Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000467160
- Subject:
- XM_011524090.3
- Aligned Length:
- 2967
- Identities:
- 2890
- Gaps:
- 66
Alignment
Query 1 ATGGGACCAGGCCAGCCTGCACCAACCTGTGTTCATCTAGCACCTAGGACCCAACTTGATGGGAGGAGCGACCC 74
|||||||||||||||||.||..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGGACCAGGCCAGCCAGCTTCAACCTGTGTTCATCTAGCACCTAGGACCCAACTTGATGGGAGGAGCGACCC 74
Query 75 CAAAGTACTTCAGACCCAGAACCAGCTGCAGTTTAATAGGAATGTTCCTACACATTCAAGCAACTTGGCGATCC 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CAAAGTACTTCAGACCCAGAACCAGCTGCAGTTTAATAGGAATGTTCCTACACATTCAAGCAACTTGGCGATCC 148
Query 149 GATATTCTTGCCCACATGCCATTAGAATTGAAAAACTGAAGCACTCATACAATGAATCATACCATTGTAAAGAT 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 GATATTCTTGCCCACATGCCATTAGAATTGAAAAACTGAAGCACTCATACAATGAATCATACCATTGTAAAGAT 222
Query 223 GCAGATTGTAGAGTTGGTCCTGACCTGGGCAGTTCTGTTTCATTTTCCGTCATATCCCAAGAGAGACTTAGCTA 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GCAGATTGTAGAGTTGGTCCTGACCTGGGCAGTTCTGTTTCATTTTCCGTCATATCCCAAGAGAGACTTAGCTA 296
Query 297 TGCTGTCCACCTAGCCAGAAGAGATGTGAAACGAAGACAATTTGAAAAACATATAAAAGAACATCATCTCAGAA 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 TGCTGTCCACCTAGCCAGAAGAGATGTGAAACGAAGACAATTTGAAAAACATATAAAAGAACATCATCTCAGAA 370
Query 371 GTCAGCCTCAAAGCTCTCAGAAGTGTGGACATACTAAGTATAAAATACCCGACCACAGGGTGGAAAGGAAGGAA 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 GTCAGCCTCAAAGCTCTCAGAAGTGTGGACATACTAAGTATAAAATACCCGACCACAGGGTGGAAAGGAAGGAA 444
Query 445 TCAAAGAGTCAAGCAGCCTGTCAGTGTAGCCACCAGCCATCCAAAGTAGAAATCTCCAGCTCCGGTGCCAAAGT 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 445 TCAAAGAGTCAAGCAGCCTGTCAGTGTAGCCACCAGCCATCCAAAGTAGAAATCTCCAGCTCTGGTGCCAAAGT 518
Query 519 ATACCTTTACTCATCTCATCCAGGCCAGTCAGATCTTACTGTGCCAAATTCGCCACCCACCCATGATCCGGGAC 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 ATACCTTTACTCATCTCATCCAGGCCAGTCAGATCTTACTGTGCCAAATTCGCCACCCACCCATGATCCGGGAC 592
Query 593 TTCAGCCTCATCCCAGGATAGGTGACCACAAAAACATAAGTGAACAGAAAAGCCTGCTAGAAGTCCAGCGACTC 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 TTCAGCCTCATCCCAGGATAGGTGACCACAAAAACATAAGTGAACAGAAAAGCCTGCTAGAAGTCCAGCGACTC 666
Query 667 CAGAAAGAACTGAGCAGTTGTATCCACAAAATTGAAGAGGTAACTAAAAAAGATAGACTAGAAGAAGCTTTGGA 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 CAGAAAGAACTGAGCAGTTGTATCCACAAAATTGAAGAGGTAACTAAAAAAGATAGACTAGAAGAAGCTTTGGA 740
Query 741 TCCAGATGAAGAACGTCGAATCCGTATCAGGAGACAGGAGCAAGCTGCTCGCTCTGCCCGAATGCTCTACGTCC 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 TCCAGATGAAGAACGTCGAATCCGTATCAGGAGACAGGAGCAAGCTGCTCGCTCTGCCCGAATGCTCTACGTCC 814
Query 815 TCCAGCAGCAGGTAAAAGAAATCCAGGAAGAATTGGATAAATTGAGTCCACATAAAATTAAACACACTAAGAAG 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 TCCAGCAGCAGGTAAAAGAAATCCAGGAAGAATTGGATAAATTGAGTCCACATAAAATTAAACACACTAAGAAG 888
Query 889 TCATGGGCAATGTCTAAGCTGGCGGCTGCCCATCGAGGAGCCATTCGGGCCTTACAGATGTTTGTCACTCAGTT 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 TCATGGGCAATGTCTAAGCTGGCGGCTGCCCATCGAGGAGCCATTCGGGCCTTACAGATGTTTGTCACTCAGTT 962
