Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000467160
• Subject: XM_011524095.2
• Aligned Length: 2967
• Identities: 2890
• Gaps: 66

Alignment

Query    1  ATGGGACCAGGCCAGCCTGCACCAACCTGTGTTCATCTAGCACCTAGGACCCAACTTGATGGGAGGAGCGACCC  74
            |||||||||||||||||.||..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGGACCAGGCCAGCCAGCTTCAACCTGTGTTCATCTAGCACCTAGGACCCAACTTGATGGGAGGAGCGACCC  74

Query   75  CAAAGTACTTCAGACCCAGAACCAGCTGCAGTTTAATAGGAATGTTCCTACACATTCAAGCAACTTGGCGATCC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CAAAGTACTTCAGACCCAGAACCAGCTGCAGTTTAATAGGAATGTTCCTACACATTCAAGCAACTTGGCGATCC  148

Query  149  GATATTCTTGCCCACATGCCATTAGAATTGAAAAACTGAAGCACTCATACAATGAATCATACCATTGTAAAGAT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GATATTCTTGCCCACATGCCATTAGAATTGAAAAACTGAAGCACTCATACAATGAATCATACCATTGTAAAGAT  222

Query  223  GCAGATTGTAGAGTTGGTCCTGACCTGGGCAGTTCTGTTTCATTTTCCGTCATATCCCAAGAGAGACTTAGCTA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GCAGATTGTAGAGTTGGTCCTGACCTGGGCAGTTCTGTTTCATTTTCCGTCATATCCCAAGAGAGACTTAGCTA  296

Query  297  TGCTGTCCACCTAGCCAGAAGAGATGTGAAACGAAGACAATTTGAAAAACATATAAAAGAACATCATCTCAGAA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TGCTGTCCACCTAGCCAGAAGAGATGTGAAACGAAGACAATTTGAAAAACATATAAAAGAACATCATCTCAGAA  370

Query  371  GTCAGCCTCAAAGCTCTCAGAAGTGTGGACATACTAAGTATAAAATACCCGACCACAGGGTGGAAAGGAAGGAA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GTCAGCCTCAAAGCTCTCAGAAGTGTGGACATACTAAGTATAAAATACCCGACCACAGGGTGGAAAGGAAGGAA  444

Query  445  TCAAAGAGTCAAGCAGCCTGTCAGTGTAGCCACCAGCCATCCAAAGTAGAAATCTCCAGCTCCGGTGCCAAAGT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  445  TCAAAGAGTCAAGCAGCCTGTCAGTGTAGCCACCAGCCATCCAAAGTAGAAATCTCCAGCTCTGGTGCCAAAGT  518

Query  519  ATACCTTTACTCATCTCATCCAGGCCAGTCAGATCTTACTGTGCCAAATTCGCCACCCACCCATGATCCGGGAC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  ATACCTTTACTCATCTCATCCAGGCCAGTCAGATCTTACTGTGCCAAATTCGCCACCCACCCATGATCCGGGAC  592

Query  593  TTCAGCCTCATCCCAGGATAGGTGACCACAAAAACATAAGTGAACAGAAAAGCCTGCTAGAAGTCCAGCGACTC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TTCAGCCTCATCCCAGGATAGGTGACCACAAAAACATAAGTGAACAGAAAAGCCTGCTAGAAGTCCAGCGACTC  666

Query  667  CAGAAAGAACTGAGCAGTTGTATCCACAAAATTGAAGAGGTAACTAAAAAAGATAGACTAGAAGAAGCTTTGGA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CAGAAAGAACTGAGCAGTTGTATCCACAAAATTGAAGAGGTAACTAAAAAAGATAGACTAGAAGAAGCTTTGGA  740

Query  741  TCCAGATGAAGAACGTCGAATCCGTATCAGGAGACAGGAGCAAGCTGCTCGCTCTGCCCGAATGCTCTACGTCC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TCCAGATGAAGAACGTCGAATCCGTATCAGGAGACAGGAGCAAGCTGCTCGCTCTGCCCGAATGCTCTACGTCC  814

Query  815  TCCAGCAGCAGGTAAAAGAAATCCAGGAAGAATTGGATAAATTGAGTCCACATAAAATTAAACACACTAAGAAG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TCCAGCAGCAGGTAAAAGAAATCCAGGAAGAATTGGATAAATTGAGTCCACATAAAATTAAACACACTAAGAAG  888

Query  889  TCATGGGCAATGTCTAAGCTGGCGGCTGCCCATCGAGGAGCCATTCGGGCCTTACAGATGTTTGTCACTCAGTT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TCATGGGCAATGTCTAAGCTGGCGGCTGCCCATCGAGGAGCCATTCGGGCCTTACAGATGTTTGTCACTCAGTT  962

Query  963  TACTGACCGAGGGGAGCATCCACTTCCTGCTCGGTGTAAGGAACTGGGCAGCCTTATTCGCCAGCTTTCACTTT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TACTGACCGAGGGGAGCATCCACTTCCTGCTCGGTGTAAGGAACTGGGCAGCCTTATTCGCCAGCTTTCACTTT  1036

