Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000467167
• Subject: XM_006715205.3
• Aligned Length: 1125
• Identities: 999
• Gaps: 126

Alignment

Query    1  ATGTTGGTGATACCCCCCGGACTGAGCGAGGAAGAGGAGGCTCTGCAGAAGAAATTCAACAAGCTCAAGAAAAA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTTGGTGATACCCCCCGGACTGAGCGAGGAAGAGGAGGCTCTGCAGAAGAAATTCAACAAGCTCAAGAAAAA  74

Query   75  GAAAAAGGCATTGCTGGCTCTGAAGAAGCAAAGTAGCAGCAGCACAACCAGCCAAGGTGGTGTCAAACGCTCAC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GAAAAAGGCATTGCTGGCTCTGAAGAAGCAAAGTAGCAGCAGCACAACCAGCCAAGGTGGTGTCAAACGCTCAC  148

Query  149  TATCAGAGCAGCCTGTCATGGACACAGCCACAGCAACAGAGCAGGCAAAGCAGCTGGTGAAGTCAGGAGCCATC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TATCAGAGCAGCCTGTCATGGACACAGCCACAGCAACAGAGCAGGCAAAGCAGCTGGTGAAGTCAGGAGCCATC  222

Query  223  AGTGCCATCAAGGCTGAGACCAAGAACTCAGGCTTCAAGCGTTCTCGAACCCTTGAGGGGAAGTTAAAGGACCC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AGTGCCATCAAGGCTGAGACCAAGAACTCAGGCTTCAAGCGTTCTCGAACCCTTGAGGGGAAGTTAAAGGACCC  296

Query  297  CGAGAAGGGACCAGTCCCCACTTTCCAGCCGTTCCAGAGGAGCATATCTGCTGATGATGACCTGCAAGAGTCAT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CGAGAAGGGACCAGTCCCCACTTTCCAGCCGTTCCAGAGGAGCATATCTGCTGATGATGACCTGCAAGAGTCAT  370

Query  371  CCAGACGTCCCCAGAGGAAATCTCTGTATGAGAGTGATCGACTTCGAGAACTAGGACCAGATGGAGAAGAGGCA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CCAGACGTCCCCAGAGGAAATCTCTGTATGAGAGTGATCGACTTCGAGAACTAGGACCAGATGGAGAAGAGGCA  444

Query  445  GAGGGCCCAGGGGCTGGTGATGGTCCCCCTCGAAGCTTTGACTGGGGCTATGAAGAACGCAGTGGTGCCCACTC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GAGGGCCCAGGGGCTGGTGATGGTCCCCCTCGAAGCTTTGACTGGGGCTATGAAGAACGCAGTGGTGCCCACTC  518

Query  519  CTCAGCCTCCCCTCCCCGAAGCCGCAGCCGGGACCGCAGCCATGAGAGGAACCGGGACA---------------  577
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||               
Sbjct  519  CTCAGCCTCCCCTCCCCGAAGCCGCAGCCGGGACCGCAGCCATGAGAGGAACCGGGACAGAGACCGAGATCGGG  592

Query  578  --------------------------------------------------------------------------  577
                                                                                      
Sbjct  593  AGCGGGATCGAGACCGGGATCGAGACAGAGACAGAGAGCGGGACAGGGATCGGGATCGGGATCGAGATCGAGAC  666

Query  578  -------------------------------------GAGACCGAGAGGGTCCTTTCCGCAGGTCGGATTCATT  614
                                                 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CGGGAACGGGACAGGGATCGGGAGCGGGATCGAGACCGAGACCGAGAGGGTCCTTTCCGCAGGTCGGATTCATT  740

Query  615  CCCTGAACGGCGAGCCCCTAGGAAAGGGAATACTCTCTATGTATATGGAGAAGACATGACACCCACCCTTCTCC  688
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CCCTGAACGGCGAGCCCCTAGGAAAGGGAATACTCTCTATGTATATGGAGAAGACATGACACCCACCCTTCTCC  814

Query  689  GTGGGGCCTTCTCTCCTTTTGGAAACATCATTGACCTCTCCATGGACCCACCCAGAAACTGTGCCTTCGTCACC  762
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GTGGGGCCTTCTCTCCTTTTGGAAACATCATTGACCTCTCCATGGACCCACCCAGAAACTGTGCCTTCGTCACC  888

Query  763  TATGAAAAGATGGAGTCAGCAGATCAGGCCGTTGCTGAGCTCAACGGGACCCAGGTGGAGTCTGTACAGCTCAA  836
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TATGAAAAGATGGAGTCAGCAGATCAGGCCGTTGCTGAGCTCAACGGGACCCAGGTGGAGTCTGTACAGCTCAA  962

Query  837  AGTCAACATAGCCCGAAAACAGCCCATGCTGGATGCCGCTACTGGCAAGTCTGTCTGGGGCTCCCTCGCTGTCC  910
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  AGTCAACATAGCCCGAAAACAGCCCATGCTGGATGCCGCTACTGGCAAGTCTGTCTGGGGCTCCCTCGCTGTCC  1036

Query  911  AGAACAGCCCTAAGGGTTGCCACCGGGACAAGAGGACCCAGATTGTCTACAGTGATGACGTCTACAAGGAAAAC  984
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AGAACAGCCCTAAGGGTTGCCACCGGGACAAGAGGACCCAGATTGTCTACAGTGATGACGTCTACAAGGAAAAC  1110

Query  985  CTTGTGGATGGCTTC  999
            |||||||||||||||
Sbjct 1111  CTTGTGGATGGCTTC  1125