Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000467160
- Subject:
- XM_011524099.2
- Aligned Length:
- 2967
- Identities:
- 1997
- Gaps:
- 963
Alignment
Query 1 ATGGGACCAGGCCAGCCTGCACCAACCTGTGTTCATCTAGCACCTAGGACCCAACTTGATGGGAGGAGCGACCC 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 CAAAGTACTTCAGACCCAGAACCAGCTGCAGTTTAATAGGAATGTTCCTACACATTCAAGCAACTTGGCGATCC 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 GATATTCTTGCCCACATGCCATTAGAATTGAAAAACTGAAGCACTCATACAATGAATCATACCATTGTAAAGAT 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 GCAGATTGTAGAGTTGGTCCTGACCTGGGCAGTTCTGTTTCATTTTCCGTCATATCCCAAGAGAGACTTAGCTA 296
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 297 TGCTGTCCACCTAGCCAGAAGAGATGTGAAACGAAGACAATTTGAAAAACATATAAAAGAACATCATCTCAGAA 370
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 371 GTCAGCCTCAAAGCTCTCAGAAGTGTGGACATACTAAGTATAAAATACCCGACCACAGGGTGGAAAGGAAGGAA 444
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 445 TCAAAGAGTCAAGCAGCCTGTCAGTGTAGCCACCAGCCATCCAAAGTAGAAATCTCCAGCTCCGGTGCCAAAGT 518
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 519 ATACCTTTACTCATCTCATCCAGGCCAGTCAGATCTTACTGTGCCAAATTCGCCACCCACCCATGATCCGGGAC 592
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 593 TTCAGCCTCATCCCAGGATAGGTGACCACAAAAACATAAGTGAACAGAAAAGCCTGCTAGAAGTCCAGCGACTC 666
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 667 CAGAAAGAACTGAGCAGTTGTATCCACAAAATTGAAGAGGTAACTAAAAAAGATAGACTAGAAGAAGCTTTGGA 740
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 741 TCCAGATGAAGAACGTCGAATCCGTATCAGGAGACAGGAGCAAGCTGCTCGCTCTGCCCGAATGCTCTACGTCC 814
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 815 TCCAGCAGCAGGTAAAAGAAATCCAGGAAGAATTGGATAAATTGAGTCCACATAAAATTAAACACACTAAGAAG 888
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 889 TCATGGGCAATGTCTAAGCTGGCGGCTGCCCATCGAGGAGCCATTCGGGCCTTACAGATGTTTGTCACTCAGTT 962
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ---------ATGTCTAAGCTGGCGGCTGCCCATCGAGGAGCCATTCGGGCCTTACAGATGTTTGTCACTCAGTT 65
Query 963 TACTGACCGAGGGGAGCATCCACTTCCTGCTCGGTGTAAGGAACTGGGCAGCCTTATTCGCCAGCTTTCACTTT 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 66 TACTGACCGAGGGGAGCATCCACTTCCTGCTCGGTGTAAGGAACTGGGCAGCCTTATTCGCCAGCTTTCACTTT 139
Query 1037 GTTCTGTCAAGCTGGATGCAGACCCTTCTGTTCCTGATGTGGTTATAGATATTCTGCAACAAATTGAGGCTTTG 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 140 GTTCTGTCAAGCTGGATGCAGACCCTTCTGTTCCTGATGTGGTTATAGATATTCTGCAACAAATTGAGGCTTTG 213
Query 1111 GAATCTCTCCTGGAAAAGAAACTGTCACCAAAAAAGGTGAAAAAATGTTTCAGTGAAATTCGGAGCAGATTTCC 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 214 GAATCTCTCCTGGAAAAGAAACTGTCACCAAAAAAGGTGAAAAAATGTTTCAGTGAAATTCGGAGCAGATTTCC 287