Query 1037  GTTCTGTCAAGCTGGATGCAGACCCTTCTGTTCCTGATGTGGTTATAGATATTCTGCAACAAATTGAGGCTTTG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GTTCTGTCAAGCTGGATGCAGACCCTTCTGTTCCTGATGTGGTTATAGATATTCTGCAACAAATTGAGGCTTTG  1110

Query 1111  GAATCTCTCCTGGAAAAGAAACTGTCACCAAAAAAGGTGAAAAAATGTTTCAGTGAAATTCGGAGCAGATTTCC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GAATCTCTCCTGGAAAAGAAACTGTCACCAAAAAAGGTGAAAAAATGTTTCAGTGAAATTCGGAGCAGATTTCC  1184

Query 1185  TATCGGTAGCCAAAAGGCCTTGGAGAGATGGCCAAGTACATCACCAAAGGGTGAGAGGAGGCCCCTCACAGCAA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TATCGGTAGCCAAAAGGCCTTGGAGAGATGGCCAAGTACATCACCAAAGGGTGAGAGGAGGCCCCTCACAGCAA  1258

Query 1259  AGGACACATTCCCACAGGAAACAAGTCGACCTTCTGTAGCAAAGCAGCTTCTTGCCGATAAGTATCAGCCCAAT  1332
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 1259  AGGACACATTCCCACAGGAAACAAGTCGACCTTCTGTAGCAAAGCAGCTTCTTGCCGATAAGTATCAGCCCGAT  1332

Query 1333  ACGGAGCTTCCGGAGACCCAGAGGTTGCAGAGTGAGCTTGATGTATTAGATGCGGATATAGTTCCGGAAGAAGG  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 1333  ACGGAGCTTCCGGAGACCCAGAGGTTGCAGAGTGAGCTTGATGTATTAGATGCGGATATAGTTCTGGAAGAAGG  1406

Query 1407  ACCATTTATTCTAGACCAAAGTGCAAGCTTCAAAGACGAGGTGTTAGCCGTGGCAAAAACAAAAGCAGGGAAAA  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  ACCATTTATTCTAGACCAAAGTGCAAGCTTCAAAGACGAGGTGTTAGCCGTGGCAAAAACAAAAGCAGGGAAAA  1480

Query 1481  AGAAGCCTGTGACTGAGAATGTGCCGTTTAGGAAGAAAGATACTCTGGCGCCAGCAAGACAGCAAGGACTCCGC  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  AGAAGCCTGTGACTGAGAATGTGCCGTTTAGGAAGAAAGATACTCTGGCGCCAGCAAGACAGCAAGGACTCCGC  1554

Query 1555  AAAGCTGAAAGAGGTAGACAAAGCCAACCTCACAGTAAAAGCAGAGTGCAGCAGACAACAGTTTCATCCAGATT  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  AAAGCTGAAAGAGGTAGACAAAGCCAACCTCACAGTAAAAGCAGAGTGCAGCAGACAACAGTTTCATCCAGATT  1628

Query 1629  AAAAATGAACCGGCAGCCTGTGAAAGACCGCAAGGCACCATGGATACCCCCAAACCCCACATCCCCACCAGCGT  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  AAAAATGAACCGGCAGCCTGTGAAAGACCGCAAGGCACCATGGATACCCCCAAACCCCACATCCCCACCAGCGT  1702

Query 1703  CTCCTAAATGTGCCGCATGGCTAAAGGTGAAAACTAGCCCCAGAGATGCCACAAAAGAGCCTCTCCAGCAAGAA  1776
            |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  CTCCTAAATGTGCTGCATGGCTAAAGGTGAAAACTAGCCCCAGAGATGCCACAAAAGAGCCTCTCCAGCAAGAA  1776

Query 1777  GATCCTCAAGAGGAAAGTCACCTGACAGGTGCTGTTGAGCATGAAGCAGCCAGGCTCGCTTGGCTTGATGCTGA  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  GATCCTCAAGAGGAAAGTCACCTGACAGGTGCTGTTGAGCATGAAGCAGCCAGGCTCGCTTGGCTTGATGCTGA  1850

Query 1851  AACTTCCAAAAGATTGAAGGAACTAGAAGAGTTAAAAGCCAAGGAAATTGACAGCATGCAAAAACAGAGGCTTG  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  AACTTCCAAAAGATTGAAGGAACTAGAAGAGTTAAAAGCCAAGGAAATTGACAGCATGCAAAAACAGAGGCTTG  1924

Query 1925  ATTGGCTTGATGCTGAAACTTCTAGAAGAACAAAGGAACTGAATGAGCTCAAAGCTGAAGAAATGTATAGACTC  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  ATTGGCTTGATGCTGAAACTTCTAGAAGAACAAAGGAACTGAATGAGCTCAAAGCTGAAGAAATGTATAGACTC  1998

