTGCTGTGGCTGCTGAACTTCAGGATATGTGCGAAGATTATGCAGAAGCTGTGTTCACCTCAGAATTC  1989

Query 2887  TTAGAGGCTGCTACA  2901
            |||||||||||||||
Sbjct 1990  TTAGAGGCTGCTACA  2004