Query 1185 TATCGGTAGCCAAAAGGCCTTGGAGAGATGGCCAAGTACATCACCAAAGGGTGAGAGGAGGCCCCTCACAGCAA 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 288 TATCGGTAGCCAAAAGGCCTTGGAGAGATGGCCAAGTACATCACCAAAGGGTGAGAGGAGGCCCCTCACAGCAA 361
Query 1259 AGGACACATTCCCACAGGAAACAAGTCGACCTTCTGTAGCAAAGCAGCTTCTTGCCGATAAGTATCAGCCCAAT 1332
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 362 AGGACACATTCCCACAGGAAACAAGTCGACCTTCTGTAGCAAAGCAGCTTCTTGCCGATAAGTATCAGCCCGAT 435
Query 1333 ACGGAGCTTCCGGAGACCCAGAGGTTGCAGAGTGAGCTTGATGTATTAGATGCGGATATAGTTCCGGAAGAAGG 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 436 ACGGAGCTTCCGGAGACCCAGAGGTTGCAGAGTGAGCTTGATGTATTAGATGCGGATATAGTTCTGGAAGAAGG 509
Query 1407 ACCATTTATTCTAGACCAAAGTGCAAGCTTCAAAGACGAGGTGTTAGCCGTGGCAAAAACAAAAGCAGGGAAAA 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 510 ACCATTTATTCTAGACCAAAGTGCAAGCTTCAAAGACGAGGTGTTAGCCGTGGCAAAAACAAAAGCAGGGAAAA 583
Query 1481 AGAAGCCTGTGACTGAGAATGTGCCGTTTAGGAAGAAAGATACTCTGGCGCCAGCAAGACAGCAAGGACTCCGC 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 584 AGAAGCCTGTGACTGAGAATGTGCCGTTTAGGAAGAAAGATACTCTGGCGCCAGCAAGACAGCAAGGACTCCGC 657
Query 1555 AAAGCTGAAAGAGGTAGACAAAGCCAACCTCACAGTAAAAGCAGAGTGCAGCAGACAACAGTTTCATCCAGATT 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 658 AAAGCTGAAAGAGGTAGACAAAGCCAACCTCACAGTAAAAGCAGAGTGCAGCAGACAACAGTTTCATCCAGATT 731
Query 1629 AAAAATGAACCGGCAGCCTGTGAAAGACCGCAAGGCACCATGGATACCCCCAAACCCCACATCCCCACCAGCGT 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 732 AAAAATGAACCGGCAGCCTGTGAAAGACCGCAAGGCACCATGGATACCCCCAAACCCCACATCCCCACCAGCGT 805
Query 1703 CTCCTAAATGTGCCGCATGGCTAAAGGTGAAAACTAGCCCCAGAGATGCCACAAAAGAGCCTCTCCAGCAAGAA 1776
|||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 806 CTCCTAAATGTGCTGCATGGCTAAAGGTGAAAACTAGCCCCAGAGATGCCACAAAAGAGCCTCTCCAGCAAGAA 879
Query 1777 GATCCTCAAGAGGAAAGTCACCTGACAGGTGCTGTTGAGCATGAAGCAGCCAGGCTCGCTTGGCTTGATGCTGA 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 880 GATCCTCAAGAGGAAAGTCACCTGACAGGTGCTGTTGAGCATGAAGCAGCCAGGCTCGCTTGGCTTGATGCTGA 953
Query 1851 AACTTCCAAAAGATTGAAGGAACTAGAAGAGTTAAAAGCCAAGGAAATTGACAGCATGCAAAAACAGAGGCTTG 1924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 954 AACTTCCAAAAGATTGAAGGAACTAGAAGAGTTAAAAGCCAAGGAAATTGACAGCATGCAAAAACAGAGGCTTG 1027
Query 1925 ATTGGCTTGATGCTGAAACTTCTAGAAGAACAAAGGAACTGAATGAGCTCAAAGCTGAAGAAATGTATAGACTC 1998
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1028 ATTGGCTTGATGCTGAAACTTCTAGAAGAACAAAGGAACTGAATGAGCTCAAAGCTGAAGAAATGTATAGACTC 1101
Query 1999 CAACAATTGAGTGTTTCTGCCACCCACTTAGCAGACAAGGTAGAGGAGGCAGTTCTGGATCGTTTGAAGCCTCT 2072
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1102 CAACAATTGAGTGTTTCTGCCACCCACTTAGCAGACAAGGTAGAGGAGGCAGTTCTGGATCGTTTGAAGCCTCT 1175
Query 2073 CTTGGTCAAGGCCCAGAGAGTCAATTCTACTACAGAAGCAAATATTCATTTGAAAGATGGCTCGTCAGTAAACA 2146