Query 1999  CAACAATTGAGTGTTTCTGCCACCCACTTAGCAGACAAGGTAGAGGAGGCAGTTCTGGATCGTTTGAAGCCTCT  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  CAACAATTGAGTGTTTCTGCCACCCACTTAGCAGACAAGGTAGAGGAGGCAGTTCTGGATCGTTTGAAGCCTCT  2072

Query 2073  CTTGGTCAAGGCCCAGAGAGTCAATTCTACTACAGAAGCAAATATTCATTTGAAAGATGGCTCGTCAGTAAACA  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  CTTGGTCAAGGCCCAGAGAGTCAATTCTACTACAGAAGCAAATATTCATTTGAAAGATGGCTCGTCAGTAAACA  2146

Query 2147  CAGCGCCAGGCCAGCCTGCACAGG--------------------------------------------------  2170
            |||||..||.||||||||||||||                                                  
Sbjct 2147  CAGCGAAAGCCCAGCCTGCACAGGAGGTTTCAGAGCAGAAGGAAATTGGAATGAAGCTCCATTGGCCCAGTGAC  2220

Query 2171  ----------------AGGTTGCAGCTGTTGATTTTGAATCCAACAACATTCGTCAGCTTGATGATTTTTTGGA  2228
                            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  CTTAGGGGCAGGAAGAAGGTTGCAGCTGTTGATTTTGAATCCAACAACATTCGTCAGCTTGATGATTTTTTGGA  2294

Query 2229  AGATTGTGCCAGTGAGCTCTGGGCTGTGACTCATGCTAAGATCTTGGGGTCTGAAACCTTAGCCACCGTTGAGG  2302
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  AGATTGTGCCAGTGAGCTCTGGGCTGTGACTCATGCTAAGATCTTGGGGTCTGAAACCTTAGCCACCGTTGAGG  2368

Query 2303  ACAGCAAGGATAGCCCAGATCTGGAGATCATGATGCGCCGAATGGAAGAGATGGAAAAATACCAGGAGTCTGTT  2376
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369  ACAGCAAGGATAGCCCAGATCTGGAGATCATGATGCGCCGAATGGAAGAGATGGAAAAATACCAGGAGTCTGTT  2442

Query 2377  CGTCAAAGATATAATAAAATCGCATATGCTGATCCTCGACTTTGGATGCAGGAAGAAAACAATGACCAAAAAAT  2450
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443  CGTCAAAGATATAATAAAATCGCATATGCTGATCCTCGACTTTGGATGCAGGAAGAAAACAATGACCAAAAAAT  2516

Query 2451  CTCAGCAATAAGTGAAAAGCCTCTATCTCCTCATCCAATCAGAATCACGAAGACAGTGGATCGCAAGGATCCAG  2524
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517  CTCAGCAATAAGTGAAAAGCCTCTATCTCCTCATCCAATCAGAATCACGAAGACAGTGGATCGCAAGGATCCAG  2590

Query 2525  CCGTGAACATCATGTTAGAAAGGCCCTGTAATGGCAATTCCCTGGATGAAAGTGTGGGAACAGAGGAAGGATCA  2598
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591  CCGTGAACATCATGTTAGAAAGGCCCTGTAATGGCAATTCCCTGGATGAAAGTGTGGGAACAGAGGAAGGATCA  2664

Query 2599  GAGAAAAGAGAGGCCCCTCTTCTCTCCCTAGCCGAAGATTCTCAACAGAAAGAAGGCCGAGCTCCCCTCTTTGT  2672
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665  GAGAAAAGAGAGGCCCCTCTTCTCTCCCTAGCCGAAGATTCTCAACAGAAAGAAGGCCGAGCTCCCCTCTTTGT  2738

Query 2673  CCCACCGGGTATGCGGCACAGCATCGGTGACTACTGTAGTCGTTTTGAGCAGTACCTTCGGATCATATCTCATG  2746
            ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2739  CCCACCGGGTATGCAGCACAGCATCGGTGACTACTGTAGTCGTTTTGAGCAGTACCTTCGGATCATATCTCATG  2812

Query 2747  AGGCTGTAGGCTCCTTCAACCCGTGGCTGATAGCTGAAAGCTTTTCAGAAGAGCTGGTAGATGAAGCTCTGGGT  2820
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2813  AGGCTGTAGGCTCCTTCAACCCGTGGCTGATAGCTGAAAGCTTTTCAGAAGAGCTGGTAGATGAAGCTCTGGGT  2886

Query 2821  GCTGTGGCTGCTGAACTTCAGGATATGTGCGAAGATTATGCAGAAGCTGTGTTCACCTCAGAATTCTTAGAGGC  2894
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2887  GCTGTGGCTGCTGAACTTCAGGATATGTGCGAAGATTATGCAGAAGCTGTGTTCACCTCAGAATTCTTAGAGGC  2960

Query 2895  TGCTACA  2901
            |||||||
Sbjct 2961  TGCTACA  2967