Query 963 TACTGACCGAGGGGAGCATCCACTTCCTGCTCGGTGTAAGGAACTGGGCAGCCTTATTCGCCAGCTTTCACTTT 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 TACTGACCGAGGGGAGCATCCACTTCCTGCTCGGTGTAAGGAACTGGGCAGCCTTATTCGCCAGCTTTCACTTT 1036
Query 1037 GTTCTGTCAAGCTGGATGCAGACCCTTCTGTTCCTGATGTGGTTATAGATATTCTGCAACAAATTGAGGCTTTG 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 GTTCTGTCAAGCTGGATGCAGACCCTTCTGTTCCTGATGTGGTTATAGATATTCTGCAACAAATTGAGGCTTTG 1110
Query 1111 GAATCTCTCCTGGAAAAGAAACTGTCACCAAAAAAGGTGAAAAAATGTTTCAGTGAAATTCGGAGCAGATTTCC 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 GAATCTCTCCTGGAAAAGAAACTGTCACCAAAAAAGGTGAAAAAATGTTTCAGTGAAATTCGGAGCAGATTTCC 1184
Query 1185 TATCGGTAGCCAAAAGGCCTTGGAGAGATGGCCAAGTACATCACCAAAGGGTGAGAGGAGGCCCCTCACAGCAA 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 TATCGGTAGCCAAAAGGCCTTGGAGAGATGGCCAAGTACATCACCAAAGGGTGAGAGGAGGCCCCTCACAGCAA 1258
Query 1259 AGGACACATTCCCACAGGAAACAAGTCGACCTTCTGTAGCAAAGCAGCTTCTTGCCGATAAGTATCAGCCCAAT 1332
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 1259 AGGACACATTCCCACAGGAAACAAGTCGACCTTCTGTAGCAAAGCAGCTTCTTGCCGATAAGTATCAGCCCGAT 1332
Query 1333 ACGGAGCTTCCGGAGACCCAGAGGTTGCAGAGTGAGCTTGATGTATTAGATGCGGATATAGTTCCGGAAGAAGG 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 1333 ACGGAGCTTCCGGAGACCCAGAGGTTGCAGAGTGAGCTTGATGTATTAGATGCGGATATAGTTCTGGAAGAAGG 1406
Query 1407 ACCATTTATTCTAGACCAAAGTGCAAGCTTCAAAGACGAGGTGTTAGCCGTGGCAAAAACAAAAGCAGGGAAAA 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 ACCATTTATTCTAGACCAAAGTGCAAGCTTCAAAGACGAGGTGTTAGCCGTGGCAAAAACAAAAGCAGGGAAAA 1480
Query 1481 AGAAGCCTGTGACTGAGAATGTGCCGTTTAGGAAGAAAGATACTCTGGCGCCAGCAAGACAGCAAGGACTCCGC 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 AGAAGCCTGTGACTGAGAATGTGCCGTTTAGGAAGAAAGATACTCTGGCGCCAGCAAGACAGCAAGGACTCCGC 1554
Query 1555 AAAGCTGAAAGAGGTAGACAAAGCCAACCTCACAGTAAAAGCAGAGTGCAGCAGACAACAGTTTCATCCAGATT 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 AAAGCTGAAAGAGGTAGACAAAGCCAACCTCACAGTAAAAGCAGAGTGCAGCAGACAACAGTTTCATCCAGATT 1628
Query 1629 AAAAATGAACCGGCAGCCTGTGAAAGACCGCAAGGCACCATGGATACCCCCAAACCCCACATCCCCACCAGCGT 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 AAAAATGAACCGGCAGCCTGTGAAAGACCGCAAGGCACCATGGATACCCCCAAACCCCACATCCCCACCAGCGT 1702
Query 1703 CTCCTAAATGTGCCGCATGGCTAAAGGTGAAAACTAGCCCCAGAGATGCCACAAAAGAGCCTCTCCAGCAAGAA 1776
|||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 CTCCTAAATGTGCTGCATGGCTAAAGGTGAAAACTAGCCCCAGAGATGCCACAAAAGAGCCTCTCCAGCAAGAA 1776
Query 1777 GATCCTCAAGAGGAAAGTCACCTGACAGGTGCTGTTGAGCATGAAGCAGCCAGGCTCGCTTGGCTTGATGCTGA 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 GATCCTCAAGAGGAAAGTCACCTGACAGGTGCTGTTGAGCATGAAGCAGCCAGGCTCGCTTGGCTTGATGCTGA 1850
Query 1851 AACTTCCAAAAGATTGAAGGAACTAGAAGAGTTAAAAGCCAAGGAAATTGACAGCATGCAAAAACAGAGGCTTG 1924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 AACTTCCAAAAGATTGAAGGAACTAGAAGAGTTAAAAGCCAAGGAAATTGACAGCATGCAAAAACAGAGGCTTG 1924
Query 1925 ATTGGCTTGATGCTGAAACTTCTAGAAGAACAAAGGAACTGAATGAGCTCAAAGCTGAAGAAATGTATAGACTC 1998
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 ATTGGCTTGATGCTGAAACTTCTAGAAGAACAAAGGAACTGAATGAGCTCAAAGCTGAAGAAATGTATAGACTC 1998