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1176 CTTGGTCAAGGCCCAGAGAGTCAATTCTACTACAGAAGCAAATATTCATTTGAAAGATGGCTCGTCAGTAAACA 1249
Query 2147 CAGCGCCAGGCCAGCCTGCACAGG-------------------------------------------------- 2170
|||||..||.||||||||||||||
Sbjct 1250 CAGCGAAAGCCCAGCCTGCACAGGAGGTTTCAGAGCAGAAGGAAATTGGAATGAAGCTCCATTGGCCCAGTGAC 1323
Query 2171 ----------------AGGTTGCAGCTGTTGATTTTGAATCCAACAACATTCGTCAGCTTGATGATTTTTTGGA 2228
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1324 CTTAGGGGCAGGAAGAAGGTTGCAGCTGTTGATTTTGAATCCAACAACATTCGTCAGCTTGATGATTTTTTGGA 1397
Query 2229 AGATTGTGCCAGTGAGCTCTGGGCTGTGACTCATGCTAAGATCTTGGGGTCTGAAACCTTAGCCACCGTTGAGG 2302
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1398 AGATTGTGCCAGTGAGCTCTGGGCTGTGACTCATGCTAAGATCTTGGGGTCTGAAACCTTAGCCACCGTTGAGG 1471
Query 2303 ACAGCAAGGATAGCCCAGATCTGGAGATCATGATGCGCCGAATGGAAGAGATGGAAAAATACCAGGAGTCTGTT 2376
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1472 ACAGCAAGGATAGCCCAGATCTGGAGATCATGATGCGCCGAATGGAAGAGATGGAAAAATACCAGGAGTCTGTT 1545
Query 2377 CGTCAAAGATATAATAAAATCGCATATGCTGATCCTCGACTTTGGATGCAGGAAGAAAACAATGACCAAAAAAT 2450
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1546 CGTCAAAGATATAATAAAATCGCATATGCTGATCCTCGACTTTGGATGCAGGAAGAAAACAATGACCAAAAAAT 1619
Query 2451 CTCAGCAATAAGTGAAAAGCCTCTATCTCCTCATCCAATCAGAATCACGAAGACAGTGGATCGCAAGGATCCAG 2524
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1620 CTCAGCAATAAGTGAAAAGCCTCTATCTCCTCATCCAATCAGAATCACGAAGACAGTGGATCGCAAGGATCCAG 1693
Query 2525 CCGTGAACATCATGTTAGAAAGGCCCTGTAATGGCAATTCCCTGGATGAAAGTGTGGGAACAGAGGAAGGATCA 2598
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1694 CCGTGAACATCATGTTAGAAAGGCCCTGTAATGGCAATTCCCTGGATGAAAGTGTGGGAACAGAGGAAGGATCA 1767
Query 2599 GAGAAAAGAGAGGCCCCTCTTCTCTCCCTAGCCGAAGATTCTCAACAGAAAGAAGGCCGAGCTCCCCTCTTTGT 2672
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1768 GAGAAAAGAGAGGCCCCTCTTCTCTCCCTAGCCGAAGATTCTCAACAGAAAGAAGGCCGAGCTCCCCTCTTTGT 1841
Query 2673 CCCACCGGGTATGCGGCACAGCATCGGTGACTACTGTAGTCGTTTTGAGCAGTACCTTCGGATCATATCTCATG 2746
||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1842 CCCACCGGGTATGCAGCACAGCATCGGTGACTACTGTAGTCGTTTTGAGCAGTACCTTCGGATCATATCTCATG 1915
Query 2747 AGGCTGTAGGCTCCTTCAACCCGTGGCTGATAGCTGAAAGCTTTTCAGAAGAGCTGGTAGATGAAGCTCTGGGT 2820
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1916 AGGCTGTAGGCTCCTTCAACCCGTGGCTGATAGCTGAAAGCTTTTCAGAAGAGCTGGTAGATGAAGCTCTGGGT 1989
Query 2821 GCTGTGGCTGCTGAACTTCAGGATATGTGCGAAGATTATGCAGAAGCTGTGTTCACCTCAGAATTCTTAGAGGC 2894
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1990 GCTGTGGCTGCTGAACTTCAGGATATGTGCGAAGATTATGCAGAAGCTGTGTTCACCTCAGAATTCTTAGAGGC 2063
Query 2895 TGCTACA 2901
|||||||
Sbjct 2064 TGCTACA 2070