Query 1999 CAACAATTGAGTGTTTCTGCCACCCACTTAGCAGACAAGGTAGAGGAGGCAGTTCTGGATCGTTTGAAGCCTCT 2072
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 CAACAATTGAGTGTTTCTGCCACCCACTTAGCAGACAAGGTAGAGGAGGCAGTTCTGGATCGTTTGAAGCCTCT 2072
Query 2073 CTTGGTCAAGGCCCAGAGAGTCAATTCTACTACAGAAGCAAATATTCATTTGAAAGATGGCTCGTCAGTAAACA 2146
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073 CTTGGTCAAGGCCCAGAGAGTCAATTCTACTACAGAAGCAAATATTCATTTGAAAGATGGCTCGTCAGTAAACA 2146
Query 2147 CAGCGCCAGGCCAGCCTGCACAGG-------------------------------------------------- 2170
|||||..||.||||||||||||||
Sbjct 2147 CAGCGAAAGCCCAGCCTGCACAGGAGGTTTCAGAGCAGAAGGAAATTGGAATGAAGCTCCATTGGCCCAGTGAC 2220
Query 2171 ----------------AGGTTGCAGCTGTTGATTTTGAATCCAACAACATTCGTCAGCTTGATGATTTTTTGGA 2228
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221 CTTAGGGGCAGGAAGAAGGTTGCAGCTGTTGATTTTGAATCCAACAACATTCGTCAGCTTGATGATTTTTTGGA 2294
Query 2229 AGATTGTGCCAGTGAGCTCTGGGCTGTGACTCATGCTAAGATCTTGGGGTCTGAAACCTTAGCCACCGTTGAGG 2302
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295 AGATTGTGCCAGTGAGCTCTGGGCTGTGACTCATGCTAAGATCTTGGGGTCTGAAACCTTAGCCACCGTTGAGG 2368
Query 2303 ACAGCAAGGATAGCCCAGATCTGGAGATCATGATGCGCCGAATGGAAGAGATGGAAAAATACCAGGAGTCTGTT 2376
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369 ACAGCAAGGATAGCCCAGATCTGGAGATCATGATGCGCCGAATGGAAGAGATGGAAAAATACCAGGAGTCTGTT 2442
Query 2377 CGTCAAAGATATAATAAAATCGCATATGCTGATCCTCGACTTTGGATGCAGGAAGAAAACAATGACCAAAAAAT 2450
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443 CGTCAAAGATATAATAAAATCGCATATGCTGATCCTCGACTTTGGATGCAGGAAGAAAACAATGACCAAAAAAT 2516
Query 2451 CTCAGCAATAAGTGAAAAGCCTCTATCTCCTCATCCAATCAGAATCACGAAGACAGTGGATCGCAAGGATCCAG 2524
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517 CTCAGCAATAAGTGAAAAGCCTCTATCTCCTCATCCAATCAGAATCACGAAGACAGTGGATCGCAAGGATCCAG 2590
Query 2525 CCGTGAACATCATGTTAGAAAGGCCCTGTAATGGCAATTCCCTGGATGAAAGTGTGGGAACAGAGGAAGGATCA 2598
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591 CCGTGAACATCATGTTAGAAAGGCCCTGTAATGGCAATTCCCTGGATGAAAGTGTGGGAACAGAGGAAGGATCA 2664
Query 2599 GAGAAAAGAGAGGCCCCTCTTCTCTCCCTAGCCGAAGATTCTCAACAGAAAGAAGGCCGAGCTCCCCTCTTTGT 2672
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665 GAGAAAAGAGAGGCCCCTCTTCTCTCCCTAGCCGAAGATTCTCAACAGAAAGAAGGCCGAGCTCCCCTCTTTGT 2738
Query 2673 CCCACCGGGTATGCGGCACAGCATCGGTGACTACTGTAGTCGTTTTGAGCAGTACCTTCGGATCATATCTCATG 2746
||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2739 CCCACCGGGTATGCAGCACAGCATCGGTGACTACTGTAGTCGTTTTGAGCAGTACCTTCGGATCATATCTCATG 2812
Query 2747 AGGCTGTAGGCTCCTTCAACCCGTGGCTGATAGCTGAAAGCTTTTCAGAAGAGCTGGTAGATGAAGCTCTGGGT 2820
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2813 AGGCTGTAGGCTCCTTCAACCCGTGGCTGATAGCTGAAAGCTTTTCAGAAGAGCTGGTAGATGAAGCTCTGGGT 2886
Query 2821 GCTGTGGCTGCTGAACTTCAGGATATGTGCGAAGATTATGCAGAAGCTGTGTTCACCTCAGAATTCTTAGAGGC 2894
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2887 GCTGTGGCTGCTGAACTTCAGGATATGTGCGAAGATTATGCAGAAGCTGTGTTCACCTCAGAATTCTTAGAGGC 2960
Query 2895 TGCTACA 2901
|||||||
Sbjct 2961 TGCTACA 2967